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细菌 CRISPR 筛选基因功能
细菌基因组组装的指数级增长以及研究细菌生命多样性的重要性日益增加，导致人们越来越关注功能基因组学方法。通过将基因组规模的遗传扰动与高通量表型分析相结合，功能基因组学系统地定义了基因-表型关系，从而可以推断未知功能基因的功能。存在几种用于扰动基因功能的高通量方法，包括基于转座子的方法（例如 Tn-seq 和 TraDIS）、敲除收集和 CRISPR 方法。这些方法各有优缺点，并且通常以互补的方式部署。然而，我们对 CRISPR 理解的进步、DNA 合成成本的降低以及新的 CRISPR 模式已导致 CRISPR 被广泛用于整个细菌领域的功能基因组学研究。
用于多个医学领域的细菌纤维素
细菌纤维素 (BC)-Nanoskin® 已成为一种新型生物材料，可用于多个医学领域，尤其是主要用于牙科和骨科应用的医疗器械。此外，由于人们对组织工程和用于伤口护理和皮肤癌治疗的再生医学材料的兴趣日益浓厚，生物材料也随之兴起。不同的发酵过程可以改变 BC 工艺的生产。它具有特殊的性能，使其成为理想的医用材料：高机械性能、与宿主组织的生物相容性以及各种形状和尺寸的生产。本综述描述了这种生物材料在人体医学中的行为研究，包括细菌纤维素、皮肤癌、covid-19 和用于医疗领域的 3-D 打印。
社论：抗菌药物和细菌来源的抗癌药
根据世界卫生组织 (WHO；https://www.who.int/whr/1996/media_centre/press_release) 的数据，传染病每年导致 1700 多万人死亡。其中，由抗菌素耐药性 (AMR) 细菌引起的医源性感染越来越难以治疗，威胁着我们在医疗保健和预期寿命方面的进步，并在全球范围内产生了巨大的社会和经济影响 (https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/antibiotic-resistance)。仅在欧洲，AMR 每年导致 33,000 人死亡，医疗保健和生产力损失达 15 亿美元 (EU Commission, 2017; Cassini et al., 2019)。美国每年发生超过 280 万例 AMR 感染，超过 35,000 人因此死亡 (CDC, 2019)。患有 AMR 感染的患者可能需要住院超过 13 天，每年增加 800 多万住院日 ( Ventola, 2015 )。当前应对这种令人担忧的情况的策略包括投资研发新抗生素。癌症是全球发病和死亡的另一大原因；2015 年癌症造成 880 万人死亡。与 AMR 感染类似，人们几十年前就认识到对经典癌症化疗药物和/或新型靶向药物的耐药性，这是化疗在癌症治疗中取得成功的重大障碍。显然，治疗感染和癌症的最大挑战是治疗耐药性和缺乏新的抗菌或抗癌药物。微生物本身是抗生素/抗癌药物最丰富的来源，而目前未知或无法培养的细菌是新型生物活性分子的最大来源之一。抗菌和抗癌药物均可从自然环境或肠道菌群中的细菌中获得，而放线菌素 D 和博来霉素等一些药物可能具有双重抗菌和抗癌特性（Karpinski 和 Adamczak，2018 年）。本研究主题中发表的论文（七篇研究文章和三篇评论）进一步证实了天然细菌中具有抗菌和抗癌特性的生物活性分子的多样性，如下文所述。
洞察珊瑚的细菌分数
