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World File Search SystemBifidobacterium
整个基因组宏基因组学作为益生菌分析的工具
许多可用于消费者的饮食产品，例如饮食补充剂，含有据称赋予人类健康益处的活微生物。有关于商业益生菌标签差异的报道，其中物种经常被错误分类或不存在，以及标签上未列出的微生物污染。这项研究的目的是更好地了解益生菌产品的质量，其标签的准确性以及使用整个基因组测序（WGS）宏基因组学鉴定潜在污染物和低水平成分的能力。在这项研究中，DNA从123种益生菌产物中纯化，并使用Illumina Miseq平台进行了元基因组测序。生成的序列用于鉴定具有基于新型内部K-MER数据库的独特物种特异性特异性特异性特异性特异性特异性标志的微生物成分。并行，使用培养依赖性方法，将产物的微生物含量生长用于单个集菌分离，然后使用WGS创建有益微生物的基因组序列数据库。此外，使用抗性基因识别剂和毒力发现者生物信息学工具来识别抗生素耐药性和毒力因子基因的存在。宏基因组方法中的一个挑战是在存在大量有意添加的物种（如乳杆菌和双叶杆菌）的情况下，以较少的数量（成分，污染物和病原体）来检测微生物。这些研究将使消费者可用的实时微生物补充剂的内容有更好的了解，并提供一种分析途径来检测低量的有害病原体。避免了这两种方法：使用特定的噬菌体和/或纯化的噬菌体赖氨酸来减少产品的本地微生物，以改善对低水平微生物成分的检测并使用靶标的物质测序。
对土壤益生菌的新兴趋势的系统评价
抽象的基于土壤的益生菌（SBP）是源自土壤的微生物，具有显着增强土壤生育能力和植物健康的潜力，类似于传统益生菌在人类和动物健康中的益处。虽然SBP在动物的肠道中的作用知之甚少，但SBP在土壤生态系统中的特定机制和长期影响仍未得到充实。本综述系统地总结了对SBP的最新研究，重点是乳酸菌（LAB），包括乳酸杆菌和双歧杆菌，以及它们在土壤和植物生态系统中的作用。使用主要数据库进行了全面的文献搜索，包括PubMed，Web of Science，Scopus和Google Scholar，涵盖了过去20年。在90项初步研究中，有30项被排除在无关紧要的情况下，根据选择标准，省略了60个研究，仅留下最相关的研究。评论强调了SBP在农业中的多方面应用，重点是它们富集土壤微生物组，促进植物生长和抑制病原体的能力。此外，SBP在牲畜饲料中还提供可持续的替代品。SBP和传统益生菌之间的比较强调了农业系统中土壤衍生菌株的独特优势。随着可持续农业实践的重要性，SBP提出了一种自然，环保的方法，可改善土壤健康和植物的弹性。继续研究对于充分利用SBP的潜力，有助于长期土壤健康，可持续农业和全球粮食安全至关重要。关键字：病原体，植物，基于土壤的益生菌，益生菌
肌肉减少症管理的方法
摘要。肌肉减少症是骨骼肌的进行性和普遍损失，与衰老相关的功能目前没有明确的治疗。肠道微生物组成的改变已成为多种疾病病理生理学的重要原因。最近，它与肌肉健康的关联指出了其在介导肌肉减少症中的潜在作用。当前的综述着重于肠道微生物群和肌肉健康的介体的关联，将肠道微生物群的影响与其代谢物对肌肉减少症生物标志物的影响联系起来。它进一步描述了肠道微生物群会随着年龄的发展影响肌肉健康的机制，从而有助于制定涉及营养补充剂和药理干预措施以及审查中汇编的生活方式的多模式治疗计划。营养补充剂含有蛋白质，维生素D，omega-3脂肪酸，肌酸，姜黄素，开菲尔和ursolic酸，对肠道微生物组有积极影响。饮食纤维为有益微生物的生长，例如双歧杆菌，粪便核酸杆菌，Ruminococcus和Lactobacillus增长。益生菌和益生元通过预防活性氧（ROS）和炎症细胞因子。它们还增加了肠道菌群代谢产物（如短链脂肪酸（SCFA））的产生，有助于改善肌肉健康。富含多酚的食物具有抗炎作用，具有抗氧化作用，有助于更健康的肠道。药理学干预措施，例如粪便微生物群移植（FMT），非甾体类抗炎药（NSAIDS），生长素蛋白模拟物，血管紧张素转化
