CRISPR 介导的基因扰动研究的成功高度依赖于 gRNA 的质量,并且已经开发了几种工具来实现最佳的 gRNA 设计。然而,这些工具并不都适用于最新的 CRISPR 模式或核酸酶,也没有提供全面的注释方法或用于高级 CRISPR 应用的可扩展性。在这里,我们介绍了一个新的 R 包生态系统,它能够为多种 CRISPR 技术实现高效的 gRNA 设计和注释,包括 CRISPR 敲除、CRISPR 激活 CRISPR 干扰和 CRISPR 碱基编辑。核心包 crisprDesign 提供了一个全面、用户友好且统一的界面,可通过几种比对方法添加靶向和脱靶注释、丰富的基因和 SNP 注释以及十几个靶向和脱靶活动分数。这些功能适用于任何 RNA 或 DNA 靶向核酸酶,包括 Cas9、Cas12 和 Cas13。我们通过为三个案例研究设计最佳 gRNA 来说明我们工具的普遍适用性:使用碱基编辑器 BE4max 平铺 BRCA1 的 CRISPRbe 库、使用 CasRx 平铺 CD46 和 CD55 的 RNA 靶向库以及使用 CRISPRa 激活 MMP7。我们的 R 软件包套件是开源的,并通过 Bioconductor 项目部署,以方便 CRISPR 社区使用它们。
入侵物种解决方案中心衷心感谢其成员和合作伙伴为支持其活动而提供的资金和实物捐助。入侵动物有限公司负责管理入侵物种解决方案中心。该项目获得了澳大利亚政府农业、水利和环境部的资助,以及联邦科学与工业研究组织 (CSIRO)、西澳大利亚州初级产业和区域发展部 (WA DPIRD) 和西澳大利亚州生物多样性、保护和景点部 (WA DBCA) 的实物支持。我们真诚感谢许多参与者抽出时间参加两次利益相关者研讨会,这些研讨会是在 CSIRO 社会科学人类研究伦理委员会 (CSSHREC) 授权 144/19 下举办的,由 PiqueGlobal Ltd. 的 David Romano 独立主持。我们感谢指导委员会在整个项目中的指导和领导,以及 Krista Verlis 和 Raghu Sathyamurthy 对报告草案的评论。本文件由 Wendy Ruscoe、Susan Campbell、Lucy Carter、Aditi Mankad、Peter Brown、Margaret Byrne、Kevin Oh、Mark Tizard 和 Tanja Strive 编写。本文件应引用为:Wendy Ruscoe、Susan Campbell、Lucy Carter、Aditi Mankad、Peter Brown、Margaret Byrne、Kevin Oh、Mark Tizard 和 Tanja Strive。(2021 年)脊椎动物害虫的遗传生物防治技术:决策框架摘要。向入侵物种解决方案中心提交的报告。堪培拉。由澳大利亚堪培拉入侵物种解决方案中心出版 www.vasives.com.au 印刷版 ISBN:978-1-925727-30-2 网站版 ISBN:978-1-925727-30-2 本报告可出于研究、讨论、记录保存、教育用途或其他公共利益的目的引用,但任何此类引用均承认入侵物种解决方案中心和出版物的作者。© 2021 Invasive Animals Ltd 封面图片:家鼠作者:Peter Brown © CSIRO。欧洲兔作者:Lawrence Sanders。欧洲鲤鱼作者:Marc Ainsworth。海蟾蜍作者:Tyler Monachino。
作为一个全球企业公民,我们致力于以可负担的价格提供基本和救命药物为平台,包括仿制药和生物仿制药。可负担性一直是中低收入国家 (LMIC) 患者以及许多高收入国家买不起保险的患者面临的挑战。在过去二十年里,我们为全球数百万患者提供了公平且可负担的药物,无论是维持生命的免疫抑制剂,还是乳腺癌药物,还是治疗糖尿病的胰岛素和胰岛素类似物。我们投资创建了最先进的全球规模生产设施,以规模经济的方式生产高质量的药物。卓越的运营
基因修饰的生物(GMO)已成为可持续生物经济学的组成部分,并在农业,生物能源和生物医学中有一系列应用。然而,转基因生物和相关合成生物学方法的快速发展引发了许多与环境逃生,检测以及对天然生态系统的影响有关的生物安全问题。已经部署在各种微生物宿主中,从经典的相互作用到全球基因组进行重新编码,已经部署了无数的遗传保护措施。然而,为了实现微生物作为生物经济中的生物催化平台的全部潜力,需要更深入地了解有关生物膜片约束的微生物响应能力的基本原理以及转基因生物与环境的相互作用。在此,我们回顾了评估生物内生物培养和微生物生物生物生产力的最新分析生物技术进步和策略,以及预测系统生物设计的机会,以确保可行的生物经济。
摘要:蛋白质具有将多种疾病视为治疗疾病和药物载体的能力,这是由于其复杂的功能性能,具有结合伴侣的特定性,生物相容性和可编程性。尽管如此,由于药代动力学特性和膜不渗透性,天然蛋白通常需要援助来靶向患病组织。通过直接结合输送部分来使治疗蛋白和药物载体功能化功能可以增强输送能力。传统上,这是通过对修改的位置或方向几乎没有控制的生物缀合方法来完成的,从而导致高度异质产物具有不同的活性。已经开发出了多种有希望的特定地点蛋白结合方法,以允许更多可调节的递送部分显示,从而增强蛋白质活性,循环特性和靶向特定的特异性。在这里,我们专注于三个特别有前途的特定地点生物缀合技术:蛋白质递送:不自然的氨基酸掺入,分类酶介导的连接和Spycatcher/Spytag化学。在这篇综述中,我们强调了特定地点生物结合对靶向药物传递的承诺,通过总结文献中有影响力的例子,考虑到构建生物缀合物时的重要设计原理,并讨论我们对未来方向的观点。■简介