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arr[hg19] 17q12(34,815,072-36,215,917)x1 全基因组 SNP 微阵列 (Reveal) 分析显示一名女性存在上述染色体片段间质缺失。此间隔包括大量 OMIM 基因(起始:ZNHIT3 至结束:HNF1B)。该区域两侧有片段重复,这容易导致不均等减数分裂重组,从而导致缺失和重复。包含 HNF1B 基因 (OMIM:189907) 的此区域的缺失与可变表型相关,可能包括以下一种或多种:囊性肾病、胰腺萎缩、肝脏异常、认知障碍和结构性脑异常、糖尿病(成年期发病)和癫痫(参见参考资料)。还报告了产前超声异常病例,例如囊性肾、羊水过多/过少和膈疝(见参考文献;Hendrix;Chen)。由于这种疾病的多变性,无法精确预测产前表型。建议进行父母随访分析,以确定这种缺失是代表遗传还是新生变化。在目前的报告标准中未检测到其他 DNA 拷贝数变化或拷贝中性 ROH。建议进行遗传咨询。应在测试代码 511810(qPCR)下提交随访父母血液(绿顶肝素钠)。产前阵列的 qPCR 随访研究是免费的。如果父母研究结果为阴性,与新生 CNV 一致,则可以考虑进行父母 FISH 以排除罕见的平衡重排。新生 CNV 的父母随访需要付费,可能需要长达 56 天才能获得结果。提交父母或家族样本时,请参考产前样本编号。计费政策详情可在 www.labcorp.com 上查看。
arr [hg19] 17p11.2(16,772,264-20,413,433)x1 x1整个基因组SNP微阵列(揭示)分析已确定了上述染色体段的界面缺失的女性。已删除的区域包括许多OMIM基因(开始:TNFRSF13B到End:SPECC1),包括RAI1,RAI1是涉及史密斯 - 麦加尼斯综合征的主要基因。史密斯 - 马格尼综合征的特征是独特的物理特征,发育延迟,认知障碍和行为异常(请参阅参考)。建议进行父母鱼类的随访分析以确认从头起源,并排除具有高复发风险的平衡重排。在本报告标准中未检测到其他DNA拷贝数更改或拷贝中性ROH。遗传咨询建议。应根据测试代码511770(FISH)提交随访父母血液(绿色顶级肝素)。费用将适用。提交父母或家族样本时,请参考概率名称,出生日期和标本号。计费策略详细信息可在www.labcorp.com上查看。母体细胞污染研究将在单独的覆盖下报告,如果有序。参考:Smith ACM,Boyd KE,Brennan C等。史密斯 - 马格尼综合症。2001年10月22日[更新2022年3月10日]。in:Adam MP,Ardinger HH,Pagon RA等,编辑。GenereViews®[Internet]。西雅图(WA):西雅图华盛顿大学; 1993-2022。 可从:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/nbk1310/方法:西雅图(WA):西雅图华盛顿大学; 1993-2022。可从:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/nbk1310/方法:
arr(X,Y)x1,(1-22)x2 全基因组染色体 SNP 微阵列 (Reveal) 分析正常。根据下文所述的本报告标准,在 277 万个区域特异性 SNP 和结构靶标中未检测到显著的 DNA 拷贝数变化或拷贝中性区域。当发现新的临床重要基因时,可以根据要求重新检查档案记录。方法:使用 Cytoscan ® HD Accel 平台进行 SNP 微阵列分析,该平台使用 2,029,441 个非多态性拷贝数探针和 743,130 个 SNP 探针进行 LOH/AOH 分析和关系评估。该阵列的平均基因内间距为 0.818 kb,平均基因间距为 1.51 kb。从提供的样本类型中提取总基因组 DNA,用 Xce1 消化,然后连接到 Xce1 接头。纯化并定量 PCR 产物。将纯化的 DNA 破碎,用生物素标记,并与 Cytoscan ® HD Accel 基因芯片杂交。使用染色体分析套件分析数据。分析基于 GRCh37/hg19 组装。此测试由 LabCorp 开发并确定其性能特征。它尚未获得食品和药物管理局的批准或认可。阳性评价标准包括:* DNA 拷贝数损失 >200 kb 或在具有至少一个 OMIM 基因的已知临床重要区域之外增加 >500 kb。* DNA 拷贝数增加/损失在或包括已知 25 kb 或更大的临床重要基因内。* 如果患者结果显示单个染色体中存在 >20 Mb 间质或 >10 Mb 端粒的长连续纯合区域(印迹染色体分别为 15 和 8 Mb),则建议进行 UPD 测试。 * 如果一个区域的连续纯合性大于 8 Mb,但低于 UPD 报告标准,则报告为隐性疾病风险增加。 * 多条染色体内连续纯合性大于 8 Mb 表明存在共同祖先。这些区域具有潜在的隐性等位基因风险。 * 由于存在大量连续的短片段(与地理或社会有限的基因库相关),报告在第 99 个百分位处存在高水平的等位基因纯合性。 SNP 染色体微阵列无法检测: * 真正平衡的染色体变异 * 序列变异