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可以使用称为Muscle的工具（按日志预期进行多个序列比较）进行比较。灰色区域表明与整体共识匹配，而彩色条/字母显示各个序列不同的地方。可以修剪多个序列比对，然后可以使系统发育树可视化无脊椎动物之间的关系。可用两种类型的系统发育树：邻居加入（NJ）和最大似然（ML）。两者都是外群（即数据集中的无脊椎动物物种与所研究的无脊椎动物物种）被选为确定树的根和分支放置在何处的参考点。
dendrobium moschatum（银行）SW的DNA条形码。标本
自然界分布稀疏的树突属是最大的兰花科之一。DNA条形码可能是快速，准确鉴定树突物种的最佳选择。本研究的目的是使用DNA条形码技术来描述树突物种。在这里，我们使用了dendrobium sp的标本。从Makawanpur的Brindaban植物园（540 m ASL）收集为测试对象。我们从标本中放大并测序了三个叶绿体基因座，RBCL（Rorose-1,5-双磷酸羧化酶），MATK（成熟酶K）和PSBA-TRNH（基因间间隔）。我们从NCBI中检索了十二个质体序列，代表了六种树枝状物种（D. Candidum，D。Crepidatum，D。Chrysanthum，D。Denneanum，D。Fimbriatum和D. Moschatum）在尼泊尔报道。同样，还检索了一个质子质体的质体胶质体，以用作组外。从每个登录中提取RBCL，MATK和PSBA-TRNH的各个对齐序列。使用Mega X的最大似然方法进行进化分析。结果表明，与用单个基因座序列生成的序列相比，与所有三个基因座（RBCL，MATK和PSBA-TRNH）的组合序列产生的进化树更好。但是，需要其他标记才能提高准确性。
使用系统发育
Silico生物学中的摘要被认为是一种有效且适用的方法来启动各种研究，例如生物多样性分类学保护。在用于兰花物种的硅分类法中使用的系统发育分析可以提供有关遗传多样性和进化关系的数据。在分类学研究中可用于评估基因基因座特定靶标的一种特殊方法是DNA条形码。进行了这项研究，以使用MAT K，RBC L，RPO C1和NRDNA标记来确定特定的靶基因基因基因，用于使用系统发育分析在硅方法中使用Silico方法的Coelogyne属的DNA条形码。所有标记序列均从NCBI网站收集，并使用多种软件和方法进行分析，即用于样品序列对齐的Clustal X和用于系统发育树的结构和分析的Mega 11。恢复表明，建议使用的基因基因座是nrDNA基因基因座。系统发育分析表明，NRDNA基因基因座的使用能够将17种coelogyne物种与两个外群物种分开，即Cymbidium和Vanilla，然后与1,5-双磷酸羧化酶/氧合酶/氧合酶/氧合酶/氧合酶大型亚基（RBC l）一起，而其他基因群和其他polim subiN locase and n namely malsy matulase k（rbc l）（namely kita k）（namely malsy matuly k）（namy k'' RPO C1）提供了一种视觉植物树，其中两个外群物种与Coelogyne物种相同。因此，这项研究的结果可用作支持Coelogyne育种和保护计划的参考。版权所有：©2023，J。热带生物多样性生物技术（CC BY-SA 4.0）
光子纤维织入服装：耐用的条形码织物标签
先进的光纤解决方案一种直接且不显眼地编织到织物中的基于光纤的条形码可以通过自动分拣设备中的传统光谱仪快速读取，从而完成从初始制造到重复使用的整个循环。为了实现这种光纤条形码，林肯实验室国防织物发现中心和密歇根大学的研究人员设计了一种光子光纤，其可调整的周期性可以提供织物组成材料的光学特征。开发过程使用由交替层市售聚合物（即聚碳酸酯和聚甲基丙烯酸甲酯）薄膜组成的预制件，将这些层热拉伸成层厚度小于 5 微米的微纤维。可以通过拉伸过程控制光纤的光子反射和吸收特性，以创建不同织物特有的聚合物组合。
使用DNA条形码识别波多黎各的海鲜欺诈...
