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PRPE，一种来自枯草芽孢杆菌的PPP蛋白磷酸酶，具有异常的底物
蛋白质磷酸化或去磷酸化是在所有生物体中发现的信号传递的重要机制。多年来，蛋白激酶和磷酸酶的性质被认为在原核生物和真核生物中是不同的。证明主要发生在组氨酸和天冬氨酸残基上，而相反，通常在丝氨酸，苏氨酸或酪氨酸残基上修饰真核蛋白。然而，近年来在细菌中报道了真核样蛋白激酶和磷酸酶，相反，在真核生物中发现了原核性蛋白质的ASP酶的同源物（有关评论，请参见[1-7]）。这些研究表明，真核生物和原核生物可能具有所有类型的信号转导的相似机制。蛋白磷酸酶可以根据其酶特异性（即促磷酸酶和Tyr磷酸酶）分为两组[8,9]。ser} THR磷酸酶在ITRO中显示出广泛的特异性，并已分为四类：PP1，PP2A，PP2B和PP2C，根据保守的基序，它们对抑制剂和离子的抑制剂和离子需求的敏感性[9-11]。氨基酸序列比较表明PP1，PP2A和PP2B是同一PPP家族的成员[10]。PPP家族代表了较高的真核生物中蛋白质ser}的最大蛋白质ser} [12]。这些酶还与对称的折断氨酸四磷酸酶具有序列相似性[13]。被识别的PPP家族的第一个原核生物是噬菌体λ221的乘积[14]。目前，几个成员在ARCHEA和细菌中均已详细介绍[15-19]。但是，关于生理学的数据很少
枯草芽孢杆菌的饮食掺入，增强生长...
这项研究评估了用枯草芽孢杆菌HBB493®补充饮食对斑马鱼（Danio rerio）生长，生存，配子发生和肠道健康的益生菌作用。600名少年分为五个实验组：对照组I（0.0 cfu/g），II组（6.5x10 9 cfu/g），III组（1.3x10 10 cfu/g），第IV组（2.6x10 10 CFU/g）和V组V（3.9x10 10 CFU/G）。每种治疗和对照都有3个重复，而每个复制都有40条鱼。实验的持续时间为100天。在实验终止时，通过组织学评估了性腺和肠道。生长参数，在饲喂的3.9x10 10 CFU/g的鱼类中与对照，II组和III组B.枯草芽孢杆菌FED组（p <0.05）中观察到的<9x10 10 cfu/g（p <0.05），而V组为最佳。治疗组之间的存活率没有显着差异（P> 0.05）。性腺的组织学观察结果揭示了喂养不同水平枯草芽孢杆菌的鱼类之间的差异。喂养饮食II，III，IV和V与没有枯草芽孢杆菌的饮食相比，性腺具有更多的性腺。使用绒毛和杯状细胞的状态来评估补充枯草芽孢杆菌的鱼类饮食的肠道健康。绒毛和杯状细胞在所有不同水平的枯草芽孢杆菌中都完好无损。本研究表明，应使用饮食补充3.9x10 10 CFU/G益生菌B.枯草脂蛋白枯草酵母在观赏斑马鱼中的生长参数，生存率，配子发生和肠道健康的增强。
淀粉酶和纤维素酶从新分离的枯草芽孢杆菌使用酸处理的马铃薯果皮废物
摘要：属于芽孢杆菌属的物种会产生许多有利的细胞外临界，这些细胞外象征在商业规模上具有巨大的应用，用于纺织品，洗涤剂，饲料，食品和饮料行业。这项研究旨在与当地环境分离出有效的热耐淀粉和纤维素细菌。使用盒子 - 贝恩肯的设计响应表面方法论，我们进一步优化了淀粉酶和纤维素酶活性。通过16S rRNA基因测序将分离株鉴定为枯草芽孢杆菌Qy4。这项研究利用马铃薯果皮废料（PPW）作为生物材料，在开放环境中过度倾倒。干燥PPW的营养状况是通过近距离分析确定的。在250 ml erlenmeyer量中进行了所有实验运行，该量含有酸处理的PPW作为底物，由耐热的枯草脂肪酸盐Qy4在37°C下孵育72 h，在浸没发酵中孵育72 h。结果表明，与酸治疗相比，稀释的H 2 SO稀释辅助高压灭菌治疗有利于产生更多的淀粉酶（0.601 IU/mL/min），而在稀酸治疗中观察到高纤维素酶的产生（1.269 IU/mL/min），并且在稀酸治疗中观察到，并且与酸辅助治疗相比非常有效。确定的P值，F值和系数证明了模型的重要意义。这些结果表明，PPW可以可持续地用于生产酶，这些酶在各种工业阵列中，尤其是在生物燃料生产中。
免疫抑制剂A金属蛋白酶有助于芽孢杆菌内肉芽菌
