Amycolatopsis mediterranei U32 是利福霉素 SV 的工业生产者,其衍生物长期以来一直是抗分枝杆菌的一线药物。为了对这种重要的工业菌株进行基因改造,过去几十年来人们付出了很多努力,我们实验室成功开发了一种基于同源重组的方法,但该方法需要使用抗生素抗性基因进行正向选择,并且不支持方便的无标记基因删除。在本研究中,我们利用成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 系统在 A. mediterranei U32 中建立了基因组编辑系统。具体来说,土拉弗朗西斯菌亚种。 novicida Cas12a (FnCas12a) 基因首先整合到 U32 基因组中,在 CRISPR RNA (crRNA) 的指导下产生靶向特异性双链 DNA (dsDNA) 断裂 (DSB)。然后,DSB 可以通过非同源 DNA 末端连接 (NHEJ) 系统或同源定向修复 (HDR) 途径修复,分别在靶基因中产生不准确或准确的突变。除了 A. mediterranei 之外,本研究还可能为 Amycolatopsis 属其他物种中 CRISPR 辅助基因组编辑系统的开发提供启示。
目前,人们普遍认为,核分类学中95-96%的平均核苷酸身份(ANI)值等于70%的数字DNA -DNA杂交(DDDH)值。然而,在本研究中,对29对杏仁核类型菌株的比较基因组分析表明,基于木乃伊超快速校准工具(动画)的70%DDDH值与95-96%的ANI相对应,但大约对应于96.6%的动画价值。基于这种相应的关系,表型和化学特征,以及系统发育分析,从Cynara scolymus的根际土壤中分离出的活化细菌菌株HUAS 11-8 t受到多位分类特征的影响。基于ezbiocloud的对准,发现Huas11-8 t菌株的16S rRNA基因相似性为99.78%,而R. Rhizosphaerae JCM 32589 t,97.8%,dongchuanensis yim 75904 t和<97.8%sequence sequencesis sequence sequence and amycolaties和其他AmycoL和其他AmycOl和其他Amycol,对16S rRNA基因序列和全基因组序列的系统发育分析表明,HUAS 11-8 T菌株密切相关
图 1. 6,6'-二硝基-2,2'-联苯甲酸。两个芳环由单键连接,这通常允许环围绕键轴自由旋转。但羧基和硝基在空间上干扰旋转,导致不可叠加的“阻转异构体”。顶部:化学结构的常见表示;底部:粗线表示芳环不是平面的。一些天然存在的具有药用特性并用于药物治疗应用的阻转异构体的例子包括从热带蕨类植物 Kniphofia foliosa 根中获得的化学结构相对较小的白三烯代谢选择性抑制剂 Knipholone(图 2 )[2],以及从土壤细菌 Amycolatopsis orientalis(东方链霉菌)中获得的化学结构非常大的抗生素万古霉素(图 2 )[3]。
摘要:三氟甲基(–CF 3)组代表药物中高度普遍的功能。在过去的几十年中,在三氟甲基化的合成方法的发展中取得了重大进展。相比之下,目前尚无已知的金属酶可以催化C(SP 3)–CF 3键。在这项工作中,我们证明了一种非血红素铁酶,羟基苯甲酸酯合成酶来自杏仁核东方(aohms),能够从高度碘(III)试剂中产生CF 3的自由基,并指导它们以辅助性烯烃丙烯酸烷烯三氟甲酰胺甲氮化酶。建立了基于Staudinger Liga的高通量筛选(HTS)平台(HTS)平台,从而实现了对这种物质转化的AOHMS变体的快速评估。最终优化的变体接受一系列烯烃底物,产生三氟甲基氮化产物的产物,产量高达73%和96:4对映体比率(E.R.)。生物催化平台可以通过改变碘(III)试剂来进一步扩展到烯烃五氟乙基氮化氮化和重氮化。另外,阴离子竞争实验为这种生物学转变提供了对根本反弹过程的见解。这项研究不仅扩大了金属酶的催化库,以进行根本转化,而且还为有机氟的合成创造了新的酶促空间。
马胎盘炎:诊断和治疗方法 Aime K. Johnson,DVM,DACT 奥本大学兽医学院 美国阿拉巴马州奥本 引言 胎盘炎是马业流产和死产的主要原因,可占所有晚期流产和新生儿死亡的近 1/3。这会造成马驹死亡和繁殖季节损失,从而造成重大的经济损失。因此,及时诊断和治疗对于挽救怀孕至关重要。 病理生理学 在大多数情况下,通过宫颈上行感染是迄今为止最常见的感染途径。传染性生物通常通过宫颈进入并感染绒毛膜尿囊。这会导致炎性细胞因子增加,进而导致前列腺素释放。这种炎症反应会引发分娩级联反应,最终导致胎儿早产。对于上行感染,宫颈星受影响最严重,因为感染始于此处,然后向子宫体移动。常见病原体包括兽疫链球菌、大肠杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯氏菌、葡萄球菌属或真菌(念珠菌属或曲霉菌属)。这种传统途径的一个显着例外是诺卡氏菌样胎盘炎。85% 的诺卡氏菌样胎盘炎是由 Amycolatopsis spp. 和 Crossiella. equi 引起的,它们是革兰氏阳性分枝放线菌。感染途径目前未知,但病变不是位于宫颈星,而是位于子宫分叉处。这些细菌会导致浓稠的棕褐色渗出物,并且经常无法诊断,因为宫颈星区域保持正常。临床症状临床症状通常在疾病发展到很晚期时才会出现,这使得成功治疗更加困难。母马往往是高龄的经产母马,并且会阴构造往往较差。与胎盘炎相关的最常见临床症状是在母马的预产期之前出现乳房早熟。这种乳房发育是母马对产驹级联开始的反应,为即将分娩的胎儿做准备。第二种最常见的临床症状是外阴分泌物。这不是一个一致的发现,因为分泌物的量各不相同。当检查母马是否乳房早熟时,应仔细检查其尾巴下面是否因外阴分泌物而导致尾毛缠结。外阴分泌物的存在可能有助于将胎盘炎与乳房早熟的另一个主要原因——双胞胎区分开来。诊断超声波应对母马进行全面的身体检查。她们很少会因胎盘炎而全身不适或发热。此时应进行彻底的妊娠检查。经直肠触诊可通过胎儿运动和宫颈完整性来评估胎儿活力。经直肠尾部生殖道超声检查已成为胎盘炎最常用的诊断方法之一。评估宫颈星形区域的胎盘可以检测出胎盘异常,例如厚度或脱落区域。将超声探头放在直肠中线附近(根据胎儿的位置,可以放在左侧或右侧),可以找到子宫动脉。可以在动脉和尿囊液之间测量子宫和胎盘的总厚度 (CTUP)(图 1)。应进行多次测量,取厚区域和薄区域的平均值以获得准确的评估。测量值应符合以下指导原则: