XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemASPS
澳大利亚植物科学家学会（ASP）昆士兰州节点会议2024
• NZSPB Roger Slack Award - David Chagné • ASPB Goldacre Award – Peter Crisp • ASPB Education Award - Ashley Jones & Benjamin Schwessinger • Break • NZSPB elected fellow to the NZ Royal Society - Andy Allan and Kevin Davies • ASPB Jan Anderson – Jenny Mortimer • ASPB JG Wood – Sergey Shabala
ASP 2024抽象书
成功的CRISPR/CAS介导的基因组编辑取决于在特定的DNA序列下的双链断裂（DSB）的诱导以及随后的错误修复机制的启动。但是，影响CRISPR/CASPR介导的DSB效率和维修保真度的因素在植物中仍未探索。这项研究使用Nicotiana Benthamiana探索DSB修复机制对CAS9和CAS12A酶的编辑效率的影响。测试了基因间（BUR2启动子）和外显子（RDR1）区域中的多个目标位点，以测试在体外和体内编辑中裂解的敏感性。目标部位之间的体内编辑和体外切割效率差异很大。此外，体内编辑效率没有反映体外切割效率。这些结果表明，通过DNA修复机制进行完美的重新连接会损害明显的编辑效率，这表明Indel积累可能无法准确反映CRISPR/CASPR/CAS介导的基因组编辑效率。可以成功设计在DSB修复期间量化和减少完美重新连接的工厂系统。对该系统进行的正在进行的测试表明，不同的CAS酶在DSB修复过程中具有不同级别的完美重新搭配，提供了见解，以进一步优化植物中的编辑策略。
ASPSCR1-TFE3 调控肺泡软组织肉瘤的血管生成程序
并且肿瘤中超过5个gRNA减少2倍的63个基因座被认为是阳性候选者（图4b，扩展数据图4c和补充表9）。通过Hi-C分析定义拓扑相关域（TAD）（图4c），并选择与每个SE包含在同一TAD中的345个候选靶基因。通过在ASPS-null细胞中下调的表达和功能注释进一步选择了56个候选基因（图4d和补充表10）。对Ccbe1、Pdgfb、Rab27a、Syngr1、Sytl2和Vwf六个候选基因进行了体内验证试验（扩展数据图4d）。验证每个基因有效敲除后（扩展数据图4e），将肿瘤克隆移植到裸鼠体内。尽管体外增殖率相当（扩展数据图 4f），但 Pdgfb、Rab27a、Sytl2 和