干旱基因编码SWI/SNF染色质重塑复合物的亚基,并经常在人类癌症中突变。我们研究了黑色素瘤患者的干旱突变,分子特征和临床结局之间的相关性。皮肤黑色素瘤样品(n = 1577)。在干旱基因(ARID1A/2/1b/5b)中,通过致病/可能的致病突变对样品进行分层。PD-L1表达。肿瘤突变负担(TMB) - - 定义为≥10个突变/mb。转录组特征可预测对免疫检查点抑制剂的反应 - 牙牙γ和T细胞发炎得分。实际总体生存(OS)信息是从保险索赔数据中获得的,从组织收集时间到上次接触日期,Kaplan-Meier估算得出。Mann – Whitney U,Chi-square和Fisher精确测试在适当的情况下应用,P值调整为多次比较。arid2突变更为普遍(11.0%:n = 451 vs 2.8%:n = 113),并同时使用ARID1A / ARID2突变在1.1%(n = 46)样品中。ARID mutations were associated with a high prevalence of RAS pathway mutations— NF1 ( ARID1A , 52.6%; ARID2 , 48.5%; ARID1A/2 , 63.6%; and ARID-WT, 13.3%; p < 0.0001) and KRAS ( ARID1A , 3.5%; ARID2 , 3.1%; ARID1A/2 , 6.5%; and ARID-WT, 1.0%; p = 0.018)),尽管BRAF突变在干旱熔化的队列中不太常见(ARID1A,31.9%; ARID2,35.6%; ARID1A/2,26.1%;和ARID-WT,50.4%; P <0.0001)。tmb-high在干旱突变的样品中更为常见(ARID1A,80.9%; ARID2,89.9%; ARID1A/2,100%; ARID-WT,49.4%; P <0.0001),而PD-L1阳性相似ARID-WT,44.9%; p = 0.109)。与ARID-WT相比,ARID1A突变患者的DMMR/MSI-H患病率更高(2.7%vs 0.2%,P = 0.030)。与ARID-WT相比,在ARID2突出的样品中,IFN-γ和T细胞特征的中值更高(IFN-γ: - 0.15 vs-0.21,p = 0.0066; t-cell:23.5 vs-18.5,p = 0.041)。ARID2突变患者的生存率提高了。 (HR:1.22(95%CI 1.0-1.5),p = 0.022)。与ARID -WT相比,使用抗PD-1治疗的ARID2突变没有观察到其他OS益处。干旱突变患者的黑色素瘤患者表现出与ICI反应相关的标志物的较高患病率,包括TMB-H和免疫相关的特征。我们的数据还表明,与抗PD1治疗无关,ARID2突变患者的生存结果改善。
ARID2 CDK4 EPHA7 FLI1 HNF1A MAGI2* NOTCH3* PPP2R2A SETBP1 TMPRSS2