补充婴儿配方和人类母乳在调节婴儿菌群组成和功能体外表现出相似的模式
摘要：健康母乳喂养的婴儿的肠道菌群通常以双歧杆菌为主。为了模仿母乳喂养的婴儿的微生物群，现代配方是用生物活性和生物生成成分加强的。这些成分促进了婴儿的最佳健康和发展以及婴儿菌群的发展。Here, we used INFOGEST and an in vitro batch fermentation model to investigate the gut health-promoting effects of a commercial infant formula supplemented with a blend containing docosahexaenoic acid (DHA) (20 mg/100 kcal), polydextrose and galactooligosaccharides (PDX/GOS) (4 g/L, 1:1 ratio), milk fat globule membrane （MFGM）（5 g/L），乳铁蛋白（0.6 g/L）和动物双歧杆菌亚种。乳酸，BB-12（BB-12）（10 6 CFU/G）。使用三个健康婴儿的粪便接种，我们评估了菌群的变化，生成效应以及补充测试配方的短链脂肪酸（SCFA）产生的短链脂肪酸（SCFA），并将其与从未含有的碱基配方和母乳对照中获得的数据进行了比较。我们的结果表明，即使在配方的含量消化之后，补充配方仍然可以保持其生物活性并调节婴儿的微生物群组成，促进更快的双歧杆菌生长并刺激SCFA的产生。因此，可以得出结论，含有生物活性混合物的测试配方会促进婴儿肠道菌群和SCFA概况，但与母乳喂养婴儿的测试配方相似，但并不相同。
芬兰益生菌干预队列中的13年随访期间与过敏性鼻炎相关的早期肠道菌群
据报道会影响过敏疾病风险的摘要围产期和早期生命因素可能是由肠道菌群变化介导的。在这里，我们探索了婴儿肠道菌群与童年时期的过敏性发病率之间的关联，直到13岁的植物益生菌干预队列中。从怀孕的第36周，直到6个月大的母亲，将四种益生菌菌株与半紫糖类的混合物与半紫糖类的混合物施加给母亲。在2岁和5岁的儿科医生中监测婴儿的湿疹，食物过敏，过敏性鼻炎和哮喘的表现；过敏状态随后由10岁和13岁的问卷验证。通过16S rRNA扩增子测序靶向V3-V4区域，在3个月时进行了粪便微生物群体，其中有没有调整潜在的重要早期生活因素。总体而言，在未调整和调整后的模型中，在2至13年之间对过敏性鼻炎的阳性诊断与菌群组成有关。与有两个特应性父母的父母所生的父母所生的孩子中，这种联系更为明显，其特征是双歧杆菌和埃希里希亚/志贺氏菌的相对丰度较低。和较高比例的杀菌剂。虽然先前显示在整个队列中的益生菌和半寡糖干预措施在一定程度上降低了湿疹的患病率，但在研究的亚匹配物中未发现3个月的肠道微生物群和儿童湿疹之间没有发现关联。
失调阴道菌群通过阴道中的致病分子诱导早产级别
摘要：不植物阴道菌群（DVM）干扰阴道环境，包括pH，代谢物，蛋白质和细胞因子谱。这项研究调查了DVM对40名韩国孕妇阴道环境的影响，并确定了可预测的出生结果生物标志物。宫颈阴道流体（CVF）样品，检查pH值，并储存在-80℃以进行进一步分析。样品分为全学期（FTB，n = 20）和早产（PTB，n = 20）。微生物群在V1 – V9区域中进行了分析。确定靶向代谢物，TLR-4和细胞因子的水平。PTB（> 4.5）的CVF的pH值明显高于FTB（> 3.5）的CVF（p <0.05）。新生儿妊娠年龄在分娩，出生体重和Apgar评分之间的分数显着不同。在FTB中，有益的乳酸杆菌属的相对丰度，例如Gasseri，Jensenii乳酸乳杆菌，Jensenii和双歧杆菌较高，而致病性肠球菌肠球菌，葡萄球菌，Prevotella，Prevotella，Prevotella，reeaeaplasma parvum，sppebma parvium，sppore sppore corneboccus faecalis ftb。在PTB中较高。乙酸，甲醇，TLR-4和TNF-α水平与分娩和出生体重时的妊娠年龄负相关。此外，乙醇，甲醇，TLR-4，IL-6，IL-1β和TNF-α水平与琥珀酸酯，乙酸，乙酸乙酸盐，甲酸盐，甲酸盐和氨和氨和氨水呈正相关。总体而言，DVM通过阴道中的病原分子诱导早产。
