摘要背景:逆转录转座子被认为是孟德尔遗传病的病因,但它们在自闭症谱系障碍 (ASD) 中的作用尚未系统地定义,因为只有从全基因组测序 (WGS) 数据中才能以足够的灵敏度调用它们,并且最近才有足够大的队列进行此项分析。结果:我们通过建立可扩展的计算流程来检测逆转录转座子插入,分析了来自 Simons Simplex Collection 的 2288 个 ASD 家族的 WGS 数据。我们报告了 86,154 个多态性逆转录转座子插入(其中 > 60% 以前未报告)和 158 个新生逆转录转座事件。ASD 个体和未受影响的兄弟姐妹之间新生事件的总体负担相似,Alu、L1 和 SVA 分别每 29、117 和 206 个出生发生 1 个新生插入,总共每 21 个出生发生 1 个新生插入。然而,ASD 病例显示 ASD 基因中 L1 从头插入比预期更多。此外,我们仅在 ASD 个体中观察到功能丧失不耐受基因中的外显子插入,包括 CSDE1 中可能致病的外显子插入。结论:这些发现表明内含子和外显子逆转录转座子插入对 ASD 的影响不大但很重要,表明了 WGS 对其分析的重要性,并强调了特定生物信息学工具对高通量检测逆转录转座子插入的实用性。关键词:转座因子、逆转录转座子、自闭症谱系障碍、从头插入、多态性插入、从头率、Alu、SVA、LINE-1、神经生物学
1。处理器检查程序计数器以查看下一步运行的指令。2。程序计数器在记忆下下一个指令所在的位置中给出了一个地址值。3。处理器从此内存位置获取指令值。4。一旦获取了指令,就需要对其进行解码和执行。例如,这可能涉及取一个值,将其放入ALU中,然后从寄存器中取出不同的值并将两个值添加在一起。5。完成此操作后,处理器将返回程序计数器以找到下一条指令。6。重复此周期直到程序结束。
计算机 2.2.1 数字计算机的组成部分 数字计算机的关键要素(如图 2.1 中的框图所示)包括:中央处理器、输入、输出和内存。 中央处理器 (CPU) 就像计算机的大脑。它负责执行指令。它控制和协调指令的执行。它由控制单元 (CU)、算术逻辑单元 (ALU) 和寄存器组成。CU 通过解码指令并生成要执行的微操作来控制指令的执行。ALU 负责执行算术和逻辑运算。指令的执行涉及 CPU 的几乎所有部分(CU、ALU 和寄存器)。因此,CPU 被称为计算机系统中最重要的组件。 输入设备用于读取要处理的指令和数据,输出设备显示执行程序后获得的结果。键盘、鼠标和扫描仪是输入设备的例子,而显示器、打印机和绘图仪是输出设备的例子。内存用作工作存储器,用于临时存储程序执行过程中生成的数据和中间结果。计算机使用两种类型的内存:主内存和辅助内存。主内存在日常用语中通常称为 RAM。它是一种读/写内存,用于存储程序和数据。由于 RAM 是易失性的,计算机还使用第二级内存(辅助内存)来永久存储内容。硬盘是不可移动的辅助存储设备,几乎存储了机器上的所有内容。计算机还使用其他可移动辅助内存,如 CD-ROM、磁带和最近的闪存驱动器,将数据永久备份到硬盘上或将数据从一台机器传输到另一台机器。可以通过描述简单个人计算机 (PC) 的主要单元及其互连来更实际地描述数字计算机。如果打开 PC 的 CPU 机柜,您会注意到它包含一个印刷电路板,上面插有许多设备。该印刷电路板通常称为主板。计算机的所有其他主要组件要么直接插入主板,要么通过一束电线连接。CPU、RAM 和设备卡插入主板的各个插槽。连接到 CPU 机柜的硬盘、软盘驱动器、CDROM 驱动器等设备通过电线带连接。主板具有印刷电路,可让所有这些组件相互通信。CPU 机柜还装有电源装置,为计算机系统的所有组件供电。在 CPU 机柜的后端,您可以注意到许多连接槽。这些插槽用于连接各种输入/输出设备,例如键盘、鼠标、打印机、扫描仪,到计算机。 2.2.2 计算机作为数据处理器 计算机的主要功能是根据特定程序处理输入数据以产生所需的输出。这就是为什么计算机通常被视为数据处理设备的原因。计算机的各个组件协同工作以
