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治疗性蛋白质的药物间相互作用评估
I. 简介 本指南旨在通过提供系统性、基于风险的方法建议，帮助新药临床试验 (IND) 申请的发起人和生物制品许可申请 (BLA) 的申请人确定治疗性蛋白质是否需要进行药物相互作用 (DDI) 研究。2,3 对于本指南，治疗性蛋白质是指根据《公共卫生服务法》第 351 条 (42 USC 262) 正在开发以获得许可或已获得许可的生物制品蛋白质。4,5 治疗性蛋白质包括纯化的单克隆抗体、细胞因子、酶和其他用于体内使用的新型蛋白质。治疗性蛋白质不包括旨在用作疫苗或过敏原产品的蛋白质、细胞和基因治疗产品和/或人体细胞、组织以及基于细胞和组织的产品。5 虽然本指南适用于治疗性蛋白质，但许多一般原则可能适用于其他生物制品，例如 CBER 监管的新产品（例如细胞和基因疗法）。由于对新产品的认识不断演变，申办方应咨询相应的审查部门以获取有关特定 DDI 评估的详细信息。
chatgpt作为生物信息合作伙伴。
摘要：由OpenAI开发的高级大型语言模型ChatGpt4O可用于分析和理解交叉反应性过敏反应。这项研究探讨了Chatgpt4O的使用来支持对过敏原的研究，尤其是在猫和猪肉之间的交叉反应性综合征中。使用对FEL D 2（猫白蛋白）和SUS S 1（猪白蛋白）的假设临床病例，模型引导的数据收集，蛋白质序列分析和三维结构可视化。通过使用SDAP 2.0和Bepipred的生物信息学工具，预测了过敏蛋白的表位区域，从而证实了它们对免疫球蛋白E（IgE）E（IgE）的可及性以及交叉反应性的概率。结果表明，具有较高表位概率的区域表现出高表面可及性，主要是线圈和螺旋结构。系统发育树的构造进一步支持了所研究的过敏原之间的进化关系。chatgpt4o通过复杂的生物信息学过程展示了其在指导非专业研究人员方面的有用性，使高级科学可访问并提高了分析和创新能力。
小麦 CRISPR 技术能够删除过敏原基因……
参考文献 (1) Sanchez-Leon, S., 等人 (2018)。利用 CRISPR/Cas9 改造的低筋非转基因小麦。Plant Bio J 16, 902-910。(2) Camerlengo, F., 等人 (2020)。利用 CRISPR-Cas9 多重编辑 α-淀粉酶/胰蛋白酶抑制剂基因以减少硬粒小麦中的过敏原蛋白。Front in Sust Food Syst 4, 104。(3) Dodo, HW., 等人 (2008)。利用基因工程缓解花生过敏：沉默免疫显性过敏原 Ara h 2 可显着减少其含量并降低花生的致敏性。Plant Bio J 6, 135-145。(4) Dodo, HW. (2021)。 SBIR 第二阶段：利用基因组编辑技术开发无过敏原花生。SBIR-STTR。(5) Sugano, S., 等人 (2020)。利用定点诱变技术同时诱导大豆中两种过敏原基因的突变等位基因。BMC plant biol 20, 1-15。(6) You, J., 等人 (2022)。CRISPR/Cas9 介导的芝麻 (Sesamum indicum L.) 高效靶向诱变。植物科学前沿 13。(7) Chang, Y., 等人 (2022)。强大的 CRISPR/Cas9 介导的 JrWOX11 基因编辑可操纵胡桃坚果树种的不定根和营养生长。Scientia Hort 303, 111199。
共价化学在靶向蛋白质降解中的应用