与珊瑚宿主相关的摘要细菌是多种多样且丰富的，最近的研究表明，这些共生体参与宿主的弹性对人为应激。尽管具有推定的重要性，但致力于培养珊瑚相关的细菌的工作很少受到关注。结合了已发表和未发表的数据，在这里我们报告了从源自热带，温带和冷水栖息地的珊瑚中分离出的可培养细菌的多样性和功能的全面概述。我们的MetaSurvey考虑了从52项研究中总共3,055个分离株。有1,045个具有全长16S rRNA基因序列，跨越了138个术语，并在proteeobacteria，firmicutes，firmicutes，chitoidetetes和pactinobacteria peryla中描述了138个。我们使用74种菌株的可用基因组和菌株中有益细菌 - 核共生的潜在特征进行了比较基因组分析。我们的分析揭示了。400个生物合成基因簇是抗氧化剂，抗菌，细胞毒性和其他次级代谢物的生物合成的基础。此外，我们发现了可能参与宿主结肠和宿主 - 西姆比恩识别，抗病毒防御机制和/或综合代谢相互作用的基因组特征（以前尚未用于珊瑚 - 杆菌共生剂），我们建议将其作为用于筛选珊瑚雌性筛查的新靶标。我们的结果强调了细菌培养物在阐明珊瑚霍洛皮特功能的重要性，并指导益生菌候选物的选择
微生物底漆：细菌生长动力学
引言了解微生物细胞功能仍然无法真正理解[1]。实现此目标的实验始于在合适的生长培养基中培养感兴趣的生物 - 微生物学艺术。微生物的生长及其动力学的解释是微生物学家的核心技能，这种技能被认为是如此简单，以至于学会了基础知识，然后迅速被遗忘了。许多科学学科都是由技术和技术的创新驱动的，这通常是为了损害已建立和强大的方法论。由微生物研究驱动的分子生物学作为一项主要技术的出现，导致了微生物生理和代谢方面的基本技能，被新的科学家的新属性所忽视，这些科学家吸引了令人兴奋的技术创新[2]。分子生物学革命实现了基因组学的诞生，随后导致了功能基因组学的出现（高通量诱变，基因组规模的记者等）和多词学方法论（转录组学，代谢组学和蛋白质组学）是研究（微）生物生物学的主要工具。尽管这些新技术对研究人员具有吸引力，但从来没有更多需要专注于知名的，基本的微生物生理学，以确保为这些分析生成坚固的高质量材料[1]。设计较差的“ OMICS实验”导致产生质量不佳的数据，从而导致了“垃圾，垃圾”的古老格言。作为多球，单细胞'OMICS和高分辨率成像技术变得越来越容易获得研究人员，因此越来越需要强调基本微生物生理学的技能，以确保对下游研究的材料进行考虑，并考虑到该生物体生理学的考虑。
细菌病原体在自身免疫性疾病中的作用
自身免疫性疾病（AD）当免疫系统错误地攻击自我组织时会出现，这通常是由于自我耐受性的崩溃。受遗传和环境因素影响的这些条件越来越多地与细菌感染作为重要触发因素有关。健康的免疫系统可保护人体免受感染。但是，当免疫系统出现故障时，它会攻击健康的细胞，组织和人体器官。这种故障或功能障碍称为自身免疫性疾病，可能影响身体的任何部位，损害心理功能并可能致命。本评论探讨了细菌病原体（例如幽门螺杆菌，弯曲杆菌的空肠杆菌和结核分枝杆菌）如何通过分子模拟物，旁观者活化和表位散布等机制来促进自身免疫性。这些过程会引起交叉反应性免疫反应，放大免疫失调并加剧组织损伤。流行病学和实验研究揭示了细菌感染与诸如Guillain-Barré综合征，类风湿关节炎和结节病之间的疾病之间的密切关联。通过分析这些病原体与免疫机制之间的相互作用，综述突出了细菌在破坏免疫耐受性和驱动自身免疫性疾病进展中的关键作用。此外，针对细菌诱导的自身免疫性的抗生素，免疫调节剂和疫苗等治疗策略为预防和治疗提供了有希望的途径。关键字：自身免疫性疾病；自我耐受；细菌感染；免疫反应了解细菌作用的机制为有效诊断，预防措施和疗法的发展提供了宝贵的见解。这篇综述强调了对自身免疫性细菌发病机理的持续研究，尤其是在遗传易感人群中，以完善有针对性的临床方法并改善这些复杂疾病的结果。
城市微生物组的细菌组合动员
