摘要:在基因组工程中,传入 DNA 的整合依赖于分裂细胞产生的酶,这一直是提高 DNA 插入频率和准确性的瓶颈。最近,据报道,使用 CRISPR 相关转座酶 (CAST) 的 RNA 引导转座在大肠杆菌中非常有效且具有特异性。在这里,我们开发了 Golden Gate 载体来在丝状蓝藻中测试 CAST,并证明它在鱼腥藻属菌株 PCC 7120 中有效。含有 CAST 和工程转座子的相对较大的质粒通过使用自杀或复制质粒的结合成功转移到鱼腥藻中。编码靶标前导链但不编码反向补体链的单向导 (sg) RNA 与 sgRNA 中包含的原间隔子相关基序 (PAM) 序列有效。在对两个不同靶位点进行分析的六种病例中,有四种的插入位点位于 PAM 之后正好 63 个碱基处。复制质粒上的 CAST 具有毒性,可用于治愈质粒。在分析的所有六种情况下,只有由从左到右元素的序列定义的转座子货物被插入目标位点;因此,RNA 引导的转座是由剪切和粘贴引起的。没有内源转座子通过暴露于 CAST 酶而重新动员。这项工作为通过 RNA 引导的转座在丝状蓝藻中进行基因组编辑奠定了基础,无论是在培养中还是在复杂群落中。关键词:鱼腥藻、CRISPR 相关转座子 (CAST)、基因组工程、RNA 引导的转座、minion 测序、从头基因组组装 ■ 简介
预计将在即将到来的12月举行的摘要船员任务。短期住宿后,希望永久存在能够实现大量的科学发现。这将需要为工作人员提供生命支持的消耗品,数量太大而无法从地球进口。这些消耗品的一部分可以在现场生产生物处理,但是不必进口原料。正在考虑的解决方案在于使用重18zotrophic,岩石 - 酸性蓝细菌作为主要生产者:喂养现场自然可用的材料,它们将提供其他生物所需的营养。这个概念最近已经取得了动力,但是由于缺乏贡献团队的一致性,尤其是共享模型有机体,进步会减慢进步。希望解决这个问题,我们介绍了为选择当前模型所做的工作。我们从怀旧家族的预选菌株开始。对Anabaena sp的基因组进行了测序。PCC 7938(唯一尚未可用的人)我们比较了菌株的基因组数据,以确定其相关性并提供对其生理学的见解。然后,我们评估并比较了相关特征:Chie ply,它们利用Martian Regolith营养素的能力,它们对高氯的耐药性(Regolith中存在的有毒化合物)以及作为中学生产者的原料(在这里是异养细菌和较高植物)。这导致选择了Anabaena sp。PCC 7938,我们建议作为模型蓝细菌,用于开发基于火星的Natu-Natu-lal资源。
摘要:不饱和二酰基甘油是一类抗氧化剂化合物,具有积极影响人类健康的可能性。他们通过根治性的清道夫活动能够打击氧化应激的能力强调了其在预防和治疗策略的背景下的意义。在本文中,我们强调了Anabaena flos-aquae作为不饱和单甘油和二酰基甘油的生产国的作用,然后证明其甲醇提取物的抗氧化活性,其主要成分是各种乙酰甘油类似物。使用可持续策略揭示了这一发现,其中一种菌株在微观中,许多化合物(OSMAC)培养与生物信息学方法结合,以使用分子网络分析来分析大量质谱数据数据集。此策略减少了时间和成本,避免了纯净的纯净步骤,并获得有关提取物代谢组成的信息数据。这项研究强调了Anabaena作为新型生物活性化合物的可持续和绿色来源的作用。
