分子对接:基于结构的药物设计的提前生物信息学策略摘要由两个或多个相互作用分子创建的结构复合物的计算建模称为分子对接。对有趣的三维结构的预测是分子对接的目的。用于分子对接的软件主要用于药物开发。分子和简单地访问结构数据库已损害了重要的机制。分子对接提供了几种用于药物设计和研究的昂贵工具。简单的分子预测和快速访问结构数据库是医疗化学家桌面上必不可少的工具。分子对接的主要应用是虚拟筛选。可以采用不同的计算技术来分析对接增益,并利用许多对接程序可视化分子的三维结构。在结构分子生物学和计算机辅助药物设计中,分子对接至关重要。对接可用于对化合物的巨大库进行虚拟筛选,评分结果并为配体如何减少靶标提供结构性假设,所有这些都对铅优化有益。关键字:分子对接;分子对接类型;对接机制;对接评估;应用。
摘要:covid-19是由新型包裹的β-核心管病毒引起的,其基因组RNA与严重的急性呼吸系统综合症 - 科罗纳病毒(SARS-COV)密切相关,并被称为冠状病毒2(SARS-COV-2)。在这项研究中,针对RBD专门停靠了六种合成药物。观察到六种化合物中的大多数与特定的非共价相互作用非常吻合。oseltamivir被发现是与RBD最强烈的相互作用,表现出高适应性和低自由能的结合能量。它在活性位点的区域中形成了多个非共价键。羟基氯喹还表现出溶剂可访问性的高结合亲和力,并且非常适合S蛋白的活性口袋。结果表明,这些化合物可能是S蛋白质的有效抑制剂,在某种程度上可以阻止其与ACE-2的相互作用。从SARS-COV-2峰值蛋白的3D结构中显而易见,随着不同药物的相互作用,这会导致不适合结合ACE2受体。因此,有必要阐明这些化合物对SARS-COV-2的作用的实验室研究,以进行临床评估。氯喹,羟基氯喹和Oseltamivir通过非共价相互作用与S蛋白的受体结合结构域相互作用,并被建议作为Covid-19的出色候选者。
发现针对 SARS- CoV-2 3CL pro 蛋白靶点的新型羟乙胺类似物:分子对接、分子动力学模拟和构效关系研究 Sumit Kumar 1,2、Prem Prakash Sharma 2、Uma Shankar 3、Dhruv Kumar 4、Sanjeev K Joshi 5、Lindomar Pena 6、Ravi Durvasula 7、Amit Kumar 3、Prakasha Kempaiah 7、Poonam 1、和 Brijesh Rathi 2,* 1 德里大学米兰达楼化学系,德里 - 110007。 2 德里大学汉斯拉吉学院转化化学与药物研发实验室,德里 - 110007 印度 3 印度理工学院生物科学与生物医学工程系,印多尔,西姆罗尔,印多尔 - 453552,印度 4 阿米蒂大学北方邦阿米蒂分子医学与干细胞研究所 (AIMMSCR),Sec-125,诺伊达 - 201313,印度 5 国防研究与发展组织技术部,总部,Rajaji Marg,新德里 - 110011 6 奥斯瓦尔多·克鲁兹基金会 (Fiocruz) Aggeu Magalhaes 研究所 (IAM) 病毒学系,50670-420,累西腓,伯南布哥州,巴西。 7 洛约拉大学斯特里奇医学院医学系,2160 South First Avenue,芝加哥,伊利诺伊州 60153,美国
摘要 - 自动化卫星对接是大多数未来轨内服务任务的先决条件。大多数基于视觉的解决方案建议使用常规摄像机。但是,由于极端的照明条件,官能相机面临挑战。事件摄像机已用于各种应用中,因为它们的优势比常规摄像机(例如高时间分辨率,更高的动态范围,低功耗和更高的像素带宽)。本文提出了一个硬件设置,以模拟低地轨道(LEO)条件。该设置旨在展示基于事件的相机对卫星对接应用程序的适用性。开发的测试环境具有类似于狮子座的照明条件,Leo是洛克希德·马丁(Lockheed Martin)的任务增强端口标准后的模拟卫星对接端口,以及一个可以将模拟卫星移动以复制太空运动的机器人臂。本文显示了在狮子座条件下(例如像素饱和度)中传统摄像机所面临的缺点,从而导致功能丧失。为了克服这些局限性,本文使用基于事件的相机介绍了端口检测管道。所提出的管道在图像空间中以平均误差为8.58像素来检测对接端口。与图像宽度和高度相比,此错误分别为2.48%和3.30%。因此,所提出的方法为卫星对接提供了有希望的结果,该卫星在狮子座环境中使用照明条件具有挑战性的情况。
