Detection and Decay of Different Classes of Environmental RNA (eRNA) from Zebrafish (Danio rerio)
目的:本技术说明通过探索中观生态系统中几种不同斑马鱼 (Danio rerio) eRNA 的检测和衰变,为不断增长的宏观真核环境 RNA (eRNA) 知识体系做出了贡献。该研究提出了四个基本假设:(1) D. rerio 会在水中沉积可检测水平的 eRNA,(2) 会检测到不同类别的 eRNA,(3) 不同的 eRNA 序列(例如,基因座)会以不同的速率降解,以及 (4) 非生物和生物因素会影响降解率。对于最后一个假设,我们追踪了不同水温和微生物活动水平处理下 eRNA 浓度的衰减,这两个因素已知会显著影响环境 DNA (eDNA) 的衰减(Barnes 等人 2014 年;Lance 等