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World File Search SystemBasidiomycota
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basidiomycota是真菌的大型且多样的门。它们可以制造生物活性代谢产物，或者启发了抗生素和农业化学物质的合成。萜类化合物是该分类单元中遇到的最丰富的天然产品类别。已经描述了其他天然产物类别，包括聚酮化合物，肽和吲哚生物碱。基本菌真菌对天然产物的发现和研究已被妨碍了杂物因子，其中包括其缓慢的生长和复杂的基因组结构。基因组和代谢组研究工具的最新发展使研究人员可以更轻松地处理基本菌真菌的次级代谢组。廉价的长读全基因组测序可以使高质量的基因组组装，从而改善了可以预测天然产物基因簇的支架。基于CRISPR/CAS9的基于基础菌进行真菌的工程已被描述，并将在将天然产品与其遗传决定因素联系起来中起重要作用。已经开发了基因瘤基因和基因簇异源表达的平台，从而实现了自然产物生物合成研究。分子网络分析和公开可用的天然产品数据库有助于数据消除和自然产品表征。这些技术进步的结合促使人们从基质菌真菌发现自然产品发现的兴趣恢复了兴趣。
鸟类肺Mycobiome：肺摄入群落的系统发育和生态驱动因素及其潜在病原体
脊椎动物肺部包含多种微生物群落，但鲜为人知的是社区组成或其对健康的后果的原因。肺微生物组组装，例如分散，协同进化和宿主开关。然而，肺微生物组的比较调查很少，特别是对于真菌成分，是mycobiome。区分真菌分类群是通才或专业共生体，潜在的病原体或偶然吸入的孢子，这是迫切的，因为有很高的新兴疾病潜力。在这里，我们提供了禽肺菌落体的第一个特征，并测试了环境，系统发育和功能性状的相对影响。我们使用了195个肺样本中的元法编码和培养，代表20个家庭中的32种鸟类。我们确定了532个真菌分类群（Zotus），其中包括许多机会病原体。这些主要由门comycota（79％）组成，其次是basidiomycota（16％）和粘膜瘤（5％）。酵母和类似酵母菌的类群（Malassezia，Filobasidium，saccharomyces，Meyerozyma和Aureobasidium）和丝状真菌（cladosporium，cladosporium，externaria，neurospora，fusarium和spergillus）很丰富。肺Mycobiomes受环境暴露的强烈影响，并通过宿主身份，性状和系统发育亲和力进一步调节。我们的结果暗示了迁移性鸟类作为机会性致病真菌的长距离传播的潜在向量。
亚甲状腺素的肌肉修复潜力
通过比较基因组学分析在10种亚米胺类物种中鉴定出参与霉菌修复的基因，并选择了一组白rot basidiomycota（14）和软 - comcomycota（12）种，以确定矩阵的独特生物修复能力。使用系统发育主成分分析（PPCA）探索了基因组，搜索已经记录在生物催化/生物降解数据库中的基因。结果强调了甲藻类中芳香族基因/酶的明显，增加的潜力，尤其强调了高拷贝数和苯甲酸酯4-单一加仑酶[EC：1.14.14.14.92]同源物的不同光谱。此外，与其他白rot基体菌菌相比，在亚无菌素中涉及降解的其他酶更丰富，而参与多环芳族芳族芳族芳族氢碳（PAHS）的降解的酶在Armillariots和其他白色杂物中更为易于量。曲霉和北极曲霉的转录组填充物证实，在木材菌丝菌根中涉及苯甲酸酯和其他单核细胞芳香族降解的几个基因在木材含量的真菌菌丝体中明显地表达。数据与甲藻类物种一致，在降解芳香剂方面具有更强大的潜力。我们的结果提供了一种可靠，实用的解决方案，用于筛选可能的真菌候选者，以根据其基因组学数据的全部生物降解潜力，适用性和可能的专业化。
肠道微生物群建立和新兴的益生元
术语“微生物群”用来表示当前微生物的群落，并且十个等同于“微生物组”一词，尽管它们有明显差异1。微生物组是一个更广泛的术语，它基本上表示微生物，其基因和环境条件2。微生物是人体不同区域（消化系统，口腔，皮肤，肺和阴道菌群）的永久居民，其中消化道不仅被认为是殖民地最多的区域，不仅是约100万亿微生物，而且还可以维持人类健康1。取决于人类消化系统（胃，小肠或大肠）的片段，由于不同的条件，这些条件更紧密地由pH，过渡时间，氧气，氧气，酸，胆汁盐等的因素，微生物群的组成也有所不同。在大肠中发现了最高浓度的微生物，由于缺乏氧气，厌氧物种占主导地位。相比之下，具有较高氧气的小肠主要由兼辅助动氧3,4居住。在该领域的可用研究表明，肠道菌群的组成由细菌组成（粉状，细菌植物，蛋白质细菌，蛋白质细菌，肌动杆菌，绿核细菌和梭菌病），真菌（真菌）（真菌（Fungi Malassezia），病毒（噬菌体）和古细菌1还报道了包括
