XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System10KB
重新组合：使用单链寡聚>的体内基因工程效率高度
重新组合提供了对任何DNA序列进行快速，精确和廉价的遗传改变的能力，无论是在染色体中还是克隆到载体上，以在大肠杆菌（或其他重新组合的培养细菌）中复制的载体，并以高效的方式进行。可以在重新组合的几天内创建不可能用体外基因工程制造的复杂遗传构建体。与单链DNA（ssDNA）重新组合可用于创建单个或多个聚类点突变，小或大（最大或最大（最高10KB）缺失）以及小（10-20个基本）插入（例如序列标签）。使用优化的条件，可以使用如此高的频率进行点突变，以至于无需选择就可以找到它们。这项技术在创建定向和随机突变方面表现出色。
同时映射6mA标签，本机DNA ...
基因转录受组蛋白转化后修饰（PTM），染色质蛋白（CAPS）和DNA甲基化（DNAME）之间的复杂相互作用的调节。绘制其基因组位置并检查这些染色质元素之间的关系是一种强大的疾病机制方法，从而可以发现新型的生物标志物和治疗剂。领先的表观基因组映射技术（例如，Chip-Seq，Cut＆Run）依靠DNA碎片来隔离感兴趣的区域以在短读平台上进行测序（例如Illumina）。这种策略导致有关周围DNA的上下文信息的实质性丧失，从而排除了单个DNA分子上多个同时出现的表观基因组特征的鉴定。相比之下，长阅读测序（LRS）平台能够从单个分子（通常> 10KB）进行很长的读取，从而使单个分子上的特征之间的关系可以用于解决混合群体内的异质性。在这里，我们报告了一种强大的多摩变方法，该方法利用LRS在单个测定中同时介绍了组蛋白PTMS（或CAPS），DNAME和父母单倍型。
ascon：轻巧密码学的新时代
摘要本章重点介绍了ASCON加密算法，该算法是一种轻巧的加密协议，专门设计用于适合具有限制资源的环境，例如物联网设备和嵌入式系统。该分析是在Ascon-128，Ascon-128a和Ascon-80PQ变体上进行的，突出了它们对不同安全和运营必需品的适当性。在各种数据尺寸（1KB，10KB，100KB和1000KB）上测量了诸如加密和解密时间，记忆消耗和吞吐量之类的主要性能指标。通过此分析，很明显，无论数据大小如何，Ascon在加密和解密中都非常稳定，有效地表现，因此，在一致的处理时间是一个重要考虑因素的系统中，可以轻松地依靠它。研究还发现，解密过程中的记忆使用量始终高于加密过程中的记忆使用情况。对于记忆敏感的应用，需要考虑此因素。至于吞吐量，该算法在解密较小的文件和较大文件的加密方面表现出了更好的结果。得出结论，Ascon算法轻巧且非常有效，这使其成为受约束环境的合适选择。关键字：时代，密码学，算法。
产品注意：使用HIFI WGS的Agilent Fem Tuls系统快速，准确的DNA尺寸
安捷伦（Agilent）开发了一个基因组质量数量（GQN）度量，用于敏捷的数据分析软件，以评分基因组DNA质量。Prosize软件根据用户定义的指定尺寸阈值的总测量浓度的比例计算出GQN值从0到10。1建议的阈值和可接受的GQN将取决于应用程序和样本准备工作流程。对于整个基因组测序，PACBIO建议启动基因组DNA在10 kb时至少具有7.0或更高的GQN（GQN10KB≥7.0），而GQN为5.0或更高，为30 Kb（GQN30KB≥5.0）的GQN为5.0或更高。图4显示了使用Agilent基因组DNA 165 Kb试剂盒在FEM脉冲系统上分析的人类唾液样本的示例。由于该样品在10 kb和30 kb的GQN阈值以下，因此建议使用短读取消除剂（SRE）试剂盒处理以耗尽分子量下分子量DNA片段，以在DNA剪切之前提高样品质量。请参阅PACBIO库准备协议，以获取有关基因组DNA质量，GQN指南和尺寸选择选项的其他信息。2
M1008.pdf
产品编号：M1008 产品名称：Pre SafeStained 1Kb DNA Ladder 内容：描述：Pre-SafeStained 1Kb DNA Ladder 含有 13 个 DNA 片段，范围从 100bp 到 10Kb。它已预染色，因此可以在凝胶运行后直接进行可视化，无需进一步的 DNA 染色步骤。SafeStain 6X DNA Loading Dye 含有两种示踪染料以及与 DNA ladder 中相同的安全绿色荧光染料。两种示踪染料用于监测琼脂糖凝胶的运行，绿色荧光染料用于染色 DNA 样本。通过使用这种特殊的 DNA 上样染料，您的琼脂糖凝胶在运行时将显示两种不同的颜色，蓝色和黄色，在 LED 或紫外线下将显示绿色荧光 DNA 带，无需额外的染色步骤。DNA ladder 和您的样本将发出绿光（530nm）。贮存：长期贮存于 4 o C 或 -20 o C ；避免光照。 DNA SafeStain 上样染料的组成：Tris-HCl 10mM EDTA 1mM 甘油 5% 二甲苯蓝 0.06% 黄色染料 0.6% 绿色荧光染料最佳 pH 值为 7.5 @ 25°C
数据量大、后量子 TLS 1.3 对时间的影响......