抽象的内膜膜是一种毁灭性的感染，可能引起失明。超过一半的芽孢杆菌内膜病例导致有用视力的显着丧失。芽孢杆菌产生许多毒力因子，可能导致视网膜损伤和稳健的炎症。我们在这种疾病的背景下分析了免疫抑制剂A（INHA）金属抑制，假设INHA有助于眼内毒力和炎症。我们分析了野生型（WT），INHA1-抑制剂（D INHA1），INHA2-偏高（D INHA2）或INHA1，A2，A2和A3偏见的表型和感染率（D Inha2）和A3 deenigent（d inha1-3）芽孢杆菌芽孢杆菌。比较了对生长，蛋白水解和细胞毒性的体外分析。WT和INHA突变体类似地对视网膜细胞具有细胞毒性。d inha1和d inha2突变体比苏云金氏菌早于木相相生长。D Inha1-3突变体的蛋白水解降低，但这种菌株在体外的生长与WT相似。 通过静脉内感染了C57BL/6J小鼠，具有200 cfu的WT B.苏云金或INHA突变体，从而启动了实验性内膜。 分析眼睛的眼内芽孢杆菌和髓过氧化物酶浓度，恢复功能丧失和组织学变化。 在整个感染过程中，感染了DINHA1或D INHA2突变菌株的眼睛含有比感染WT的眼睛的细菌数量更多的眼睛。 被单个突变体感染的眼睛具有炎症和视网膜功能损失，类似于感染WT菌株的眼睛。 感染了D inha1-3突变体的眼睛清除了感染。蛋白水解降低，但这种菌株在体外的生长与WT相似。通过静脉内感染了C57BL/6J小鼠，具有200 cfu的WT B.苏云金或INHA突变体，从而启动了实验性内膜。分析眼睛的眼内芽孢杆菌和髓过氧化物酶浓度，恢复功能丧失和组织学变化。在整个感染过程中，感染了DINHA1或D INHA2突变菌株的眼睛含有比感染WT的眼睛的细菌数量更多的眼睛。被单个突变体感染的眼睛具有炎症和视网膜功能损失，类似于感染WT菌株的眼睛。感染了D inha1-3突变体的眼睛清除了感染。定量实时PCR（QRT-PCR）结果表明，单个INHA突变体中其他INHA可能存在补偿性表达。这些结果表明，INHA金属蛋白酶有助于感染的严重程度和芽孢杆菌内po虫的炎症。
通过微型DNA核酸酶ISCB
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年2月14日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.637773 doi：Biorxiv Preprint
从第二次世界大战地点分离的炭疽芽孢杆菌的细菌学和基因组研究，中国
炭疽菌是一种革兰氏阳性细菌，可能导致包括人类在内的野生和家庭伴侣之间的危害威胁性疾病（1）。B.炭疽病可以形成孢子，在不利条件下实现长期生存。先前已经报道了从储存到60年的土壤中分离植物的息肉。 由于其致病性特征，炭疽芽孢杆菌被认为是用于进行生物果或生物恐怖主义的最严重和威胁性的药物之一（3，4）。 In our previous study, 3 of 24 soil samples collect- ed from a World War II (WWII) site in northeastern China (Appendix Figure 1; https://wwwnc.cdc.gov/ EID/article/30/12/23-1520-App1.pdf) tested positive for B. anthracis using RPA/CRISPR-Cas12a, real-time PCR, and metagenomic analysis ( 5 ）。 值得注意的是，这些阳性样品是从731单元（45°36′55.940'n，126°38′33.738'e）的位点获得的，这是日本军队经营的前bacteria实验室（5）。 我们从距离第二次世界大战实验室遗迹的0.5 km，3 km和5 km内的12个收集地点中收集了24个样品（附录图2）。 但是，我们在新收集的样品中没有检测到炭疽芽孢杆菌的痕迹，这意味着我们以前发现的阳性样品可能不是源自局部自然来源。 Using polymyxin B-lysozyme-EDTA-thallous ac- etate agar and API 50CHB-API 50CH biochemical re- agents (BioMérieux, https://www.biomerieux.com), we successfully isolated and identified a B. anthracis strain (named BA20200413YY) from one of the soil samples. 形态学，溶血和生化先前已经报道了从储存到60年的土壤中分离植物的息肉。由于其致病性特征，炭疽芽孢杆菌被认为是用于进行生物果或生物恐怖主义的最严重和威胁性的药物之一（3，4）。