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两个单倍型解析的基因组揭示了大叶绣球花（Hydrangea macrophylla）的重要花朵特征以及对菊科植物进化的见解
绣球花属属于绣球花科，属于开花植物山茱萸目，该目早期在菊科中分化，包括几种常用的观赏植物。其中，大叶绣球是苗圃贸易中最有价值的物种之一，但这种作物或密切相关的菊科物种的基因组资源很少。绣球花品种“Veitchii”和“Endless Summer”的两个高质量单倍型解析参考基因组[最高品质为 2.22 千兆碱基对 (Gb)、396 个重叠群、N50 22.8 兆碱基对 (Mb)]被组装并支架到预期的 18 条假染色体中。利用新开发的高质量参考基因组以及其他相关开花植物的高质量基因组，发现核数据支持菊科植物演化支中的单个分歧点，其中山茱萸目和杜鹃花目均与真菊科植物分化。使用 F 1 杂交种群进行基因作图证明了连锁作图与新基因组资源相结合的强大功能，可以识别位于 4 号染色体上的花序形状基因 CYP78A5 和位于 17 号染色体上的导致重花的新基因 BAM3。本研究开发的资源不仅有助于加速绣球花的遗传改良，还有助于了解最大的开花植物群——菊科植物。
咖啡基因组提供了对咖啡因生物合成融合演化的见解
咖啡是一种有价值的饮料作物，由于其特征性的味道，香气和咖啡因的刺激作用。我们生成了该物种咖啡佳虫的高质量草稿基因组，该种类在Asterid被子植物中显示了保守的染色体基因顺序。尽管没有显示出在番茄等茄科物种中鉴定出的全基因组三重固定的迹象，但该基因组包括几种特定物种的基因家族膨胀，其中包括N-甲基转移酶（NMT）参与咖啡因生产，国防相关的基因，以及涉及碱性蛋白酶的二级混合物合成。咖啡因NMT的比较分析表明，这些基因通过可可和茶的基因独立于基因而扩展，这表明eudicots中的咖啡因是多形的起源。W