阴道显微科学和子宫内膜异位症的营养不良之间的相关性：系统评价和荟萃分析
子宫内膜异位症是由子宫内子宫内膜样组织的定义，是一种慢性雌激素依赖性疾病，其炎症性质标志着。在生殖年中影响了大约10％的女性，子宫内膜异位症会严重影响生活的质量，从严重的痛经到慢性骨盆疼痛，尽管有些人仍然无症状，但由于其高度异质[1]。子宫内膜异位症的病因是多因素的，其理论包括逆行月经，肾上腺失衡，免疫改变，遗传和表观遗传因素，甚至是干细胞的不规则性，可能在其发作和进展中起作用[2]。子宫内膜异位症的发病机理与免疫学变化无关。但是，这种关系的细节尚未完全理解。在动物模型中的研究表明，子宫内膜异位症可以通过增加炎症介质的产生来驱动炎症，这可能是由于向炎症免疫和粘膜微生物谱转移而引起的[3]。“细菌污染假说”表明细菌内毒素在子宫内膜异位症的发病机理中的作用，研究表明，子宫内膜异位症患者的月经血液和腹膜液中大肠杆菌污染显着[4]。值得注意的是，子宫内膜异位患者子宫内膜的梭杆菌的存在明显更高，这表明细菌感染可能是一个促成因素[5]。一项国家队列研究表明，较低的生殖道感染可能是子宫内膜异位症的独立危险因素[6]。女性阴道微生态学是一个由阴道微生物群（VMB），宿主内分泌系统，阴道解剖结构和局部免疫系统组成的生态系统。VMB是指阴道中常见的微生物。Microbial populations isolated from the vagina include Lactobacillus , Gardnerella vaginalis , Prevotella bivia , Atopo- bium spp ., Mobiluncus , Bacteroidetes , Bifidobacterium spp ., Escherichia coli , Candida albicans , Trichomonas vaginalis , Actinobacillus spp ., and Sheathed Anaerobic Coccobacillus ,以及其他稀有细菌和非细菌病原体。VMB对与泌尿生殖道和性传播疾病的传染病相关的病原体具有抵抗力。隐型微生物群是一个重要的障碍，可保护宿主免受各种细菌，真菌的侵害
土壤益生菌新兴趋势的系统评价
摘要 土壤益生菌 (SBP) 是源自土壤的微生物，具有显著提高土壤肥力和植物健康的潜力，类似于传统益生菌对人类和动物健康的益处。虽然人们对 SBP 在动物肠道中的作用了解很多，但 SBP 在土壤生态系统中的具体机制和长期影响仍未得到充分探索。本综述系统地总结了最近关于 SBP 的研究，重点关注乳酸菌 (LAB)，包括乳酸杆菌和双歧杆菌，及其在土壤和植物生态系统中的作用。使用主要数据库（包括 PubMed、Web of Science、Scopus 和 Google Scholar）进行了全面的文献检索，检索时间涵盖了过去 20 年。在 90 项初始研究中，30 项因不相关而被排除，另外 60 项根据选择标准被省略，只留下最相关的研究进行分析。该评论强调了 SBP 在农业中的多方面应用，重点关注其丰富土壤微生物群、促进植物生长和抑制病原体的能力。此外，SBP 还为牲畜饲料提供了可持续的替代品。SBP 与传统益生菌的比较凸显了土壤衍生菌株在农业系统中的独特优势。随着可持续农业实践的重要性日益增加，SBP 提供了一种自然、环保的方法来改善土壤健康和植物的恢复力。持续的研究对于充分利用 SBP 的潜力至关重要，有助于长期的土壤健康、可持续农业和全球粮食安全。关键词：病原体、植物、土壤益生菌、益生菌
Tripterygium Hypoglaucum提取物可以改善辅助...
