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leukemiutringbenmärg/blod mylood面板*(ABL1,ANKRD26,ASXL1,ATRX,BCOR,BCOR,BCORL1,BRAF,CALR,CALR,CBL,CBL,CBL,CBL,CDKN2A,CDKN2A,CEBPA,CEBPA,CEBPA,CSF3R,CSF3R,CSF3R,CUX1,DDX41,DDX41,DNMT3A fbxw7, FLT3, GATA1, GATA2, GNAS, HRAS, Idh1, Idh2, Ikzf1, jak2, jak3, kdm6a, kit, kraas, kmt2a, mpl, myd88, NF1, Notch1 (INKLUSIVE 3´UTR), NPM1, NRAS, PDGFRA, PHF6, PPM1D, Pten, Ptpn11, Rad21, Runx1, Samd9, SAMDL9, Setbp1, SF3B1, SMC1A, SMC3, SRSF2, Stag2, Stat3, Stat5B, Tet2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR2, BTK, plcg2, terc) Div>
PBIO 3940. 生态系统建模。3 学分。涵盖用于建模生态和环境系统的方法,重点是系统动力学和基于代理的建模。探索生态系统的复杂性,包括系统组件之间的突发特性和反馈。利用系统动力学软件 Stella 和基于代理的编程语言 Netlogo。先决条件:BCOR 2100 或 NR 2030 或生态学和/或进化论的同等中级课程。
参考文献 • Batkova M、Havlovicova M、Nocar A、Dudakova L、Macek M、Liskova P、DostalovaT。在携带新型新生 BCOR 致病变异的两个捷克家族中观察到眼-面-心-牙 (OFCD) 综合征的牙齿异常。BMCOral Health。2024 年 10 月 22 日;24(1):1264。doi: 10.1186/s12903-024-05005- y。PubMed 上的引用(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/39438869) • Gorlin RJ、Marashi AH、Obwegeser HL。眼-面-心-牙 (OFCD) 综合征。Am J Med Genet。1996 年 5 月 3 日;63(1):290-2。 doi:10.1002/(SICI)1096-8628(19960503) 63:13.0.CO;2-G。PubMed 上的引用 (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8723122) • Hedera P, Gorski JL。眼-面-心-牙综合征:母亲和女儿的 X 染色体失活偏斜提示 X 连锁显性遗传。Am JMed Genet A。2003 年 12 月 15 日;123A(3):261-6。doi: 10.1002/ajmg.a。 20444. PubMed 上的引文(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14608648)• Horn D、Chyrek M、Kleier S、Luttgen S、Bolz H、Hinkel GK、Korenke GC、Riess A、Schell-Apacik C、Tinschert S、Wieczorek D、Gillessen-Kaesbach G、Kutsche K。眼-面-心-牙综合征患者中有 3 名 BCOR 出现新突变,但 Lenz 小眼综合征患者中无突变。Eur J Hum Genet。2005 年 5 月;13(5):563-9。doi:10.1038/sj.ejhg.5201391。 PubMed 上的引文 (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.go v/15770227) • McGovern E、Al-Mudaffer M、McMahon C、Brosnahan D、Fleming P、Reardon W。母女中的眼面部心脏牙齿综合征。Int J OralMaxillofac Surg。2006 年 11 月;35(11):1060-2。doi: 10.1016/j.ijom.2006.05.001。Epub2006 年 7 月 10 日。PubMed 上的引文 (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16829040)
