在患有家族性帕金森病 (PD)、帕金森病性痴呆 (PDD) 和路易体痴呆 (DLB) 的患者中,已发现低密度脂蛋白相关蛋白 10 基因 (LRP10) 中罕见的致病变异 (Quadri et al., 2018)。此外,对携带不同 LRP10 变异的患者的尸检分析显示,脑干、边缘和皮质区域中存在严重的 α-突触核蛋白相关病理负担,表现为路易体 (LB) 和路易体神经突 (LN) (Quadri et al., 2018)。重要的是,功能研究表明,最初发现的 LRP10 致病变异影响 LRP10 转录本表达和稳定性、蛋白质稳定性或蛋白质定位,表明功能丧失 (LoF) 是一种共同的致病机制 (Quadri et al., 2018)。此外,早期使用 LRP10 过表达模型的研究报告称 LRP10 参与细胞内运输途径 (Boucher et al., 2008; Brodeur et al., 2009, 2012; Doray et al., 2008). 尽管有这些数据,但对于内源性 LRP10 在健康和疾病中的功能知之甚少,部分原因是缺乏体外 LRP10 敲除 (KO) 模型。
体外:293T、人类视网膜类器官、iPSC 衍生的 RPE、人类视网膜外植体、人类 RPE/脉络膜外植体 体内:C57BL/6J 小鼠(WT 和 Abca4 huG1961E)、非人类灵长类动物(食蟹猴)
AAVpro 包装质粒 (AAV2,#6234;AAV5,#6664;AA6,#6665,Takara Bio) 和 AAVpro 293T 细胞系 (#632273,Takara Bio)。所有 AAV 载体质粒均通过将对应于目标基因座和敲入序列的 PCR 片段克隆到 EcoRV 和 BglII 限制位点之间的 pAAV-CMV 载体中,去除 CMV 启动子、b-珠蛋白内含子和 hGH polyA 来构建。按照制造商的说明,使用 Xfect 转染试剂 (#631318,Clontech) 将 AAV 质粒和包装质粒转染 293T 细胞。使用 AAVpro 纯化试剂盒 (所有血清型) (#6666,Takara Bio) 提取和浓缩 AAV。使用 AAVpro 滴定试剂盒(#6233,Takara Bio)和热循环仪 Dice 实时系统 III(TP950,Takara Bio)估算病毒基因组拷贝数。
。STHCSM的RNA裂解在每个切割位点生成2',3'> P和5'-OH,我们假设RTCB的连接酶活性参与了图中确定的RNA修复。1(中间)。b)用抗RTCB或抗ACTB(加载对照)抗体的蛋白质印迹,用(+)或没有( - )RTCB耗竭的293T细胞的裂解物进行抗体。参见图中的未编写图像。S2。c)PARK7成绩单针对5
纠正了本文:Oncotarget在本文中调查了对重复图像的担忧。在图3中,面板3D中的小管蛋白带是面板3C中H3带的重复。此外,肌动蛋白频带是早期文章的图4C所示的重复,其中包括两位与Oncotarget论文共同的作者[1]。我们还发现了补充图1(三种Lancap细胞系的AR-V7 Western印迹)在[1]的图7C中与WB带重叠。这两篇文章的对应作者Xuesen Dong博士都说:“这些错误的原因是Haolong Li博士同时一直在研究两份出版物(Oncotarget和Cell and Cell and Death and Disey)。每个项目都涉及大量的蛋白质印迹测定;负载控件的所有图像看起来非常相似,并且很容易放错位置。无论如何,这些小错误并没有影响我们得出的结论。”作者提供了原始的Western印迹,上面有校正数字的日期邮票,并指出图3a肌动蛋白(2 h处理),图3D小管蛋白(第二个面板,293T细胞,用质粒编码AR(F876L)转染的293T细胞(F876L)和补充图1 AR-V7 Blot在图组合过程中被放错了。 使用原始数据获得的校正图3和补充图1如下所示。 作者声明这些更正不会改变本文的结果或结论。使用原始数据获得的校正图3和补充图1如下所示。作者声明这些更正不会改变本文的结果或结论。
为了扩展哺乳动物基因组重复元素的基因组编辑的边界,我们利用了一组Dead-Cas9基本编辑器(DBE)变体,这些变体允许通过与DNA双重链断管突破和单个单链损坏相关的细胞死亡,以每个细胞的数以安装每个细胞的编辑。我们使用了一组GRNA目标重复元素 - 在每个单元格中大约32至161 000的目标副本中。dbes在大规模基础编辑后启用了生存,可在293T中以高达约13 200和〜12200基因座的焦点突变,分别诱导人类诱导的多能干细胞(HIP-SC),三个数量级比以前记录的大三个。这些DBE可以克服当前的靶向突变和毒性障碍,以防止大规模基因组工程后细胞存活。
摘要:亨廷顿氏病 (HD) 是一种致命的神经退行性疾病,由亨廷顿基因 (HTT) 外显子 1 的 CAG 重复扩增引起。尽管亨廷顿氏病具有单基因特性,但其发病机制仍未完全了解,目前尚无有效的治疗方法。基因组工程等新技术的发展为疾病建模领域带来了新机遇,并使得具有相同遗传背景的同源模型的生成成为可能。这些模型对于研究疾病的发病机制和药物筛选非常有价值。本文报告了一系列在 HTT 基因座上具有不同 CAG 重复数的纯合 HEK 293T 细胞系的生成,并展示了它们在测试治疗试剂方面的实用性。此外,利用 CRISPR-Cas9 系统,我们纠正了 HD 人类诱导多能干细胞中的突变并生成了 HTT 基因的敲除,从而为 HD 研究提供了一套全面的同源细胞系。
我们报告了通过体细胞核移植 (SCNT) 和胚胎碱基编辑克隆了一只 12 岁的转基因绿色荧光蛋白 (GFP) 猴,同时对腺嘌呤碱基编辑器 (ABE) 进行了安全性评估。我们首先展示了 ABEmax 通过在 293T 细胞中对 GFP 序列进行 A 到 G 编辑来沉默 GFP 的能力。随后,使用表达 GFP 的猴子的供体细胞,我们成功生成了 207 个 ABEmax 编辑 (SCNT-ABE) 和 87 个野生型 (SCNT) 胚胎,用于胚胎移植、基因分型以及基因组和转录组分析。使用一种名为 OA-SCNT 的新方法,对 SCNT-ABE 和 SCNT 胚胎进行比较以进行脱靶分析,而无需遗传变异的干扰。在编辑的猴胚胎中,ABEmax 不会诱导明显的脱靶 DNA 突变,但会诱导广泛的脱靶 RNA 突变,其中 35% 是外显子。研究结果为ABE的临床应用提供了重要参考。
