保留所有权利。未经许可不得重复使用。永久。预印本(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 medRxiv 许可,可以在此版本中显示预印本。版权所有者于 2025 年 1 月 29 日发布此版本。;https://doi.org/10.1101/2025.01.27.25321226 doi: medRxiv preprint
与编码基因类似,miRNA 由 RNA 聚合酶 II 从 miRNA/MIR 基因转录成长的初级转录本,称为初级/pri miRNA(图1)。此后,pri-miRNA 被 RNaseIII 样酶(称为 DICER-LIKE (DCL 1))与其他蛋白质一起切割成前体/前 miRNA。这些前 miRNA 进一步由 DCL1 加工成 20-24 个核苷酸长的 miRNA:miRNA 双链体。然后,双链体在 3' 端被 HUA 增强子 1 甲基化,并通过 EXPORTIN-5 输出到细胞质中。然后将双链体加载到含有 ARGONAUTE (AGO) 蛋白的 RNA 诱导沉默复合物 (RISC) 中。来自 miRNA:miRNA 双链中只有一条 RNA 链被加载到 RISC 上,而另一条链被小 RNA 降解核酸酶降解。最后,加载的 miRNA 将 RISC 靶向其互补的 mRNA,因此,根据其与目标 mRNA 的互补程度,它可能导致两种结果。如果 miRNA 与目标 mRNA 高度同源,则可能导致 mRNA 的位点特异性裂解,而与目标 mRNA 的弱碱基配对则导致翻译抑制(图1)。
铁硫 (Fe–S) 蛋白对于产甲烷菌进行甲烷生成和生物固氮(固氮)的能力至关重要。尽管如此,产甲烷菌中 Fe–S 簇生物合成所涉及的因素仍然很大程度上未知。最小 SUF Fe–S 簇生物合成系统 (即 SufBC) 被假定为产甲烷菌中的主要系统。本文研究了 SufBC 在含有两个 sufCB 基因簇的 Methanosarcina acetivorans 中的作用。CRISPRi-dCas9 和 CRISPR-Cas9 系统分别用于抑制或删除 sufC1B1 和 sufC2B2 。在任何测试条件下,包括固氮,无论是 sufC1B1 和 sufC2B2 的双重抑制还是同时删除 sufC1B1 和 sufC2B2 都不会影响 M. acetivorans 的生长。有趣的是,仅删除 sufC1B1 在所有生长条件下都会导致生长延迟表型,这表明 sufC2B2 的删除在没有 sufC1B1 的情况下起到了抑制突变的作用。此外,删除 sufC1B1 和/或 sufC2B2 不会影响 M. acetivorans 细胞中的总 Fe-S 簇含量。总体而言,这些结果表明最小 SUF 系统不是 M. acetivorans 中 Fe-S 簇生物合成所必需的,并挑战了 SufBC 在产甲烷菌中 Fe-S 簇生物合成中的普遍作用。
Target Gene Forward Reverse Bop1 GGTCTCGGAGGAAGAGCACC ACCGCCAAATAGTCCCCTCG Gapdh GGTCCTCAGTGTAGCCCAAG AATGTGTCCGTCGTGGATCT Gemin4 CCTCACAGGTCCACGAAGGG TGCCCACATCCATCACCAGA Its1 TCCATCTGTTCTCCTCTCTCT ATCGGTATTTCGGGTGTGAG Its2 CTGCCTCACCAGTCTTTCTC ACCTCGACCAGAGCAGAT Ecad ACACCGATGGTGAGGGTACACAGG ACACCGATGGTGAGGGTACACAGG Ncad AAAGAGCGCCAAGCCAAGCAGC TGCGGATCGGACTGGGTACTGTG Nop58 acagcagaagcatagcagca cgacagccaggggttcatgg npm1 gcgagagatctcctgcgcgaccat acttcggtgtgtggggagaagcc cascl tgctaaggcagttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttctagtagttagta AAGGAAATGCCCTGAAGCCG Rpl29 GCAGTGAGGGAAGCTTTTCCG CATGTCTGCACGGTAACCCG Rpl8 ACAGAGCTGTTCATCGCAGC ACGATCGTACCCTCAGGCAT Rps24 ACACAGTAACCATCCGGACCA TTTTGGCCAGCTTTTCCCGA