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CVN - Ilario Gelmetti - FECYT
2015 年至 2019 年，他前往塔拉戈纳，在加泰罗尼亚化学研究所 (ICIQ) 和罗维拉伊维尔吉利大学电气电子工程与自动化系在 Emilio Palomares 教授的指导下攻读博士学位。他的博士学位由“Severo Ochoa”卓越奖学金资助。他在 ICIQ 的工作重点是无机和混合半导体的合成、它们在薄膜中的沉积以形成完整的光电装置以及材料和完整装置的高级表征。在此期间，他获得了使用各种设备和设施制造薄膜的经验，例如：洁净室、旋涂机、高真空热蒸发、手套箱、加热板、喷雾热解；各种薄膜表征技术，例如：AFM、XRD、SEM、SEM-EDX、时间分辨光致发光、瞬态吸收、轮廓测量、光学显微镜、开尔文探针力显微镜；以及各种用于完整设备的电气特性分析技术：激光脉冲扰动期间的电压示波器监测、电流-电压特性测量、阻抗光谱。此外，在攻读博士学位期间，他开发并发布了用于轻松数据采集的 Python 软件（目前在 5 个研究机构中使用）和用于数据分析和报告生成的 R 软件。他的博士论文获得了国际提名的优秀优等奖。
什么是DNA隔离定义
DNA提取自1869年弗里德里希·米舍（Friedrich Miescher）首次试图隔离它以来，它已经走了很长一段路，意外地发明了一种核酸隔离方法，后来其他人会完善。该过程涉及分解细胞膜和核信封以获得DNA，这对于PCR，DNA克隆，测序和电泳等各种分子生物学应用至关重要。取决于样本类型 - 需要植物，血液，细菌或其他 - 需要不同的提取方法，每种方法都有自己的手术，以确保DNA的所需纯度和数量。从苯酚 - 氯仿等醇到蛋白酶K，CTAB，自旋柱，磁珠等等，存在各种技术，每个技术都基于样品的特定要求选择。DNA提取的故事是连续的创新和精致之一，像Meselson和Stahl这样的先驱在1958年建立了全功能程序，而其他人则随着时间的推移贡献了他们的方法。从细胞中提取DNA的过程涉及三个主要步骤：细胞裂解，沉淀和溶解DNA。所使用的化学或组合的类型可能会根据目标和细胞类型而有所不同。对于柔软的细胞壁，如在结核分枝杆菌中发现的，用简单的裂解缓冲液加热是有效的。然而，较硬的细胞壁需要机械，化学和酶促方法来提取DNA。基于化学的DNA提取方法是基于溶液的，涉及各种有机和无机溶液。这些包括SDS，CTAB，苯酚，氯仿和硫氰酸鸟酯。所有程序的主要步骤是细胞裂解，降水和洗脱。基于溶液的（化学）DNA提取进一步分为基于有机溶剂的和基于无机溶剂的方法。有机溶剂（如苯酚和氯仿）以前已被使用，但由于危险而灰心。相反，采用了更安全的替代方案，例如Triton X100和EDTA。不同的化学物质有特定目的；蛋白酶K等酶分解蛋白质直接靶向氨基酸连接。DNA提取过程的有效性可能受细胞类型的影响以及某些化合物或化学物质组合的使用。在冷链中，尽管有一些缺点，但基于蛋白酶K的DNA分离方法还是有效的方法。此过程的一个问题是酶的稳定性降低，随着时间的流逝而降低。使用无机溶液（例如氯化钠和乙酸钾）与蛋白酶K结合使用的盐溶液。但是，提取的DNA的纯度可能是一个问题，因为尽管获得了足够的质量，但收益率可能不会令人满意。苯酚 - 氯仿 - 异氧化酒精法（PCI）是提取DNA的另一种流行技术。它使用液化缓冲液，苯酚和氯仿对蛋白质和破坏细胞，从而产生出色的产率和纯度。可以通过使用现成的DNA提取缓冲区来修改此方法，从而快速而简单。高质量的DNA产量和简单操作系统对于准确的DNA分析至关重要。相反，基于二氧化硅的DNA提取方法提供了一种独特的方法，依赖于二氧化硅和DNA相互作用的独特化学。带正电荷的二氧化硅颗粒在离心过程中与带负电荷的DNA结合，从而允许高质量的DNA产量和易于操作。由于其简单性和有效性，该市售技术已在诊断实验室中被广泛接受。为了验证提取的DNA，可以使用溴化乙锭或其他与DNA在UV光下反应的荧光染料在琼脂糖凝胶上电泳。通过计算260 nm和280 nm波长的吸光度来测量DNA的纯度。确定DNA纯度的最常见方法是A260/A280比率，对于优质DNA，应在1.7-2.0之间。较低的比率表明存在更多的污染物。荧光测量是确定DNA产量和浓度的另一种流行方法，它由于其广泛的可用性和比吸光度方法更高的灵敏度。也可以使用二苯胺（DPA）指示器确认DNA的存在，该指标涉及DNA化学水解。与分光光度计在600 nm处的吸光度强度也可以通过将DNA浓度与已知DNA浓度的标准曲线进行比较来确定DNA浓度。已开发和应用多种用于DNA提取的方法，包括用于传染病的护理核酸测试和人类DNA提取方法。方法的选择取决于DNA的特定应用和所需的质量。
太赫兹超材料微生物传感器的开发......