课程大纲 植物学学士
第一单元：微生物（15 讲）病毒——发现、一般结构、复制（概述）、DNA 病毒（T 噬菌体）；溶菌和溶原循环、RNA 病毒（TMV）；经济重要性；细菌——发现、一般特征和细胞结构；类型——古细菌、真细菌和支原体。繁殖——营养、无性和重组（接合、转化和转导）；经济重要性。第二单元：藻类（15 讲）一般特征；生态和分布；藻类组织和繁殖的范围；史密斯藻类分类；以下藻类的形态和生命周期：念珠藻、水绵、马尾藻和多管藻。藻类的经济重要性，特别涉及食品、生物肥料和医药。第三单元：真菌（15 讲）简介 - 一般特征、生态学和意义、叶状体组织范围、细胞壁组成、营养、繁殖、Ainsworth 分类和经济重要性（特别参考医学）；根霉（接合菌门）、青霉（子囊菌门）和蘑菇（担子菌门）的生命周期；共生群落 - 地衣：一般说明、繁殖和意义；菌根：外生菌根和内生菌根及其意义。第四单元：苔藓植物（15 讲）一般特征、叶状体组织范围。Riccia、Anthoceros 和 Funaria 的 Smith 分类（直至科）、形态、解剖学和繁殖（不包括发育细节）。苔藓植物的生态学和经济重要性（特别提到泥炭藓）。建议阅读：
乳糖仿形的酵母菌含有高脂肪酸积累的酵母菌，未经靶向的生物镜头
抽象的生物探测可以发现具有有趣的生态特征和有价值的生物技术特征的新酵母菌菌株和物种，例如将不同的碳源从工业侧转化为生物蛋白酶UCT的能力。在这项研究中，我们在热带西非进行了未靶向的酵母菌生物镜头，收集了1,996株分离株，并在70种不同的环境中确定了它们的生长。该系列包含许多分离株，具有吸收几种具有成本效益且可持续的碳和氮源的潜力，但我们专注于含有203种能够生长在乳糖上的菌株的特征，乳糖是乳制品的主要碳源，这是乳制品行业丰富的侧流奶酪乳清中的主要碳源。通过内部转录的间隔测序对乳糖映射菌株，我们从腹部和基本肌菌群中鉴定了30种不同的酵母菌物种，以前没有证明其中有一些在乳糖上生长，有些是新物种的候选者。观察到的生长和细胞外乳糖酶活性的生长和比率差异表明，酵母菌使用一系列不同的策略来代谢乳糖。值得注意的是，几种基质菌酵母，包括apiotirichum mycotoxinivorans，Papiliotrema laurentii和Moesziomyces natararcitus，积累了多达40％的细胞干重的脂质，证明它们可以将乳糖转化为重大生物含量的生物产物。
γδT细胞直接有选择地对IL-17依赖性真菌控制的皮肤共同酵母菌Malassezia反应
皮肤的稳定微生物定殖取决于宿主免疫系统的严格控制。脂质依赖性的酵母菌通常将皮肤定位为无害的剂量，并且受到宿主17型免疫监视，但这种真菌也与人类和动物的多样化皮肤病理有关。使用Malassezia暴露的鼠模型，我们表明Vγ4 +皮肤γδT细胞迅速扩展，是IL-17A介导真菌控制的主要来源。即使在真菌清除率后，也会在皮肤中持续存在的记忆样的玛拉西氏症响应性Vγ4 + T细胞富含排水淋巴结，并在几周后的真菌重新暴露后被保护。诱导γδT17免疫取决于IL-23和IL-1家族细胞因子信号传导，而TOLL样和C型凝集素受体则是可分配的。此外，暴露于Malassezia的宿主的Vγ4 + T细胞能够直接和选择性地对Malassezia衍生的配体进行反应，而与抗原呈递的宿主细胞无关。被检测到的真菌含量是在Malassezia属的各种物种上共享的，但在其他基本菌或aycomycota中没有使用。这些数据提供了对17型免疫监视的诱导和维护，对皮肤的诱导和维护，对皮肤健康具有重要意义。
来自东非裂谷的三个苏打湖的原核和真核微生物多样性，由扩增子测序确定
