方法:这项在Jean Perrin中心进行的单中心研究将涉及50例UM患者的外显子组测序,这些患者在BAP1或MBD4基因中没有已知的致病变异。主要目标是鉴定UM患者中与遗传癌易感性相关的新型候选基因。将进行多步生物信息学分析,以识别感兴趣的基因。次要目标是探索已知与其他癌症有关的基因,这已经描述了紫抗体黑色素瘤的发生,但尚未完全建立关联。该研究已于2024年10月开始,患者招募持续了12个月。未计划随访期,但是遗传分析的持续时间估计为六个月,最终研究报告预计到2026年10月。
简介:液体活检是一种非侵入性方法,通过分析血液或其他体液中的癌症生物标志物来检测癌症并监测治疗反应。脑膜瘤是最常见的原发性中枢神经系统肿瘤,生物标志物在其诊断、预后和治疗监测中起着至关重要的作用。世界卫生组织 (WHO) 根据肿瘤等级和基因的分子改变对脑膜瘤进行分类,例如 NF2、AKT1、TRAF7、SMO、PIK3CA、KLF4、SMARCE1、BAP1、H3K27me3、TERT 启动子和 CDKN2A/B。液体活检,特别是游离 DNA (cfDNA) 分析,已显示出监测脑膜瘤的潜力,因为它可以检测血液中的 ctDNA 释放,不受血脑屏障的影响。还发现,microRNA (miRNA) 在各种癌症(包括脑膜瘤)中失调,具有作为诊断生物标记物的潜力。此外,研究肿瘤微环境中的细胞因子可能有助于建立脑膜瘤的预后或诊断组。
ABL1、ABL2、AKT1、ALK、APC、AR、ARAF、ARID1A、ARID1B、ATM、ATR、ATRX、BAP1、BARD1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BRIP1、C11orf65、CCND1、CDH1、CDK12、CDK4、CDKN2A、CDX2、CHEK1、CHEK2、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCL、FBXW7、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、FOXA1、FOXL2、GATA3、GNA11、GNAQ、GNAS、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、INPP4B、 JAK1、JAK2、JAK3、KDM5C、KDM6A、KEAP1、KIT、KRAS、MAP2K1、MAP2K2、MAPK1、MET(外显子 14 跳跃)突变)、MLH1、MPL、MSH2、MSH6、MTOR、MUTYH、MYC、MYCN、MYD88、NF1、NF2、NOTCH1、NPM1、NRAS、NTRK1、NTRK3、PALB2、PBRM1、PDGFRA、PIK3CA、PMS2、POLD1、POLE、PPP2R2A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD54L、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RIT1、ROS1、SETD2、SF3B1、 SMAD4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STK11、TERT、TP53、TSC1、TSC2、VHL
f i g u r e 1通过癌症类型的晚期癌症患者的比例,他们有资格获得与生物标志物相关的治疗或由生物标志物指导的临床试验。改编并从Normanno等人,2022年进行更新。9基于AACR Genie Real -World基因组数据集的内部分析,版本8版(AACR Project Genie Consortium,2017年10)。基于2015 - 2017年UK Cancer Research的癌症发病率。 由英国癌症研究和国家癌症研究所的监视,流行病学和最终结果(SEER)计划和其他来源的晚期疾病患者的比例。 基于FDA批准的批准治疗。 Clinical trial biomarkers (cancer types are excluded where drugs have already been approved): ERBB2 mutation and amplification (excluding breast, NSCLC, and stomach), KRAS G12C (excluding NSCLC), CCNE1 amplification, STK11 (NSCLC only), MET amplification, PALB2 (breast, pancreas, ovary), ARID1A, EGFR (excluding NSCLC), IHD1/2 (excluding biliary), PIK3CA (excluding breast), AKT1/2/3 (excluding breast), CDK12, ERBB3/4 amplification and mutation, FGFR1 fusion and mutation, ATM (excluding prostate), BAP1, CTNNB1, NF1/2和PTCH1。 