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生物信息学和微生物组中的硕士论文
项目背景：微生物组在人类健康和疾病中起重要作用。下一代16S rRNA基因测序是一种强大的技术，用于表征粪便，诸如感染，癌症，糖尿病，神经退行性疾病和肥胖等疾病的样品中的细菌组成。微生物组分析有望有望诊断和整合常规临床微生物学。但是，16S测序数据所需的生物信息学分析的复杂性仍然是一个主要障碍。开发简化的管道来简化此分析对于常规诊断使用至关重要。目标：该项目的目的是通过一般微生物组组成输出来构建和验证16S rRNA基因测序分析的标准化生物信息学管道和工作流程。方法：Qiime2将与NextFlow结合使用，以创建标准化的16S rRNA测序工作流，用于微生物组分析。微生物组测序和常规诊断的分析数据将用于测试和验证工作流程。
基础分子遗传技术和生物信息学...
在过去十年中，SAAPBT 开展了 20 多个分子遗传技术和生物信息学工具培训项目。这些项目使 200 多名参与者受益，包括来自兽医、农业、医学和纯科学研究和教学领域的教职员工、研究生和博士学者。基于这一经验，SAAPBT 目前正在 Thrissur 的 Mannuthy 兽医和动物科学学院 SAAPBT 组织一项名为“生命科学研究的基本分子遗传技术和生物信息学工具”的培训项目。该项目专为参与生物科学研究或教学的政府和私人机构的教职员工、研究人员和专业人士而设计。对于那些在分子遗传学实验室工作的人来说，它尤其有价值。培训涉及广泛的学科，包括兽医学、农业、医学和基础科学研究。培训分为两个模块，参与者可以选择其中一个模块或两个模块。每个模块都提供有针对性的培训，参与者完成每个模块后都会获得证书。
生物启发的kirigami metasurfaces作为辅助鞋握把
摘要：跌倒和随后的并发症是导致发病率和死亡率的主要因素，尤其是在老年人中。为了解决这个问题，我们旨在开发一种轻巧的动态装置，以增加鞋子和步行表面之间的摩擦，这些设备在各个表面，尤其是冰之间有效。受自然界中发现的爪子和鳞片的启发，我们开发了一系列的基里加米结构，这些结构可用于鞋类外极端，以在前脚中产生较高的摩擦力。我们通过数值模拟，体外表面相互作用和体内人力板测量评估了这些元面孔，以鉴定能够调节一系列表面摩擦的最佳基里加米设计。我们预计这些系统的潜在应用可以帮助减轻各种环境中跌倒的风险。
复制 Cynandra opis 蝴蝶的结构颜色，用于仿生双色滤光片
微结构或纳米结构会引起衍射、干涉和散射。[3] 以这种方式产生的结构色通常与角度有关（彩虹色），与光吸收产生的颜色相比，结构色更鲜艳、可调且稳定。[4] 到目前为止，已有多种光子结构被用于产生结构色并取代传统的色素沉着。这些包括可调高折射率光子玻璃、微米级球形胶体组件和衍射光栅结构。[5,6] 虽然仿生光子结构已被用于创造高度饱和的结构色，但它们制造困难且成本高，不适合大规模生产。此外，整个可见光谱范围内对新的仿生结构色的需求尚未得到满足。因此，更好地理解结构着色的潜在机制无疑将改善颜色特性和寿命。虽然自然界中存在大量结构色的例子，但由于蝴蝶翅膀的光子纳米结构颜色鲜艳，因此人们对其的研究兴趣颇多。[7,8] 例如，Vigneron 等人发现，Pierella luna（月神蝴蝶）翅膀鳞片产生的彩虹色效应是由整个鳞片的宏观变形引起的，当翅膀被白光照射时，就像衍射光栅一样分解
2024-25 年度生物信息学硕士预录取名单
1S 2816 NIOHI PREM MISHRA 女 将军 72.87 71.63 72.25 16 615 SHRUTINARENDRAJADHAV 女 SC 70.37 69.87 70.12 11 \ 440 RffiJEN RAFE RAFERALE 将军 65.88 67.38 66.63 18 3665 FERJN SHANTILAL PATEL 女 将军 56 58.62 57.31 19 3478 PRrYANKA RAMESH RAMES .. 女 将军.RAL 52.62.SSS 54.06.