计算机系统的框图是一个视觉表示,可展示其主要组件以及它们如何相互作用。此解释将深入到计算机的框图中,并探索其各个部分。计算机的主要元素包括CPU(中央处理单元),内存,输入设备,输出设备,所有这些都对其操作至关重要。框图提供了系统的简化视觉概述,突出显示了关键组件及其互连。计算机的基本框图将说明这些主要部分以及它们如何共同发挥作用。让我们在计算机框图的上下文中检查每个重要组件。从CPU或中央处理单元开始,它本质上是计算机的大脑,负责处理数据,执行程序和管理硬件组件。CPU的主要角色是运行程序,同时还控制输入/输出设备和内存。在较小的计算机中,微处理器芯片用作CPU。CPU的关键子组件包括控制单元(CU),算术和逻辑单元(ALU)和累加器寄存器。控制单元充当各种计算机操作的协调员,促进输入单元,输出单元,ALU和主内存之间的通信。它负责控制计算机内的所有活动,从内存中接收说明,将其转换为计算机不同部分的信号,并生成必要的时机和控制信号以执行这些说明。这些功能是:1。2。算术和逻辑单元(ALU)执行基本的算术操作,例如加法,减法,乘法和数据,以及逻辑操作,例如和或,或,或,或,或,不及排他性。它处理数据和指令,并可以执行其他功能,例如合并,分类和选择数据。从内存中接收数据后,Alu进行操作,然后将结果发送回存储器或输出单元。寄存器用于在处理过程中存储临时结果和数据。通过快速访问正在处理的数据,他们在计算机的有效操作中起着至关重要的作用。CPU及其子组件(例如控制单元,ALU和寄存器)与其他组件(例如内存,输入设备和输出设备)和谐相处,以确保计算机系统的平滑功能。了解这些元素及其相互作用是掌握计算机运行方式的基础。计算机中内存的主要目的是存储信息,具有两种主要类型:主内存/主内存和次要内存/辅助内存。前者是挥发性的,关闭时会丢失存储的信息,而后者保留了永久数据。其他记忆(例如缓存内存和虚拟内存)增强了性能。输入设备通过将原始数据转换为二进制形式,使用户能够将原始数据输入到计算机中。它们是用户和计算机之间的中介者,采用各种形式的数据,例如文本,图像,音频或视频。相比之下,输出设备以各种格式显示了来自计算机的处理数据。关键功能包括处理用户数据,将其转换为机器可读的二进制代码(0s和1s),将转换的数据传输到主内存中,并且通常使用标准输入设备(例如键盘)。输入设备的示例包括键盘,鼠标,扫描仪,麦克风/相机,操纵杆,轻笔和轨迹球。他们将处理的数据转换为可读形式(通常是十进制或字母数字),显示,打印,播放或投射给用户。输出设备的示例是监视器,打印机,扬声器和投影仪。此表示形式是计算机组件的一般概述,该概述可能会根据台式机,笔记本电脑,服务器等及其设计(例如台式机,笔记本电脑,服务器等)等计算机的类型而有所不同。数字计算机处理数字数据,该数据以二进制形式呈现。这与使用连续数据的模拟计算机不同。CPU或中央处理单元是进行所有计算和操作的数字计算机的主要组件。它从各种来源获取输入数据,根据程序说明对其进行处理,并产生数字输出。CPU具有两个主要功能:执行算术和逻辑操作,例如加法,减法,乘法和划分,以及执行逻辑操作,例如和或,或,或,不和排除。这些操作对于分析和评估数据至关重要,该数据通常与存储在程序或内存中的一组已知值相匹配。计算机中的内存是数据和程序的存储库,类似于笔记本以供将来参考。3。可以将其分类为两种主要类型:主要内存,用于在执行过程中暂时存储数据和程序,以及用于存储不需要直接CPU访问的操作系统,编译器和应用程序的辅助内存。输入单元接受来自外部来源的指令和数据,将它们转换为可读的计算机可读格式,并将其提供给系统以进行处理。输出单元接受计算机产生的结果,将其转换为人类可读格式,并将其提供给外界。计算机组件和操作计算机的功能基于四个主要组件:数据,图片,声音和图形。这些元素使计算机能够迅速,准确地解决复杂问题。如图所示,计算机系统执行五个基本功能,无论其尺寸或配置如何。数据输入:这涉及将信息和程序输入计算机系统。数据存储:此过程永久保存数据和指令。数据处理:中央处理单元(CPU)根据给定指令根据数据执行算术和逻辑操作。4。输出生成:计算机由处理的数据产生结果,然后将其存储以进行进一步处理。5。控制操作:控制单元执行指令并监督所有操作的分步性能。输入操作:输入过程涉及将原始数据馈送到计算机系统中。该数据是组织和处理以产生输出的。存储操作:数据存储在系统中永久保存信息。在处理开始之前,由于CPU的快速处理速度,必须将数据馈入系统。主存储单元在CPU处理它们时暂时存储数据和指令。计算机在其功能单元之间分配任务,以执行上一节中概述的操作。该系统包括三个主要组件:算术逻辑单元(ALU),逻辑单元,控制单元(CU)和中央处理单元(CPU)。