●Arichile:巴塔哥尼亚的创新项目。新的电解溶液原型制作(Innowwide Program)●HOASIS:应用于氢行工业(水能食品Nexus)的循环经济。将包括3GW PV设施和2GW电解设施。用于不同应用的氢和氧(氨,采矿迁移率,混合,出口)。●HVALLESUR:开发绿色氢走廊,用于在智利中南部地区进行林木繁重运输以进行林木的重型运输。●绿色氢生产阿根廷的采矿公司的技术和经济研究:
sherin.dr@iiitmk.ac.in & manojtk@iiitmk.ac.in 摘要:正常细胞的基因组身份受端粒保护,有时由于细胞连续分裂导致端粒酶缩短,从而观察到染色体不稳定性。报告表明,端粒酶长度对于确定端粒酶活性至关重要,而端粒酶活性又会导致癌症发生。据报道,端粒长度调节已被确定为一种可行的癌症诊断和治疗策略。在本 MS 中,我们使用计算方法探索了儿茶素类似物及其低聚物的端粒酶抑制活性。使用密度泛函理论计算了 MS 中讨论的不同配体的结构性质。使用计算方法探索了不同色烯亚基(例如 2R、3R 构象)的构象效应。还研究了这些配体对受体结合的立体化学贡献,例如配体内 π 相互作用。我们在此提出,儿茶素及其低聚物的立体化学方面是决定与端粒酶 N 端结构域有效结合的最重要因素,而这种结合是癌症治疗的有效策略。
目前,空间站平台对接装置被动部分已完成定型,需要一种能够利用原位资源在轨组装大型有效载荷的对接机构。本文提出一种紧凑、高精度双组件对接机构的设计,用于大型空间载荷的对接。首先,提出主动侧和被动侧的参数设计,并建立捕获机构的约束方程。接下来,提出一种先粗校正、后精校正的渐进定位方法。分析双组件的校准和定位性能,初步捕获较大的偏差,随后实现电气和液压连接器的高精度对接。单、双组件的静态分析表明,承载能力与直径呈正相关。在原型测试期间,测得的最大位置偏差在X方向为0.12 mm,在Y方向为0.5 mm,在Z方向为0.07 mm。双组件联合操作时最大角度偏差为0.04°。最后,分析了轨道对接轴向和径向条件的影响,验证了载荷要求。本研究为未来大型空间载荷对接机构的研制提供了理论和技术指导。
RdRp 0.587302 0.087633 0.890853 0.065624 0.284112 NSP2 0.587302 0.046212 0.968646 0.036751 0.333196 N 蛋白 0.578125 0.083752 0.790443 0.02517 0.305663 NSP10 0.45122 0.017466 0.523294 0.039623 0.12841 ExoN 0.486842 0.014993 0.606035 0.036957 0.228533 NSP12 0.578125 0.059686 0.946454 0.036738 0.243958 NSP13 0.397849 0 0.272434 0.01722 0.128044 NSP9 0.513889 0.010905 0.629844 0.025474 0.183429 赫尔 0.45122 0.002244 0.355033 0.021652 0.040965
用于治疗 COVID-19 的药物研究仍然具有挑战性。SARS-CoV-2 通过血管紧张素转换酶 (ACE2) 受体进入人体。SARS-CoV-2 的 S(刺突)蛋白结构与 ACE2 受体的活性位点相互作用,该活性位点定义为肽酶结构域,由 Gln24、Asp30、His34、Tyr41、Gln42、Met82、Lys353、Arg357 组成。这项工作研究了三种喹啉类抗疟药物与 ACE2 受体肽酶结构域的相互作用。从蛋白质数据库下载了人 ACE2 受体的 X 射线晶体结构。使用 MarvinSketch 构建配体,并使用 LigandScout 中的 MMFF94 进行几何优化。能量最小化的配体对接至 ACE2 受体的肽酶结构域。结果表明,氯喹、羟氯喹和奎宁可以与 ACE2 受体肽酶结构域中的氨基酸残基相互作用。在这三种化合物中,奎宁对 ACE2 受体的亲和力最强(-4.89 kcal/mol),其次是羟氯喹(-3.87 kcal/mol)和氯喹(-3.17 kcal/mol)。总之,奎宁、氯喹和羟氯喹可以通过与 ACE2 受体肽酶结构域中的 Lys353 残基相互作用来阻断 SARS-CoV-2 病毒的感染,因此有可能用作 COVID-19 解毒剂。这项研究将为喹啉类抗疟药物抑制 SARS-CoV-2 病毒感染的机制提供更多见解。关键词:ACE2 受体,COVID-19,氯喹,羟氯喹,奎宁,SARS-CoV-2