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CAS9系统从更新中产生琥珀酸
摘要背景：琥珀酸具有巨大的潜力，可以成为基于生物的新基础，用于推导工业中多种增值化学品。基于可再生生物量的琥珀酸生产可以提供一种可行的方法来部分减轻全球制造对石油炼油厂的依赖性。为了改善生物过程的经济学，我们试图通过真菌细胞平台探索可能的解决方案。在这项研究中，尼日尔（Aspergillus Niger）是一种著名的生物基有机酸工业生产生物，因其琥珀酸产生的潜力而被利用。结果：使用核糖核蛋白（RNP）的CRISPR – CAS9系统，连续的遗传操作是在产生柠檬酸菌株的工程中实现的。两种涉及两种副产品的基因，即葡萄糖酸和草酸，被破坏。此外，有效的C 4-二羧酸盐转运蛋白和可溶性NADH依赖性富马酸酸盐还原酶被过表达。所得的菌株SAP-3产生了17 g/l琥珀酸，而使用合成底物在野生型菌株中未检测到可测量水平的琥珀酸。此外，还研究了两个培养参数，温度和pH值，以实现其对成功的粉刺产生的影响。3天后在35°C下获得最高量的琥珀酸，低培养pH值对琥珀酸的产生具有抑制作用。探索了两种类型的可再生生物量作为琥珀酸产生的底物。6天后，SAP-3菌株能够分别从甜菜糖蜜和小麦水解物中产生23 g/L和9 g/l琥珀酸。结论：在这项研究中，我们成功地将基于RNP的CRISPR-CAS9系统应用于尼日尔的基因工程中，并显着改善了工程菌株中的琥珀酸产生。关于栽培参数的研究揭示了pH和温度对琥珀酸产生的影响以及未来在菌株发展中的挑战。使用可再生生物量使用糖浆和小麦稻草水解产物来证明了可再生生物量来生产琥珀酸。关键字：尼日尔曲霉，代谢工程，琥珀酸生产，CRISPR – CAS9系统
Epetraborole是一种新型的细菌亮氨基-TRNA合成酶抑制剂，它表现出有效的功效并提高了护理标准方案的功效
背景：Epetraborole（EBO）是含硼的口服叶木基-TRNA合成酶的口服抑制剂，这是蛋白质合成中必不可少的酶； EBO表现出对非结核分枝杆菌的有效活性。这些研究评估了EBO的口服剂量（PO）针对慢性小鼠感染模型中的5 M. Avium复合物（MAC）菌株作为单一疗法或与标准护理[SOC；克拉霉素（CLR），利法布丁（RFB），ethambutol（emb）]方法：针对Avium 2285R M. 2285r评估EBO的试验性慢性疗效研究，每天1、10、30、100、300和500 mg/kg PO每天（QD）（QD），而不是250 mg/kg/kg Clr PO QD。C57BL/6小鼠用1x10 11 CFU的肺气溶胶感染。从感染后第28天开始进行56天的治疗。在感染后第1、28和84天评估肺中的细菌负担（CFU），通过在Middlebrook 7H11木炭琼脂板上镀匀性稀释液。与MAC的SOC治疗（CLR 250 mg/kg，RFB 100 mg/kg，100 mg/kg），EBO剂量为100、200、300或400 mg/kg QD评估了4株Mac菌株。在一组未感染的小鼠中确定了EBO的口服暴露（表1）。 结果：在对Avium 2285R的一项研究中，生物膜形成菌株，EBO在所有剂量上测试的EBO明显好于以250 mg/kg剂量的CLR（图1），并且在含有EBO的琼脂平板上检测到NO NO CFU（16 mg/L）。 在随后的研究中，将SOC与其他4种MAC菌株中的EBO进行了比较（图2）。 结论：在这种慢性小鼠肺部感染模型中，在第84天未检测到Avium 2285R的EBO耐药性发展。在一组未感染的小鼠中确定了EBO的口服暴露（表1）。结果：在对Avium 2285R的一项研究中，生物膜形成菌株，EBO在所有剂量上测试的EBO明显好于以250 mg/kg剂量的CLR（图1），并且在含有EBO的琼脂平板上检测到NO NO CFU（16 mg/L）。在随后的研究中，将SOC与其他4种MAC菌株中的EBO进行了比较（图2）。结论：在这种慢性小鼠肺部感染模型中，在第84天未检测到Avium 2285R的EBO耐药性发展。EBO单一疗法的功效比SOC比对Avium ATCC 700898更好，而与M. Intacellulare 1956，M。el. ellacelulare DNA00055和M. el. ellacululare DNA00111相比，与2-4.8 log 10相比，它与M. Intarululare DNA00055和M. M. soc一样好。在测试的所有四种菌株中，200 mg/kg EBO近似于500 mg的人口腔等效剂量，与单独使用SOC相比，SOC的细菌杀死从1.4-3.0 log 10 CFU增加，从而导致总肺CFU降低总量为4.6-5.6 log 10。eBO与5种MAC菌株具有有效的体内功效，并在与SOC结合使用时会显着提高功效，从而支持EBO的进一步临床发育。
biogaia益生菌整个儿童期
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电子补充信息β-内酰胺酶...
