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与海洋生物相关的细菌已成为全球研究的重点,因为它们产生了生物活性物质,例如抗菌化合物。这项研究旨在确定印度尼西亚的Teluk Awur Jepara与痤疮和表皮葡萄球菌的抗菌相关细菌的抗菌活性。在这项研究中采样了三种海藻物种,Caulerpa Racemosa,Padina Minor和Halimeda Opuntia。使用纸盘扩散和最小抑制浓度方法,选择了其分离株的抗菌活性,并根据16S RNA基因(27F-1492R)对分子进行了鉴定。从3种海藻物种中分离出21个分离株:11个来自C. racemosa,6个来自P. Minor的菌株,而H. Opuntia的4个分离株。进一步的测试揭示了对抗菌活性的潜在分离株(C2A,C2C,C2D和H2D),抗菌活性对痤疮疟原虫F2 ATCC 6919和S. epidermidis fncc-0048。Gene-based identification using 16s RNA (27F-1492R) demonstrated the occurrence of 4 bacterial species, namely Vibrionaceae bacterium PH25 (99.86 %), Vibrio alginolyticus strain GS MYPK1 (99.65 %), Salinivibrio costicola strain M318 (99.86 %), and V. alginolyticus strain 2014V-1011 (99.93%)。
CRISPR/Cas9(成簇的规律间隔的短回文重复序列/CRISPR 相关蛋白)系统是一种快速高效编辑基因组的有用工具。然而,使用 CRISPR/Cas9 编辑细菌基因组仅限于选择主要用于高价值产品生物生产的微生物底盘。因此,需要将 CRISPR/Cas9 工具扩展到其他微生物。在这里,我们的目标是评估 CRISPR/Cas9 对柠檬酸杆菌 ATCC 8090 型菌株基因组编辑的适用性。我们评估了常用的双质粒 pCas/pTargetF 系统,以实现柠檬酸杆菌中的基因删除和插入,并确定了编辑效率。基于 CRISPR/Cas9 的方法对半乳糖激酶 (galk) 的删除具有高编辑效率(~91%),并且能够使用各种单向导 RNA (sgRNA) 序列进行删除。为了评估 CRISPR/Cas9 工具插入基因的能力,我们使用了荧光报告基因 mNeonGreen、内肽酶 ( yebA ) 和转录调节剂 ( xylS ),发现每个基因都以高效率 (81 – 100%) 成功插入。这些结果加强并扩展了 CRISPR/Cas9 基因组编辑在 C. freundii 中的应用,将其作为额外的微生物底盘。
缩写:α-SMA,α-平滑肌肌动蛋白;ALP,碱性磷酸酶;ALT,丙氨酸氨基转移酶;ASBT,顶端钠依赖性胆汁酸转运蛋白;ASBTi,ASBT 抑制剂;ATCC,美国典型培养物保藏中心;AUC inf,从给药时间到最后可测量浓度的 AUC 并外推至无穷大;BAs,胆汁酸;BDL,胆管结扎;C4,7α-羟基-4-胆甾烯-3-酮;CA,胆酸;CDCA,鹅去氧胆酸;CK7,细胞角蛋白-7;CMC,羧甲基纤维素;Cyp7a1,细胞色素 P450 家族 7 亚家族 A 成员 1;d,天;DCA,脱氧胆酸;DEGs,差异表达基因;GCDCA,甘氨鹅去氧胆酸; GO,基因本体;H&E,苏木精-伊红;IC50,半数最大抑制浓度;LCA,石胆酸;LC-MS/MS,液相色谱串联质谱法;MCA,鼠胆酸;MCP-1,单核细胞趋化蛋白-1;MDR3,多药耐药蛋白3;基质金属蛋白酶7 (MMP-7),基质金属蛋白酶7;NRC,正常大鼠胆管细胞;NTCP,Na+-牛磺胆酸共转运多肽;OST α /OST β,有机溶质转运蛋白α/β;QWBA,定量全身放射自显影;RNAseq,RNA测序;RT-qPCR,定量实时PCR;SAD,单次递增剂量;t 1/2,终末半衰期;UDCA,熊去氧胆酸;WT,野生型。