摘要 — 本研究介绍了一种基于超材料 (MTM) 的紧凑型多波段生物传感器的创新设计，旨在检测早期宫颈癌。该设备在太赫兹 (THz) 频率范围内工作，具体来说是 0 至 6 THz。所提出的传感器架构采用 MTM 层，该层由沉积在聚酰亚胺基板上的图案化铝结构组成。主要设计目标是优化几何参数，以在整个工作带宽内实现近乎完美的电磁 (EM) 波吸收。设计过程利用全波 EM 仿真工具。本文详细介绍了传感器拓扑开发的所有中间步骤，并以连续架构变化的吸收特性为指导。它还分析了基板和谐振器材料的影响。使用包含该设备的微波成像 (MWI) 系统证明了所提出的传感器适用于早期癌症诊断。大量的模拟研究证实了该传感器区分健康和癌变宫颈组织的能力。为了进一步验证，我们针对近期文献中报道的众多先进传感器设计进行了全面的基准测试。这些比较研究表明，所提出的传感器在吸光度水平和工作带宽宽度方面均具有优异的性能，这两者都提高了癌症检测的灵敏度。
在新鲜肉中优化DNA提取方法（大鼠...
摘要：DNA（脱氧核糖核酸）提取方法是将DNA与样品分离的过程。在此过程中，必须保护获得的DNA免受RNA，碳水化合物，脂质和蛋白质的污染。RNA，碳水化合物，脂质和蛋白质的污染可以增加DNA纯度。 使用通过260 nm和280 nm波长的吸光度比测量的纳米体2000分光光度计测量 DNA纯度。 优质DNA的260 /A 280比率为1.7-2.0，浓度> 0.03 pg。 这项研究旨在获得适当的DNA提取方法（大鼠和鸡肉的混合物）。 这项研究由两个阶段组成：使用easyfast™大鼠检测套件的肉类产品中的easyfast™提取套件的DNA提取阶段和放大阶段。 这项研究使用了16种与大鼠肉浓度的大鼠肉和鸡肉混合物的样品：5、10、15和20％。 在提取阶段，孵育时间优化了15、30、45分钟和1小时。 结果表明，在PCR扩增的结果中，一小时的孵育值最低。 关键字：DNA提取，孵化时间，实时PCR电子邮件：hadi_sunaryo@uhamka.ac.ac.id 1，apewewirman@gmail.com 2，etindiah_permanasari@uhamka.ac.ac.ac.id 3 desi.nurjanah@gazi.edu.tr 6 *通讯作者RNA，碳水化合物，脂质和蛋白质的污染可以增加DNA纯度。DNA纯度。优质DNA的260 /A 280比率为1.7-2.0，浓度> 0.03 pg。这项研究旨在获得适当的DNA提取方法（大鼠和鸡肉的混合物）。这项研究由两个阶段组成：使用easyfast™大鼠检测套件的肉类产品中的easyfast™提取套件的DNA提取阶段和放大阶段。这项研究使用了16种与大鼠肉浓度的大鼠肉和鸡肉混合物的样品：5、10、15和20％。在提取阶段，孵育时间优化了15、30、45分钟和1小时。结果表明，在PCR扩增的结果中，一小时的孵育值最低。关键字：DNA提取，孵化时间，实时PCR电子邮件：hadi_sunaryo@uhamka.ac.ac.id 1，apewewirman@gmail.com 2，etindiah_permanasari@uhamka.ac.ac.ac.id 3 desi.nurjanah@gazi.edu.tr 6 *通讯作者
测定各种辣椒（辣椒...）中的维生素 C 含量
