甲烷古细菌是厌氧消化1中的甲烷生产商,它们是电力到气体过程中的生物催化剂2,它们是全球碳循环3中的重要参与者,甚至由天体生物学家研究4,5。氢化甲烷剂使用还原性乙酰-COA途径进行CO 2固定6,这是一种从CO 2合成有机碳的能节能途径和与乙蛋白酶中存在的途径相似的氢。然而,乙酸7与ATP与离子梯度投资的CO 2降低的甲烷生成方式之间存在细微的差异,并且在辅助因子利用率8方面存在差异8。因此,建议同时考虑乙蛋白原和甲烷剂,作为可能的宿主生物,用于从CO 2作为碳源生产燃料和化学物质。
微生物学轨道研究生物体在大多数情况下,肉眼不容易看到,包括藻类,古细菌,细菌,真菌,原生动物和病毒。微生物因引起疾病而臭名昭著,但微生物在维持人类健康和支持地球上的生活方面也起着关键作用。在微生物学轨道中,您将在医学,分子生物学,细胞生物学,遗传学,免疫学,生物技术,生态学和进化的背景下探索微生物。微生物学轨道为学生准备许多领域的职业,包括医学,农业,公共卫生,政府,环境科学,基础研究,教育,工业微生物学,食品微生物学和药物。
•任何基因修饰的(GM)动物,植物,无脊椎动物,水生生物,微生物,细胞或病毒载体。•任何非GM动物,植物,无脊椎动物,水生生物,细胞或微生物都包含转基因的微生物或转基因材料。•源自转基因生殖的所有生殖阶段和繁殖材料:配子,受精卵,胚胎,花粉,种子,幼虫。IBC - 机构生物安全委员会微生物的意思是:原生动物,真菌,古细菌,细菌,单细胞藻类,病毒,病毒,病毒,寄生虫或prion。在本文档中使用的情况下,微生物是指风险2组或转基因微生物,或已知或可能包含这些样品的样品。
肠道微生物组包括数万亿微生物,包括细菌,病毒,真菌和古细菌,它们通过各种信号通路积极与宿主积极通信。[3]持续的证据表明,这种复杂的肠道微生物网络在多种生理过程中起着至关重要的作用,包括免疫调节,营养代谢和神经递质的合成。此外,最近的研究通过迷走神经,免疫系统和微生物代谢产物的产生确定了肠道与大脑之间的双向通信。这种通信系统被称为肠脑轴,作为认知功能和神经退行性疾病(例如痴呆症)的潜在介体引起了人们的重大关注。
•任何基因修饰的(GM)动物,植物,无脊椎动物,水生生物,微生物,细胞或病毒载体。•任何非GM动物,植物,无脊椎动物,水生生物,细胞或微生物都包含转基因的微生物或转基因材料。•源自转基因生殖的所有生殖阶段和繁殖材料:配子,受精卵,胚胎,幼虫。IBC - 机构生物安全委员会微生物的意思是:原生动物,真菌,古细菌,细菌,单细胞藻类,病毒,病毒,病毒,寄生虫或prion。在本文档中使用的情况下,微生物是指风险2组或转基因微生物,或已知或可能包含这些样品的样品。
在实验室中生长微生物的能力可以使其遗传学的可重复研究和工程化。不幸的是,由于识别培养条件所需的努力,生命树中的大多数微生物仍然没有耕种。对指导实验测试的可行生长条件的预测将是非常可取的。虽然可以通过注释的基因在计算上预测碳和能源,但很难预测其他生长的要求,例如氧,温度,盐度和pH。在这里,我们开发了基于基因组的计算模型,能够预测氧耐受性(92%平衡精度),最佳温度(r 2 = 0.73),盐度(r 2 = 0.81)和pH(r 2 = 0.48),而新的分类微生物家族无需功能基因注释。使用15,596种细菌和古细菌的生长条件和基因组序列,我们发现氨基酸频率可预测生长需求。只有两个氨基酸可以预测氧气耐受性,其精度为88%。使用蛋白质的细胞定位来计算氨基酸频率改善了pH的预测(r 2增加0.36)。由于这些模型不依赖于特定基因的存在或不存在,因此可以将它们应用于不完整的基因组中,仅需要10%的完整性。我们应用模型来预测所有85,205种测序细菌和古细菌的增长需求,发现未养殖物种富含嗜热,厌氧菌和嗜酸菌。这项工作指导了对不同微生物实验室种植的生长限制的识别。最后,我们将模型应用于具有元基因组组装的基因组的3,349个环境样品,并表明社区中的个别微生物具有不同的增长需求。
