抗泛细菌的兴起正在迫切需要结构新颖的抗生素。人工智能方法可以发现新的抗生素,但是现有的方法具有明显的局限性。性能预测模型,该模型评估给定特性的分子一对一,尺度较大到大化的化学空间。直接设计分子的生成模型迅速探索了巨大的化学空间,但产生了构成挑战的分子。在这里,我们引入了Synthemol,这是一种设计新化合物的生成模型,从近300亿个分子的化学空间易于合成。我们将合成醇应用于设计分子,该分子抑制了鲍曼尼杆菌的生长,鲍曼尼(Baumannii)是一种繁重的革兰氏阴性细菌病原体。我们合成了58个产生的分子并实验验证它们,六个结构新颖的分子表明抗菌活性针对鲍曼尼a。这证明了生成人工智能设计的潜力,这些潜力是从广阔的化学空间中设计出结构新颖的,可综合和有效的小分子抗生素候选物,具有经验验证。
liriomyza trifolii,一种农业害虫,偶尔被沃尔巴基亚感染。liriomyza trifolii中存在的沃尔巴氏菌菌株与细胞质不相容性(CI)作用相关,导致胚胎因抗生素治疗或自然无沃尔巴氏菌的菌株与无沃尔巴氏菌的菌株和沃尔巴赫氏菌之间的不相容杂交导致胚胎死亡。在这项研究中,采用高变量rRNA基因的高通量测序来表征沃尔巴契亚感染的未经抗生素治疗的沃尔巴奇氏菌的细菌群落。分析表明,Wolbachia在L. trifolii中主导了细菌群落,而较小的活杆菌,假单胞菌和Limnobacter的存在较小。为了阐明CI表型的遗传基础,还进行了元基因组测序以组装Wolbachia菌株的基因组。Wolbachia菌株W LTRI的草稿基因组为1.35 Mbp,GC含量为34%,包含1,487个预测基因。值得注意的是,在W LTRI基因组中,有三种不同类型的细胞质不兼容因子(CIF)基因:I型,III型和V型CIFA; b。这些基因可能是导致在三乳杆菌中观察到的强细胞质不相容性的原因。
ACHS Australian Council for Healthcare Standards ANC Absolute neutrophil count ASA American Society of Anaesthesiology AVF Arteriovenous fistula AVG Arteriovenous graft BBV Blood-borne virus BC Blood culture BSI Bloodstream infection CA-CDAD Community-associated Clostridioides difficile-associated diarrhoea CAI Community-associated infection CARAlert Critical antimicrobial resistance alert system CC Cuffed catheter CDC Centers for Disease Control and Prevention CDI Clostridioides difficile infection CI Centrally-inserted (central line) CLABSI Central line-associated bloodstream infection CLUR Central line utilisation ratio CPAB Carbapenemase-producing Acinetobacter baumanii CPE Carbapenemase-producing肠杆菌CPO碳青霉烯酶产生生物体CPPA碳青霉烯酶产生的生成假单胞菌铜绿铜CRE碳纤维碳纤维抗体肠杆菌肠系膜科CSF CSF CSF脑脊液脑脊髓流体CT计算 Extended Spectrum carbapenemase GI GVHD Gastrointestinal graft versus host disease HAI Healthcare-associated infection HA-SABSI Healthcare-associated Staphylococcus aureus bloodstream infection HBV Hepatitis B virus HCA Healthcare-associated HCF Healthcare facility HCW Healthcare worker HCV Hepatitis C virus HD Haemodialysis HD-BSI血液透析血液感染
微生物通过减少化学施肥的需求,在植物营养方面在农业中至关重要。近年来,促进植物生长细菌(PGPB)已被广泛用作农业生物肥料(BF)。进行了这项研究,以确定促进植物生长细菌对豌豆植物发展的影响。首先确定了本研究中使用的细菌的磷酸盐溶解和氮固定电位。在研究中,4种不同组合的效果,F1 [(根瘤菌(FR-13)和假单胞菌Alcaligenes(FDG121)],F2 [(Pseudomonas荧光型生物型F(FDG-7),根瘤菌(FR-18)和芽孢杆菌 - GC亚组B(FDG-134)],F3 [Chrthrobacter oxydans(FDG-72),杆菌-GC亚组B(FDG-146),Rhizobium sp。(FR-11)]和F4 [ACINETOBACTER GENOSPECIES 9(FDG-116),BREVIBACILLUS AGRI(FDG-118),ZATMANIII(FDG-123)甲基杆菌(FDG-123)和杆菌-Megaterium-Megaterium-GC-GC亚级亚基A(FDG-153)。用细菌制成的配方在这些菌株中指定的特性中被发现是在温室条件下针对豌豆植物进行测试的,并研究了它们对植物总新鲜和干重的影响。该研究的设置为3个复制。是通过获得的数据进行的统计分析的结果,与对照相比使用的制剂; F2,F3和F1应用在总重量中分别很重要,而F2和F3应用在总干重中很重要。因此,这三种制剂对豌豆植物的产量特别有效,可以用作潜在的生物肥料。