应有两个理论(Paper-I和Paper-II)。每个携带75分和一张实用纸,在三年综合学位课程时间的第1年检查中携带50分:3小时] Paper-I和Paper-II的说明[完整分数:751。问题编号。我将是强制性的,由15项客观类型问题组成,涵盖了教学大纲的A组和B组部分。客观类型问题将有一个陈述,四个可能的答案标记为A,B,C和D,其中只有一个是正确的答案。15分2。每个组(A和B)将既有简短的答案类型问题,又有长答案类型的问题。候选人必须在每个组中回答两种类型的问题。3。简短的答案类型问题将有8个项目,其中5个项目应在四个/五个句子中回答。30分4。长答案类型问题将是常规类型,必须从提供的3个选项中回答一个问题。30标记论文 - I组 - A:加密藻藻类:(1)藻类的一般特征和分类,(2)氰基科的一般特征,参考振荡器和iVularia和ivularia,nostoc,nostoc,anabaena,anabaena,(3)以下一代的结构和生活历史,参考了以下一代的结构和生活历史:cara carne of Chara,cara cara,cara,cara,care con,cole con,cole con,ogologogogogogogogogologogogogogogogogogoln Ectocarpus,Fucus,Batrachospermum和Polysiphonia。(4)藻类经济学重要性的研究。地衣:一般帐户。真菌:(1)真菌的一般角色分类和经济重要性,(2)以下属的结构和生活历史:同步性,Albugo,Erysiphe,Peziza,Peziza,Ustilago,Puccinia,externaria,externaria和cercospora。
理论Syllabus子代码:BOT 101教学:45小时(4小时/周)末期学期检查:3hrs(80 m)会话持续时间检查持续时间:1小时(20m)学期检查:80 M课程检查:80 M课程检查:20 M大杆菌,放线菌的简短说明。(4H)2。蓝细菌:一般特征,细胞结构,thallus组织及其(6H)作为生物肥料的意义,特别参考了振荡器,Nostoc和Anabaena。3。地衣:结构和繁殖:生态和经济重要性。(5H)单元-II 11小时4。病毒:结构,复制和传播;由病毒引起的植物疾病以及(7H)对烟草和米龙的控制。5。细菌:结构,营养,繁殖和经济重要性。由细菌引起的(8H)植物疾病的植物疾病,参考棉和大米的细菌枯萎病。6。支原体的一般描述,指的是brinjal和木瓜叶卷曲的小叶子
paper-i;微生物学和微生物多样性实用-I(4小时/周)1。微生物实验室标准和安全协议。2。简单和复合显微镜的研究。3-4。微生物实验室基本设备的工作原理和操作(高压灭菌,热空气烤箱,孵化器,层流空气流量系统,膜过滤器,菌落柜台,菌落计数器,pH表,分光光度计,比色计,涡流搅拌机,磁性搅拌器)。5。基本微生物工具的应用(移液器,微管,接种环和针头,撒布机,软木鲍尔)。6。制备污渍和媒元 - 甲基蓝,水晶紫,safranin,nigrosin,carbol fuchsin,carbol fuchsin,孔雀石绿色,革兰氏碘和棉蓝色。7。细菌的简单(直接和间接)染色。8。革兰氏染色和内孢子染色。9。通过悬挂滴法观察细菌运动。10。通过微米测量微生物细胞的大小11。研究蓝细菌,微囊藻,阿纳巴氏菌和螺旋藻。12。藻类螺旋藻,硅藻和gracilaria的研究。13。fungi-rhizopus,曲霉,agaricus和fusarium的研究。14。原生动物 - 尤格纳和黑晶的研究。15。病毒研究; T4噬菌体,TMV和流感病毒。
