参考:1。Thermo Scientific™sensitiTre™革兰氏阳性MIC板。马萨诸塞州沃尔瑟姆:Thermo Scientific™。2024年1月22日访问。https://www.thermofisher.com/search/browse/category/category/us/en/90222073 2。Hardydisks™Ceftolozane/Tazobactam,C/T40。圣玛丽亚,加利福尼亚州:Hardy Disk Diagnostics。2024年1月22日访问。https://hardydiagnostics.com/z9341 3。liofilchem®MTS™(麦克风测试条)。Roseto degli abruzzi(TE)意大利:liofilchem®S.R.L.2024年1月22日访问。https://www.liofilchem.com/solutions/clinical/clinical/arm/mts-mic-test-strip 4。vitek®2BioMérieuxprn 066862的新革兰氏阴性AST投资组合。盐湖城,犹他州:BioMérieuxusa。2024年1月22日访问。www.biomerieux-usa.com/patents 5。etest®ceftolozane/tazobactam。盐湖城,犹他州:BioMérieuxusa。2024年1月22日访问。https://www.biomerieux-usa.com/etest-ct 6。Microscan®革兰氏阴性组合面板。布雷亚,加利福尼亚:贝克曼·库尔特公司(Beckman Coulter,Inc。BD Phoenix™NMIC。新泽西州富兰克林湖:BD Phoenix™。2024年1月22日访问。https://www.bd.com/en-us/products-and-solutions/products 8。美国食品药品监督管理局。FDA认可的抗菌敏感性测试解释标准。访问2024年2月15日。临床和实验室标准研究所(CLSI)。第33版。第33版。抗菌敏感性测试的性能标准。CLSI补充M100 ISBN 978-1-68440-171-0。美国临床和实验室标准研究所,2023年。
到巴塞罗那高中希伯伦谷医学系血液学系,西班牙贝拉特拉08193和研究所。到巴塞罗那高中希伯伦谷医学系血液学系,西班牙贝拉特拉08193和研究所。
arrowia lipolytica 属于子囊菌门、酿酒菌亚门和双足菌科 (1)。除了工业用途 (2) 之外,Y. lipolytica 还广泛存在于食品、环境和动物中 (1)。由于其能够在 32°C 以上不稳定地生长,因此通常认为该菌种可安全用于工业用途 (1)。Yarrowia lipolytica 是一种机会性病原体,可引起侵袭性念珠菌病 (3)。在体外,该菌种被认为对氟康唑敏感 (4)。第一个 Y. lipolytica 基因组 (CLIB122) 于 2004 年发布 (5)。我们报告了对氟康唑有抗性的 Y. lipolytica 临床分离株的基因组草图,该分离株是从溃疡性结肠炎手术后的血培养中采集的。有趣的是,尽管之前曾接触过唑类药物,但使用梯度浓度试纸法(Etest;bioMérieux),该菌株的氟康唑 MIC 为 0.256 mg/mL。患者成功地用卡泊芬净治疗。该菌株在 35°C 的显色琼脂平板(CAN2;bioMérieux)上生长,并使用 Vitek 基质辅助激光解吸电离 - 飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 仪器(bioMérieux)进行鉴定。在溶菌酶细胞壁消化后,使用 QIAmp DNA minikit(Qiagen)提取基因组 DNA。使用 Illumina DNA 制备标记试剂盒(Illumina)构建文库。简而言之,使用珠状转座子技术和集成 DNA 技术 (IDT) 的 Illumina DNA/RNA 独特双重 (UD) 索引集将 30 ng 总 DNA 片段化并进行索引。使用 Qubit 高灵敏度试剂盒 (Thermo Fisher Scienti ) 对文库进行扩增、纯化和定量。最后,将 9 pM 汇集和变性文库放入 2 250-bp v2 试剂盒 (Illumina) 中,并使用 MiSeq 仪器 (Illumina) 进行测序。使用 CLC Genomics Workbench v22.0 (Qiagen) 中的 Trim Reads v2.5 和 De Novo Assembly v1.5 工具对原始读取进行修剪、组装成重叠群并进行搭建。使用覆盖率与长度图丢弃覆盖率为 , 10 且长度为 , 500 bp 的重叠群 (6)。