In our previous study, 3 of 24 soil samples collect- ed from a World War II (WWII) site in northeastern China (Appendix Figure 1; https://wwwnc.cdc.gov/ EID/article/30/12/23-1520-App1.pdf) tested positive for B. anthracis using RPA/CRISPR-Cas12a, real-time PCR, and metagenomic analysis ( 5 ）。值得注意的是，这些阳性样品是从731单元（45°36′55.940'n，126°38′33.738'e）的位点获得的，这是日本军队经营的前bacteria实验室（5）。我们从距离第二次世界大战实验室遗迹的0.5 km，3 km和5 km内的12个收集地点中收集了24个样品（附录图2）。但是，我们在新收集的样品中没有检测到炭疽芽孢杆菌的痕迹，这意味着我们以前发现的阳性样品可能不是源自局部自然来源。Using polymyxin B-lysozyme-EDTA-thallous ac- etate agar and API 50CHB-API 50CH biochemical re- agents (BioMérieux, https://www.biomerieux.com), we successfully isolated and identified a B. anthracis strain (named BA20200413YY) from one of the soil samples.形态学，溶血和生化
苏云金芽孢杆菌及其毒素的生物技术进步：最近的更新
广泛的害虫，主要是鳞翅目（毛毛虫），双翅目（蚊子和黑蝇）和鞘翅目（甲虫幼虫）（Sanchis 2011）。bt的特征是在孢子形成过程中生产，内毒素蛋白（称为哭泣的蛋白），这些蛋白会积聚并形成晶体包含体。昆虫必须消耗/摄取这些哭泣的蛋白质，才能感受到其作用，直到昆虫死亡。在摄入后，昆虫中肠内的碱性条件会导致晶体的溶解化，从而将其转化为有毒的核心碎片（Sansinenea 2019）。这些有毒蛋白与位于昆虫中肠上皮细胞上的受体（糖蛋白或糖蛋白）结合（Bravo等人2011）。结合后，毒素会改变其构象，从而使其插入细胞膜并形成阳离子选择通道（Bravo等。2013）。当形成足够的这些通道时，几个阳离子进入了细胞。这会导致细胞内部的渗透不平衡，从而导致中肠上皮完整性的丧失。这使碱性肠道果汁和细菌可以通过中肠地下膜，杀死昆虫。当用作喷雾剂时，这些毒素无效地防止昆虫攻击植物的根或植物的内部部分（Sanahuja等人。2011）。这些局限性引发了人们对开发新的遗传修饰植物和细菌表达哭泣和其他BT-杀虫基因的兴趣，以便提供更有效的毒素递送系统来控制这些昆虫（Azizoglu和Karabörklü2021）。2021; Lazarte等。在生物技术技术（例如基因工程）中的持续进展，具有计算生物学的能力，导致了有关BT的发展和发现。在这种情况下，全球各个研究小组对寻找具有新的抑制活性范围和高水平的毒性毒素的新型哭泣毒素非常感兴趣，这是针对虫害的一种替代品，这种毒性毒性具有更高的抗药性水平（Hou等人 2019; Crickmore等。 2021）。 结果，使用术基因组数据，遗传修饰（GM）微生物的发展的持续菌株改善正在成为不可避免的能够实现非本地基因表达和改善本机生产国以发展遗传学改善菌株的工具包（Liu等人（Liu等）（Liu等人。 2017; Azizoglu等。 2020）。 今天的新一代方法，例如模拟和动态研究，2019; Crickmore等。2021）。结果，使用术基因组数据，遗传修饰（GM）微生物的发展的持续菌株改善正在成为不可避免的能够实现非本地基因表达和改善本机生产国以发展遗传学改善菌株的工具包（Liu等人（Liu等）（Liu等人。2017; Azizoglu等。2020）。今天的新一代方法，例如模拟和动态研究，
从应变表征到现场授权：velezensis菌株B25植物的有益特性及其在植物致病真菌上的活性
