3月29日,上午8:00 - 下午7:00,亚历山大生命科学中心450 E 29街,纽约市议程,截至3/19/2024 7:45 - 8:30 - 8:30 - 8:30注册和网络早餐8:30 - 9:00开幕式欢迎并待在欢迎和言论ACGT首席计划委员会,Michael T. Lotze,Michael T. Lotze,Michiect oggrific,Migh t. lotze,ACGT,ACG T. 10:00 Fireside Chat:永远不要停止问:“下一步是什么?”乔治·扬科普洛斯(George Yancopoulos),医学博士,Regeneron博士和宾夕法尼亚大学医学博士的Carl H. June,主持人:Gregory C. Simon,Simonovation,LLC; Biden Cancer倡议前主任10:00 - 10:15休息10:15 - 11:15重点关注胰腺癌10:15 - 11:00小组讨论:胰腺癌 - 创新和挑战Michael T.Lotze,医学博士,医学博士,匹兹堡Ben Z. Stanger,Memorial phd,Memorial pennsyia eilelvania ofernsyia'''' Kettering癌症中心主持人:Mark Dudley,PhD,Intil Bio 11:00 - 11:15宣布ACGT 2024胰腺癌RFP Barbara Lavery,ACGT首席项目官11:15 - 12:00专注于脑癌的介绍对ACGT研究Fellows 11:15-11:30 andonio Hosport fillows fillows fillows fillows in Noffic ers hosport in antonio Chiiocca,brigh brigh higring brigh abrigh A” GBM表达溶瘤病毒的GADD4
DNA结构设计通过人工扩展的基本对字母(包括循环和不匹配热力学参数)Tuan M. Pham 1,§,Terrel Miffin 2,§,Hongying Sun 3,§,肯尼斯·K·肯尼斯·K·肯尼斯·K·夏普2,Xiaoyu wang 2,米格尼Jason D. Kahn 2*和David H. Mathews 1*摘要:我们表明,通过将基本配对字母扩展到A-T和G-C之外,可以改善DNA二次结构的硅设计中,以包括2-氨基-8--(1'-β-β-D-2-2'-deoxyrabofuranosyl)之间的一对 - )-4-和6-氨基-3-(1'-β-d-2'-脱氧核糖核基)-5-硝基 - (1 H)-Pyridin-2-One,简单p和Z。为了获得在设计中包括P-Z对所需的热力学参数,我们进行了47个光学熔化实验,并将结果与先前的工作结合在一起,以适合P-Z对和G-Z摇摆对的一组新的自由能和焓最接近的邻居折叠参数。我们发现G-Z对具有与A-T对相当的稳定性,因此应通过结构预测和设计算法进行定量考虑。此外,我们推断了循环,末端不匹配和悬挂端参数的集合,以包括P和Z核苷酸。这些参数已纳入用于辅助结构预测和分析的RNAstructure软件包。使用RNAstructure设计程序,我们使用ACGT字母或补充P-Z对提出的100个设计问题中的99个。通过归一化的集合缺陷(NED)评估,延长了字母,降低了序列折叠成脱靶结构的倾向。延长了字母,降低了序列折叠成脱靶结构的倾向。在提供Eterna-player溶液中的91个情况中,有91个中的91例中,NED值相对于来自Eterna示例解决方案的值提高了。含P-Z的设计的平均NED值为0.040,明显低于仅标准DNA设计的0.074,并且包含P-Z Pairs会减少在设计上收敛所需的时间。这项工作提供了将任何扩展的字母核苷酸纳入预测和设计工作流中的样本管道。关键词:DNA二级结构设计,合成生物学,DNA折叠热力学,扩展的DNA字母