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在冷藏期间中国新鲜牛肉的微生物多样性和社区结构及其与液泡的相关性
摘要：为了研究中国新鲜牛肉（CFB）的微生物的多样性和动力学，在冷藏过程中无酸排放处理，采用了高通量测序来分析CFB对0、3、7和10天的冷藏。结果表明，真菌和细菌的社区丰富性显着下降。但是，早期阶段的多样性下降，并在后期增加。在门水平上，蛋白酶（74.1–94.1％）和Firmicutes（77.3–96.8％）是绝对主要的真菌和细菌门。真菌和细菌门的相对丰度表现出增加然后减少的趋势。在属水平上，念珠菌（29.3–52.5％）和乳酸菌（19.8–59.3％）分别是主要的真菌和细菌属。念珠菌的相对丰度显示出增加然后减少的趋势，而乳球菌则具有相反的趋势。KEGG代谢途径分析表明，碳水化合物代谢，膜转运和氨基酸代谢是细菌的主要代谢途径。BugBase预测表明，冷藏过程中CFB细菌的主要微生物表型为革兰氏阳性（17.2–31.6％）。相关性分析表明，乳酸菌，柠檬酸杆菌，蛋白质和杜鹃花可能是促进CFB中降级物质产生的主要微生物。这项研究为保存中国新鲜牛肉提供了理论基础。
BeefBot：利用先进的 LLM 和 RAG 技术为牛肉生产商提供科学技术解决方案
我们提出了 BeefBot，这是一款专为牛肉生产商设计的由 LLM 驱动的聊天机器人。它检索最新的农业技术 (AgTech)、实践和科学见解，以提供快速、特定领域的建议，帮助有效应对农场挑战。虽然像 ChatGPT 这样的通用大型语言模型 (LLM) 对于信息检索很有用，但它们往往会产生幻觉，无法根据牛肉生产商的特定需求提供定制的解决方案，包括特定品种的策略、操作实践和区域适应。在 LLM 应用程序中合并领域特定数据有两种常用方法：检索增强生成 (RAG) 和微调。然而，它们各自的优点和缺点还不太清楚。因此，我们实现了一个流程，使用 BeefBot 中的开源 LLM 应用 RAG 和微调，并评估权衡。通过这样做，我们能够选择最佳组合作为 BeefBot 的后端，提供可操作的建议，提高牛肉生产商的生产力和可持续性，同时减少幻觉。BeefBot 的主要优势包括其作为与任何浏览器兼容的基于 Web 的平台的可访问性、通过 RAG 不断更新知识、通过本地部署实现机密保证以及通过交互式网站提供的用户友好体验。BeefBot 的演示可在 https://www.youtube. com/watch?v=r7mde1EOG4o 上访问。
在多特征基因组评估中包括微生物组信息：肉牛纵向生长表现的案例研究
抽象的背景增长率是牛的饲料转化效率的重要组成部分，并且在整个终结期的不同阶段各不相同。瘤胃微生物组的代谢作用对于牛生长至关重要，研究了这种时间变化的基因组和微生物因子，可以帮助每个生长阶段在每个生长阶段最大程度地提高饲料转化效率。通过分析术期间的纵向体重，以及来自359牛牛的基因组和宏基因组数据，我们的研究表明，宿主基因组对功能性瘤胃微生物的影响有助于不同月份的平均每日增长时间（ADG 1，ADG 1，ADG 1，ADG 2，ADG 2，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 3，ADG 4）。五百三十三十三个转化的微生物基因（ALR -MG）的基因组相关性（r g）至少具有一个ADG属性（范围从| 0.21 | | 0.42 |）。只有少数ALR -MG与多个ADG特征相关，这表明差异宿主 - 微生物组的决定论是不同阶段的ADG。这些ALR -MG参与核糖体生物合成，能量过程，硫和氨基酸代谢和trans-或脂多糖信号传导等。We selected two alternative subsets of 32 alr -MG that had a non-uniform or a uniform r g sign with all the ADG-traits, regardless of the r g magnitude, and used them to develop a microbiome-driven breeding strategy based on alr -MG only, or combined with ADG-traits, which was aimed at shaping the rumen microbiome towards increased ADG at all finishing stages.预测的选择响应随准确性而持续变化。相对于直接育种策略（仅使用ADG -Traits），将基因组估计值（GEBV）（GEBV）（GEBV）的预测准确性（GEBV）提高了11％至22％（仅使用ADG -Traits），而仅使用微生物组信息，则仅使用微生物组信息，将基因组估计值（GEBV）提高了11％至22％，而仅实现了较低的精度（从7％到41％），则将ALR -MG信息组合到11％至22％。与非均匀的子集相比，基于其r g标志（均匀子集）限制ALR -MG在预测的响应中没有产生增益，这是由于缺乏ALR -MG至少显示非零r g，至少具有多个ADG特性。