摘要 — 事实证明，使用 NIST 的后量子算法 ML-KEM 和 ML-DSA 进行后量子密钥交换和身份验证将对 Web 或其他应用程序中使用的 TLS 1.3 性能产生影响。迄今为止的研究主要集中在抗量子算法对 TLS 首字节时间（握手时间）的开销。虽然这些工作对于量化连接建立速度的减慢非常重要，但它们并没有捕捉到现实世界中携带大量数据的 TLS 1.3 连接的全貌。直观地说，在连接协商中引入额外的 10KB ML-KEM 和 ML-DSA 交换将按比例增加连接建立时间，而不是增加携带 200KB 数据的 Web 连接的总连接时间。在这项工作中，我们量化了 ML-KEM 和 ML-DSA 对典型 TLS 1.3 连接的影响，这些连接将几百 KB 从服务器传输到客户端。我们研究了在正常网络条件下以及在数据包延迟变化性和丢失概率较高的较不稳定环境中后量子连接的最后一个字节时间的减慢情况。我们表明，在稳定的网络条件下，ML-KEM 和 ML-DSA 对 TLS 1.3 最后一个字节时间的影响低于对握手的影响，并且随着传输数据的增加而减小。对于高带宽、稳定的网络，最后一个字节时间的增幅保持在 5% 以下。在低带宽、稳定的网络条件下传输 50KiB 或更多数据时，握手时间从增加 32% 变为最后一个字节时间增加 15% 以下。即使拥塞控制影响连接建立，当连接数据增加到 200KiB 时，额外的减慢也会降至 10% 以下。我们还表明，有损或不稳定网络中的连接可能会受到后量子握手的更大影响，但这些连接的最后一个字节传输时间下降仍会随着传输数据的增加而下降。最后，我们表明，无论 TLS 握手如何，此类连接已经非常缓慢且不稳定。
使用Shortmer Combinatorial编码
1摘要与世界以指数速率生成数字数据，DNA已成为一种有希望的档案介质。由于其耐用性，物理密度和高信息容量，它提供了更高效，更持久的数字存储解决方案。该领域的研究包括编码方案的开发，这些方案与现有的DNA合成和测序技术兼容。最近的研究表明，使用复合DNA字母来利用这些技术的固有信息冗余性。这种方法中的一个主要挑战涉及嘈杂的推理过程，这阻止了大型复合字母的使用。本文引入了一种基于DNA的数据存储的新方法，与标准基于DNA的存储系统相比，逻辑密度增加了6.5倍，其重建误差接近零。组合DNA编码使用一组可明显区分的DNA短裤来构建大型组合字母，其中每个字母代表一个短成员的子集。这些组合字母的性质可以最大程度地减少混合误差，同时也确保了系统的鲁棒性。正如本文所示，我们正式定义了各种组合编码方案并研究其理论属性，例如信息密度，重建概率和所需的合成以及测序多重性。然后，我们建议使用基于组合DNA的数据存储系统的端到端设计，包括编码方案，二维误差校正代码和重建算法。在使用计算机模拟中，我们演示了我们建议的方法，并评估不同的组合字母，用于在不同的误差方面编码10KB消息。模拟揭示了重要的见解，包括核苷酸替代误差对缩短器级插入和缺失的相对可管理性。测序覆盖范围被发现是影响系统性能的关键因素，并且使用二维REED - 固体（RS）误差校正已显着提高了重建率。我们的实验概念证明通过使用吉布森组装构建两个组合序列来验证我们的方法的可行性，从而模仿了一个4周期组合合成过程。我们确认了成功的重建，并确定了我们方法对不同错误类型的鲁棒性。子采样实验支持采样率的重要作用及其对整体性能的影响。我们的工作证明了组合短材料编码基于DNA的数据存储的潜力，同时提出了理论研究问题和技术挑战。这些包括组合DNA的误差校正代码的开发，最佳采样率的探索以及支持组合合成的DNA合成技术的发展。将组合原理与错误校正校正策略结合起来为有效的，错误的DNA的存储解决方案铺平了道路。