1 Greentech，Biop fe le clermont-limagne，63360法国圣布泽尔； aureliewauquier@greencell.tech（A.W.）; producty@greencell.tech（R.D.）; jeanyvesberthon@greentech.fr（J.-Y.B.）2 Labgem，GénomiqueMébabolique，Genoscope，Genoscope，InstitutFrançoisJacob，CEA，CNRS，CNRS，Universitéd'évryUniversitéd'évry，Universitéparis-Saclay，2 Rue Gastoncrémieux，91057 Evry，France，France; acalteau@genoscope.cns.fr（A.C。）; mbeuvin@genoscope.cns.fr（M.B.）; vallenet@genoscope.cns.fr（d.v.）3植物和病原体，研究所的土地自然与环境，日内瓦工程，建筑与景观学院（HEPIA），HES-SO SO-SO应用科学与艺术大学西瑞士，瑞士1254，瑞士朱西； julien.crovadore@hesge.ch（J.C。）; bastien.cochard@hesge.ch（B.C.）; francois.lefort@hesge.ch（F.L。）*信函：pijoly@gmail.com;电话。： +33-（0）4-73-33-44-55
通过其分泌的代谢物揭示枯草芽孢杆菌DSM 29784家禽益生菌的好处：一种体外方法
摘要益生菌枯草芽孢杆菌29784（BS29784）通过生物活性代谢物低黄嘌呤（HPX），烟酸（NIA）（NIA）和Pantothenate（PTH）来维持鸡的肠道健康，从而增强动物的韧性和性能。在这里，使用肠球菌在体外模型中，我们确定了这些代谢产物与肠道弹性的三个支柱之间的功能联系：免疫反应，肠壁和微生物群。我们在体外评估了BS29784营养细胞，孢子和代谢产物的能力，以调节全球免疫调节剂（使用HT-29-NF-κB和HT-29-AP-1报道细胞），肠道完整性），肠道完整性（HT-29-MUC2报道细胞）（HT-29-MUC2报道细胞和CACO-2细胞）以及CACO细胞（CACO-2），以及CACO-2-2。最后，我们使用鸡肉肠含量作为接种，模拟了肠发酵，以确定BS29784代谢产物对微生物群及其发酵型的影响。BS29784营养细胞比孢子更有效地降低了炎症反应，这表明它们的益处与代谢活性有关。为了评估这一假设，我们分别研究了BS29784代谢产物。结果表明，每个代谢产物都有不同的有益作用。pth和niA降低了促炎性途径AP-1和NF-κB的激活。HPX通过增强MUC2表达上调粘蛋白的产生。HPX，NIA和PTH增加了细胞增殖。PTH和HPX通过限制渗透性的增加来提高上皮弹性对炎症挑战。在盲肠发酵中，nia增加了乙酸乙酸盐，HPX增加了丁酸酯，而PTH则增加了乙酸乙酸酯，丁酸酯和丙酸酯。在回肠发酵中，PTH增加了丁酸酯。 所有分子调节菌群，解释了不同的发酵模式。 总的来说，我们证明了BS29784通过其分泌的代谢物在弹性的三条线上作用，从而影响了肠道健康。在回肠发酵中，PTH增加了丁酸酯。所有分子调节菌群，解释了不同的发酵模式。总的来说，我们证明了BS29784通过其分泌的代谢物在弹性的三条线上作用，从而影响了肠道健康。
生物信息学分析L-天冬酰胺酶结构（枯草芽孢杆菌），中嗜（Kibdelosporangium）和嗜热（Thermoco
抽象背景：L-天冬酰胺酶在治疗急性淋巴细胞白血病（ALL）方面用作抗癌药。此外，它在医学，食品和制药行业中广泛应用。方法：源自枯草芽孢杆菌的L-天冬酰胺酶的核苷酸和氨基酸序列最佳7613，kibdelosporangium sp。MJ126-NF4和kodakarensis kod1是从GenBank和NCBI数据库中获得的。使用Clustalw 1.83进行了浮雕水的成对序列比对。使用瑞士模型软件进行了研究的不同L-天冬酰胺酶分子的二级和三级蛋白质结构的预测。此外，使用Prosite软件分析了源自三种细菌的L-天冬酰胺酶的蛋白质结构域。使用蛋白质PI计算器（http：// isoelectric.ovh.org/）预测理论等电点（PI），分子量和氨基酸组成。结果：尽管三种细菌菌株中L-天冬酰胺酶的结构差异，但其功能特征没有差异，包括分子量，PI和功能域。结论：分析结构差异并找到功能相似性可用于设计具有较高稳定性和生物半衰期的药物。我们的分析表明，具有不同结构的蛋白质可能具有相似的功能特征，这证明了密码子使用假设。关键字：天冬酰胺酶，淋巴细胞白血病，生物信息学