MD,美国。4. DeepSeq,诺丁汉,英国。5. 乌普萨拉大学免疫学、遗传学和病理学系生命科学实验室,瑞典乌普萨拉。6. 莱斯大学计算机科学系,美国德克萨斯州休斯顿主街 6100 号。* 通讯作者;贡献相同摘要单细胞 DNA 测序的出现揭示了基因组变异的惊人动态,但未能表征在种系水平上具有深远影响的较小到中等尺寸的变异。在这项工作中,我们利用单细胞长读测序发现了三个大脑中的新动态。这为了解单个细胞基因组的动态提供了关键见解,并进一步强调了转座因子的大脑特定活动。主要单细胞全基因组扩增(WGA)使通常使用短读在低覆盖率 1 下进行的单细胞全基因组测序(scWGS)成为可能,它通常只能检测 Mb 级 CNV,尽管据报道识别了 > 50kbp 的 CNV 2 。无论如何,许多预期的变体(如 Alu 或 LINE 变体)都被遗漏了。这些转座因子 (TE) 家族是最丰富和活跃的转座子,总共占人类基因组的约 27% 3 ,并有助于健康神经元 4 和神经退行性疾病 5–7 的重组。同时,长读测序的出现使得准确检测 Alu 或其他转座子介导的突变成为可能 8 。最近有报道称,在液滴中使用等温多重置换扩增 (MDA) (dMDA) 进行 WGA 后,在 T 细胞上使用长读 scWGS (scWGS-LR) 来组装单个细胞的一个基因组。然而,它的成本很高,而且由于嵌合体和扩增子大小限制,完整性有限 9 。尽管如此,这为进一步探索类似的方法是否能为单细胞的基因组变异提供新的见解开辟了新领域。
ALU。它由解码器、控制逻辑电路和时钟组成,以确保一切都在正确的时间发生。它还负责执行指令执行周期。寄存器阵列这是一小块内部存储器,用于快速存储和检索数据和指令。所有处理器都包含一些用于特定功能的通用寄存器,即程序计数器、指令寄存器、累加器、内存地址寄存器和堆栈指针。系统总线这由控制总线、数据总线和地址总线组成。它用于处理器、内存和外设之间的连接,以及各个部件之间的数据传输。内存内存不是 CPU 本身的实际部分,而是位于主板的其他地方。然而,正在执行的程序就存储在这里,因此是程序执行所涉及的整体结构的重要组成部分
美国陆军后勤大学 (ALU) 的前身是 1954 年 7 月 1 日在弗吉尼亚州李堡开设的为期 12 周的陆军供应管理课程。该课程是作为军需总长的二级活动设立的,但由陆军部 (DA) 总部级别的后勤副参谋长 (DCSLOG) 直接控制。自 1956 年 5 月 1 日起,美国陆军管理中心 (ALMC) 在李堡成立,由 DA DCSLOG 负责运营控制,此后不久,课程中又增加了五门新的功能课程,包括需求管理、采购、配送、维护和财产处置。1956 年 9 月,ALMC 课程扩展为包括函授课程和校外授课模式的认证教员。1958 年 9 月,后勤研究和理论被添加为 ALMC 任务。
说明:滴灌是最便宜,最简单的灌溉方式。(iv)选项(b)是正确的。解释:热带落叶中发现的主要品种是Sal,Teak,Arjun,Mahua,Shisham,Palas,Mulberry,Semul,Semul和Sandal Wood。(v)选项(a)是正确的。解释:铝土矿是Alu Minum的主要矿石。(vi)选项(c)是正确的。说明:天然气是造成污染的不可再生能源。(vii)选项(b)是正确的。解释:班加罗尔是IT行业的枢纽。(viii)选项(a)是正确的。说明:茶是一种商业农作物,通过种植园方法大规模生长。(ix)选项(a)是正确的。解释:洪水和地震破坏了水道和陆地运输。(x)选项(b)是正确的。解释:破碎的玻璃,聚乙烯和塑料袋是不可生物降解的产品。