西北太平洋牛肉饲料牛的食源性病原体患病率喂养了两种不同的直接喂养微生物
近年来，由于可能污染周围粮食作物的可能性，人们对食源病原体的肉牛脱落的兴趣增加。但是，由于大多数研究强调缓解后的研究工作，因此发表的有关该主题的研究数量下降了。进行了一项领域的研究，以确定饲喂两种不同的直接喂养微生物（DFMS）的肉牛病原体和指标细菌的患病率。粪便样品被随机分配给了16支笔。在研究期间，饮食补充了两个不同的DFM。）嗜酸乳杆菌（NP51）和弗洛伊德尼里奇丙肽（NP24）（9 log 10 cfu/head/day）和ii。）唾液乳杆菌（L28）（6 log 10 cfu/head/day）。粪便样品，并分析了沙门氏菌和大肠杆菌O157：H7的存在以及大肠杆菌O157：H7，肠杆菌科和浓度的浓度。粪便样品从饲养的L28中收集的L28的浓度较低（P <0.05），并且具有相似的患病率，并且在103天之前，在研究中，在饲料的NP51/NP24中，在大肠杆菌O157：H7中没有显着差异。在第103天，饲喂L28的患病率为40％，浓度为0.95 log 10 mpn/g，而喂养的NP51/NP24的患病率为65％，浓度为1.2 log 10 mpn/g。沙门氏菌患病率，但在任何样本中未检测到以显着量得出结论的样本。补充了NP51/ NP24的牛在103日的供应期间，在103日的供应期间，EB将EB的显着减少减少了2.4 log 10 cfu/ g。很明显，大肠杆菌O157：H7和其他食源性病原体仍在牛业务中普遍存在，并且应考虑预见前的缓解策略来降低牛肉产品的风险。
采用精密牲畜耕作技术有可能减轻牛肉生产的温室气体排放
为了达到巴黎协议的目标，该协议的目标是将全球温度的升高限制在1.5°C下，在所有部门中都需要大量的温室气体（GHG）降低。这包括农业，占全球温室气体排放量的很大比例。因此，迫切需要对农场的新技术采用，以减少温室气体排放并朝着当前的政策目标发展。最近，精确的牲畜种植（PLF）技术被强调为有希望的温室气体缓解策略，可通过提高生产效率间接减少温室气体排放。使用苏格兰作为案例研究，使用苏格兰牛追踪系统（CTS）的平均数据来创建两个基线牛肉生产场景（一个放牧和一个饲养系统），并使用Agrecalc Carbon Carbon carbon脚印来计算排放估算。随后对整个农场和产品排放的采用各种PLF技术的影响进行了建模。场景包括采用自动称重平台，基于加速度计的传感器进行发感检测（生育传感器）和基于加速度计的早期疾病检测传感器（健康传感器）。模型假设基于经过验证的技术，农场的直接经验和专家意见。采用所有三种PLF技术降低了整体排放（KG CO 2 E）和产品排放（KG CO 2 E/KG DEADWERIGHT）在放牧系统和容纳系统中。一般而言，PLF技术的采用对住房系统的影响要比放牧系统更大。例如，虽然健康传感器将总排放量减少了6.1％，但放牧系统的影响略低于4.4％。采用自动体重平台后，观察到总排放量最大，该平台在放牧系统中降低了3个月的屠杀年龄（6.8％），以及用于住房系统中健康监测的传感器（6.1％）。健康传感器还导致住房（12.0％）和放牧系统（10.5％）的产品排放量最大。这些发现表明，PLF可能是苏格兰牛肉系统的有效缓解策略。尽管这项研究利用了苏格兰牛场的数据，但在其他具有相似农业系统的欧洲国家可能可以实现可比的排放量。
比较基因编辑与常规育种的比较，以使投票等位基因浸入热地适应的澳大利亚牛奶种群
dehorning是实际去除角以保护动物和人类受伤的过程，但是该过程是昂贵，不愉快的，并且面对面对越来越多的公众审查。在遗传上占主导地位的投票（无角）的遗传选择是消除除去的需求的长期解决方案。然而，由于澳大利亚婆罗门公牛的投票数量有限，北澳大利亚牛肉人口仍然主要是有角的。最近证明了使用基因编辑来产生高遗传归档的牛的潜力。为了进一步探讨该概念，这项研究模拟了通过常规繁殖或基因编辑（每年的种子托牛公牛/年的最高1％或10％），将民意测验的等位基因渗入了热情适应的澳大利亚牛肉人群中，以对3种民意测验的配对方案，并将结果与基本的遗传选择（日本选择Index Index Index，$ Japox，$ japox）进行比较，而不是20岁。基线场景并没有显着降低20年的角等位基因频率（80％），但导致遗传增益的最快率之一（每年8.00美元）。与基线相比，传统的繁殖场景优先用于育种，无论其遗传优点如何，都显着降低了20年的角等位基因频率（30％）（30％），但导致遗传增益的速度明显较慢（$ 6.70/年/年，P≤0.0.005）。需要独家使用纯合调查的公牛的交配方案，导致20年的角等位基因频率（8％），但这种常规的繁殖场景导致遗传增益率最慢（每年5.50美元）。在每种常规育种方案中添加了基因编辑，在每年的种子托牛牛犊中的最高1％或10％导致遗传增益的速度明显更快（最高$ 8.10/年，P≤0.05）。总体而言，我们的研究表明，由于澳大利亚婆罗门公牛的数量有限，对被调查的强烈选择压力对于在此