用于治疗各种临床适应症，包括癌症、抗感染、胃肠道、中枢神经系统和心血管疾病。1–3 例如，阿司匹林是一种已使用了 100 多年的止痛药，它共价乙酰化环氧合酶-1 (COX-1) 的活性丝氨酸残基，而 COX-1 是一种在前列腺素生物合成中起关键作用的酶。4–6 除阿司匹林外，青霉素类抗生素是另一个经典的共价抑制剂例子，其中 β-内酰胺支架不可逆地与细菌 DD-转肽酶 (也称为青霉素结合蛋白) 的活性位点丝氨酸结合，从而使负责细菌细胞壁合成的酶失活。 7,8 尽管共价药物取得了成功，但在 2013 年首个共价激酶抑制剂依鲁替尼获批之前，共价药物在药物化学和药物开发中一直被忽视。人们之所以不愿使用共价药物，主要是因为人们担心由于反应性混乱、半抗原化和特异性药物相关毒性而导致的潜在脱靶毒性。9–11 研究表明，化学反应性药物代谢物可以与肝脏蛋白共价结合，从而引起肝毒性。12,13 放射性标记研究表明，产生的反应性物质与各种细胞蛋白共价结合，这可能导致细胞毒性。14 在某些情况下，反应性药物代谢物与蛋白质的共价结合可能具有免疫原性，导致患者出现过敏反应。1,15
AllerTrans：使用深度学习
摘要：认识到蛋白质的潜在过敏性对于确保其安全性至关重要。过敏原是确定蛋白质安全性的主要问题，尤其是随着重组蛋白在新医疗产品中的使用越来越多。这些蛋白质需要仔细的过敏性评估以确保其安全性。但是，传统的实验室测试过敏既昂贵且耗时。为了应对这一挑战，生物信息学为预测蛋白质过敏性提供了有效且具有成本效益的替代方法。在这项研究中，我们开发了一种增强的深度学习模型，以基于其主要结构为蛋白质序列的主要结构来预测蛋白质的潜在过敏性。我们的方法利用了两个蛋白质语言模型，为每个序列提取不同的特征向量，然后将其输入到深层神经网络模型中进行分类。每个特征向量代表蛋白质序列的特定方面，并将它们组合起来可以增强最终结果，并平衡模型的灵敏度和特异性。该模型将蛋白质分类为过敏反应或非过敏性类别。我们提出的模型表明，与ALGPRED 2.0模型相比，所有评估指标的可接受改进，其敏感性为97.91％，特异性为97.69％，精度为97.80％，使用Algpred 2.0 2.0 Dataaset的ROC曲线在99％下的敏感性为97.80％，使用标准的五fordation fortal-forcectation。
选择和表征DNA适体用于高度选择性识别橄榄花粉E 1
在这项研究中，使用指数富集（SELEX）方法选择了使用配体的系统演化，选择了与OLE E 1（橄榄花粉的主要过敏原）的单链DNA适体。通过酶联寡核苷酸测定（ELONA）和适当沉淀测定法首先建立了适体的结合。此外，还使用适体模型的单片毛细血管色谱法，以评估该过敏蛋白对其他非靶向蛋白的识别。结果表明aptole1＃6是为OLE E 1.选定的适体对该蛋白显示出良好的选择性识别，无法保留其他非靶蛋白（HSA，CYT C和其他花粉蛋白，例如OLE E 9）。通过在过敏皮肤测试中选择性识别OLE E 1的选择性识别，证明了Aftiminity整体柱的可行性。该整体柱的稳定性和可重复性是合适的，在保留时间和峰面积值分别为7.8和9.3％（列到柱可重新可重复），相对标准偏差（RSD）分别为7.8和9.3％。这是第一项研究，描述了该相关过敏原的有效DNA适体的设计。©2021作者。由Elsevier B.V.这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。
食品发酵作为一种生物技术过程
生物技术利用包括微生物在内的生物系统生产出改善人类生存的产品。食品发酵是生物技术中众所周知的技术，它通过营造有益微生物战胜危险疾病的环境来帮助保存食物。发酵食品极其重要，因为它们提供并保存了大量营养丰富的食物，这些食物具有各种风味、气味和质地，丰富了人类的饮食。自从人类来到地球以来，这一过程就一直在使用和存在。在烹饪界，发酵以各种方式用于生产各种各样的食物和饮料。细菌发酵赋予酸奶和奶酪等乳制品质地和风味，而酵母则利用碳水化合物制作面包和酒精饮料。值得注意的是，发酵通过提高营养物质的生物利用度、合成维生素和产生生物活性化学物质，有助于发酵食品的健康益处。发酵通过营造有益微生物可以战胜危险疾病的环境来帮助保存食物。它还可以减轻某些食物的过敏性并抵消抗营养影响。发酵过程中微生物群落的动态相互作用使世界各地的烹饪传统变得多样而独特。本章讨论了微生物如何与食物相互作用以延长其保质期、确保其微生物安全性，甚至可能改善某些食物的消化率的技术。关键词：发酵；生物技术；生物活性；微生物；营养素