a Diagnosis must include flow cytometry, karyotype, rapid order (<72 hours) molecular tests (to include: FLT3, NPM1, IDH1, and IDH2), and myeloid NGS test (at minimum must include: ASXL1, BCOR, CEBPA, EZH2, FLT3, IDH1, IDH2, NPM1, RUNX1, SF3B1, srsf2,stag2,tp53,u2af1和zrsr2);其他可选基因包括:CBL,DDX41,KIT,KRAS,NRA和其他与髓样肿瘤相关的基因;也可以在病理学家的前提下或自行决定进行AML鱼类测试(可以包括:-5/5Q,-7/7Q,-7/7Q,KMT2A,T(8; 21)runx1 :: Runx1t1,t(15; 17; 17)PML :: Rara,t(16:16)或Inv(16:16)或Inv(16)或Inv(16)CBFB :: bbfb :: bbl :: bbl:n; TP53)
a Diagnosis must include flow cytometry, karyotype, rapid order (<72 hours) molecular tests (to include: FLT3, NPM1, IDH1, and IDH2), and myeloid NGS test (at minimum must include: ASXL1, BCOR, CEBPA, EZH2, FLT3, IDH1, IDH2, NPM1, RUNX1, SF3B1, srsf2,stag2,tp53,u2af1和zrsr2);其他可选基因包括:CBL,DDX41,KIT,KRAS,NRA和其他与髓样肿瘤相关的基因;也可以在病理学家的前提下或自行决定进行AML鱼类测试(可以包括:-5/5Q,-7/7Q,-7/7Q,KMT2A,T(8; 21)runx1 :: Runx1t1,t(15; 17; 17)PML :: Rara,t(16:16)或Inv(16:16)或Inv(16)或Inv(16)CBFB :: bbfb :: bbl :: bbl:n; TP53)
a Diagnosis must include flow cytometry, karyotype, rapid order (<72 hours) molecular tests (to include: FLT3, NPM1, IDH1, and IDH2), and myeloid NGS test (at minimum must include: ASXL1, BCOR, CEBPA, EZH2, FLT3, IDH1, IDH2, NPM1, RUNX1, SF3B1, srsf2,stag2,tp53,u2af1和zrsr2);其他可选基因包括:CBL,DDX41,KIT,KRAS,NRA和其他与髓样肿瘤相关的基因;也可以在病理学家的前提下或自行决定进行AML鱼类测试(可以包括:-5/5Q,-7/7Q,-7/7Q,KMT2A,T(8; 21)runx1 :: Runx1t1,t(15; 17; 17)PML :: Rara,t(16:16)或Inv(16:16)或Inv(16)或Inv(16)CBFB :: bbfb :: bbl :: bbl:n; TP53)
结果 TP53 和 DNMT3A 突变是最常见的突变。在我们队列中检测到了在 HGESS( ZC3H7B- BCOR 和 NUTM2B-YWHAE )和 LGESS( JAZF1-SUZ12 )中常见的经典融合。CCND1 在 HGESS 中显著上调,而编码雌激素受体 (ER) 和孕激素受体 (PR) 的 GPER1 和 PGR 的表达在 HGESS 和 LGESS 之间没有显著差异。60% 的 HGESS 患者检测到了富集同源重组修复、细胞周期和磷酸肌醇 3-激酶/AKT/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白途径的可操作突变。HGESS 中上调表达的基因在 5 个免疫相关途径中显著富集。大多数 HGESS 患者(85.7%)具有免疫治疗疗效的阳性预测因子。免疫微环境分析显示HGESS具有较高的免疫浸润程度,其中ZC3H7B-BCOR融合的HGESS患者免疫浸润程度相对高于NUTM2B-YWHAE融合的患者。
摘要:在人类诱导的多能干细胞(HIPSC)分化和增殖过程中发生的意外遗传修饰会导致肿瘤性。这是开发基于干细胞的疗法的关注点,以确保最终产品的安全性和功效。此外,常规的遗传稳定性测试方法受到低灵敏度的限制,这是一个尚未解决的问题。在这项研究中,我们使用各种测试方法(包括核分型,Cytoscanhd芯片分析,全异位测序和靶向测序)评估了HIPSC和HIPSC衍生的心肌细胞的遗传稳定性。在KMT2C和BCOR中的两个特定遗传突变是从通过全异常和靶向测序方法鉴定的17种基因变体中选择的,使用液滴数字PCR验证。根据国际协调委员会(ICH)指南,包括特异性,精度,鲁棒性和检测限制,该方法对基于干细胞的治疗产品的适用性进一步证明了相关的验证。我们的液滴数字PCR结果显示出高灵敏度和定量检测基因突变的准确性,而常规QPCR无法避免误报。总而言之,液滴数字PCR是一种高度敏感且精确的方法,用于评估具有致肿瘤潜力开发基于干细胞的疗法的突变的表达。