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使用以 Morgan 指纹为特征的深度神经网络模型预测 ErbB 抑制剂的结合亲和力
ErbB 受体家族（包括 EGFR 和 HER2）在细胞生长和存活中起着至关重要的作用，并与乳腺癌和肺癌等各种癌症的进展有关。在本研究中，我们开发了一个深度学习模型，使用基于 SMILES 表示的分子指纹来预测 ErbB 抑制剂的结合亲和力。每种 ErbB 抑制剂的 SMILES 表示均来自 ChEMBL 数据库。我们首先从 SMILES 字符串生成 Morgan 指纹，并应用 AutoDock Vina 对接来计算结合亲和力值。根据结合亲和力过滤数据集后，我们训练了一个深度神经网络 (DNN) 模型来根据分子指纹预测结合亲和力值。该模型取得了显著的性能，训练集上的均方误差 (MSE) 为 0.2591，平均绝对误差 (MAE) 为 0.3658，R 平方 (R²) 值为 0.9389。尽管在测试集上性能略有下降（R² = 0.7731），但该模型仍然表现出强大的泛化能力。这些结果表明深度学习方法对于预测 ErbB 抑制剂的结合亲和力非常有效，为虚拟筛选和药物发现提供了宝贵的工具。
激酶抑制剂结合亲和力用验证的图形编码器和语言模型
动机：抑制剂 - 激酶结合亲和力的准确预测对于药物发现和医疗应用至关重要，尤其是在治疗诸如癌症之类的疾病中。现有的预测抑制剂 - 激酶亲和力的方法仍然面临挑战，包括数据表达不足，功能提取有限和性能低。尽管通过人工智能（AI）方法（尤其是深度学习技术）取得了进展，但许多当前的方法未能捕获激酶与抑制剂之间的复杂相互作用。因此，有必要开发更先进的方法来解决抑制剂 - 激酶结合预测中的现有问题。结果：这项研究提出了Kinhibhib，这是抑制剂 - 激酶结合亲和力预测指标的新型框架。kinhibit会整合自我监督的预训练的预训练的分子编码器和蛋白质语言模型（ESM-S），以有效提取特征。kinhibit还采用特征融合方法来优化抑制剂和激酶特征的融合。实验结果证明了这种方法的优越性，在三种MAPK信号途径激酶的抑制剂预测任务中，精度达到了92.6％的精度：RAF蛋白激酶（RAF），有丝分裂原激活的蛋白激活蛋白激酶激酶激酶（MEK）和细胞外信号调节激酶（ERK）。此外，该框架在包含200多个激酶的数据集上达到了令人印象深刻的精度。这项研究为药物筛查和生物科学提供了有希望的有效的工具。
激酶抑制剂结合亲和力用验证的图形编码器和语言模型
动机：抑制剂 - 激酶结合亲和力的准确预测对于药物发现和医疗应用至关重要，尤其是在治疗诸如癌症之类的疾病中。现有的预测抑制剂 - 激酶亲和力的方法仍然面临挑战，包括数据表达不足，功能提取有限和性能低。尽管通过人工智能（AI）方法（尤其是深度学习技术）取得了进展，但许多当前的方法未能捕获激酶与抑制剂之间的复杂相互作用。因此，有必要开发更先进的方法来解决抑制剂 - 激酶结合预测中的现有问题。结果：这项研究提出了Kinhibhib，这是抑制剂 - 激酶结合亲和力预测指标的新型框架。kinhibit会整合自我监督的预训练的预训练的分子编码器和蛋白质语言模型（ESM-S），以有效提取特征。kinhibit还采用特征融合方法来优化抑制剂和激酶特征的融合。实验结果证明了这种方法的优越性，在三种MAPK信号途径激酶的抑制剂预测任务中，精度达到了92.6％的精度：RAF蛋白激酶（RAF），有丝分裂原激活的蛋白激活蛋白激酶激酶激酶（MEK）和细胞外信号调节激酶（ERK）。此外，该框架在包含200多个激酶的数据集上达到了令人印象深刻的精度。这项研究为药物筛查和生物科学提供了有希望的有效的工具。
利用交叉注意力网络发现成对相互作用来预测药物-靶标亲和力 S. Falahati a、F. Zamani* a、MA Khodamoradi b
在药物发现中，药物-靶标亲和力 (DTA) 被视为至关重要的一步，因为它有助于在开发过程中识别最有前途的候选药物。由于必须考虑药物和靶分子的结构和功能，以及它们复杂而非线性的相互作用，DTA 预测是一项具有挑战性的任务。本研究的目的是提出一种新颖的 DTA 预测框架，该框架利用图神经网络 (GNN) 的交叉注意网络 (CAN) 的优势。然而，使用 GNN 表示图会保留其 3D 结构信息。现有的基于注意力的方法并未充分利用它们。我们的框架使用 CAN 通过分析药物分子的不同部分如何与蛋白质的特定区域相互作用来捕获药物-靶标对的更准确表示。我们在顺序架构中使用 GIN 和 GAT 来捕获药物图分子的局部和全局结构信息。我们在两个基准数据集 Davis 和 KIBA 上评估了所提出方法的性能。其性能令人鼓舞，在均方误差 (MSE) 和一致性指数 (CI) 方面优于许多最先进的方法。具体来说，对于 Davis 数据集，我们实现了 0.222 的 MSE 和 0.901 的 CI，而对于 KIBA，我们获得了 0.144 的 MSE 和 0.883 的 CI。我们的方法提高了相互作用分析的可解释性和特异性，为药物发现过程提供了更深入的见解，并为预测的 DTA 提供了有价值的解释。我们的研究代码可在以下网址获取：https://github.com/fsonya88/CAN-DTA。