使用 QUAST v5.0.2 对最终的 scaffold 集进行质量分析 (7)。总基因组大小为 20,255,408 bp,分布在 521 个 scaffold 上(覆盖率为 100 ),N 50 值为 105 kbp(最长 scaffold,397 kbp),GC 含量为 49.03%。AUGUSTUS v3.4.0 (8) 使用白色念珠菌训练数据集预测了 6,151 个蛋白质编码基因,使用 tRNAscan-SE 2.0 检测到了 484 个 tRNA 基因 (9)。使用 BUSCO v5.3.2 和 saccharomycetes_odb10 谱系数据集 (10) 估计基因组完整性为 95.3%。平均核苷酸同一性 (ANI) 计算
1神经系统疾病和感知身体的部门,波尔图医院中心 - 桑托·安东尼奥医院。(sara-avaco@uiowa.edu; saracavaco@yahoo.com)2波尔图大学生物医学研究的多学科单位。3爱荷华大学医学院的行为神经病学和认知神经科学的划分。
1 Centro de Biotecnolologe i y gen gen gen gen rica de Plantas(CBGP),研究所研究Instituto nacional deIncorkingaciónyy y y y y y y agraria y Food(Inia-csic),政治是Cnica de Madrid(UPM),28222333233323332233233 pozuelo de alarar c。 daniel.truchado@upm.es(D.A.T。); mjuamol@ibmcp.upv.es(M.J.-M。); sararincre@gmail.com(s.r。); lucia.zurita@inia.csic.es(L.Z. ); jaime.tome@upm.es(J.T.-A。) 2 Unidad deInnovación Biom是Dica,调查中心能量是TICAS,中世纪,tecnológicas(ciemat),Avenida Complutense 40,28040,西班牙马德里; chorz@ciemat.es 3 Institution ofResjuctionación健康医院12 de Octubre(IMAS12),Avenida decórdobas/n,28041 Madrid,西班牙4RespessivaciónBiom中心是Red de decáncer(Ciberonc),Avenida de Monforte de Monforte de Monforte de Monforte de lemos 3-5-5统治:fponz@inia.csic.es†当前地址:Biologo de Instituto deBiologoí分子Y Celular de Plantas(IBMCP),UPV-CSIC,C/de l'Enginyer Fausto Elio s/n,46022,46022,Val是Ncia,Spain。); jaime.tome@upm.es(J.T.-A。)2 Unidad deInnovación Biom是Dica,调查中心能量是TICAS,中世纪,tecnológicas(ciemat),Avenida Complutense 40,28040,西班牙马德里; chorz@ciemat.es 3 Institution ofResjuctionación健康医院12 de Octubre(IMAS12),Avenida decórdobas/n,28041 Madrid,西班牙4RespessivaciónBiom中心是Red de decáncer(Ciberonc),Avenida de Monforte de Monforte de Monforte de Monforte de lemos 3-5-5统治:fponz@inia.csic.es†当前地址:Biologo de Instituto deBiologoí分子Y Celular de Plantas(IBMCP),UPV-CSIC,C/de l'Enginyer Fausto Elio s/n,46022,46022,Val是Ncia,Spain。
1 马德里 12 de Octubre 健康研究中心 (imas12) iPS 细胞转化研究组,28041 马德里,西班牙 2 马德里自治大学医学院生物化学系,“Alberto Sols”生物医学研究所 (UAM-CSIC),28029 马德里,西班牙 3 马德里 12 de Octubre 健康研究中心 (imas12) 遗传学服务中心,28041 马德里,西班牙 4 马德里 12 de Octubre 健康研究中心 (imas12) 线粒体和神经肌肉疾病实验室,28041 马德里,西班牙 5 生物医学研究中心罕见疾病网络 (CIBERER) 提示,28029 马德里,西班牙 6 艾克斯-马赛大学,INSERM,MMG,13385 马赛,法国 7 分子、细胞和基因组生物医学研究组,健康研究所 La Fe (IIS La Fe),46029 瓦伦西亚,西班牙 * 通讯地址:egallardo.imas12@h12o.es
