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RNA2024 - 爱丁堡
PLENARY and CONCURRENT SESSIONS Bioinformatics & Genomics Chromatin & Epigenetics Chemical Biology of RNA New Technologies Extracellular RNA Granules & Condensates High through-put discovery Interconnected RNA Processes Long Non-coding RNAs & Circular RNAs Origins of Life and evolution Regulatory RNAs in Bacteria & Archaea Ribosome Biogenesis & Modification Ribozymes & Riboswitches RNA & Cellular Immunity RNA & Disease RNA Modification & Editing RNA Nanotechnology RNA Structure, Folding & Modeling RNA Synthetic Biology & Systems Biology RNA Transport & Localization RNA Turnover RNPs: Biogenesis, Structure & Function Polyadenylation & 3′ end formation Small Non-coding RNAs in Eukaryotes Splicing Mechanism Splicing Regulation & Alternative用于治疗和诊断转录的靶向RNA靶向RNA：机理与生物学翻译机制翻译调节tRNA：处理和功能病毒RNAS
基于 CRISPR/Cas 的诊断和基因治疗
在过去的几十年里，位点特异性DNA结合蛋白极大地改变了生物技术和医学研究领域。然而，由于开发针对特定靶位的DNA结合蛋白的复杂性，基因编辑通常需要蛋白质工程师[1]。CRISPR/Cas技术的进步极大地扩展了生物研究人员的分子工具箱[2]。CRISPR/Cas系统是在细菌和古细菌中发展起来的一种适应性免疫系统，可用于防御外源遗传元件。在细菌和古细菌中，进化的Cas蛋白可以切割入侵病毒和质粒的核酸[1]。此外，细菌细胞可以使用CRISPR-Cas系统保护自己免受再次感染。CRISPR/Cas通过插入一小段外源DNA在第一次感染防御后赋予一种免疫记忆[3]。因此，CRISPR-Cas系统可以为宿主提供保护
10种微生物
微生物是没有显微镜的微小生命形式。他们约占地球生物的60％。“微生物”一词是指各种微观生物，包括细菌，真菌，病毒，古细菌和生物。这些微生物可能对人类无害或有害。一些微生物会引起严重的感染和疾病，而另一些微生物有助于维持环境平衡。古细菌是单细胞原核生物，具有与细菌不同的细胞壁结构。它们包含独特的脂质，使它们能够在极端环境中蓬勃发展。古细菌也可以在人类的肠道和皮肤中找到。微生物，包括微生物，是作为单细胞或簇存在的微观生命形式。有七种主要类型：细菌，古细菌，原生动物，藻类，真菌，病毒和多细胞动物寄生虫（Helminths）。古细菌由于其独特的细胞壁结构和缺乏肽聚糖而与真实细菌区分开。它们是可在极端条件下生存的原核细胞。一些古细菌组包括甲烷基因，卤素，热疗法和精神病/冷冻剂。这些生物使用各种能源，例如氢气，二氧化碳，硫或阳光（光营养形式）来存活。真核生物是包含核和复杂细胞器的单细胞或多细胞细胞。他们使用专业结构通过光合作用或吸收/摄入获得滋养。大多数真核细胞具有真实的核，并且主要是多细胞的。在数量，生物量和多样性方面，最大的微生物群是真核生物。鞭毛使用类似鞭子的结构进行运动；纤毛具有微小的跳动头发； Amoeboids采用伪虫； Sporozoans是非运动的。由几丁质组成的细胞壁支持各种营养方法：分解器吸收有机材料，共生体与植物形成关系，寄生虫与宿主有害相互作用。真菌产生称为菌丝的丝状管，骨料形成菌丝体。繁殖是通过释放孢子而发生的。