摘要。蓝细菌生物多样性代表了潜在发现新的有前途微生物物种的重要储藏。这项研究的目的是探索蓝细菌的多样性,并确定位于Zhetysu地区的Zharkent地热春季中发现的耐热物种。在从春季开始抽水时,温度达到75-80°C。在溪流周围鉴定出微生物聚集的形式的蓝细菌垫。九种蓝细菌种类,包括synechococcus,phormidium,gloeocapsa,uscillatoria,fischerella和nostoc。在居住在温泉的蓝细菌中,有44%是非核形式,而其余的则表现出杂化特性或作为单细胞生物存在。振荡量最为主要的,包括四个物种,其次是三个物种的阶次。从地热弹簧中分离出蓝细菌的纯培养物,例如eSciltotoria formasa,nostoc cuminca,nostoc cumince,anabaena cylindrica和fischerella thermalis。在不同温度下,对这些培养物进行了Thermotolext56rance评估。所有检查的菌株在45-50°C时表现出高生长速度,在55和60°C下的增长速度下降。最佳生长温度为45-50°C,除了Fischerella Thermalis菌株,该菌株在60°C下显示活性生长。获得的结果强调了分离菌株在生物技术中的潜在应用。
测试的代表性微生物:(部分概要)HyGenesis 系统:细菌 醋酸钙不动杆菌 1 真菌 黑曲霉 基于独特的抗菌技术,可有效控制各种处理物品和基质上的细菌、真菌、藻类 枯草芽孢杆菌 烟曲霉 和酵母。抗菌活性物质是在美国环境保护局和全球类似监管机构注册的猪布鲁氏菌 杂色曲霉 布鲁氏菌 出芽短梗霉 伯克霍尔德菌 洋葱毛壳菌。这种抗菌剂已安全有效地使用了三十多年。产气荚膜梭菌 镰刀菌 鲍氏棒状杆菌 粉红粘帚菌 本表是应众多要求编制的,要求提供该技术有效的微生物清单。我们选择了大肠杆菌 ATCC 23266 白色青霉菌,以提供测试谱,其中大肠杆菌 1 黄青霉菌 代表所有重要类型和猪嗜血杆菌 柑橘青霉菌 微生物种类。流感嗜血杆菌 秀丽隐杆线虫 肺炎克雷伯菌 ATCC 4352 绳状青霉 干酪乳杆菌 腐殖质青霉 乳酸明串珠菌 青霉菌 单核细胞增多性李斯特菌 变异青霉 耐甲氧西林葡萄球菌 金黄色葡萄球菌 黑根霉 微球菌 sp. Stachybotrys atra 耻垢分枝杆菌 黄木霉 结核分枝杆菌 趾间毛癣菌 痤疮丙酸杆菌 须毛癣菌 奇异变形杆菌 藻类 奇异变形杆菌1 鱼腥藻 B-1446-1C 普通变形杆菌 小球藻 铜绿假单胞菌 Gium sp. LB 9c 铜绿假单胞菌 PRD-10 波恩颤菌 LB143 铜绿假单胞菌 1 胸膜球菌属 LB11 洋葱假单胞菌 四尾假单胞菌 细长月牙藻 B-325 猪霍乱沙门氏菌 团藻属 LB 9 伤寒沙门氏菌 酵母菌 金黄色葡萄球菌(无色素)1 白色念珠菌 金黄色葡萄球菌(有色素)1 酿酒酵母 表皮葡萄球菌 1 病毒 粪链球菌 禽流感 变形链球菌 HIV B 万古霉素耐药肠球菌 (VRE) 甲型流感 野油菜黄单胞菌 SARS
技术 HPLC、IC、GCMS、ICPOES、分子克隆、蛋白质印迹、凝集素印迹、酶动力学、生物反应器培养(大肠杆菌、微藻、蓝藻)、共聚焦显微镜、流式细胞术、实时 qPCR、PCR、SDS PAGE、提取(蛋白质、氨基酸、脂肪酸、色素、碳水化合物、PHB) 出版物 Kriechbaum R.、Kronlachner L.、Limbeck A.、Kopp J.、Spadiut O.;迈向循环经济——利用小球藻重新利用马铃薯加工行业的副产品。环境管理杂志 (2024)。DOI:https://doi.org/10.1016/j.jenvman.2024.121796 Kriechbaum R.、Spadiut O.、Kopp J.;普通小球藻对呋喃化合物的生物转化——揭示生物技术潜力。微生物(2024)。 DOI:https://doi.org/10.3390/microorganisms12061222 Grivalský T、Lakatos GE、Štěrbová K、Manoel JAC、Beloša R、Divoká P、Kopp J、Kriechbaum R、Spadiut O、Zwirzitz A、Trenzinger K、Masojídek J (2024)集胞藻 MT_a24 在水道池中利用城市废水生产聚-β-羟基丁酸酯。