• 2021 年,在重症监护病房 (ICU) 住院超过两天的患者中有 11,551 名 (15.6%) 出现至少一种 ICU 获得性医院相关感染 (HAI)(肺炎、血流感染或尿路感染)。 • 在 ICU 住院超过两天的所有患者中,10% 出现肺炎,8% 出现血流感染 (BSI),4% 出现尿路感染 (UTI)。 • 66% 的肺炎发作与插管有关,38% 的 BSI 发作与导管有关,97% 的 UTI 发作与导尿管有关。 • ICU 获得性肺炎发作中分离出的最常见微生物是铜绿假单胞菌,ICU 获得性血流感染中分离出的凝固酶阴性葡萄球菌,以及 ICU 获得性尿路感染中分离出的大肠杆菌。 • 53% 的“治疗日”(DOT)中抗菌药物的使用是经验性的,38% 的 DOT 中是指导性的,9% 的 DOT 中是预防性的。 • 15% 的金黄色葡萄球菌分离株对苯唑西林有耐药性 (MRSA),7% 的肠球菌属对糖肽有耐药性。据报道,20% 的大肠杆菌分离株、42% 的克雷伯氏菌属分离株和 46% 的肠杆菌属分离株对第三代头孢菌素有耐药性。据报道,12% 的克雷伯氏菌分离株、30% 的铜绿假单胞菌分离株和 85% 的鲍曼不动杆菌分离株对卡巴培南类抗生素有耐药性。
1. Kuehnast, T.、Kumpitsch, C.、Mohammadzadeh, R.、Weichhart, T.、Moissl-Eichinger, C. 和 Heine, H. 2024.《探索人类古生物组:其与健康和疾病的相关性及其与人类免疫系统的复杂相互作用》,FEBS 杂志。 10.1111/febs.17123 2. Zamyatina, A., Strobl, S., Zucchetta, D., Vasicek, T., Alessandro, M., Ruda, A., Widmalm, G. 和 Heine, H. 2024.《非还原糖支架能够开发具有皮摩尔效力的免疫调节 TLR4 特异性 LPS 模拟物》,Angew Chem Int Ed Engl:e202408421。 10.1002/anie.202408421 3. Heine, H.、Adanitsch, F.、Peternelj, TT、Haegman, M.、Kasper, C.、Ittig, S.、Beyaert, R.、Jerala, R. 和 Zamyatina, A. 2021.《使用二糖脂质 A 模拟物定制调节细胞促炎反应》,Front Immunol,12:631797。10.3389/fimmu.2021.631797 4. Vierbuchen, T.、Stein, K. 和 Heine, H. 2019.《RNA 正在造成损害:RNA 特异性 Toll 样受体对健康和疾病的影响》,Allergy,74:223-35。 10.1111/all.13680 5. Stein, K., Brand, S., Jenckel, A., Sigmund, A., Chen, ZJ, Kirschning, CJ, Kauth, M. 和 Heine, H. 2017.“树突状细胞对乳酸乳球菌 G121 及其 RNA 的内体识别是其抗过敏作用的关键”,《过敏与临床免疫学杂志》,139:667-78 e5。 10.1016/j.jaci.2016.06.018 6. Vierbuchen, T.、Bang, C.、Rosigkeit, H.、Schmitz, RA 和 Heine, H. 2017. “与人类相关的古细菌 Methanosphaera stadtmanae 通过其 RNA 被识别并诱导 TLR8 依赖的 NLRP3 炎症小体激活”,Front Immunol,8:1535。10.3389/fimmu.2017.01535 7. Bang, C.、Weidenbach, K.、Gutsmann, T.、Heine, H. 和 Schmitz, RA 2014. “肠道古细菌 Methanosphaera stadtmanae 和 Methanobrevibacter smithii 激活人类树突状细胞”, PloS one, 9: e99411。10.1371/journal.pone.0099411 8. Debarry, J.、Hanuszkiewicz, A.、Stein, K.、Holst, O. 和 Heine, H. 2010.《鲁氏不动杆菌 F78 的过敏保护特性是由其脂多糖赋予的》,过敏,65:690-7。 10.1111/j.1398-9995.2009.02253.x 9. Debarry, J.、Garn, H.、Hanuszkiewicz, A.、Dickgreber, N.、Blumer, N.、von Mutius, E.、Bufe, A.、Gatermann, S.、Renz, H.、Holst, O. 和 Heine, H. 2007.“从农场牛棚中分离出的鲁氏不动杆菌和乳酸乳球菌菌株具有很强的过敏保护特性”,过敏与临床免疫学杂志,119:1514-21。 10.1016/j.jaci.2007.03.023 10. Heine, H.、Kirschning, CJ、Lien, E.、Monks, BG、Rothe, M. 和 Golenbock, DT 1999.《切割