缩写:α-SMA,α-平滑肌肌动蛋白;ALP,碱性磷酸酶;ALT,丙氨酸氨基转移酶;ASBT,顶端钠依赖性胆汁酸转运蛋白;ASBTi,ASBT 抑制剂;ATCC,美国典型培养物保藏中心;AUC inf,从给药时间到最后可测量浓度的 AUC 并外推至无穷大;BAs,胆汁酸;BDL,胆管结扎;C4,7α-羟基-4-胆甾烯-3-酮;CA,胆酸;CDCA,鹅去氧胆酸;CK7,细胞角蛋白-7;CMC,羧甲基纤维素;Cyp7a1,细胞色素 P450 家族 7 亚家族 A 成员 1;d,天;DCA,脱氧胆酸;DEGs,差异表达基因;GCDCA,甘氨鹅去氧胆酸; GO,基因本体;H&E,苏木精-伊红;IC50,半数最大抑制浓度;LCA,石胆酸;LC-MS/MS,液相色谱串联质谱法;MCA,鼠胆酸;MCP-1,单核细胞趋化蛋白-1;MDR3,多药耐药蛋白3;基质金属蛋白酶7 (MMP-7),基质金属蛋白酶7;NRC,正常大鼠胆管细胞;NTCP,Na+-牛磺胆酸共转运多肽;OST α /OST β,有机溶质转运蛋白α/β;QWBA,定量全身放射自显影;RNAseq,RNA测序;RT-qPCR,定量实时PCR;SAD,单次递增剂量;t 1/2,终末半衰期;UDCA,熊去氧胆酸;WT,野生型。
PING CHEN 葡萄糖-PTS 调节甘油代谢和过氧化氢介导的血链球菌竞争 FABIANA ROGLIERO 新型聚氨酯基聚合物材料在运动护齿制造中的生物相容性 ANH HAO DANG 重新定位 FDA 批准的抗抑郁药 2-PCPA 以治疗牙周炎 ADRIAN REQUEJO 小鼠脑部感染新生隐球菌后星形胶质细胞的强效活化 ANJALI SONI 利用虚拟和增强现实技术彻底改变正畸教育、诊断和治疗计划 EDISON N. TRAN CRISPR-Cas 系统可以调节 PGN_1547:牙龈卟啉单胞菌 ATCC 33277 中的一种新的假设毒力因子 BEN L. OFRI 了解心理弹性对医疗干预期间患者幸福感的影响DANNIEL PHAM 血链球菌葡萄糖-PTS 的遗传特征,检测其竞争力和适应度 THOMAS DUARTE 使用机器学习和非破坏性检测来预测定制护齿套的机械性能 TUSHAR DESARAJU 探索 TLR2 信号对 TLR2-/- 小鼠生态时间序列多菌牙周感染后牙槽骨吸收的影响 ASHITHA YADA TLR2-/- 小鼠生态时间序列多菌牙周感染 (ETSPPI) 后的牙周细菌传播 GRACE ADAMS Cbp+ 变形链球菌与老年人根龋的关联 RAFAEL GARCIA 新型隐球菌葡萄糖醛酸木甘露聚糖通过抑制嘌呤能来损害小胶质细胞趋化性受体
缺乏对抗木质甲壳虫Fastidiosa(XF)的可持续策略突出了对新型实用抗菌工具的紧迫需求。在这项研究中,乳酸乳酸乳酸亚生成乳杆菌。乳酸菌株ATCC 11454(乳酸乳杆菌)以其生产奈瑟蛋白A而闻名,对XF亚种进行了体外测试。pauca。初步研究表明,乳乳杆菌对XF表现出强的拮抗活性。因此,通过体外和植物实验的结合,对尼沙蛋白A的功效进行了全面评估。采用可行的定量PCR,点测定,浊度降低测定,荧光显微镜和透射电子显微镜的体外研究表明,在最小的0.6 mg/mL的最小致死浓度下,尼沙蛋白对XF的鲁棒性杀菌作用。由荧光和透射电子显微镜产生的结果表明,尼沙蛋白直接和快速与XF细胞的膜相互作用,从而导致细菌细胞在几分钟内破坏。在Planta测试中,Nisin还证明了在接种后74天无症状74天内解决烟草本植物中XF感染的能力。此外,RPLC-ESI-MS/MS分析表明,尼生蛋白转移到植物的所有部分,并保持完整长达9天。首次,这项研究强调了基于尼我们的策略,作为一种现实且环保的方法,可以进一步研究该领域的XF感染。