7-氨基-3-氯甲基-3-头孢烯-4-羧酸对甲氧基苄酯盐酸盐 (ACLE) 购自 AK Scientific (加利福尼亚州联合城)。4-硝基苯硫酚 (NBT) 和 3-马来酰亚胺基丙酸购自 TCI Chemicals (日本东京)。头孢噻吩购自 P212121, LLC (马萨诸塞州波士顿)。氘代二甲基亚砜 (DMSO-d 6 ) 购自 Cambridge Isotope Laboratories (马萨诸塞州安多弗)。三乙胺 (TEA)、4-甲基吗啉 (NMM)、无水二氯甲烷 (DCM)、无水二甲基甲酰胺 (DMF)、己烷、乙醚、乙酸乙酯、薄层色谱法 (TLC) 硅胶 60 玻璃板、无水磷酸氢二钠、无水磷酸二氢钠、CENTA、二甲基亚砜 (DMSO)、三氟乙酸 (TFA)、苯甲醚、硫醇官能化的 4 臂聚乙二醇 (4 臂-PEG-SH; 20 kDa)、来自蜡样芽孢杆菌的 β L (β L-BC; cat.# P0389, 28 kDa, 2817.8 U/mg 蛋白, 4.72% 蛋白)、来自铜绿假单胞菌的 β L (β L-PA; cat.# L6170, 30 kDa, 1080 U/mg 蛋白，1% 蛋白）、来自阴沟肠杆菌的 β L（β L-EC；目录号 P4524，20-26 kDa，0.37 U/mg 蛋白，56.45% 蛋白）、来自溶组织梭菌的胶原酶、磷酸盐缓冲盐水 (PBS)、硝酸钠、阳离子调整的 M¨uller-Hinton 肉汤 (CMHB)、α-氰基-4-羟基肉桂酸、1-[双 (二甲氨基) 亚甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶 3-氧化物六氟磷酸盐 (HATU)、N,N-二异丙基乙胺 (DIPEA) 和盐酸 (HCl) 均购自 Millipore Sigma（密苏里州圣路易斯）。甲醇、硅胶、胰蛋白酶大豆肉汤 (TSB) 和 SYLGARD 184 硅胶弹性体试剂盒购自 Thermo Fisher Scientific (马萨诸塞州沃尔瑟姆)。甲氧基聚乙二醇硫醇 (mPEG-硫醇；1.7 kDa) 购自 Laysan Bio, Inc. (阿拉巴马州阿拉伯)。金黄色葡萄球菌菌株 25923 和 29213、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 (MRSA) MW2、蜡样芽孢杆菌 13061、大肠杆菌 25922 和阴沟肠杆菌 13047 购自 ATCC (弗吉尼亚州马纳萨斯)。铜绿假单胞菌 PA01 由沃尔特里德陆军研究所 (马里兰州银泉) 慷慨捐赠。大肠杆菌 DH5-α 购自 Life Technologies (加利福尼亚州卡尔斯巴德)。双马来酰亚胺-PEG 3（mal-PEG-mal，494.5 Da）购自 BroadPharm（加利福尼亚州圣地亚哥）。Repligen Biotech 纤维素酯 500-1000 Da 分子量截留 (MWCO) 透析管购自 Spectrum Labs Inc.（加利福尼亚州兰乔多明格斯）。超高纯度氮气（99.999%）购自 Airgas（罗德岛州沃里克）。所有实验均采用超纯去离子水（18.2 MΩ·cm，Millipore Sigma，马萨诸塞州比勒里卡）。本研究中提到的室温 (RT) 约为 23 ◦ C。
开发经过验证的定量聚合酶链反应测定和真菌培养物，用于诊断Budgerig中的大型Ornithogaster
胃。4个临床体征包括反流，腹泻，体重减轻，以及通常是猝死。3,4,6,9的组织学变化可以包括预脑炎，粘膜增生和腺体发育不良。5也已记录了MO感染与预脑脑腺癌之间的关联。5个可变的粪便脱落使得对虫的MO诊断具有挑战性。最常见的原反长期诊断是粪便的显微镜检查，包括直接湿坐骑，革兰氏染色，Romanowsky污渍，宏观求和技术和迷你链球菌技术。1,3,4,7,9,11,12但是，这些微观技术有局限性。微观诊断需要完整的MO生物体，这些生物可能并不总是显而易见的。间歇性脱落还可以排除受感染鸟类中生物体的粘性。7此外，可能会误认为碎屑和大的丝状，革兰氏阳性细菌，而这种生物并不总是染色或固定在幻灯片上。3,4,13，以帮助应对这些挑战，最近使用了泄殖腔拭子和粪便的PCR。PCR有许多优势：它可以从少量DNA中检测到MO，它不需要完整的生物进行诊断，并且与微观粪便相比，它具有提高的诊断敏感性。3,7在一项研究中，来自MO感染的Budgerigars的7个常规PCR诊断MO的可能性是粪便革兰氏染色的2.38倍。4但是，这些该生物的18S rRNA和结构域D1/D2区域最初用于从本质上鉴定为酵母。14已使用嵌套和半固定的PCR方法进行了传统的PCR，以放大该D1/D2区域，18S rRNA，内部转录垫片和日本宠物鸟类粪便中的1个区域。15粪便PCR可以具有限制，包括细菌DNA降解和粪便抑制剂16；但是，这种诊断有能力提供一种简单的无创方法来测试MO的鸟类，尤其是在大型鸟类环境中。除了显微镜和分子诊断外，MO培养还进行了培养，但由于特定和挑剔的生长需求而具有挑战性。17在传统真菌媒体上培养Mo的努力并没有成功，但是在微型自毒环境中，MO已成功地使用特定媒体和某些环境条件进行了培养。17根据文献，目前尚无研究表明MO已在培养中维持，或者已经进行了广泛的反抗易感性测试。实际上，没有私人实验室和美国类型文化收藏（ATCC）具有可用的MO文化。无法维持可持续的文化对发病机理，抗真菌敏感性和系统发育多样性的研究有限。由于某些设施中的鸟类发病率高和差异率很高，因此需要有效的MO治疗选择。常用的治疗方法包括两性霉素B（通过口腔膨胀或饮用水），苯甲酸钠（通过饮用水）和Nystatin（通过饮用水）。
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