This Study •There are unconfirmed speculations that rays are being used to replace chapínin turnovers.•Detect the presence of Nurse Shark, as protected from fishing, possession, and sale , in shark fillets and shark processed products•A recent study found that nurse sharks were sold to local fish markets (Franqui-Rivera, 2020)•Demonstrates seafood fraud as the prohibited take and sale of a protected species
DNA条形码揭示了心脏脑头sp的发生。 （Digenea：strigeidae）感染大毛骨曲局碳（L. 1758）
抽象的cormorant（Pelecaniformes）在全球范围内广泛分布，是内陆水域和海洋环境中的沿海鸟类，并且与某些水生寄生虫的传播有关。因此，本工作的目的是研究心脏脑头核苷（Digenea：Strigeidae）的发生和形态变化，这是伟大的cormorant phalacrocorax carbo的寄生虫。从维多利亚湖从Mwanza Gulf收集的大cormorant的肠道中获得了用于分子分析（DNA条形码（COX 1）区域）的心脏脑标本（COX 1）区域。心脏脑头像标本的形态检查表明，属于心脏脑脑属的四个形态摩托克可能存在。然而，对COX 1序列，系统发育和单倍型的分析表明，所有四个形态摩托物都属于心脏脑脑的单个未知物种。本文提供了有关较棒的毛叠曲局碳纤维碳纤维的第一份报告，该报告是淡水系统中心脏脑的确定宿主。调查结果还表明，非洲心脏脑的多样性比以前报道的要高。此外，它强调了在坦桑尼亚进行更多研究的必要性，以泄露蜗牛和与水生环境中鸟类和其他脊椎动物的生命周期有关的蜗牛物种。关键字：digenean trematodes;斯特里吉德; Phalacrocorax Carbo;心脑头；考克斯1。简介
DNA条形码和分子分类法的进步
DNA条形码和分子分类法的进步5与分类法相关的程序发展简介其应用和未来的DNA技术在物种识别中的应用和未来的方向Gulab Khedkar1和S. bijoy Nandan2 1Paul Heber dna dna barcoding and Biodortity研究中心电子邮件：gkhedkar.phcdbs@bamu.ac.in 2海洋生物学和生物化学系海洋科学学院，科萨，喀拉拉邦，科萨，喀拉基。电子邮件：bijoynandan@cusat.ac.c.在远古时代命名“事物”的命名史是人类交流的一部分，这是通过单词和相关语言的一部分。人们认识到他们的经历的对象，这是日常分类学不可或缺的一部分。基于对象的相似性和差异，观察者组识别，命名和分类。使用名称的使用，作为嵌入不同语言的许多不同种类的名词，将命名法连接到理论语言学，而人类的方式与单词含义和经验相关的是与语言哲学有关的方式。这种做法进一步发展到了诸如“ nomastics”之类的结构化过程中，（研究专有名称，其起源以及文化领域），人类学象征性（与人类名称有关），替代名称（对地名的研究）和词源（历史和使用）（历史和使用），如比较和描述性语言所示。对自然世界命名对象的简单，稳定和国际接受系统的科学需求产生了许多正式的命名系统。可能是这些命名自然系统中最著名的是管理有机体的拉丁语科学名称的五个生物命名法。拉丁语术语nenclatura是指名称列表，命名词词组也可以指示提供商或名称的播音员。DNA条形码和分子分类学的进步6命名法中的文化关注点不太清楚，构成和命名法之间的区别并不清楚：对大多数人来说，Onomastics是一种不熟悉的纪律，并且在学术意义上使用命名词也不是通常的。尽管两个字段集成，但命名法更涉及用于形成名称的规则和约定。由于社会，政治，宗教和文化动机，可能会给出不同名称的事物，而不同的事物可能会得到相同的名字；密切相关的类似事物可能被认为是分开的，而另一方面，事物的显着不同。名称为我们提供了一种在脑海中构造和绘制世界的方式。从某种意义上说，名称代表了我们经验的对象。阐明名词和名词之间的联系，含义，以及我们感知世界为普通人提供了丰富的研究领域。这种本能已诞生了术语“ Folk分类学”。民间分类学现代科学分类学被描述为“基本上是民间分类原理的文艺复兴时期的编纂”。科学命名和分类的形式系统以生物分类为例。所有分类系统都是出于目的的。科学分类系统将每个生物体锚定在国际接受分类类别的嵌套层次结构中。该系统的维护涉及正式的命名规则和
