发布和批准流程很长。请注意,此跟踪器上的每个地点都涉及该地点内的多个办事处。由于批准流程的复杂性,有时某个地点不会发生重大变动(可能是数周)。这并不罕见。有关批准流程时间表的更多信息:晋升委员会批准流程
摘要:定向进化 (DE) 是一种强大的工具,可用于优化蛋白质适应特定应用。然而,当突变表现出非加性或上位性行为时,DE 可能效率低下。在这里,我们介绍了主动学习辅助定向进化 (ALDE),这是一种迭代机器学习辅助 DE 工作流程,它利用不确定性量化来比当前的 DE 方法更有效地探索蛋白质的搜索空间。我们将 ALDE 应用于对 DE 具有挑战性的工程领域:优化酶活性位点中的五个上位性残基。在三轮湿实验室实验中,我们将非天然环丙烷化反应所需产物的产量从 12% 提高到 93%。我们还对现有的蛋白质序列适应度数据集进行了计算模拟,以支持我们的论点,即 ALDE 比 DE 更有效。总体而言,ALDE 是一种实用且广泛适用的策略,可以解锁改进的蛋白质工程成果。关键词:蛋白质工程、定向进化、酶工程、原珠蛋白、卡宾、立体选择性、机器学习、贝叶斯优化、主动学习、不确定性量化
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加拿大纽芬兰海岸。对所谓的费森登振荡器的研究一直持续到 1931 年,在此期间,频率从 540 Hz 增加到 1,000 Hz(Lasky,1977 年;Hackman,1984 年;Bjørnø,2003 年;Katz,2005 年)。第一次世界大战中,潜艇成为较弱海军强国的首选武器——用今天的话来说,这是一种“不对称威胁”——刺激了对水下潜艇的探测需求,而这些潜艇本来是隐形的(Cote,2000 年)。潜艇的隐蔽性和海洋的不透明性深刻改变了 20 世纪剩余时间的海战(Keegan,1990 年;Cote,2000 年)。由于声音是唯一能在水中传播可观距离的传输能量,因此必须利用声学回声测距来应对这一威胁。第一次世界大战后出现的最重要的回声测距系统是超声波 ASDIC,这是英国和法国海军合作研制的。ASDIC 是盟军潜艇探测调查委员会的缩写,该委员会在第一次世界大战期间成立,以开展潜艇探测研究。意大利也进行了类似的研究,美国的研究范围更为广泛。1918 年,法国物理学家 Paul Langevin 使用一种设计为以 38 kHz 机械共振的发射器演示了第一个 ASDIC 系统,并用它来估计目标距离和方位(Lasky,1977 年;Urick,1983 年;Burdic,1984 年;Hackman,1984 年;Bjørnø,2003 年;Proc,2005 年)。第一个 ASDIC 舰载系统于 1919 年安装,该系统有一个覆盖式圆顶,使系统可以在船舶移动时运行。工作频率从 20 到 50 kHz 不等。在 20 世纪 20 年代和 30 年代初,ASDIC 被开发用于驱逐舰的反潜战 (ASW)。两次世界大战之间的时期也是水下声学基础研究的时期。这一时期的一个关键发现是,水下较高频率的声音在穿过海水时,其振幅比较低频率的声音衰减得更大。基于这一观察,新型驱逐舰 ASDIC(119 型)的频率范围从
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