XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System富集
基于总体评分的OMICS数据的富集分析
Chen Peng是Zhejiang University生命科学研究所的博士生。Qiong Chen是Zhejiang University生命科学研究所的博士后研究员。Shangjin Tan正在BGI研究中工作。Xiaotao Shen是斯坦福大学医学院迈克尔·斯奈德（Michael Snyder）实验室的博士后研究员。Chao Jiang是郑大学生命科学研究所的首席研究员。 收到：2023年12月5日。 修订：2024年1月25日。 接受：2024年3月1日。 ©作者2024。 牛津大学出版社出版。 这是根据Creative Commons Attribution许可条款（https://creativecommons.org/licenses/4.0/）分发的一篇开放访问文章，该文章允许在任何媒介中不受限制地重复使用，分发和再现，前提是适当地引用了原始工作。Chao Jiang是郑大学生命科学研究所的首席研究员。收到：2023年12月5日。修订：2024年1月25日。接受：2024年3月1日。©作者2024。牛津大学出版社出版。这是根据Creative Commons Attribution许可条款（https://creativecommons.org/licenses/4.0/）分发的一篇开放访问文章，该文章允许在任何媒介中不受限制地重复使用，分发和再现，前提是适当地引用了原始工作。
荧光 Cas9 mRNA 用于富集 CRISPR-...
图 2：使用荧光 Cas9 mRNA 富集基因敲除 A. 对与 mKate2 Cas9 mRNA 和阳性对照 PPIB crRNA:tracrRNA 共电穿孔并根据 mKate2 荧光进行分选的 K-562 细胞群进行错配检测分析。B. 在次优和最优脂质转染条件下，EGFP Cas9 mRNA 分选的 U2OS 细胞群的 FACS 数据。C. 对 EGFP Cas9 mRNA 分选的 U2OS 细胞群进行错配检测分析
人类内部空间的分子富集和清除
颅内溶质运输的机制是人类脑健康的基础，其变化通常与疾病和功能障碍有关，并有独特的个性化诊断和治疗机会。然而，我们对这些机制及其相互作用的理解仍然不完整，部分原因是跨尺度，物种和不同模态之间的洞察力的复杂性。在这里，我们结合了混合尺寸建模，多模式磁共振图像和高性能计算，以构建和探索人类颅内分子富集的高保真性内部模型。该模型预测了在蛛网膜下腔，心室系统和脑实质的图像衍生几何表示中溶质的颞空间扩散，包括表面周围空间（PVSS）的网络。我们的发现强调了脑脊液（CSF）产生和颅内搏动性对鞘内示踪剂注射后分子富集的显着影响。我们证明，低频血管舒张症会在表面PVS网络中引起中度CSF流量，从而大大增强了示踪剂的富集，并且富集受损是PVS扩大的直接自然结果。因此，这个公开可用的技术平台为整合了关于神经胶体扩散，血管动力学，颅内搏动性，CSF的产生和外排的单独观察的机会，并探索了人脑中的药物输送和清除率。
新型自动应用CD34+细胞的富集...
已对一种全面的流式细胞量QC方案进行了发展，以分析起始和靶向细胞产品，结合了CD34 +细胞和白细胞细胞的细胞浓度，细胞频率以及可行性的方便，快速评估，以及对潜在污染物的准确检测以及诸如残留的T和B细胞和分类的准确检测。MacSquant®分析仪10和16的抗体面板和相应的门控策略如图3a＆3b。，根据流式细胞仪的CD34 +细胞终止终止的ISHAGE指南，茎的门控策略
Illumina DNA准备外显子组2.5富集
Illumina DNA Prep和Exome 2.5富集提供经济的人类全外观测序（WES）结果，具有出色的性能和数据质量。易于使用的库的准备和富集解决方案是从样本到报告的端到端工作流程的一部分（图1）。Illumina合格的方法可通过我们的合作伙伴提供一系列自动化平台。Illumina DNA与Exome 2.5富集的PrEP始于提取的基因组DNA（GDNA）或直接血液或唾液输入，并结合了快速的珠宝上标记文库制备化学化学，然后进行混合捕获外部体富集（图2）。1具有富集化学的Illumina DNA准备支持高质量输入DNA（≥50ng）的综合归一化，这可以实现简单的基于体积的合并进行杂交，并提供来自每个富集外来图书馆的测序输出。库在Novaseq
DNA转座子通过富集转录因子结合基序
从基因组的非编码区域通过突变依次出现。除其他外，此类突变分析转录并创建一个新的开放阅读框（ORF）。尽管ORF出现的机制有充分的文献证明，但对实现新转录事件的机制知之甚少。然而，在许多物种中，已经报道了基因组所有区域的缺乏和非常突出的转录之间的连续体。在这项研究中，我们使用新组装的基因组和七个果蝇的近交系列的转录组和转录组搜索了从头转录本，该基因组和一个来自六个欧洲和一个非洲人口的近交系列。此设置使我们能够检测Sam ple特定的从头转录本，并将其与其他样品中的同源非转录区以及遗传和基因间控制序列进行比较。我们研究了与转换元件（TES）的关联，并富集了从头开始出现的转录本上游的转录因子基序，并将其与调节元素进行了比较。我们发现，从头的成绩单与TES重叠的频率比偶然性的频率更高。新转录本的出现cor与高鸟嘌呤 - 环蛋白含量和TE表达的区域有关。此外，从头转录本的上游区域高度丰富了调节基序。这种基序在与TES（尤其是DNA TES）重叠的新转录物中更丰富，并且比上游的“非转录同源物”更保守上游。总体而言，我们的研究表明，TE插入对于转录本的出现很重要，部分是通过引入DNA te家族的新调节图案。
Epimark甲基化的DNA富集套件，E2600，手册
通过与人MBD2A蛋白的甲基-CPG结合结构域结合与人IgG1（MBD2A-FC的FC尾巴）的甲基-CPG结合结构域结合，将甲基化的DNA从碎片的基因组DNA（5 ng-25μg）中分离出来，该蛋白与人IgG1（MBD2A-FC）的FC尾部结合，从而与paramagnetic Hydophilic Protein a betein a bead a bead a bead a bead a bead a bead a bead a bead a bead a bead a。两个FC结构域可以与具有高亲和力的蛋白质A上的一个位点结合（K d = 10 –7）。由于FC片段是二聚体，因此四个MBD2结构域暴露于每个分子蛋白A分子的溶剂，从而增加了相对平衡常数100倍。这种稳定的复合物将选择性地结合含有DNA的双链甲基化的CpG。在简单的洗涤步骤随后进行磁捕获后，通过在65°C下孵育，富集的DNA样品很容易在少量无核酸酶的水中洗脱。样本可以立即通过多种方法进行下游分析，包括：
Illumina DNA准备外观2.0加富集
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基因本体学富集分析和可视化工具
描述：用于识别和可视化基因排名列表中的丰富GO术语的工具。它可以以两种模式之一运行： *搜索富集的GO术语，这些术语在排名的基因列表的顶部，或 *与基因的基因目标列表中的基因列表中的富集术语搜索。