摄影清单，DNA条形码以及来自Faafu Atoll的新型海sl和蜗牛的新物种，马尔代夫（Astropoda：heterobranchia和vetigastropoda）2279
摘要：基线生物多样性数据是生态和进化研究的关键，并且与印度洋的马尔代夫群岛等地区特别相关，印度洋可以充当分布广泛的海洋物种的垫脚石。我们通过浮潜和水肺潜水调查了Faafu和Malé环礁的岛屿和礁石，收集了两个腹足类亚类，Heterobranchia和Vetigastropoda。我们的库存包括104种活着拍摄的物种，以创建标识指南。我们还为大多数物种提供COI条形码，并为马尔代夫Malacofauna添加了新的序列数据。我们一半的物种代表了马尔代夫的新记录，强调要发现多少多样性。物种分布反映生态稀有性，仅在一个地点发现了近60％的分类单元。我们还根据文献记录编制了马尔代夫的异源和vetigastropods的全面清单，导致了320种，这些物种与条形码数据一起表明了印度 - 普基菌中的几种潜在的隐性物种。描述了六种新物种，裸叶兰德拉·埃文尼（Limenandra evanescenti n）。sp。，Eubranchus putnami n。sp。，Sakuraeolis Marhe n。sp。，Moridilla Maldivensis n。sp。，tergiposacacca perspicua n。sp。和sacoglossan costasiella fridae n。 sp。
人畜共患寄生虫颌口线虫的遗传特征和 DNA 条形码
结果 PCR 扩增：共进行了 32 次扩增；28S 8 次、CO1 8 次、CO2 16 次（分为两个独立试验，每次试验 8 次扩增）。 28S rRNA 基因： • 100% 的扩增成功，但 25% 的扩增显示轻微错误引导，37.5% 的扩增显示严重错误引导（表 2）。 • 在可用的 28S 序列中，37.5% 可组装为共识序列。 CO1 基因： • 100% 的扩增成功，但 12.5% 的扩增显示严重错误引导。 • CO1 序列被证明是最成功的，在创建共识序列方面的成功率为 75%。 CO2 基因： • CO2 基因的前 8 次扩增显示 0% 的成功率，因此修改了 PCR 方案。 • CO2 扩增被证明是最不成功的，第二轮扩增成功率为 75%，其中 66.7% 出现严重错误引导。• 未生成 CO2 序列。
在欧洲沿海地区发生的海洋无脊椎动物非土著物种（NIS）的DNA条形码的汇编，修订和注释
摘要：引入非土著物种（NIS）是对欧洲沿海生态系统完整性的主要威胁之一。基于DNA的评估已越来越多地用于监视NIS。但是，基于DNA的分类学分配的准确性在很大程度上取决于DNA条形码参考库的完成和可靠性。因此，我们旨在编译和审核欧洲发生的海洋无脊椎动物NIS的DNA条形码参考库。为此，我们使用三个数据库编制了NIS列表：欧洲外星物种信息网络（EASIN），关于水生非土著和隐性物种（Aquanis）的信息系统以及引入海洋物种（WRIMS）的世界登记册。对于每个物种，我们从生命数据系统（BOLD）的条形码（BOLD）中检索了可用的细胞色素C氧化酶亚基I（COI）线粒体基因序列，并使用了条形码，审计和等级系统（BAGS）来检查形成型名称和条形码索引编号（BINS）之间的一致性。从编译的1249种物种中，大约42％的物种有BOLD的记录，其中56％是不和谐的。我们进一步分析了这些案例，以确定不一致的原因并归因于其他注释标签。成功解决了35％，这增加了元法数据集中检测到的NIS数量的12个。但是，相当数量的垃圾箱仍然不一致。参考条形码记录的可靠性在NIS的情况下尤其重要，如果不需要时，错误的识别可能会触发动作或无所作为。