伤口中的多药耐药(MDR)感染引起了重大关注。黄色有色的海洋细菌,菌株AK 11,是从珊瑚孔分离的。在Gosong Beach,Rembang,Central Java,印度尼西亚,并在实验室进行培养。这项研究旨在确定细菌共生体以及产生的色素类型,并确定黄色色素对引起伤口感染的细菌的抗菌效果。使用三种不同的方法进行提取过程,每种方法都以溶剂和蒸发过程进行区分。使用金黄色葡萄球菌,铜绿假单胞菌和大肠杆菌的测试细菌通过扩散法进行了抗菌活性测试。结果表明,最合适的色素提取方法是方法III,甲醇作为溶剂和使用N2的干燥技术。黄色色素提取物对金黄色葡萄球菌ATCC 6538和金黄色葡萄球菌菌株MDR的抗菌活性表现出抑制区直径为35±1.08和25±1.06mm。同时,铜绿假单胞菌和大肠杆菌细菌没有表现出任何抗菌活性。结果还揭示了细菌共生体是使用16S rRNA基因测序的微球菌,产生了类胡萝卜素的色素。总之,黄色颜料提取物具有抗菌的潜力,尤其是针对金黄色葡萄球菌。建议未来的研究继续专注于抗菌作用在体内的运作方式。
摘要 具有木质素解聚、分解代谢或两者兼有能力的新型细菌分离物可能与木质纤维素生物燃料应用有关。在本研究中,我们旨在识别能够解决微生物介导的生物技术所面临的经济挑战(例如需要曝气和混合)的厌氧细菌。利用从温带森林土壤中接种并在缺氧条件下以有机溶剂木质素作为唯一碳源进行富集的菌体,我们成功分离出一种新型细菌,命名为 159R。根据 16S rRNA 基因,该分离物属于 Bruguierivoracaceae 科的 Sodalis 属。全基因组测序显示基因组大小为 6.38 Mbp,GC 含量为 55 mol%。为了确定 159R 的系统发育位置,使用 (i) 其最亲属的 16S rRNA 基因、(ii) 100 个基因的多位点序列分析 (MLSA)、(iii) 49 个直系同源群 (COG) 结构域簇和 (iv) 400 个保守蛋白质重建了它的系统发育。分离株 159R 与枯木相关的 Sodalis 行会密切相关,而与采采蝇和其他昆虫内共生体行会关系较弱。估计的基于基因组序列的数字 DNA-DNA 杂交 (dDDH)、基因组保守蛋白质百分比 (POCP) 以及 159R 与 Sodalis 进化枝物种之间的比对分析进一步支持分离株 159R 属于 Sodalis 属的一部分和 Sodalis ligni 的一个菌株。我们建议将之命名为 Sodalis ligni str。 159R (=DSM 110549 = ATCC TSD-177)。
简介:牛至提取物等植物和天然药物可以成为控制污染细菌的有希望的成分,也是延缓致病细菌的良好盟友。方法:这是一项定性研究,在巴拉那大学微生物实验室进行,旨在使用营养琼脂培养基评估牛至提取物对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌 ATCC 022 菌株的抗菌潜力。选择了两个不同品牌的牛至提取物,并将测试分为两组,每组 15 个营养琼脂平板,以三种不同的稀释度对每种微生物进行测试。结果与讨论:两种提取物对两种微生物(大肠杆菌和金黄色葡萄球菌)的结果相似,使用 2 滴提取物的稀释液显示正常生长,而使用 5 滴提取物的稀释液与第一次稀释相比生长减少。在 8 滴稀释度下,仅在培养基边缘获得增殖,而该边缘不存在提取物,这表明具有抑菌潜力。细菌重新接种显示大肠杆菌和金黄色葡萄球菌生长正常,表明提取物不具有杀菌作用。最后的考虑:在实验室中进行实验后,金黄色葡萄球菌提取物的结果存在分歧,但在提取物的最高浓度下,有抑菌作用的迹象。提取物的使用显示出对大肠杆菌的抑菌作用。因此,植物治疗剂因其抗菌潜力而被视为抗击传染病的重要盟友。