菲律宾是生物多样性的热点,因为它的物种丰富性和特有性以及人为活动带来的物种和栖息地丧失的巨大威胁。虽然已经努力记录该国的动物和植物生物多样性,但只能说所谓的隐藏生物多样性 - 微生物世界。为了记录该国的总生物多样性的文献,我们对菲律宾描述的新型微生物进行了系统的文献综述。新型微生物是药物,环境和生物技术应用的化合物的潜在新来源,并且可以在许多生态系统过程中起关键作用;他们的持续发现和进一步的研究使科学界可以研究这些微生物,从而影响当地社区。我们的清单报道了古细菌,细菌,生物,藻类和真菌(包括地衣)的物种,这些物种是由菲律宾人或外国科学家从该国收集的标本中发现的。我们记录了708种新型物种,如2023年10月的文献报道。这些分组为古细菌(n = 12),细菌(n = 28),较低的真菌(n = 11),较高的真菌(n = 142),生物(n = 13),藻类(n = 251)和地衣(n = 251)。大多数发现的新型微生物都是从该国主要岛屿(尤其是吕宋岛)分离或收集的,这突出了许多领域,这些领域的微生物多样性研究有限或不存在。此外,研究还确定了阻碍菲律宾微生物分类法进展并提供解决方案的挑战。此清单是记录新型微生物物种的首次尝试,以此来提高人们对记录我们微生物生物多样性的认识的策略。
科学利益:了解蛋白质翻译起始因子,核糖体生物发生,ABC转运蛋白和多药耐药的结构功能关系。蛋白质翻译起始:古细菌的翻译起始被认为与真核病相似,而不是细菌。我们试图识别和理解古细菌中推定起始因素的结构功能关系(Gogoi等,2016,Gene; Srivastava等,2016,《理论生物学杂志》; Gogoi和Kanaujia; Gogoi and Kanaujia,2018年,2018年,科学报告和FEBS LETTLES; GOGOI LETTERS; GOGOI等,2019年GEN。 Biotechnology Journal;核糖体生物发生和抗生素耐药性:假设约200个因素与核糖体生物发生有关。其中,rRNA甲基转移酶通过修饰rRNA分子在核糖体生物发生中起关键作用,并且也已知与抗生素耐药性有关。我们的兴趣是了解对它们的结构功能关系和设计抑制剂。ABC进口商:ABC进口商仅在原核生物中鉴定出来,尽管也在少数植物中。因此,细菌ABC进口商被认为是潜在的药物靶标,也被用作药物输送系统,生物传感器和生物标志物。也已知它们参与耐药性。在这种情况下,我们一直在努力阐明少数ABC糖,金属,金属,脂质和抗菌肽等少数ABC的结构(Chandravansi等,2016,Gene; Mandal等,2019,2019,2019,Metalallomics; Metallomics; Metalolomics; Chandravanshi等,2019,Gene; Chandravanshi; Chandravanshi; Chandravanshi等人,2021年,FEBS Journal; 2021年,国际生物大分子杂志;
描述主要的微生物细胞结构,生长速率参数和代谢途径。(2)应用微生物细胞结构,生长和代谢的基本概念来理解致病性和共生性相互作用。(3)解释细菌,古细菌和真核生物之间的相似性和差异,并了解这些概念如何与这三个领域的进化历史相关。(4)使用无菌技术分离细菌培养物,并评估实验室中的微生物表型,生长参数和代谢能力。(5)描述并演示了评估微生物多样性和建立富集培养的方法。(6)在微生物学领域中了解和分析主要文献,并通过海报和实验室报告传达有关微生物实验的数据。
摘要:成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 相关内切酶 9 (CRISPR/Cas9) 基因编辑系统在许多细菌和古菌中发挥免疫抑制作用,具有高效、多样性和模块化等多种优势。它现在被广泛用于提高作物的质量和数量以满足全球粮食需求。尽管这些前景很诱人,但仍需要更深入的了解来提高其效率和安全性。因此,对这一特殊系统的概述非常重要。在这篇综述中,简要介绍了目前对不同类型的 CRISPR/Cas 系统的了解以及它们的机制、在作物育种中的应用和局限性,为未来的利用提供基本理解和指导。