AACR表示美国癌症研究协会;中枢神经系统,中枢神经系统;美国食品和药物管理局FDA; Genie,基因组学证据肿瘤信息交流; NSCLC,Nonsmall细胞肺癌; SCLC,小细胞肺癌。基于2015 - 2017年UK Cancer Research的癌症发病率。由英国癌症研究和国家癌症研究所的监视,流行病学和最终结果(SEER)计划和其他来源的晚期疾病患者的比例。基于FDA批准的批准治疗。Clinical trial biomarkers (cancer types are excluded where drugs have already been approved): ERBB2 mutation and amplification (excluding breast, NSCLC, and stomach), KRAS G12C (excluding NSCLC), CCNE1 amplification, STK11 (NSCLC only), MET amplification, PALB2 (breast, pancreas, ovary), ARID1A, EGFR (excluding NSCLC), IHD1/2 (excluding biliary), PIK3CA (excluding breast), AKT1/2/3 (excluding breast), CDK12, ERBB3/4 amplification and mutation, FGFR1 fusion and mutation, ATM (excluding prostate), BAP1, CTNNB1, NF1/2和PTCH1。AACR表示美国癌症研究协会;中枢神经系统,中枢神经系统;美国食品和药物管理局FDA; Genie,基因组学证据肿瘤信息交流; NSCLC,Nonsmall细胞肺癌; SCLC,小细胞肺癌。AACR表示美国癌症研究协会;中枢神经系统,中枢神经系统;美国食品和药物管理局FDA; Genie,基因组学证据肿瘤信息交流; NSCLC,Nonsmall细胞肺癌; SCLC,小细胞肺癌。
粘液表皮样癌 (MEC) 占涎液肿瘤的 10-15%。由于发病率低,进行临床试验和制定治疗指南具有挑战性。虽然手术是治疗可切除肿瘤的最常见方法,但人们已经研究了化疗、放疗和免疫疗法等各种治疗方法。由于 MEC 是一种常见的组织学亚型,因此需要实施标准化治疗方案来有效管理它。此外,评估最近在 MEC 中发现的染色体和基因异常已变得至关重要,包括 CDKN2A 、 TP53 、 CDKN2B 、 BAP1 等的改变。这些突变与低级别肿瘤向高级别肿瘤的转化有关,是评估这种癌症侵袭性行为的重要工具。详细的免疫组织化学和易位研究有助于开发针对性治疗方法和监测治疗反应。因此,生物标志物驱动的研究将极大地改善治疗结果,尤其是在晚期病例中。基于彻底的组织学和染色体易位,更个性化的治疗计划可以改善整体疾病结果。本文的目的是阐述当前的治疗进展,特别是化疗和靶向治疗,作为管理 MEC 的有效治疗方式,并强调与传统治疗方法的比较。
因为站点可以预测广泛的临床特征,并且可以从治疗方案中选择。皮肤中出现常见的皮肤黑色素瘤(〜90%的病例)。很少,黑素瘤(例如,胃肠道和生殖道的粘膜(约1 - 2%)出现在眼睛,眼睛(〜5%的情况)(约5%)中,在卵巢(脉络膜,iris和睫状体)中,或者在conjunctiva(conjunctiva conjunctiva scline scliends of conjunctiva and sclinies of sclinies of sclindions of sclinies of sclinies)图1)。特别关注的是,这些罕见的黑色素瘤亚型的治疗选择有限。许多流行病学和实验研究将非易纤维皮肤皮肤的常见黑色素瘤与暴露于紫外线辐射(UVR)及其基因组相结合,因此显示了直接UVR诱导的DNA损伤的证据,表现出高肿瘤突变负担(TMBS),c> t> t> t> t> t> t> t tistition 7(TMBS)的高度突变的底基7(TMBS)。2相比之下,稀有黑色素瘤通常具有较低的TMB,而C> T跃迁和SBS7的比例较低,但是具有大量的基因组结构变异(SV),具有特征性的染色体成分和损失。不同的黑色素瘤亚型也由不同的癌基因驱动。皮肤黑色素瘤通常由BRAF,NRA和NF1驱动,HTERT和TP53中有继发突变。粘膜黑色素瘤由BRAF和NRA驱动,但频率低于皮肤黑色素瘤,而Kit在该疾病中也是常见的驱动力。最后,紫veal黑色素瘤由GNAQ,GNA11和CYSLTR2驱动,BAP1,SF3B1和EIF1AX中具有次要突变。3 - 6
Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组:AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1
图 1 按照癌症类型划分的晚期癌症患者比例,这些患者可能有资格接受生物标志物相关疗法或生物标志物指导的临床试验。根据 Normanno 等人,2022 年的资料改编和更新。9 生物标志物流行率数据基于对 AACR GENIE 真实世界基因组数据集第 8 版的内部分析(AACR Project GENIE Consortium,2017 10)。癌症发病率基于 2015-2017 年英国癌症研究中心的数据。晚期疾病患者比例来自英国癌症研究中心和国家癌症研究所监测、流行病学和最终结果 (SEER) 计划以及其他来源。获批疗法基于 FDA 批准。临床试验生物标志物(已获批准药物的癌症类型除外):ERBB2 突变和扩增(乳腺癌、NSCLC 和胃癌除外)、KRAS G12C(NSCLC 除外)、CCNE1 扩增、STK11(仅限 NSCLC)、MET 扩增、PALB2(乳腺癌、胰腺癌、卵巢癌)、ARID1A、EGFR(NSCLC 除外)、IHD1/2(胆道癌除外)、PIK3CA(乳腺癌除外)、AKT1/2/3(乳腺癌除外)、CDK12、ERBB3/4 扩增和突变、FGFR1 融合和突变、ATM(前列腺癌除外)、BAP1、CTNNB1、NF1/2 和 PTCH1。AACR 表示美国癌症研究协会;CNS,中枢神经系统;FDA,美国食品药品监督管理局;GENIE,基因组学证据肿瘤信息交换;NSCLC,非小细胞肺癌;SCLC,小细胞肺癌。
摘要背景葡萄膜黑色素瘤 (UM) 是最常见的眼癌类型,起源于眼球的葡萄膜。UM 占黑色素瘤的 3-5%,转移和早期死亡率为 50%。已知肿瘤大小与 UM 和其他癌症的转移性疾病和死亡风险有关。大型 UM 肿瘤被认为更具侵袭性,并具有高风险遗传因素。肿瘤大小由国际抗癌联盟 (UICC) 肿瘤淋巴结转移 (TNM) 分期系统分类。病理分期 (T1) 肿瘤按最大直径 12 毫米和深度 3 毫米(如果直径为 12-9 毫米)/ 深度 6 毫米(如果直径小于 9 毫米)的尺寸分类。UM 患者的主要治疗方法是如果肿瘤较大则摘除眼球(摘除术),如果肿瘤较小则进行放射性斑块治疗。然而,由于临床上很难区分黑色素瘤和良性痣,因此通常会对它们进行一段时间的跟踪以证明其生长情况,然后再进行斑块放射治疗或眼球摘除手术。由于 T1 肿瘤稀有,并且如果用放射性斑块治疗(近年来更流行的方法)则缺乏可用的组织学材料,因此关于 T1 肿瘤行为的文献存在很大空白。现有的研究表明,T1 肿瘤的转移频率明显低于较大的肿瘤,这可能是因为继发性突变的积累较少。目的确定一批患有 T1 摘除肿瘤的患者,以确定他们的无病生存率和总生存率。将其与已知的不良生存率分子标记(如 BAP1 状态、3 号染色体单体性和 8 号染色体的获得)相关联。
第 2 阶段是治疗阶段。MiST 治疗方案将根据第 1 阶段的生物标志物检测结果针对分配给患者的治疗进行具体说明。具体药物如下:1. MiST1:针对 BRCA1/BAP1 阴性间皮瘤患者的 Rucaparib(600 mg,每日两次(BID),每 28 天一次),共 6 个周期。已停止招募。2. MiST2:针对 p16INK4A 阴性间皮瘤患者的 Abemaciclib(200 mg,每日两次(BID),每 28 天一次),共 6 个周期。已停止招募。3. MiST3:Pembrolizumab 和 bemcentinib。没有特定的生物标志物要求。Bemcentinib 将每 21 天口服一次,共 8 个周期。在给药的前 3 天,剂量为 400 毫克(第 1、2 和 3 天);从第 4 天开始,患者的每日剂量为 200 毫克。Pembrolizumab 将以 200 毫克的固定剂量通过静脉输注 (IV) 在每个 21 天周期的第 1 天给药,共 8 个周期。- 已停止招募。4. MiST4:用于 PDL1 表达阳性间皮瘤患者的阿替利珠单抗和贝伐单抗。阿替利珠单抗将以 1200 毫克的剂量通过静脉输注 (IV) 给药,贝伐单抗将以 15 毫克/千克的剂量通过静脉输注 (IV) 给药。两种药物都将在每 21 天的第 1 天给药,共 8 个周期。已停止招募。 5. MiST 5:Dostarlimab 和尼拉帕尼用于治疗铂敏感型复发性间皮瘤患者。尼拉帕尼将根据患者的体重和血小板计数每天给药一次。一个周期为 21 天,总共最多 35 个周期: 5.1. ≥77 公斤和 ≥150,000 μL 300 毫克(3 X 100 毫克胶囊) 5.2. <77 公斤或 <150,000 μL 200 毫克(2 X 100 毫克胶囊) Dostarlimab 将以固定剂量 500 毫克通过静脉输注给药,在每个 21 天周期的第 1 天给药,共 4 个周期。随后在每个 42 天周期的第 1 天通过静脉输注 1000 毫克,最长 24 个月。