非细胞实体由核酸核心组成，这些核酸核心被蛋白质涂层包围，缺乏繁殖外宿主细胞或独立代谢的能力。他们可以感染原核细胞和真核细胞，从而导致疾病。真核生物（如扁虫和round虫）共同称为蠕虫，在技术上不是微生物，而是微生物生命阶段，对于临床目的而言很重要。微生物的生物实体太小，无法用肉眼看到。例子包括细菌，古细菌，藻类，原生动物和微观动物（如尘螨）。尽管它们的重要性，但这些生物在历史上被低估了，直到Antonie van Leeuwenhoek发明了显微镜。发现微生物的发现使路易斯·巴斯德（Louis Pasteur）意识到许多疾病是由它们引起的，促进了巴氏杀菌的实践以确保食品安全。今天，我们认识到微生物在各种环境中的作用，包括水，土壤，动物皮肤和消化道。这种理解强调了免疫系统在预防疾病中的重要性。微生物在生态系统中起着重要作用，就像其他生物一样。细菌，特别是与引起疾病的病原体有关，但也具有帮助人类的有益特性。研究表明，古细菌与Eubacteria明显不同，甚至可能与人类更紧密相关。古细菌可以在各种环境中找到，包括水，土壤和我们的消化系统，它们有助于维持我们的健康。他们也可以在极端条件下繁衍生息，例如高温，酸度或咸味，使其成为温泉的常见居民和大多数生物体敌对的其他地区。几种动物物种以微观形式出现，包括节肢动物，旋转膜，loricifera，nematodes和原生动物。原生动物是一组单细胞的真核生物，其比细菌或古细菌的细菌更像动物和植物。它们会引起几种严重的人类疾病，例如疟疾，弓形虫病，贾第鞭毛虫，非洲卧铺疾病和chagas病。像酵母一样的微观真菌对人类无害，但在烘烤和酿造中起着至关重要的作用。酵母以糖为食，并将其转化为二氧化碳和乙醇，这会导致烘焙食品上升和发酵饮料变得陶醉。模具是微生物，与真菌具有某些特征但不是真正的真菌。它们包括感染植物并在过去引起毁灭性作物失败的致病霉菌。粘液模具是能够令人印象深刻的合作的单细胞生物，许多细胞聚集在一起以作为一个实体运行。科学家已经使用粘液模具来研究智能和解决问题。微观藻类曾经被认为是植物，但现在被认为是导致陆地植物的谱系的亲属。这些光合生物在整个历史中都很重要，有助于将氧气泵入大气中。藻类既可以通过清洁水，产生氧气或产生最终在我们的海鲜和饮用水中产生的有毒化合物来受益和伤害人类。科学家正在努力进行分类的其他许多微观生物。过去，许多微生物被聚集在“生物学家”的类别下，但是许多科学家现在认为该系统不足。在这里，科学家曾经使用文章文本，曾经使用一个称为“ Protista”的王国对无法识别为植物，动物或真菌的真核生物进行分类。然而，遗传分析揭示了该群体的许多成员与其他王国更紧密相关，而不是彼此之间的关系。不同的微生物可能对人类无害或有害，例如链球菌细菌，会导致链球菌喉咙和猩红热，以及乳酸杆菌，这有助于抵抗诸如胃流感之类的疾病。微生物提出的新发现已经根据光学显微镜研究推翻了先前的假设，揭示了对微生物的更复杂的理解。研究的进步导致了过去十年来我们对这些微小生命形式的理解的重大转变，并继续迅速发展。
让微生物活动起来的简单测试可能会促进寻找外星生命的努力
柏林工业大学研究员马克斯·里克莱斯说：“我们测试了三种微生物——两种细菌和一种古细菌——发现它们都向一种名为 L-丝氨酸的化学物质移动。这种运动被称为趋化性，可能是生命存在的有力指标，可以指导未来在火星或其他星球上寻找生物的太空任务。”
CRISPR/Cas 技术
答：CRISPR（成簇的规律间隔短回文重复序列）是存在于原核生物（如细菌和古细菌）基因组中的一类 DNA 序列。这些序列来自先前感染原核生物的病毒的 DNA 片段，用于在后续感染期间检测和破坏类似病毒的 DNA。因此，这些序列在原核生物的抗病毒防御系统中起着关键作用。
atoplex metabarcoding库准备用户手册
