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使用RNA-Seq Data
使用RNA-Seq DataAbstRactObjectivesiveSimple序列重复序列（SSRS）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记或微观片状，这是由于适当的遗传覆盖物之一，并且是较高的遗传因素，到目前为止，尚未报道Scorpion andractonus crassicouda的简单序列重复标记。因此，该研究的目的是使用RNA-Seq数据识别和验证蝎子andractonus crassicouda的简单重复序列标记。材料和方法在从分木毒液腺体中提取RNA后，对样品进行定性和定量评估样品。然后将样品与Illumina Hiseq 2000平台进行测序。笔录的重建是使用Trinity软件通过从头组装方法完成的。接下来，为了识别新的SSR标记，使用FullSSR软件（版本1.5）分析了Scorpion Andrachtonus crassicouda的转录组。为了验证已识别的SSR标记，通过引物3软件设计了8对引物，并通过聚合酶链反应方法对60种从蝎子组织提取的DNA样品进行评估。通过Trinity程序进行的回流分解记录产生了744,804个转录本和563,526个Unigenes。在这项研究中，Fullssr软件对952,725个序列的检查导致了315,395 SSR MA 的识别使用RNA-Seq DataAbstRactObjectivesiveSimple序列重复序列（SSRS）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记（SSR）标记或微观片状，这是由于适当的遗传覆盖物之一，并且是较高的遗传因素，到目前为止，尚未报道Scorpion andractonus crassicouda的简单序列重复标记。因此，该研究的目的是使用RNA-Seq数据识别和验证蝎子andractonus crassicouda的简单重复序列标记。材料和方法在从分木毒液腺体中提取RNA后，对样品进行定性和定量评估样品。然后将样品与Illumina Hiseq 2000平台进行测序。笔录的重建是使用Trinity软件通过从头组装方法完成的。接下来，为了识别新的SSR标记，使用FullSSR软件（版本1.5）分析了Scorpion Andrachtonus crassicouda的转录组。为了验证已识别的SSR标记，通过引物3软件设计了8对引物，并通过聚合酶链反应方法对60种从蝎子组织提取的DNA样品进行评估。通过Trinity程序进行的回流分解记录产生了744,804个转录本和563,526个Unigenes。在这项研究中，Fullssr软件对952,725个序列的检查导致了315,395 SSR MA
来源:Arácnido使用RNA-Seq Data
摘要
objectiveimple序列重复序列（SSR）标记或微卫星是由于适当的基因组覆盖范围和高可重复性而研究的遗传多样性中最好，最完整的分子工具之一。到目前为止，尚未报道Scorpion andractonus crassicouda的简单序列重复标记。因此，该研究的目的是使用RNA-seq数据来识别和验证蝎子andractonus crassicouda的简单重复序列标记。
材料和方法在从蝎子毒腺中提取RNA后，对样品进行定性和定量评估。然后将样品与Illumina Hiseq 2000平台进行测序。笔录的重建是使用Trinity软件通过从头组装方法完成的。接下来，为了识别新的SSR标记，使用FullSSR软件（版本1.5）分析了Scorpion Andrachtonus crassicouda的转录组。为了验证已识别的SSR标记，通过引物3软件设计了8对引物，并通过聚合酶链反应方法对60种从蝎组织提取的DNA样品进行评估。
结论遗传多样性的不同标准都表明人口高度多样化，但某些因素降低了研究人群的多样性。这意味着人口不平衡，观察到的杂合子的数量小于预期的杂合子。有必要调查导致多样性减少以防止其进一步减少的因素。总的来说，这项研究的结果表明，新的SSR对于理解种群结构并研究了蝎子Andractonus crassicouda的遗传多样性很有用。
农业生物技术杂志 ，17（2），第31-54页。 doi：10.22103/jab.2025.24286.1625