生物信息学和基因组数据分析简介
II。 菜单此学科提供了生物信息学和基因组数据分析的基本概念和工具的介绍。 该课程解决了生物信息学的历史和重要性，生物数据库的使用，序列比对技术和相似性搜索，新一代测序方法（NGS）以及遗传变异性分析。 学生将通过为分子和基因组生物学的实际应用做好准备来学习如何解释和分析基本基因组数据。II。菜单此学科提供了生物信息学和基因组数据分析的基本概念和工具的介绍。该课程解决了生物信息学的历史和重要性，生物数据库的使用，序列比对技术和相似性搜索，新一代测序方法（NGS）以及遗传变异性分析。学生将通过为分子和基因组生物学的实际应用做好准备来学习如何解释和分析基本基因组数据。
bioinformatics_dsi.docx
立场摘要Ifakara Health Institute（IHI）与卫生部通过国家疟疾控制计划，总统办公室，地区管理局和地方政府以及国家医学研究所（NIMR）共同实施了Malararia Malararia在Tanzania内部（MSMT2）项目的第二阶段。同时，IHI正在寻求一名精力充沛，熟练的后博士后研究员，以加入我们的团队，进行一项尖端的研究项目，专注于MSMT项目的第二阶段。成功的候选人将与多学科研究人员，公共卫生专业人员以及本地和国际利益相关者紧密合作，以增强和规模，以增强和扩展本地能力，以基于该项目的目标，以支持分子，遗传，基因组和数据分析，以支持疟疾分子监测和其他要求。该项目最终将支持政策变化，并为坦桑尼亚的疟疾控制和消除提供明智的决策。
相关免疫细胞浸润的生物信息学分析...
方法：用于对ONFH患者和健康对照组中的mRNA表达训练进行仔细检查，其数据整合来自GEO数据库。de mRNA。通过基因和基因组（KEGG）途径富集分析，基因本体论（GO）功能分析以及基因集富集分析（GSEA）的基因和基因组（KEGG）途径富集分析，基因和基因组百科全书（GSEA）探索了DE mRNA的生物学功能。此外，支持向量机 - 递归特征消除（SVM-RFE）和最低绝对收缩和选择操作员（Lasso）（Lasso）被用来辨别与该疾病相关的诊断生物标志物。接收器操作特征（ROC）分析用于评估特征基因的统计性能。使用QRT-PCR在从ONFH患者和健康对照组中获得的骨组织中进行关键基因的验证。成骨分化，以验证关键基因与成骨分化之间的相关性。最后，执行免疫细胞进行锻炼分析以评估ONFH中的免疫细胞失调，同时探索免疫细胞内效率与关键基因之间的相关性。
程序生物信息学课程2024 .docx
目标：为来自拉丁美洲国家的研究生和年轻研究人员提供单细胞转录组学和蛋白质组学的基础知识。在此课程中，参加者将学习如何使用可用的基于R的计算和统计方法来分析免疫细胞数据集。该课程的组织方式是在早晨，在聆听主题演讲者的工作之后，将讨论不同技术的理论方面，在下午，计算和统计方法的专家将提供个性化培训，以分析免疫细胞数据集（来自文献或早晨暴露的论文）。尽管在过去几年中已经实施了几门虚拟课程，但我们仍然认为面对面的会议允许最大程度的互动。因此，下午的会议将以一个教授/组织者将协助一组4-5名学生的方式组织。将向每个组提供一组带有相关数据集的纸张，并在课程期间分析，并将在最后一天评估结果的最终介绍。重点将放在实施常用的软件和管道上（例如Cellranger，Seurat，ArchR）。我们期望为早期研究人员和学员创造一个培养和支持的环境，从而影响我们的研究，教学和卫生系统的质量。