摘要 辣椒是公认的富含维生素 C 的水果之一，维生素 C 是各种生理过程不可或缺的关键营养素，包括胶原蛋白合成、骨骼和牙齿形成、伤口愈合以及增强免疫系统抵御感染的能力。维生素 C 是一种水溶性化合物，暴露在空气中时容易降解。因此，必须小心保存辣椒以保持其维生素 C 水平。本研究的主要目的是辨别辣椒成熟度的三个不同阶段（幼熟、半熟和全熟）内的维生素 C 浓度。本研究采用的方法是紫外可见分光光度法，维生素 C 定量的最大波长为 265 nm。这种方法在各个阶段得到的吸光度值分别为 0.696、0.564 和 0.478。定量分析显示，幼辣椒、半熟辣椒和完全成熟辣椒中的维生素 C 浓度分别为 8.1397 ppm、5.9559 ppm 和 4.5313 ppm。这些发现明确表明，与半熟辣椒和完全成熟辣椒相比，幼辣椒中的维生素 C 含量明显更高。辣椒素配体的对接结果分别为吉布斯能 (ΔG)、Ki 和 IC 50 值 -6.14 kkal/mol、31.34 µm 和 19.143 ppm。结果表明，辣椒素与糖原磷酸化酶催化位点表现出良好的相互作用，可作为潜在的抗糖尿病药物。
3D可打印金属 - 聚合物纳米复合材料的等离子体表征
摘要：等离子聚合物纳米复合材料（即包含等离激元纳米结构的聚合物矩阵）吸引候选者，以开发依靠光 - 物质相互作用的流形技术设备，前提是它们具有固有的特性和处理能力。等离子体纳米复合材料的智能开发需要深入的光学分析，以证明材料性能，以及指导量身定制材料的合成的相关研究。重要的是，来自金属纳米颗粒产生的等离子体共振会影响纳米复合材料的宏观光学响应，从而导致较远和近场的扰动有助于解决材料的光学活性。我们根据带有Au或Ag纳米颗粒的丙烯酸树脂基质分析了两种适合3D打印的纳米复合材料的等离子行为。我们将实验性和计算的UV- VIS宏观光谱（远场）与单粒子电子损失光谱（EELS）分析（近场）进行了比较。我们扩展了Au和Ag等离子体相关的共振的计算，并在不同的环境和纳米颗粒大小上进行了计算。uv- vis和鳗鱼之间的差异取决于所考虑的金属，周围介质和纳米颗粒的大小之间的相互作用。这项研究允许详细比较Au和Ag聚合物纳米复合材料的等离子性能，其等离子响应可以更好地解决，这考虑了其预期的应用（即它们是否依赖于远场或近场相互作用）。关键字：局部表面等离子体共振，金属 - 聚合物纳米复合材料，电子能量损失光谱，UV-可吸光度，远处和近场性能■简介
饮用水紫外线消毒指南
1. 准直光束测试——准直光束装置可产生波长为 254 nm 的精确、均匀的紫外线输出，用于确定挑战性微生物的紫外线剂量反应曲线。在实验室测试中，对含有挑战性微生物的水样进行照射，并在暴露于不同剂量的紫外线之前和之后测量活微生物的浓度。剂量反应曲线是通过绘制挑战性微生物的对数失活与所施加剂量的关系来绘制的。所施加的剂量是根据测量的紫外线强度、水的紫外线吸光度、水的深度和挑战性微生物在准直光束下的暴露时间来计算的。紫外线剂量反应曲线是挑战性微生物对紫外线敏感度的测量值，并且是微生物所独有的。请注意，准直光束装置使用低压 (LP) 灯，必须使用校正因子来调整剂量反应曲线，以便与中压 (MP) 灯一起使用（见第 6.3 节）。2. 全尺寸反应器测试 – 使用与准直光束测试相同的挑战微生物，在特定操作条件下（即流速、UVT 和 UV 强度）从全尺寸反应器测试中收集对数灭活数据。3. 减量当量剂量 – 减量当量 (RED) 是通过将全尺寸反应器测试的对数灭活结果插入到 UV 剂量反应曲线上来估算的
使用Nebridge®金门组件进行蛋白质工程的DNA洗牌