[摘要]传统上，Triverygium hypoglaucum（levl。）Hutch（Thh）被广泛用于中国人治疗类风湿关节炎（RA）。这项研究旨在研究THH的抗RA效应是否与肠道菌群有关。通过HPLC-MS鉴定出准备的Thh提取物的主要组合。用佐剂提取物治疗带有辅助性关节炎（AIA）的C57BL/6小鼠通过gavage处理一个月。提取物可显着缓解AIA小鼠的踝关节肿胀，关节腔渗出和关节软骨破坏。肌肉和血浆中炎症介质的mRNA和蛋白质水平表明，通过阻止TLR4/MYD88/MAPK信号通路，可以通过阻断关节中的炎症反应减弱。提取物明显恢复了AIA小鼠中肠道菌群的营养不良，以双歧杆菌，Akkermansia和乳酸杆菌的增加以及丁甲酸，副翅目，副翅目和腹膜的降低为特征。此外，改变的细菌与生理指数密切相关，并驱动了肠道菌群的代谢变化。此外，还采用了抗生素诱导的无菌细菌小鼠来验证肠道菌群的作用。令人惊讶的是，这种治疗未能改善无伪细菌小鼠的关节炎症状和信号传导途径，这验证了肠道菌群的必不可少的作用。首次证明了Thh提取物通过操纵肠道菌群并调节TLR4/MYD88/MAPK信号通路来保护关节炎症。因此，Thh提取物可以用作微生物调节剂，以回收斜角实践中的ra。
naringin通过刺激脂肪的热生成和褐变来改善肥胖，并调节饮食诱导的肥胖小鼠的肠道菌群
naringin是一种主要在柑橘类水果中发现的天然黄酮，由于其公认的抗氧化，抗炎和心脏保护属性，人们引起了人们的注意。但是，纳林蛋白在调节能量消耗中的功能知之甚少。在本研究中，我们观察到补充十二周的纳林蛋白补充剂基本上重塑了高脂饮食（HFD）喂养小鼠的代谢特征，通过抑制体重增加，减轻肝脏体重和改变身体成分。值得注意的是，Naringin通过增强棕色脂肪组织（BAT）（BAT）和刺激腹股沟白色脂肪组织（IWAT）刺激褐变的肉基因活性来增强测试小鼠的全身能量消耗的能力。此外，我们的结果表明，补充纳林蛋白改变了肠道菌群的组成，SPE逐渐增加了双歧杆菌和lachnospiraceae_bacterium_28-4，同时减少了lachnospiraceae_bacacterium_baccetterium_bactterium_bacterium_bacterium_bacterium_bacterium_bacterium_dww59 and dubosecress_n。随后，我们还发现，补充纳尔·英丁（Nar Ingin）通过显着促进牛磺酸，酪醇和胸腺的产生，改变了粪便代谢物谱，它们充当热量调节的有效活化剂。有趣的是，纳林蛋白的代谢作用通过抗生素干预消除了肠道菌群消耗，同时导致纳林蛋白诱导的热生成的消失以及对饮食诱导的肥胖症的保护作用。这一发现揭示了肠道细菌和脂肪组织之间的新型食物驱动的横截面通信。collective，我们的数据表明，补充纳林蛋白会刺激蝙蝠的热发生，改变脂肪分布，促进褐变过程，从而抑制体重增加。重要的是，这些代谢作用需要肠道细菌的参与。