应用微生物学与生物技术 108 (1):1- 12。doi:10.1007/s00253-023-12924-3 Kriechbaum R、Loaiza SS、Friedl A、Spadiut O、Kopp J (2023) 利用小球藻产生的稻草衍生的半纤维素水解物:为生物精炼方法做出贡献。应用藻类学杂志。doi:10.1007/s10811-023-03082-0 Doppler P、Kriechbaum R、Spadiut O (2022) 使用流式细胞术对丝状蓝藻 Anabaena sp. 进行高通量表征。微生物学方法杂志 199:106510。 doi:10.1016/j.mimet.2022.106510 Doppler P、Gasser C、Kriechbaum R、Ferizi A、Spadiut O (2021) 使用超声增强 ATR-FTIR 光谱探针对光生物反应器培养的集胞藻中的聚羟基丁酸酯进行原位定量分析。生物工程 8 (9):129 Doppler P、Kriechbaum R、Käfer M、Kopp J、Remias D、Spadiut O (2022) Coelastrella terrestris 用于生产 Adonixanthin:生理表征和次级类胡萝卜素生产力评估。 Marine Drugs 20 (3):175 Doppler P, Kriechbaum R , Singer B, Spadiut O (2021) 使微藻培养物再次无菌——利用荧光激活细胞分选的快速简便的工作流程。微生物方法杂志 186:106256。doi:https://doi.org/10.1016/j.mimet.2021.106256 Kriechbaum R , Ziaee E, Grünwald-Gruber C, Buscaill P, van der Hoorn RAL, Castilho A (2020) BGAL1 耗竭可提高 N. benthamiana 中 N- 和 O-聚糖的 β-半乳糖基化水平。植物生物技术杂志 18 (7):1537-1549。 doi:10.1111/pbi.13316 会议和研讨会 AlgaEurope – 希腊雅典 12/2024 海报展示:“循环水产养殖中的小球藻 – 鱼类废水中分析物的定量和预测”研讨会 Kreislauf Alge – Vom Abwasser zur Ressource 06/2024 口头报告和联合主持人
藻类品种包括海藻,池塘浮渣和海带都来自同一个家庭。这些生物的植物样特征如叶绿体,可以进行光合作用的LIK植物。有些藻类还鞭毛和中心藻,在饲料习惯方面,它们与动物更相似。藻类范围从微小的单细胞生物到大型多细胞类型,它们生活在各种环境中,包括盐水,淡水,湿土或潮湿的岩石。较大的藻类物种通常被称为简单的水生植物。硅藻是盐水环境中最丰富的浮游生物类型,人数超过金棕色藻类。没有细胞壁,硅藻具有称为浮雕的二氧化硅壳,其形状和结构取决于物种。金棕色藻类虽然不太常见,但被称为纳米膨胀,仅由50微米的细胞组成。消防藻类,也称为鞭毛藻,是单细胞的,当它们大量盛开时会引起红潮,在海洋中以红色的色调出现。某些吡咯烷物种是生物发光的,导致水在夜间发光。鞭毛藻是有毒的,会产生可破坏人和其他生物体肌肉功能的神经毒素。与鞭毛藻类似的Cryptomonads也可能会产生有害的藻华,将水变深褐色或红色。netrium desmid是在淡水和盐水环境中发现的单细胞绿藻类的顺序,在具有对称结构的长丝状菌落中生长。绿藻主要居住在淡水中,但也可以在海洋中找到。F.E.它们具有由纤维素制成的细胞壁,并含有叶绿体,使它们可以进行光合作用。