邀请的评论：使用辅助生殖技术来加速遗传增益并增加奶牛群中牛肉产量的价值
小牛企业对奶牛场利润的贡献通常被认为很小，对奶牛场的牛肉选择通常不被视为优先级。然而，随着某些国家的乳制牛群的迅速扩张速度将在未来发生变化，奶牛群生育能力的改善相结合，以减少奶牛场所需的乳制品犊牛的优势。这提供了增加牛肉犊牛比例的机会，从而增加了小牛销售的价值和犊牛的销售性。牛肉胚胎可能会成为乳制品的新育种工具，因为生产商需要重新评估其繁殖政策，这是由于福利担忧和小牛价格差而需要重新评估其繁殖政策。辅助生殖技术可以通过允许增加遗传学精英大坝产生的后代来加速遗传增益。综合乳制品 - 牛奶牛肉系统有以下三类供体女性：（1）精英乳制品大坝，使用卵子拾起，从活着的女性中回收卵母细胞，并在体外用精液中的精液从精英奶牛场中施肥； （2）精英牛肉大坝，那里的卵母细胞是用卵子拾起从活雌性中回收的，并用精英牛肉牛的精液施肥； （3）商业牛肉大坝（≥50％的牛肉遗传学），其中卵巢是从battoir splausger中收集的，卵母细胞与精英牛肉牛的精液受精，这些精液适合于奶牛上使用（导致胚胎（胚胎含有≥75％的牛肉遗传学））。本评论的目的是描述除了将乳制牛群农作物的转化为良好的遗传优点乳制雌性犊牛和优质牛肉犊牛的结合外，这些共同发展的预期益处包括牛奶和牛肉产量的加速遗传增益。
有关外部资助项目的报告
3.1.5 Developing a Market Oriented and Environmentally Sustainable Beef Meat Industry (1493) .......................................................................................................................................................... 29
肉科学-Rothamsted存储库
在高收入国家中，公民对牛肉消费的态度发生了变化，导致其消费量下降。COVID-19大流行可能影响了公民对病房消费的态度和行为。这项研究旨在调查智利公民对大流行最初18个月中牛肉消费的态度。的社会人口统计学特征和对牛肉消费的态度。公民对牛肉饮食和生产的态度在开始时与19次大流行爆发后一年以上之间没有变化。与动物产量，女性，年轻和非肉类消费者无关的参与者表现出对牛肉消费和生产的负面态度。一半的参与者同意牛肉对环境有害，但只有30％的人同意牛肉对人类健康不利。一半的参与者减少了牛肉的消费量，而48％的参与者表示未来减少牛肉消费的意图，这主要是由与动物福利，环境和人类健康有关的担忧。大多数颗粒ipant（80％）认为他们的同胞应减少牛肉消费，但只有50％的人认为这会发生这种情况。我们得出结论，智利消费者对牛肉饮食的态度并没有改变，这是由于19号大流行病的爆发。由于环境，动物和健康问题，参与者对单独和社会的牛肉消费表示强烈关注，并且认为智利人应在将来减少牛肉的消费量，但对这种情况的信心很低。
疫情条件下牛肉食品供应链的经济动态 Grace Melo a、Luis Peña-Lévano b 和 Kori Luengo c
1 新冠疫情期间的美国牛肉市场截至 2020 年 5 月，肉类行业面临新冠疫情造成的严重经济扭曲。从需求方面来看，由于封锁期间餐馆和学校等主要客户停止运营，需求下降 (Peña-Lévano、Burney 和 Adams 2020a；Cowles 2020；Reuters 2020)。此外，由于人们认为经济衰退迫在眉睫，预计 2020 年家庭牛肉需求将下降 (Corkery 和 Yaffe-Bellany 2020)。部分原因是收入受限的消费者通常会在经济衰退期间放弃反刍动物肉制品，转而选择鸡肉、火鸡或植物蛋白等更便宜的商品 (Plumer 2020)。从供应方面来看，随着工人感染新冠的人数增加，大型加工厂纷纷关闭。农民无法出售他们的动物，这迫使农民将它们关押比原计划更长的时间（Plumer 2020）。