全基因组筛选是全面了解生物现象分子机制的有效方法。然而,尽管它在过去几十年中广泛应用于各种生物目标,但将其应用于具有暂时和可逆生物输出的生化反应仍然是一项艰巨的挑战。为了揭示各种生化反应背后的分子机制,我们最近开发了复兴筛选方法,该方法结合了基于流式细胞术的细胞分选和从收集的细胞中重建文库。我们对传统全基因组筛选技术的改进已被证明能成功揭示感兴趣的生化反应的分子机制。在本文中,我们阐明了复兴筛选的技术基础,重点介绍了其在 CRISPR-Cas9 单向导 RNA (sgRNA) 文库筛选中的应用。最后,我们还讨论了全基因组筛选的未来,并描述了体外和体内筛选的最新成果。
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BC 401 综合生物化学 I 学分:3 (3-0-0) 课程描述:大分子结构和动力学;膜;酶;生物能学。先决条件:(CHEM 241 或 CHEM 245 或 CHEM 343,可同时修读)和(MATH 155 或 MATH 160)和(LIFE 201B,可同时修读或 BZ 350,可同时修读或 SOCR 330,可同时修读)。限制:不得为:大一学生。注册信息:大二学生。可提供的课程:在线。提供的学期:秋季、春季。评分模式:传统。特殊课程费用:否。
在过去的几十年中,生物技术工具的应用改变了制造食品和药品的过程。这些工具是指使用生物学手段来处理自然资源的工程和科学原理。工具,包括使用酶,合成和系统生物学以及生化工艺工程的工具,用于开发面包,葡萄酒,葡萄酒,蒸馏烈酒,氨基酸,有机酸,抗生素,维生素等产品。这些产品具有数十亿美元的市场价值,制造它们的行业需要高素质的专业人员,对涉及用于制造它们的流程的基本和工程原则有核心了解。目前在印度和国外,对工业生物技术的兴趣越来越大,重点是精确发酵作为蜂窝农业的一部分。细胞农业涉及使用大规模发酵来生产具有特定功能或感觉特征的产品。精确发酵的当前状态仍在研发中。与传统的发酵不同,精确发酵需要更密集的控制和制造过程,这需要对主题的了解,包括生物反应器设计和分析,仪器和控制以及扩展。
目前,柠檬酸是通过微生物发酵生产的,使用各种微生物,有三种不同的技术,即深层发酵 (SmF)、固态发酵 (SSF) 和液体表面发酵 (LSF)。目前,柠檬酸的大部分商业化生产是通过深层发酵,使用 A. niger 作为糖工业副产品的底物。然而,最近,固态发酵的开发已显示出一些前景,有望成为柠檬酸商业化生产深层发酵的替代品。为了找到一种比现有发酵技术更有效、更省油、更省力、更经济的柠檬酸生产替代发酵技术,本综述对固态发酵和深层发酵进行了比较。
制备标准溶液和试剂;碳水化合物:定性反应;淀粉的估计;从水果中估计减少和非还原糖;氨基酸:氨基酸的反应;蛋白质:通过Lowry方法估计蛋白质;脂肪酸:游离脂肪酸的估计;测定碘植物油数量的数量;维生素:抗坏血酸的估计;技术:纸色谱法,薄层色谱;从花中提取的色素的电泳,从油种子中提取油;酶:酶测定,酶固定。
天然产品在整个人类历史上都发挥了重要作用。在这里,我们首先提供了天然产品的简要概述,它们的分类和生物合成起源,以及用于发现的生物学和遗传学方法。我们还描述并讨论了彻底改变该领域的技术,这些技术从经典遗传学转变为大约二十年前的以基因组为中心的发现。然后,我们突出显示了当前基因组时代的最新进展和AP,其中基因组挖掘是一种标准操作,高通量分析方法允许以前所未有的速度平行发现基因和分子。最后,我们解决了天然产物领域以及系统异源表达和不依赖应变的发现所面临的新挑战,该发现有望比以往任何时候都提供更多的小瓶分子。
CRISPR-Cas(成簇的规律间隔的短回文重复序列 - CRISPR 相关核酸酶)防御系统已多次自然地用于指导 RNA 定向转座。在所有情况下,转座子 Tn7 相关的各种元件都参与了转座。Tn7 严格控制转座;只有当专用靶位选择蛋白识别特殊靶标时,转座酶才会被激活。Tn7 和与 CRISPR-Cas 系统合作的 Tn7 样元件进化出了互补的靶向途径:一条途径识别染色体中高度保守的位点,另一条途径靶向能够进行细胞间转移的移动质粒。Tn7 和 Tn7 样元件将单一整合传递到它们识别的位点,并控制整合事件的方向,为未来用作可编程基因整合工具提供了潜力。早期研究表明,引导 RNA 介导的转座系统可以适应不同的宿主,甚至在微生物群落内,这表明将这些系统设计为强大的基因编辑工具具有巨大的潜力。