![arxiv：2206.08336v2 [q-bio.qm] 2023年1月27日](/simg/g:\will\search\icon\source\c\c441eb90dd6affeff4125bfcb809d98667997d48.webp)
arxiv：2206.08336v2 [q-bio.qm] 2023年1月27日
1引言扩展和激活T细胞的肽疫苗已成为一种有希望的预防性和治疗方法，用于应对与健康相关的挑战，包括传染病和癌症（Malonis，Lai，Lai和Vergnolle 2019）。与基于整个器官或基于整个细胞蛋白亚基的整个器官或亚基疫苗相比，肽疫苗是基于一系列的蛋白质碎片（肽），这些蛋白质碎片（肽）具有足够的反应，并且具有更大的反应性，而又一次反应了，这是造成的，而这些反应范围更大，这是造成的，而这些反应是更大的反应，而这些反应是更大的反应（等2014）。肽疫苗的设计包括选择免疫原性蛋白片段，通常称为表位（Li等人2014），当疫苗中包括时会扩大表位时特定的T细胞。机器学习的进步使我们能够预测主要的组织辅助分子（MHC）分子将通过自适应免疫系统进行监视（Ching等人2018，Reynisson等。 2020），可以用来识别将显示哪些表位（Sohail等人。 2021）。 个体所显示的表位取决于其MHC基因的特定等位基因，因此免疫系统显示的肽可能会因个人而异（Zaitouna，kaur，）而有很大差异2018，Reynisson等。2020），可以用来识别将显示哪些表位（Sohail等人。2021）。个体所显示的表位取决于其MHC基因的特定等位基因，因此免疫系统显示的肽可能会因个人而异（Zaitouna，kaur，
华盛顿大学健康部门职位描述 - 过敏抗原专家
1. 独立工作并作为诊所工作人员（医生和护士）的联络人，支持药物使用系统。2. 通过对无菌技术和其他配制任务的年度评估，展示配制过敏原提取物处方组的知识和能力。3. 清点和订购库存抗原和提取物、稀释剂、小瓶、毒液试剂盒、邮寄物、标签和其他用品。4. 使用适当的清洁、消毒和监控系统妥善维护设施。5. 保持对实践参数指南、免疫治疗标准的了解，并将其纳入日常工作流程和程序中。6. 接收和审查医嘱的免疫治疗；协助创建需要连续稀释（复杂数学计算）的复杂过敏测试试剂盒。制定针对抗原挑战和测试的患者特定方案。7. 准备免疫治疗混合表，计算适当的抗原强度和稀释剂量。 8. 将制备好的患者样本提取物分发或递送至不同地点，并酌情使用快递、美国邮政和联邦快递。必须持有科室车辆使用许可。9. 制备用于科室内部和不同地点测试的毒液。10. 必须了解抗原及其他免疫疗法相关药物的复杂账单和费用转移流程；11. 提交账单代码和免疫疗法文件，以纳入患者病历。12. 培训新员工正确制备测试材料和患者抗原稀释液。13. 测试或开发新的过敏检测程序。
补充喂养
该立场论文考虑了互补喂养（CF）的不同方面，重点是欧洲健康的婴儿。在审查了当前的知识和实践后，我们提出了这些建议：时间：独家或完整的母乳喂养至少4个月（17周，生命的第5个月开始）以及独家或主要的乳房喂养约6个月（26周，第7个月的开始，第7个月的开始）是一个值得的目标。补充食物（母乳或婴儿配方奶之外的固体和液体），但不应延迟6个月。内容：应为婴儿提供各种浅色和质地的食物，包括苦味绿色蔬菜。持续的母乳喂养与CF一起推荐。全牛的牛奶不应在12个月大之前用作主要饮料。在4个月后的任何时间开始启动CF时，可能会引入过敏性食物。患有花生过敏风险高的婴儿（患有严重湿疹，卵过敏或两者兼有的患者）应在4到11个月之间引入花生。可能会在4到12个月之间引入麸质，但是在麸质引入后的第一周和婴儿期间，应避免大量消耗。所有婴儿均应收到富含铁的CF，包括肉类产品和/或富含铁的食物。不应将糖或盐添加到CF中，应避免果汁或糖甜饮料。纯素食应仅在适当的医疗或饮食监督下使用，父母应承受严重的后果，即未能遵循有关补充饮食的建议。方法：应鼓励父母回应婴儿的饥饿和饱腹运动，并避免进食以舒适或作为回报。