多细胞种类的绿藻形成菌落,从四个细胞到几千个细胞。用于繁殖,一些物种与一个鞭毛一起游泳的非运动型植物孢子或Zoospores。绿藻类的类型包括海莴苣,马毛藻和死者的手指。红藻通常在热带海洋位置发现,生长在珊瑚礁等实心表面或附着在其他藻类上。它们的细胞壁由纤维素和各种碳水化合物组成。红藻通过产生由水流携带的单孢子直至发芽的单孢子。他们还经历了有性繁殖和几代人的交替。不同种类的红藻形成不同的海藻类型,例如以其优雅的外观而闻名的plumaria elegans。海带是在水下海带森林中发现的一种棕色藻类。棕色藻类是最大的藻类类型之一,由在海洋环境中发现的各种海藻和海带组成。它们具有分化的组织,包括锚固器官,浮力的空气口袋,茎,光合器官以及产生孢子和配子的生殖组织。棕色藻类的生命周期涉及世代的交替。一些棕色藻类的例子包括萨尔加苏姆杂草,岩藻和巨型海带,它们的长度最高可达100米。黄绿色藻类是藻类的最少种类的类型,只有几百种,它们是单细胞生物,具有由纤维素和二氧化硅制成的细胞壁。藻类是具有类似于植物的特征的生物。它们最常见于水生环境中,藻类有七种主要类型,每个藻类具有不同的特征。绿藻通常生活在淡水中,而红绿色藻类则生活在新鲜和盐水环境中。本文解释了藻类的不同类型,包括它们的独特特征和栖息地。它还讨论了藻类作为包含植物样特征并具有光合作用的生物的重要性。藻类的大小差异很大,范围从单细胞到大型多细胞物种,并且可以在不同的水生环境以及潮湿的表面上找到。与较高的植物不同,它们没有根,茎,叶或花朵,并且缺乏血管组织。藻类作为主要生产者在水生生态系统中起着至关重要的作用,它是盐水虾和磷虾等各种海洋生物的食物来源。他们通过性和无性恋方法繁殖,一些物种经历了世代的交替。繁殖方法通常取决于温度,盐度和营养供应性等环境因素。Fritsch分类藻类基于色素沉着,thallus结构,储备食品,鞭毛和繁殖方式。藻类的两种主要类型是叶绿素(绿藻)和Phaeophyceae(棕色藻类)。叶绿素科包括约7,000种,主要在具有海洋形式的淡水环境中发现。他们通过性,无性和营养方法繁殖。它们表现出各种结构,例如单细胞,殖民地,丝状和管状形式。绿藻由于含有不同颜料的叶绿体而能够进行光合作用。它们的颜色范围从黄绿色到深绿色,它们具有线粒体,带有平坦的Cristae,中央液泡和由纤维素和果胶制成的细胞壁。Phaeophyceae由大约2,000种生活在海洋环境中。它们的特征是由于高水平的岩甘氨酸而引起的棕色着色,这是诸如Chl-A,C,Carotenes和Xanthophylls之类的光合色素的另一种存在。他们的植物体被分为固定的锚固,长期存在的stipe,lamina或frond可能是一年。海带或海藻在这一组中是显着的较大形式,其中一些物种达到了相当大的尺寸,例如大环(30-60m),使其成为最大的海洋植物。这些藻类包含由纤维素和藻类等多糖制成的细胞壁,纤维素和藻类酸是一种复杂的多糖,有助于保护它们免受各种环境因素的侵害。棕色藻类包含锚定器官,茎,光合器官以及发展孢子和配子的生殖组织。,他们以拉米那肽和甘露醇的形式保留食物,如在拉米那尼亚,大环,内囊等物种等物种中所见。红色藻类具有植物蛋白酶和植物素色素,使它们的颜色显得红色,尤其是在更深的水域中。这些生物可以由于这些色素而吸收蓝绿色的光谱,从而使它们在更大的深度繁殖。一个例子是液泡。大多数红藻是光自人营养的,但有一些例外,例如Harveyella,它生活在其他红藻类上。它们的细胞壁由纤维素,果胶和硫酸化植物胶体(如琼脂)组成。红藻中的thallus组织可以从单细胞到类似蕾丝的结构不等。这些生物可以保留食物为佛罗里达淀粉,在Gonyostomum和Chattonella等物种中发现。黄绿色藻类是最少的多产量,只有450-650种。