Rps28 GATATCCAGAACCCCACCAGC AATGTCAAAGGCCCCGTTCG Rps9 GTCTCGGGCCTGAGTTCGTA CCTGCGCAGTAAAGTGTCGT S100a4 CCTGTCCTGCATTGCCATGAT CCCACTGGCAAACTACACCC Setd4 GGAACTGCGCGTCCTTGTG gtaacaaaaacgccctcgcgca蜗牛Actggtgagaagccattctcct ctggcactggtatctcttcaca utp6 agggcatttgggggggggggggggggggggggggggtgggggggggggggtgggtctgtctctctcagt vim
核糖体生物发生的摘要是癌症的标志,促进了对转化需求改变的适应性,这是肿瘤进展的必要方面的必要方面。在核糖体生物发生和癌症中,复杂的互相互相互动,强调了动态调节,由致癌信号传导路径策划了。研究研究核糖体的多卵形作用,Xtending be y ond蛋白f Actories中,将调节功能包括在mRNA翻译中。dy的核糖体生物发生不仅会阻碍对全球蛋白质产生和增殖的精确控制,还影响了诸如维持干细胞样性质和上皮间质转变等过程,导致癌症进展。干扰核糖体生物发生,尤其是通过RNA Pol I抑制作用,引起以核仁完整性丧失为标志的应力反应以及随后的G1细胞周期停滞或细胞死亡。这些发现表明,癌细胞可能依赖于RNA Pol I转录的增强,从而使核糖体RNA合成成为潜在的治疗脆弱性。<部门进一步探讨了靶向核糖体生物发生脆弱性,这是破坏全球核糖体生产的有前途的策略,为癌症治疗带来了治疗机会。
摘要:烟酰胺单核苷酸(NMN)已成为针对年龄相关疾病(包括2型糖尿病)的有希望的治疗干预措施。在这项研究中,我们证实了NMN治疗对葡萄糖摄取的先前观察到的影响,并研究了其在各种组织和细胞系中的基本机制。通过迄今为止最全面的蛋白质组学分析,我们发现了一系列新型器官特异性作用,负责通过IPGTT:脂肪组织生长来测量的葡萄糖摄取(通过增加蛋白质合成,降解和MTORPORPRIFTIAL SIGNAMENTION提高)。值得注意的是,我们观察到了热UCP1的上调,促进了肌间脂肪组织中的葡萄糖转化为热量,同时显示出对肌肉和大脑线粒体生物发生的令人惊讶的抑制作用。此外,肝脏和肌肉细胞表现出独特的反应,其特征是剪接体下调和同时上调伴侣,蛋白酶体和核糖体,从而导致轻度受损和能量感知的蛋白质合成机制。此外,我们的发现揭示了大脑中明显的代谢重新布线。这涉及增加酮体的产生,线粒体Oxphos和TCA循环成分的下调以及诱导众所周知的禁食相关作用。共同阐明了NMN作用的多方面性质,突出了其特异性效应及其在改善葡萄糖摄取中的作用。这些发现加深了我们对NMN治疗潜力的理解,并为管理代谢疾病的新策略铺平了道路。
简单摘要:这项研究研究了人淋巴结细胞系中异构体生物发生的顺式调节。总共95个SNP – Isomir对表现出SNP和5'以异构体之间的显着关联,包括基础取代,三件替代,扩展和添加。值得注意的是,该研究确定了Rs6505162和HSA-MIR-423-3P的5'扩展之间的关联,以及HSA-MIR-423-5P的5'修剪。此外,Isomir表达与TCGA数据集中乳腺癌状态的相关性为与乳腺癌肿瘤发生的遗传关联提供了宝贵的见解。这项研究还强调说,规范miRNA可能不是人淋巴母细胞系中最丰富的异构体,强调了异构体在生物过程中的作用。此外,miRNA的等位基因表达的存在表明遗传变异参与miRNA调节。
KMT2C 和 KMT2D 是人类癌症中最常见的突变表观遗传基因。虽然 KMT2C 被确定为急性髓系白血病 (AML) 中的肿瘤抑制因子,但 KMT2D 在这种疾病中的作用仍不清楚,尽管它的缺失会促进 B 细胞淋巴瘤和各种实体癌。据报道,KMT2D 在 AML 中下调或突变,并且通过 shRNA 敲低或 CRISPR/Cas9 编辑导致其缺陷会加速小鼠的白血病形成。造血干细胞和祖细胞以及 Kmt2d 缺失的 AML 细胞的核糖体生物合成显著增强,并且核仁持续增大,rRNA 和蛋白质合成率增加。从机制上讲,发现 KMT2D 缺陷会导致小鼠和人类 AML 细胞中 mTOR 通路的激活。 Kmt2d 直接调节 Ddit4 的表达,Ddit4 是 mTOR 通路的负调节因子。与核糖体生物合成异常一致,研究表明,RNA 聚合酶 I 抑制剂 CX-5461 可显著抑制体内 Kmt2d 缺失的 AML 生长,并延长白血病小鼠的生存期。这些研究证实 KMT2D 是 AML 中事实上的肿瘤抑制因子,并揭示了对核糖体生物合成抑制前所未有的脆弱性。