1里昂大学，克劳德·伯纳德·里昂1大学，Vetagro SUP，UMR Ecologie Microbien，CNRS 5557，INRA 1418，69280 Marcy L'Etoile，法国； 2里昂大学，Insa Lyon，UMR Environnement，City，Société，CNRS 5600，18 Rue Chevreul，69362法国里昂； ; 3里昂大学，UMR Triangle，CNRS 5206 Jean Monnet Saint Etienne，6 Rue Basse des Rives，42023 Saint-Etienne，法国； 4里昂大学，Insa Lyon，Deep，EA7429，11 Rue de La Gysique，69621法国Villeurbanne； 5里昂大学，UMR Gate，CNRS 5824，LumièreLyon University 2，93 Chemin des Mouilles，69131 Ecully，法国，
分析细菌污染和紫外线的有效性
结论：总而言之，这项研究证明了D45紫外线系统在减少耳鼻喉科学中使用的超声探针上的细菌污染中的有效性。UV-C光消毒方法显着降低了细菌载荷，其中70％的探针显示没有残留污染。从标准化RAMS测试机构获得的结果还突出了紫外线系统的高生殖减少功能。UV-C光消毒提供了优势，例如标准化和一致的净化功效，对手动清洁的依赖减少以及与传统方法相比的重新处理时间较短。进一步的研究和评估对于建立有效重新处理超声探针在耳鼻喉科学中，确保患者的安全性并最大程度地降低了交叉污染和感染传播的风险。总而言之，UV-C光是耳鼻喉科中的内窥镜检查的一种有前途的方法。其速度和一致性，加上杀死微生物的有效性，使其成为降低感染传播风险的宝贵工具。
细菌肾脏感染和防御（Baricade）
尿路通常受细菌感染的影响，这些感染通常会传播到肾脏上。由于多种因素，例如宿主合并症和抗菌素耐药性，降低了治疗的成功，因此这可能会威胁生命。因此，迫切需要在分子水平上更好地理解这些感染。因此，跨学科研究小组于2022年成立，涉及来自德国4所医学大学的研究人员，以研究肾脏细菌感染的原因和分子机制，并为新的治疗策略铺平了道路。这次国际会议涉及尿路和肾脏感染的增加：从病原体到宿主再到治疗。
细菌基因组学研讨会呼叫 - 概要
加纳大学（NMIMR-UG）与剑桥大学兽医系合作，正在组织为期五天的强化生物信息信息研讨会，题为细菌基因组学简介。主题：下一代应用生物信息学家日期的细菌基因组学的建筑能力：2025年2月3日至7日。 Registration closes: 31 st December 2024 Notification date: 10 th January 2025 ( Only shortlisted applicants will be contacted ) Application: Interested individuals should complete an application through https://bit.ly/bacterialgenomicsgh2025 on or before 31 st December 2024.您将需要上传不超过1页的申请信。在您的信中，请包括您当前研究的科学概述，参加研讨会的理由以及计划如何应用当前或将来的研究中获得的知识。目标参与者：有针对性的参与者包括研究助理，硕士和博士学位的研究生，毕业后的研究生以及来自生物学，生物信息学和生物化学等背景的年轻研究人员或任何相关学科，旨在应用工具，以应用这些工具，以增强其当前或近乎未来的研究活动。参与者应该在研讨会时在加纳进行身体参与。nb。将优先考虑与细菌一起工作的人，他们计划尽快应用知识。所有参与者都必须带上他们的个人笔记本电脑。先决条件：不需要使用命令行的先验知识。但是，将要求选定的参与者在研讨会之前浏览相关的材料/资源，以使他们能够从研讨会中获得最大收益。研讨会费，住宿和运输：参与者将没有讲习班费用。研讨会将为有限数量的参与者提供住宿/住宿。住宿的机会只会向住在阿克拉以外的参与者提供。但是，所有已经居住在阿克拉的参与者都将获得一些津贴，以帮助他们在此期间往返研讨会地点的运输。将在整个星期的研讨会地点提供餐点。研讨会不会支付往返阿克拉的旅行费用。资助者：剑桥 - 非洲Alborada研究基金