Highly accurate long-read single-molecule sequencing has revolutionized the comprehensive assembly of phased genetic architectures (Wenger et al.2019; Vollger等。2020; Nurk等。2022)。In addition, long-read single-molecule sequencing has permitted the direct identification of modified DNA bases such as m6A and 5-methylcytosine (5mC) (Marks et al.2012;克拉克等。2012; Murray等。2012; Loman等。2015; [CSL样式错误:没有印刷表格的参考。])启用单分子染色质纤维测序(Stergachis等人2020; Lee等。2020; Abdulhay等。2020; Shipony等。2020)。Specifically, single-molecule chromatin fiber sequencing leverages non-specific methyltransferases to selectively stencil chromatin protein occupancy patterns directly onto their underlying DNA molecules in the form of modified bases.修饰碱基。For example, during single-molecule, real-time (SMRT) sequencing, the identity of each base is determined based on the fluorophore-labeled
激光能量的作用下,基质的性质(包括其化学性质、电导率和微图案)会影响样品的电离效率,从而影响测量灵敏度。[8–11] 例如,微米级孔可用于分离不同成分的样品,以便分别进行分析。[12–14] 孔阵列还兼容主动 [15,16] 或被动上样技术,[12,17] 以简化分析样品的制备。然而,MALDI-MS 要求在分析前将样品干燥。当液滴在平面上干燥时,由于咖啡环效应,它们往往会将分析物分布在周边。[18,19] 圆柱形孔中也会发生类似的过程,导致沿周边出现沉淀 [20,21],因为激光被孔壁遮挡,信号受到抑制。这两种情况下的结果是灵敏度降低,测量变异性增加,这是由于样品点的不均匀性造成的。 [18,22]
fe fe fe ni ni ni ni ni mg平均平均值(UM)2.331 12,375 52.090 2.072 12.185 50.658 45.517 STDEV(UM)0.008 0.027 0.143 0.143 0.008 0.008 0.008 0.027 0.027 0.252 0.252 0.062 0.062 STDEV(%) 0.22%0.50%0.14%fe fe fe ni ni ni ni ni mg平均平均值(UM)2.331 12,375 52.090 2.072 12.185 50.658 45.517 STDEV(UM)0.008 0.027 0.143 0.143 0.008 0.008 0.008 0.027 0.027 0.252 0.252 0.062 0.062 STDEV(%) 0.22%0.50%0.14%
一种基于计算机的快速准确 Covid-19 自动诊断方法(预印本) Abdullah Al Jaid Jim 1、Ibrahim Rafi 1、Md. Sanaullah Chowdhury 1、Niloy Sikder 2、MA Parvez Mahmud 3、Saeed Rubaiee 4、Mehedi Masud 5、Anupam Kumar Bairagi 2、Kangkan Bhakta 1、Abdullah-Al Nahid 1,* 1 电子与通信工程学科 库尔纳大学 库尔纳 9208,孟加拉国 2 计算机科学与工程学科 库尔纳大学 库尔纳 9208,孟加拉国 3 迪肯大学工程学院 吉朗,维多利亚州 3216,澳大利亚 4 工业与系统工程系 机械与材料工程系 吉达大学,沙特阿拉伯 5 计算机科学系 塔伊夫大学通讯地址:nahid.ece.ku@gmail.com (A.-A. N) 摘要:目前,全世界正在目睹由 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 引起的可怕疫情。导致这种疾病的病毒称为 SARS-CoV-2。它会影响患者的呼吸系统并引起严重的肺部炎症,使他们呼吸困难。