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人类胰腺神经内分泌细胞系
在罕见的胰腺神经内分泌肿瘤 (P-NET) 患者中，相当一部分患有遗传性癌症综合征多发性内分泌肿瘤 1 型 (MEN1)，这是由 MEN1 抑制基因的种系突变引起的。在散发性 P-NET 中也经常发现体细胞突变和 MEN1 蛋白 (menin) 的缺失。因此，具有 MEN1 双等位基因失活的人类神经内分泌胰腺细胞系可能对研究肿瘤发生有价值。我们使用多克隆人类 P-NET 细胞系 BON1（该细胞系表达 menin、血清素、嗜铬粒蛋白 A 和神经降压素）通过 CRISPR/Cas9 编辑生成单克隆稳定的 MEN1 敲除 BON1 细胞系 (MEN1-KO-BON1)。分析了形态、激素分泌和增殖的变化，并使用 nanoLC-MS/MS 和 Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 评估了蛋白质组学。缺乏脑膜炎的 MEN1-KO-BON1 细胞嗜铬粒蛋白 A 的产生增加，并且比对照细胞更小、更均质、更圆且生长更快。蛋白质组学分析显示 457 种蛋白质发生显著改变，IPA 确定了与癌症相关的生物学功能，例如翻译后修饰和细胞死亡/存活。在 39 种表达差异至少两倍的蛋白质中，有 12 种与葡萄糖稳态和胰岛素抵抗有关。发现稳定的单克隆 MEN1-KO-BON1 细胞系保留了神经内分泌分化、增殖增加和蛋白质谱改变。
原位缺失揭示了拟南芥中细胞内免疫受体基因及其共表达基因表达的调控成分
图 8 LHY1 和 bHLH28 在 SNC1 表达调控中的作用。（a）来自 DAP-seq 数据库的 SNC1 基因座中两个转录因子 LHY1 和 bHLH28 的结合。这是从浏览器图像中重新绘制的。结合用彩色块表示，高度代表检测到的结合水平。（b）野生型或 bon1 中突变体 bhlh28 和 lhy1 的生长表型。植物在 22°C 下 16 小时/8 小时光照下生长。（c）通过定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) 测定 bhlh28 和 lhy1 单突变体和双突变体与 bon1 的相对 SNC1 表达。肌动蛋白被用作参考基因，并将表达水平与 Col-0 进行比较。显示的是三次生物学重复的平均值，误差线表示标准差。不同字母表示基因型之间的统计学显著差异（p < 0.05，学生 t 检验）。（d）LHY1-GFP 和 bHLH28-GFP 与 SNC1 启动子区的染色质免疫沉淀 (ChIP)-qPCR 分析。分别在“A”位点和“B”位点（如 a 所示）检测到 LHY1-GFP 和 bHLH28-GFP 的结合。显示了两个独立生物学重复的数据。“N”位点（如 a 所示）是 SNC1 基因体上的一个区域，在 DAP-seq 数据库中未检测到 LHY1 或 bHLH28 的结合信号。“GFP”是用抗 GFP 抗体孵育的样品，“NoAb”是不含抗 GFP 抗体的样品。不同字母表示通过单因素方差分析（ANOVA）得出的基因型间统计学差异具有显著性（p < 0.05）[彩色图可在 wileyonlinelibrary.com 上查看]