它们主要是单细胞的,具有纤维素 - 硅细胞壁,用于运动的鞭毛以及缺乏某些色素的叶绿体。Xanthophyceae通常形成细胞的小菌落,并具有用于运动的鞭毛。他们将食物保留为脂肪,主要是在具有盐水适应的淡水环境中发现的。他们的性繁殖很少见。菊科是单细胞或殖民地鞭毛物,包括各种类型的球形,衣壳,丝状,丝状,变形虫,质子和实质形式。大约12,000种菊科,主要是居住在淡水环境中,其中一些在盐水栖息地中发现。这些微生物的特征在于诸如叶绿素A,P-胡萝卜素和叶黄素等色素。黄金藻类以脂肪的形式存储能量,很少经历有性繁殖,并产生称为囊肿的专门静息细胞。运动形式具有一两个不同类型的鞭毛:金属丝或鞭打。chrysocapsa,lagynion,ochromonas,chrysamoeba是金藻的例子。例子包括气旋,thalassiosira,Navicula和Nitzschia。接下来,芽孢杆菌科(硅藻)由约12,000至15,000种。这些微生物在显微镜下显示为鼓形细胞,并带有一些形成的链。硅藻以脂肪的形式存储能量,并经历广泛的有性繁殖。它们具有由果胶和二氧化硅组成的硅化细胞壁,存在于淡水,海洋和陆地环境中。隐藻科是单细胞鞭毛形式,约有200种。在光学显微镜下,它们以红色或红色颜色的逗号形细胞出现。Cryptophyceae以淀粉的形式存储能量,具有由纤维素组成的细胞壁,并具有两个不等的鞭毛。罕见的异恋性繁殖发生在这些生物体中,居住在淡水和海洋环境中。例子包括plagioselmis,falcomonas,rhinomonas,teleaulax和chilomonas。Dinophyceae是大约200种的运动单细胞生物。他们的主要色素包括叶绿素a和c,β-胡萝卜素和叶丁香。罕见的异恋性繁殖发生在这些生物中,这些生物主要居住在海洋环境中,但有些存在于淡水中。Dinophyceae以淀粉或脂肪的形式存储能量。例子包括Alexandrium,Dinophysis,Gymnodinium,Peridinium,Polykrikos,Noctiluca,Ceratium和Gonyaulax。叶绿素科是具有鲜绿色色谱和过量叶丁香的单细胞生物。他们以脂肪的形式存储能量,并具有双足动动物形式。这些微生物仅居住在淡水环境中。euglenineae是具有光合色素的运动单细胞或殖民地生物,例如叶绿素a和b,β-胡萝卜素和木蛋黄酱。他们以淀粉或脂肪的形式存储能量,并具有类似于微观动物的裸纤毛生殖器官。有性繁殖尚未得到这些生物的明确证明。尤格伦氨酸中不存在细胞壁,其中一种或多种金属丝类型。一个例子是Euglena。最后,蓝藻科或粘菌科(蓝绿色藻类)由单细胞,殖民地或多细胞体组成,具有原核核和双膜性线粒体和叶绿体。这些微生物居住在各种环境中,并具有多种特征。颜料在蓝藻科的独特蓝色中起着至关重要的作用,植物蛋白蛋白是主要的贡献者。这组藻类缺乏运动阶段,而以氰基雄雄或粘菌糖淀粉的形式存储食物。它们的细胞壁由果胶或纤维素组成。在许多蓝绿色藻类物种中常见的独特特征,例如“假”分支和杂环。在蓝菌科中没有有性繁殖,无处不在,到处都可以找到。这些生物的例子包括Nostoc,振荡器,Anabaena,Lyngbya和Plectonema。藻类是主要生产者,利用叶绿素A和B进行光合作用,并且具有确定其颜色的各种色素。藻类通常被错误地考虑到植物或生物。然而,某些物种可以产生有毒的花朵,例如红潮,蓝绿色藻类和蓝细菌,对人类健康,水生生态系统和经济构成重大威胁。藻类有多种类型的藻类,包括绿藻(绿藻),Phaeophyceae(棕色藻类),rohodophyceae(红藻类),Xanthophyceae(黄绿色藻类)和氰基藻科和粘液菌科或粘粒细菌(蓝绿色藻类)。这些生物可以大致分为三个大藻类:棕色藻类,绿藻和红藻。