这项研究的目的是获得有关房屋中室内空气中存在哪些可栽培细菌物种的知识,以及空气传播细菌的浓度和多样性是否与不同的因素相关。在五个房屋的不同房间内和52套房屋中一次进行了整整一年的测量。在房屋内,发现了空中细菌浓度的房间对房间的变化,但是在整个房间中发现了细菌物种的重叠。发现了11种非常常见的物种,其中包括:lowffii,巨芽孢杆菌,B。pumilus,kocuria carniphila,K。Palustris,K。Rhizophila,Rhizophila,Micrococcus flavus,M.Luteus,M。Luteus,Moraxella oslaensis and paracococcus yei。通常,革兰氏阴性细菌的浓度和物种叶过与季节显着相关,春季浓度最高。P. Yeei,K。Rhizophila和B. pumilus的浓度与相对湿度(RH)呈正相关,而K. rhizophila的浓度与温度和空气变化速率(ACR)负相关。微球菌浓度与ACR负相关。总体而言,这项研究确定了房屋中室内空气中通常存在的物种,并且某些物种的浓度与这些因素有关:季节,ACR和RH。
•在2020年,在监测下至少有一个ICU获得的医疗保健相关感染(HAI)(肺炎,血液质感染,或泌尿术感染),在重症监护病房(ICU)中停留的11124(12.7%)在重症监护室(ICU)中至少出现。•在ICU中停留超过两天的所有患者中,有8%出现肺炎,6%患有血液感染(BSI),尿路感染(UTI)为3%。•71%的肺炎发作与插管有关,38%的BSI发作与导管相关,而95%的UTI发作与尿导管的存在有关。•最常见的微生物是ICU获得的肺炎发作中的铜绿假单胞菌,在ICU获得的BSIS中,ICU型BSIS中的凝固酶阴性葡萄球菌和ICU摄取的Escherichia大肠菌中的葡萄球菌。•在51%的“治疗日”(DOTS)中,抗菌剂的使用是经验的,指向37%的点,而在10%的点中进行了预防。•金黄色葡萄球菌分离株的14%是耐氧蛋白(MRSA)和16%的肠球菌spp。是抗糖肽。在22%的大肠杆菌分离株(38%的克雷伯氏菌属)中抗抗性头孢菌素。隔离株和39%的肠杆菌属。隔离。碳青霉苯甲酸抗性属于克雷伯氏菌属的11%。分离株,铜绿假单胞菌分离株的26%,鲍曼尼杆菌的54%分离株。
首字母缩写全名ACH急诊医院的目标公共卫生实验室协会信息学消息传递服务APHL公共卫生实验室协会和抗微生物抗药性Arln抗菌抵抗实验室网络作为抗微生物抗菌管理AST AST AST AST AST AST AST AST AST AST抗微生物敏感性抗菌敏感性测试Bap Blood Agar Plays Blot Prots Bmuis Microdur c.A a c. a c. a a and Prevention CEMB Clinical and Environmental Microbiology Branch (CDC Branch within DHQP) CFR Code of Federal Regulations CLIA Clinical Laboratory Improvement Amendments CPO Carbapenemase-Producing Organism CRAB Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii CRE Carbapenem-Resistant Enterobacterales CRO Carbapenem-resistant organism CRPA Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa DHQP Division of Healthcare Quality Prevention (CDC Division) DSHS Department of State Health Services ESBL Extended-Spectrum Beta-Lactamases GAS Group A Streptococcus GBS Group B Streptococcus GC Neisseria gonorrhoeae HAI Healthcare-associated Infection HCP Healthcare Personnel HHD Houston Health Department HSU医疗保健安全部门IATA国际航空运输协会ICAR感染控制评估和反应IP感染预防主义者BLA IMPIMIPENEMASE IP IP感染预防主义者BLA KPC KPECELAKLAKLA KLAEMONIAIAE CARBAPENEMASE CARBAPENEMASE LHD地方卫生局LHD本地卫生部LIMS LIMS实验室信息实验室信息管理系统LTACH长期急诊医院
摘要近年来,可持续和生态粮食生产的发展引起了全球的兴趣。很明显,随着新的整合系统的发展,这种现象正在引起以水产养殖研究的变化。但是,仍然有必要了解综合系统中涉及的不同方面,包括虾和海藻等共培养系统。这项研究评估了绿色海藻作为食物来源对白虾penaeus vannamei肠道细菌群落的影响。虾:仅用颗粒(P)喂食,仅ulva Clathrata(UC),U。Clathrata + Pellet(UCP),仅ULVA LACTUCA(UL)(UL)和U. lactuca + lactuca + pellet(ULP)。在生长和生存方面,与对照(P)相比,ULP和UCP处理之间没有发现显着差异(P> 0.05)。对虾肠的细菌生物群的分析显示,与对照(P)相比,ULP,UL和UC中社区组成的显着差异(P <0.05)。我们发现,蛋白杆菌是所有治疗中最丰富的门,其次是用于UC,UCP和UL和UL和ULP治疗的细菌菌。虾只用海藻U. lactuca(UL,ULP)的rubritalea,lysinibacillus,acinetobacter和bellopopirellula的丰富度明显更高,用于U. Clathrata治疗(UC,UCP),是litoreibacter。对照(P)中颤动的相对丰度更高,显示出UC和UL处理的减少。我们的发现可以更好地了解综合的水产养殖系统,特别是那些利用海藻作为天然饲料来源的水产养殖系统。