亲和力小组电子书：受监管的大麻行业的兴起和曼岛优势
法律挑战：大麻部门面临的最重要的障碍之一是复杂且通常不一致的法律格局。在国家和国际层面存在监管障碍，为企业驾驶的挑战性迷宫。跨国立法的差异可能会使事情进一步复杂化。例如，尽管加拿大这样的国家已经完全合法化了大麻，但它仍然严格控制着许多国家。这种差异为希望跨境扩展的企业造成了不确定性，要求他们理解并遵守不同的法规，这通常是令人生畏的和资源密集的。
大麻 | Affinity Group
完善的基础设施，实现医用大麻行业高效管理。高效、健全的大麻监管框架。大麻监管符合欧盟良好生产规范 (GMP) 指南。符合国际标准的现代化医用大麻生产和分销。一系列大麻相关业务的许可证，包括种植、提取、制造等。0% 企业税率和资本利得税。成熟的国际金融中心，为创业创造了非常有利的环境。可接触对该行业感兴趣的知名银行。在全球市场中占据战略地位，可轻松进入英国、欧洲和其他全球市场。稳定的政治、法律和经济环境。全球公认的医用大麻中心和受监管的司法管辖区。可接触高度重视技术和创新的高技能劳动力。
bioAffinity Technologies 报告 CyPath® Lung 在德克萨斯州 Beta 版发布会上取得积极成果
本新闻稿中的某些陈述构成联邦证券法所定义的“前瞻性陈述”。诸如“可能”、“或许”、“将”、“应该”、“相信”、“期望”、“预期”、“估计”、“继续”、“预测”、“预报”、“项目”、“计划”、“打算”等词语或类似表达，或关于意图、信念或当前期望的陈述，均属于前瞻性陈述。这些前瞻性陈述基于当前估计和假设，包括关于 2025 年销售持续增长、2025 年向退伍军人和军事医疗系统推出销售以及期待在 2025 年与关键意见领袖合作以扩大公司市场以改善肺癌早期诊断并为高危患者提供安心的陈述。
基于配体的外泌体亲和纯化 (LEAP) 柱...
摘要 外泌体是纳米级的细胞外囊泡，在细胞间通讯中起着重要作用，携带可影响生理和病理过程的蛋白质、脂质和 RNA 等生物分子。纯外泌体的分离对于基础研究和临床应用（包括诊断和治疗）都至关重要。传统的外泌体分离技术（例如超速离心）缺乏特异性并且可能产生不纯的样品，因此显然需要先进的分离技术。基于配体的外泌体亲和纯化 (LEAP) 柱层析是一种利用针对外泌体表面标志物的特定配体的新方法，为外泌体分离提供了一种高度特异性、温和且可扩展的方法。这篇小型综述探讨了 LEAP 层析的机制、优点和临床应用潜力，强调了其在基于外泌体的诊断和治疗中日益增长的重要性。
FlowDock：生成蛋白质配体对接和亲和力预测的几何流量匹配
最近已经提出了动机的强大生成模型，但这些方法中很少有支持柔性蛋白质配体对接和亲和力估计。没有人可以直接对多种结合配体进行同时建模，也可以根据药理学相关的药物靶标进行严格的标准，从而阻碍了它们在药物发现工作中的广泛采用。 导致这项工作，我们提出了FlowDock，这是一种基于条件流量匹配的深几何生成模型，该模型学会了将其直接映射到其绑定的（Holo）对应物中，以将其映射到任意数量的结合配体中。 此外，Flowdock与其每种生成的蛋白质配体复杂结构中提供了预测的结构置信度评分和结合亲和力值，从而实现了新（多配体）药物目标的快速虚拟筛选。 对于常用的PoseBusters基准数据集，Flotdock使用Unbound（APO）蛋白质输入结构实现了51％的盲区对接成功率，而没有任何来自多个序列比对的信息，并且对于具有挑战性的新Dockgen-E数据集，FlotDock与单次序列Chai-1的性能相匹配。 此外，在第16个社区范围内的结构预测技术批判性评估（CASP16）的配体类别中，Flowdock在140种蛋白质配体复合物中的药理学结合亲和力估计的前5位方法中排名，证明了其在虚拟筛选中的学位表达的功效。没有人可以直接对多种结合配体进行同时建模，也可以根据药理学相关的药物靶标进行严格的标准，从而阻碍了它们在药物发现工作中的广泛采用。导致这项工作，我们提出了FlowDock，这是一种基于条件流量匹配的深几何生成模型，该模型学会了将其直接映射到其绑定的（Holo）对应物中，以将其映射到任意数量的结合配体中。此外，Flowdock与其每种生成的蛋白质配体复杂结构中提供了预测的结构置信度评分和结合亲和力值，从而实现了新（多配体）药物目标的快速虚拟筛选。对于常用的PoseBusters基准数据集，Flotdock使用Unbound（APO）蛋白质输入结构实现了51％的盲区对接成功率，而没有任何来自多个序列比对的信息，并且对于具有挑战性的新Dockgen-E数据集，FlotDock与单次序列Chai-1的性能相匹配。此外，在第16个社区范围内的结构预测技术批判性评估（CASP16）的配体类别中，Flowdock在140种蛋白质配体复合物中的药理学结合亲和力估计的前5位方法中排名，证明了其在虚拟筛选中的学位表达的功效。可用性和实现源代码，数据和预训练的模型可在https://github.com/ bioinfaramefaraminelearning/flowdock上找到。
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