ATOPLEX METABARCODING用户手册为MGI定制产品平台上的测序进行多个PCR扩增提供了指导。荟萃编码通常用于物种分类，丰度分析和各种生物样品的比较研究。The barcodes frequently used for biodiversity assessment include prokaryotic 16S ribosomal DNA (for bacteria and archaea), eukaryotic 18S ribosomal DNA (for diverse eukaryotes such as plants, protists, and fungi), eukaryotic ITS ribosomal DNA (for fungi), mitochondrial COI gene (for a wide range of eukaryotes including animals and生物）和线粒体12S DNA（专门针对鱼）。This user manual is only applicable to the use of the library construction products described in this document: ATOPlex 16S V3V4 rDNA Primer Pool, ATOPlex 18SV4 rDNA Primer Pool, ATOPlex ITS1 rDNA Primer Pool, ATOPlex COI mtDNA Primer Pool, ATOPlex Ac12S mtDNA Primer Pool, ATOPlex MiFish Primer Pool, and ATOPlex DNA Dual Barcode Library Preparation测序套件。
除了研究
微生物学领域研究了肉眼太小的生命形式，无法检测到。任何对肉眼太小的生物实体都被认为是“微生物”。微生物生态学，分子生物学，免疫学，工业微生物学和生物技术只是在过去150年中出现的微生物学的较新分支。微生物学研究领域的所有这些新兴领域都帮助将受试者推向前进。微生物具有不同的形式和大小，可以在生命的三个领域（细菌，古细菌和eukarya）中找到。微生物宽阔是地球上最常见的生命形式。微生物包括细菌，古细菌，生物（包括原生动物和藻类），真菌，蠕虫（寄生虫）和病毒都是生物学剂的实例。此外，还有蠕虫和寄生虫需要考虑。生物不仅限于原生动物或藻类，还包括细菌和古细菌。大多数微生物都是有帮助的，例如那些有助于净化水和种植某些食物的微生物。其中许多生物对于全球环境的平稳功能也很重要。尽管某些细菌可能对某些动植物的健康有害，甚至有助于人类严重疾病的发展，但绝大多数人对于我们地球上存在的生态系统的适当运作非常重要。
多元化的农作物系统和受精策略对氮循环的土壤微生物丰度和功能潜力的影响
多样化的农作物系统和受精策略，以增强土壤微生物组的丰度和多样性，从而稳定其有益的服务，以维持土壤生育能力和支持植物的生长。在这里，我们在欧洲（荷兰，比利时，德国北部）的三个不同长期现场实验中进行了评估，是否多样化的农作物系统和受精策略也影响了其功能性基因丰度。通过定量PCR分析土壤DNA，以量化细菌，古细菌和真菌以及与氮（N）转化有关的功能基因；包括细菌和古细菌硝化（AMOA -BAC，ARCH），分别降解过程的三个步骤（NIRK，NIRS和NOSZ -Cladei，II）和N 2 Asmimi with（NIFH）。作物多样化和受精策略通常增强了土壤总碳（C），N和微生物丰度，但地点之间的变化。多样化的农作物系统和受精策略对功能基因的总体影响要比细菌，古细菌和真菌的丰度强得多。基于豆类的农作物系统不仅在刺激N固定微生物的生长方面具有巨大的潜力，而且在增强N循环的下游功能潜力方面也具有巨大的潜力。基于高粱
蓝藻生物修复重金属的分子见解：当前和未来的挑战
近年来，过度开采矿石和工业发展是环境中重金属释放的主要因素。结果，粮食作物和水体受到金属污染，可能对人类和其他生物的健康产生多种不利影响。这些金属和准金属，如锌、铜、锰、镍、铬、铅、镉和砷，会扰乱生物体内代谢物合成的生化途径，并导致不同疾病的病因。微生物包括细菌、古细菌、病毒和许多单细胞真核生物，它们可以跨越三个生命域——古细菌、细菌和真核生物——一些微生物，如蓝藻，在重金属的生物吸附率方面表现出很高的效率。蓝藻适合生物修复，因为它们可以在恶劣的环境中生长，对周围环境的负面影响较小，而且管理成本相对较低。蓝藻的结构没有显示出广泛的内部结合膜，因此它可以直接利用生理机制从污染地点吸收重金属。这种生化组成适合管理和生物修复污染环境中的重金属浓度。本综述旨在探索蓝藻在水体中重金属和准金属的生物修复潜力。此外，我们还确定了提高生物修复效果的前景。