用于DNA和RNA样品的真实端到端电泳质量控制的完整解决方案是自动电泳解决方案,用于DNA和RNA样品的质量控制(QC)。挂接系统是多合一的平台,其中包括仪器,数据处理软件,试剂和现成的屏幕截图设备,用于分析样本量,数量和完整性。提供高度准确和精确的分析评估,该系统完美地拟合到下一代测序(NGS),生物库或疫苗开发工作流程,用于低到高样品吞吐量。
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C. 使用另一款市场领先的柱式试剂盒 Apostle MiniMax ®(试剂盒 A)从 cfDNA 试管 1 和 cfDNA 试管 2 中采集的 1 mL 血浆中提取 DNA。此外,还使用另一款市场领先的柱式试剂盒 Apostle MiniMax ®(试剂盒 A)和另一个基于微珠的试剂盒(试剂盒 B)从 EDTA 采集管中采集的 1 mL 血浆中提取 DNA。对于每个试管,Apostle MiniMax ® 提取的 DNA 总产量更高。使用 Agilent Bioanalyzer 2100 分析 DNA 大小。对于所有三种试管类型,Bioanalyzer 的曲线表明提取的 DNA 与预期的 cfDNA 大小(约 170 bp)相关。
Dovetail®,DovetailGenomics®和Hirise®是美国和/或其他国家的Cantata Bio LLC的全资子公司Dovetail Genomics,LLC的商标。iLlumina®,HISEQ®,Miseq®,Miniseq®,ISEQ®,NextSeq®,NovaseQ®是Illumina,Inc。的注册商标。BeckmanCoulter™和Spriselect®是Beckman Coulter,Inc.Qubit®的商标或注册商标。Tapestation®和Bioanalyzer®系统是安捷伦技术的注册商标。Invitrogen®是Thermo Fisher Scientific Inc.的注册商标
图 1. 使用 Norgen 的 cf-DNA/cf-RNA 保存管保存的血浆中含有大量 cf-DNA。将来自同一供体的血液样本抽入竞争对手的管或 Norgen 的 cf-DNA/cf-RNA 保存管中,并在室温下保存 7 天。Norgen 的 cf-DNA/cf-RNA 保存管回收了 6.5 毫升血浆,而竞争对手的管回收了 3.5 毫升血浆。然后使用 Norgen 的血浆/血清无细胞循环 DNA 纯化中型试剂盒 (Cat. 55600) 和 Norgen 的血浆/血清无细胞循环 DNA 纯化大型试剂盒 (Cat. 55800) 从每个管中回收的整个血浆体积中分离 cf-DNA。使用安捷伦生物分析仪高灵敏度 DNA 芯片评估从两个样本中回收的 DNA 数量。从生物分析仪的痕迹可以看出,与从竞争对手的防腐管中回收的 cf-DNA 相比,Norgen 的防腐管产生了更多的 cf-DNA(蓝色峰)。
定性和定量核酸数据或命令专业基因组学实验室进行此类分析。不符合所选测序文库制备方案中指定的质量标准的样本仅在获得书面同意的情况下进行处理,其中用户同意其不会收到任何成功建库的保证,并且将承担与获得成功建库的尝试(包括不成功的尝试)相关的全部费用。 2. 提交现成DNA库的用户需遵循样本分析部门负责人批准的样本制备方案。他们还应提供所提供文库的质量数据(使用 Agilent Bioanalyzer 或类似设备获得的结果)或订购专业基因组学实验室对文库质量进行分析。在提交文库进行测序之前,应该报告任何修改(例如由于人为错误)。对于用户提供的文库,基因组学专家实验室对所获得的测序结果的质量不承担任何责任。 3. 提交测序结果进行分析的用户应
图3。水溶液中珠与DNA比对碎片恢复的影响。 为了确定不同的珠与DNA比对DNA片段尺寸选择的影响,将DNA尺寸梯子稀释至总体积为50 µL,并与各种体积的QIASEQ珠子从25 µL(0.5倍)到75 µL(1.5x)孵育。 在室温下DNA结合5分钟后,将管子放在磁性台上,再将溶液清除为止。 接下来,将上清液丢弃,并用200 µl 80%乙醇洗涤两次珠子。 在最终的乙醇洗涤后,除去上清液并将磁珠完全干燥。 将沉淀在6 µL缓冲液EB中洗脱。 在Agilent生物分析仪高灵敏度芯片上分析了等分试样(1 µL)以及未覆盖的尺寸梯子(参考阶梯)。 (a)片段定量。 (b)片段分布的百分比与参考相比。水溶液中珠与DNA比对碎片恢复的影响。为了确定不同的珠与DNA比对DNA片段尺寸选择的影响,将DNA尺寸梯子稀释至总体积为50 µL,并与各种体积的QIASEQ珠子从25 µL(0.5倍)到75 µL(1.5x)孵育。在室温下DNA结合5分钟后,将管子放在磁性台上,再将溶液清除为止。接下来,将上清液丢弃,并用200 µl 80%乙醇洗涤两次珠子。在最终的乙醇洗涤后,除去上清液并将磁珠完全干燥。将沉淀在6 µL缓冲液EB中洗脱。在Agilent生物分析仪高灵敏度芯片上分析了等分试样(1 µL)以及未覆盖的尺寸梯子(参考阶梯)。(a)片段定量。(b)片段分布的百分比与参考相比。
图 3. Bioanalyzer 2100 DNA 12000 右侧尺寸选择日期。A1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 0.5 倍。B1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 0.6 倍。C1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 0.7 倍。D1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 0.8 倍。E1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 1.0 倍。F1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 1.4 倍。A2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 – 0.5 倍/2.0 倍。B2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 – 0.6 倍/1.9 倍。C2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 – 0.7 倍/1.8 倍。 D2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 — 0.8×/1.7×。E2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 — 1.0×/1.5×。F2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 — 1.4×/1.1×。
图 1. 使用 Norgen 的 cf-DNA/cf-RNA 保存管保存的血浆中含有大量 cf-DNA。将来自同一供体的血液样本抽入竞争对手的管或 Norgen 的 cf-DNA/cf-RNA 保存管中,并在室温下保存 7 天。Norgen 的 cf-DNA/cf-RNA 保存管回收了 6.5 毫升血浆,而竞争对手的管回收了 3.5 毫升血浆。然后使用 Norgen 的血浆/血清无细胞循环 DNA 纯化中型试剂盒 (Cat. 55600) 和 Norgen 的血浆/血清无细胞循环 DNA 纯化大型试剂盒 (Cat. 55800) 从每个管中回收的整个血浆体积中分离 cf-DNA。使用安捷伦生物分析仪高灵敏度 DNA 芯片评估从两个样本中回收的 DNA 数量。从生物分析仪的痕迹可以看出,与从竞争对手的防腐管中回收的 cf-DNA 相比,Norgen 的防腐管产生了更多的 cf-DNA(蓝色峰)。