苏打湖是具有高碱度和盐分的独特聚会环境，尽管具有极端的性质，但仍支持各种微生物群落。在这项研究中，使用Amplicon测序确定了三个苏打湖，阿比亚塔湖，Chitu湖和沙拉湖的样品中的原核和真核微生物多样性。与培养的分析显示，所有三个苏打湖中原核和真核微生物群落的多样性都比以前报道的要高。通过非依赖性的扩增子测序发现了总共3,603个原核生物和898个真核操作分类单元（OTU），而只有134个细菌Otus仅通过丰富的培养物获得3％。这表明在实验室条件下只能培养这些栖息地的微生物的一部分。在三个苏打湖中，来自奇图湖的样品显示出最高的原核多样性，而沙拉湖的样品显示出最低的多样性。Pseudomonadota ( Halomonas ), Bacillota ( Bacillus , Clostridia ), Bacteroidota ( Bacteroides ), Euryarchaeota ( Thermoplasmata , Thermococci , Methanomicrobia , Halobacter ), and Nanoarchaeota ( Woesearchaeia ) were the most common prokaryotic microbes in the three soda lakes.鉴定出高度多样性的真核生物，主要由Ascomycota和basidiomycota代表。与其他两个湖泊相比，在阿比亚塔湖（Lake Abijata）发现了更多的真核OTU。本研究表明，这些独特的栖息地具有多种微生物遗传资源，并可能在生物技术应用中使用，应通过功能性宏基因组学进一步研究。
土壤微生物群落对中国煤炭工业区域重金属压力的生态反应
摘要：土壤微生物在生态系统功能中起着至关重要的作用，而土壤微生物群落可能受到与煤炭工业相关的人为活性引起的重金属污染的影响。这项研究探讨了重金属污染对围绕中国山西省的不同煤基工业领域（煤矿开采行业，煤炭制备行业，基于煤炭的化学工业和燃煤电力行业）的围绕土壤细菌和真菌群落的影响。此外，从所有工厂收集了农田和公园的土壤样本作为参考。结果表明，大多数重金属的浓度大于局部背景值，特别是对于砷（AS），铅（PB），镉（CD）和汞（HG）。在抽样场中，土壤纤维素酶和碱性磷酸酶活性存在显着差异。在所有取样场中，土壤微生物群落的组成，多样性和丰度截然不同，尤其是对于真菌群落而言。肌动杆菌，蛋白质细菌，氯酸环菌和酸性杆菌是主要的细菌门，而Ascomycota，Mortierellomycota和basidiomycota在这个基于煤炭的工业强化地区的真菌社区主导了该研究的真菌社区。冗余分析，方差分析分析和Spearman相关性分析表明，土壤微生物群落结构受到CD，总碳，总氮和碱性磷酸酶活性的显着影响。这项研究填写了中国北部一个基于煤炭的工业地区的土壤物理化学特性，多种重金属浓度和微生物群落的基本特征。
迈向可持续茶产量
Camellia sinensis植物的叶子用于生产茶，这是全球最消耗的饮料之一，其中包含各种有助于促进人类健康的生物活性化合物。茶种植在经济上很重要，其可持续生产在提供农业机会和降低极端贫困方面会产生重大影响。土壤参数众所周知，会影响所得叶子的质量，因此，对茶园土壤微生物的多样性和功能的理解将为利用土壤微生物群落提供洞察力，以提高茶的产量和质量。Current analyses indicate that tea garden soils possess a rich composition of diverse microorganisms (bacteria and fungi) of which the bacterial Proteobacteria, Actinobacteria, Acidobacteria, Firmicutes and Chloroflexi and fungal Ascomycota, Basidiomycota, Glomeromycota are the prominent groups.优化时，这些微生物在保持花园土壤生态系统方面的功能通过作用于养分循环过程，生物肥料，虫害和病原体的生物防治以及持续有机化学物质的生物修复来平衡。在这里，我们总结了（茶园）土壤微生物作为生物量化剂，生物控制剂以及作为改善土壤健康的生物培养基的研究研究，因此，茶的产量和质量主要集中在细菌和真菌成员上。研究了茶园中各种微生物的分子技术的最新进展。在病毒方面，关于茶园中土壤病毒的任何有益功能的信息很少，尽管在某些情况下，昆虫致病性病毒已用于控制茶叶害虫。这里报道了土壤微生物的潜力，以及用于研究微生物多样性及其遗传操作的最新技术，旨在提高茶厂的产量和质量以实现可持续生产。