该病毒通过空气传播,因此感染率很高。该病毒于去年 12 月起源于中国,现已传播到七大洲,影响了 210 多个国家的人口,成为有史以来最严重的流行病之一。尽管多次独立和合作尝试开发疫苗或治疗方法,但尚未找到有效的解决方案。虽然这种疾病使世界陷入停顿,但尽快检测阳性对象并将其与其他人隔离是最大程度地减少其传播的唯一方法。然而,许多国家目前正面临诊断设备和医务人员的严重短缺。这种不足促使我们研究一种基于计算机的 COVID-19 自动诊断方法。在本文中,我们提出了一种基于顺序卷积神经网络 (CNN) 的模型,通过分析计算机断层扫描 (CT) 图像来检测 COVID-19。该模型能够以近 92.5% 的准确率识别疾病。我们相信,该模型的实施将帮助世界各地的医生和病理学家快速找出受害者,从而降低 COVID-19 的流行率。关键词:COVID-19、CT 扫描图像、卷积神经网络、SARS-CoV-2 病毒
摘要 — 本文介绍了一种处理和分类视觉诱发电位信号 (SSVEP) 的原创方法。它介绍了一种将典型相关分析与基于功率谱密度的方法相结合的集成学习模型。所用的刺激物是使用 LED 构建的,范围从 7.04 Hz 到 38.46 Hz。使用 ADS1299 和三个干电极收集数据。针对不同的光强度和 LED 之间的不同距离进行了测试。总共招募了 22 名参与者,平均准确率为 99.1 ± 2.27%,决策时间为 1 秒。据我们所知,这些结果超过了之前在 SSVEP-BCI 中使用高频刺激的其他作品中发表的结果,即平均准确率约为 90%,决策时间为 5 秒。索引术语 — 典型相关分析、脑机、EEG、视觉诱发电位、SSVEPC。
图2:在选定情况下不同模型的性能比较以及不同模型之间结构违规的比较。(a)(b)在8D01_L/8DOY_L之间的TM得分和六个不同模型生成的100个构象之间的TM得分散点图。(c)(d)用8D01_L/8DOY_L从UFCONF覆盖了采样结构。青色:8D01_L实验结构;红色:8DOY_L实验结构;绿色:最接近8D01_L的采样结构;洋红色:采样结构最接近8doy_l。(e)(f)8i6o_b/8i6q_b和六个不同模型生成的100个构象之间的TM得分的散点图。(g)(h)用8i6o_b/8i6q_b从UFCONF中采样结构的覆盖。青色:8i6o_b实验结构;红色:8i6q_b实验结构;绿色:最接近8i6o_b的采样结构;洋红色:采样结构最接近8i6q_b。(i)所有产生的构象在20中定义的总违规损失; (J)所有产生的构象的碳氮(C-N)键损失(表明违反C-N键长度的违规); (k)所有产生的构象之间的残基数(表明残基之间的原子半径限制的侵犯)计数; (l)所有产生的构象中残留物中的冲突计数(表明残基中原子半径限制的侵犯);
摘要近年来,新的基于混乱的加密算法激增,其中许多声称具有异常大的钥匙空间。尽管加密原语(例如对称键密码)应该具有足够大的秘密键空间以抵抗蛮力攻击,但仅增加秘密密钥的大小可能不会导致安全保障的提高。n -bit键不一定会由于密钥调度算法或如何使用密钥而具有2 n -1的密钥空间。在本文中,我们从其关键时间表的角度来看,加密基于混乱的算法。我们的数值分析基于Kerckhoff的原理,并考虑用于实数计算的数字表示。我们的分析表明,这些密码的实际安全保证金显着降低,其中有些比所声称的超过200倍以上。然后,我们为这些密码提供准确的键空间估计值。最后,我们重点介绍了如何在基于混乱的密码学背景下如何使用秘密密钥的替代解决方案,并提出了一个简单的密钥时间表作为概念证明。尽管简单起见,但提出的密钥时间表不仅可以确保钥匙空间匹配密钥长度,而且还通过NIST和ENT统计测试套件,也使其成为生成安全加密密钥的可行选择。我们的工作有助于解决基于混乱的密码学中基本问题之一,该问题限制了其在加密社区中的实际影响和声誉。
由于长期阅读的DNA测序技术,可以进行复杂基因组的从头基因组组件。但是,基于长阅读的组件质量最大化是一项具有挑战性的任务,需要开发专门的数据分析技术。我们提出了用于组装单倍体和二倍体生物的长DNA测序读数的新算法。组件算法构建了一个无方向的图,每个读取两个顶点是根据由k-mer分布得出的哈希函数所指出的最小化器所读取的。在图形构造过程中收集的统计信息被用作通过选择边缘来构建布局路径的功能,该边缘通过似然函数排名。对于二倍体样品,我们整合了对RefHAP算法进行分子相分化的重新配置。我们在PACBIO HIFI和纳米孔测序数据上运行了从不同物种的单倍体和二倍体样品中采集的纳米孔测序数据。与当前使用的其他软件相比,我们的算法表现出竞争精度和计算效率。我们希望这种新的发展对于为不同物种建立基因组组件的研究人员将很有用。
(c 1,c 2,。。。,c k)(c k +1 = c 1 + n)和l [i]∈{1,2,...,d},对于0≤i≤k,其中残基之间的接触