组合片段的序列和所得的吸光度光谱用于开发计算模型，以预测片段的进一步组合，从而导致其他新型颜色。用适配器（TwistBioscience®，South San Francisco，CA）重新排序基因片段，以进行扩增，并使用Q5®热启动High Fidelity 2X Master Mix（NEB＃M0494）在50 µL反应中放大了PCR，并使用Spri®Beads清洁，并在100 µL水中洗净。使用Opentrons OT-2，将包含目的地矢量的主混合物和15 µL Nebridge Golden Gate组件套件（BSAI-HFV2）的组件组件组装在4°C温度模块上，然后通过涡旋将其混合在甲板上。然后，液体处理程序在没有温度控制的情况下将主混合物分布在96孔板上。使用OT-2，在3小时以上（总计576个零件）的过程中，将每个组件的6个零件移动。然后将板密封，并进行37°C的30个循环1分钟16°C 1分钟，然后在60°C的最终持有5分钟。2 µL转化为20 µL T7 Express Compation E.Coli。5 µL的稀释或浓缩转化铺在LB KAN上，并在37°C下生长过夜。菌落生长后，将它们从孵化器中取出，并允许在台式上开发颜色过夜，然后在4°C的冰箱中发育。
取代基因位置对量子信息设备方形染料的过渡偶极矩，差静态偶极子和疏水性之间关系的影响
摘要：表现出激素耦合的有机染料的聚集体具有广泛的应用，包括医学成像，有机光伏和量子信息设备。可以修改染料单体的光学特性，作为染料骨料的基础，以增强激子耦合。Squaraine（SQ）染料对于这些应用的吸光度很强，在可见范围内具有吸引力。先前已经检查了取代基类型对SQ染料光学特性的影响，但尚未研究各种取代基因位置的影响。在这项研究中，使用密度功能理论（DFT）和时间依赖性密度功能理论（TD-DFT）来研究SQ取代的位置与染料聚集系统性能性能的几个关键特性，即差静态偶极子（∆ D），过渡次要次偶极力矩（µ），Hydrophobicition和Hydrophobicity和the grout（ΔD）。我们发现，沿染料的长轴连接取代基可能会增加µ，而放置长轴则显示出增加∆ d并减少θ。θ的降低很大程度上是由于∆ d方向的变化，因为µ的方向不受取代位置的显着影响。疏水性降低时，当电子粉状取代基靠近吲哚美氨酸环的氮。这些结果提供了对SQ染料的结构与毛皮关系的见解，并指导染料单体的设计，用于具有所需属性和性能的聚集系统。
红姜乙醇提取物抑制大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的效果及机制
大肠杆菌和金黄色葡萄球菌是导致全球传染病的细菌。随着当今医学的发展，抗生素耐药性病例不断增加，人们越来越需要探索具有杀菌或抑菌特性的替代物质，包括来自天然来源的物质。红姜 (Zingiber officinale var. rubrum) 以其药用特性而闻名，尤其是其抗菌作用。这项研究旨在评估红姜抑制大肠杆菌和金黄色葡萄球菌生长的能力。进行了植物化学测试以确定提取物中的活性化合物，同时使用最低抑菌浓度 (MIC) 评估抗菌活性。用分光光度计和扫描电子显微镜 (SEM) 研究了抗菌作用机制。结果表明，红姜提取物含有生物碱、黄酮类化合物、皂苷、单宁和萜类化合物等活性化合物。大肠杆菌的最低抑菌浓度为 125 μg/ mL，金黄色葡萄球菌的最低抑菌浓度为 500 μg/ mL。在 260 nm 和 280 nm 吸光度下测量，添加 MIC 1 和 MIC 2 的红姜乙醇提取物与对照组相比显著影响细胞渗漏 (p<0.01)。SEM 分析显示，用红姜提取物处理的细菌细胞出现受损和空泡。因此，可以得出结论，红姜提取物对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的生长具有抑制作用，可以推荐作为治疗传染病的天然抗生素的替代品。