1 加的斯大学医学院人体解剖学和胚胎学系,西班牙加的斯 11003; noelia.geribaldi@uca.es(NG-D.); ricardo.pardillo@uca.es (RP-D.) 2 加的斯生物医学研究与创新研究所 (INiBICA),11009 加的斯,西班牙; ihervas91@gmail.com(IH-C.); ricardo.gomez@gm.uca.es (RG-O.); samuel.dominguez@uca.es(SD-G.); felix.ruiz@uca.es(法语); ilirene27@gmail.com(II-L.); livia@us.es(LC); jlgilsalu@hotmail.com(JLG-S.); pnunez@us.es (PN-A.) 3 加的斯大学医院 Puerta del Mar 研究部门,11009 加的斯,西班牙 4 加的斯大学医学院生理学领域,11003 加的斯,西班牙 5 加的斯大学医学院营养学领域,11003 加的斯,西班牙 6 塞维利亚大学药学院生理学系,41012 塞维利亚,西班牙 7 目前在阿利坎特卫生和生物医学研究所(ISABIAL)工作,03010 阿利坎特,西班牙 * 通讯地址:valor_lui@externos.gva.es (LMV); carmen.castro@uca.es (CC) † 这些作者对这项工作做出了同等贡献。
遗传学,疫苗和感染性DESEOS研究小组(GENVIP),圣地亚哥卫生研究所(IDIS)(IDIS),西班牙圣地亚哥·德·科斯特拉(Santiago de Compostela)西班牙c研究中心(CSIC),西班牙和生物群岛的De Compostela,在传染病网络(Ciberinfec),马德里,西班牙胆小的儿科和传染病疾病,西班牙疾病,西班牙临床医院,Spantiago deia compostera(Chusa)(CH)(CH)
伦敦大学学院、雷塔·莉拉·韦斯顿研究所,伦敦,英国; b 帕金森病和运动障碍科、神经内科、巴塞罗那医院诊所、奥古斯特·皮和桑耶尔生物医学研究所(IDIBAPS)、巴塞罗那大学、神经退行性炎症生物医学研究中心(CIBERNED:CB06/05/0018-ISCIII)巴塞罗那,巴塞罗那,西班牙; c 意大利罗马圣拉斐尔大学和 IRCCS San Raffaele Pisana 神经病学系; d 葡萄牙里斯本大学医学院临床药理学和治疗学实验室;以及 CNS – 神经学园区,葡萄牙托雷斯韦德拉什; f 神经科学和临床药理学系、临床研究中心 CIC1436 和 NS-Park/FCRIN 网络;法国图卢兹 INSERM 和图卢兹第三大学图卢兹大学医院; g 帕多瓦大学神经科学系神经退行性疾病研究中心(CESNE)运动障碍科; h 奥地利因斯布鲁克医科大学神经病学系
Clara Bueno(西班牙Josep Carreras Leukemia研究所)Raul Torres-Ruíz(西班牙CNIO)Talia Velasco-Hernandez(Spain) Eno(西班牙医学院生物医学学院的Josep Carreras Leukemia研究所)弗吉尼亚·罗德里格斯·科尔特斯(Josep Carreras Leukemia Research Institute,eritxell vinyoles) Ea Vegar-García(西班牙西班牙Sant JoandeDéu研究生血液学实验室)Sandra Rodriguez-Perales(西班牙CNIO)JoséSegovia(生物医学创新单位Oscar Quintana-Bustamante(CIEMAT/CIBERER/IIS-FJD,西班牙) Anindita Roy(牛津大学,英国) Claus Meyer(DCAL,法兰克福歌德大学药物生物学研究所,德国) Rolf Marschalek(法兰克福歌德大学,德国) Alastair Smith(韦瑟罗尔分子医学研究所,英国) Thomas Milne(牛津大学,英国) Mario Fraga(罕见疾病生物医学研究中心 (CIBERER),西班牙) Juan Ramón Tejedor(罕见疾病生物医学研究中心 (CIBERER),西班牙) Pablo Menéndez(加泰罗尼亚高等研究院 (ICREA),西班牙)