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生物信息学：论文803（BIF 803）
此处发布的信息可能会发生变化，并且可以在此信息发布后修改。一般法规（G法规）适用于比勒陀利亚大学的所有学院。期望学生对这些法规以及一般规则部分中包含的信息很好地熟悉自己。关于这些法规和规则的无知将不会被视为任何违法行为的借口。
土壤生物多样性和线虫作为土壤健康的生物指导者（C003954）
本课程的总体目的是提供洞察陆地生态系统的结构和功能，特别着重于线虫多样性及其用作健康土壤的生物指导者。因此，本课程应启动可持续的土壤管理。在第一部分中，学生将获得对土壤生态学对土壤结构，土壤生育能力，养分平衡，碳固存和植物生产的重要性的见解。第二部分包括对“社区”和“功能”指数的详尽讨论及其与土壤监测的相关性。在第三部分中，学生将获得技能，以识别生态相关的分类学水平，以识别自由生活的陆地线虫。理论部分中介绍的理论知识将通过案例研究来说明，并在现场进行采样和实验室分析以及通过练习来说明。非常强调为学生提供有关数据集分析和结果解释的相关方法，目的是使学生能够自主对使用线虫作为模型的陆地土壤问题进行自主进行研究。
生物信息学（C004122）中的Capita Selecta
1本课程主要旨在表明学生表明生物信息学的领域是1个完整的开发中，它显示了不同的应用程序如何推动生物信息学中的基本研究，以及如何支持生物信息学来支持和1利用湿实验室研究。2对生物信息学应用领域的高级知识。3在生物信息学中识别重要的生物信息学方法。4理解英语的研讨会，用英语写报告。5了解寿命长期学习的重要性对于迅速发展的领域是一种生物信息学。6意识到与生物信息学有关的道德话题（例如合成1生物学，患者信息的机密性）。
生物信息学中的Chatgpt和DeepSeek -IJRPR
近年来，人工智能（AI）已成为各个领域的强大工具，生物信息学是其表现出变革性潜力的最杰出领域之一。生物信息学涉及大规模的生物学数据分析，包括基因组序列，蛋白质结构和临床数据。使用机器学习（ML），深度学习（DL）和自然语言处理（NLP）技术在理解复杂的生物学现象方面加速了进展，而在这项革命的最前沿，是OpenAI开发的大型语言模型。chatgpt建立在GPT（生成预审预测的变压器）等尖端神经网络体系结构上，在文本生成，数据解释甚至对话交流方面都表现出了非凡的功能。其在生物信息学中的实施可以导致更快，更有效的研究和更有效的临床决策。从协助基因组学到改善医学教育和增强药物发现，Chatgpt正在改变生物信息学家和医疗保健专业人员处理复杂问题的方式。但是，与任何技术进步一样，需要考虑的挑战。这些包括数据隐私问题，AI-I-Intent的道德含义以及AI模型在临床决策中的可靠性。本手稿旨在探索生物信息学中Chatgpt的潜力和局限性，从而概述其应用，道德考虑以及AI在生物医学科学中的未来方向。
特刊 - 生物信息学在微生物组中的应用...
基因对我们对生物学的理解至关重要，诸如基因组学和基因组编辑之类的现代进步一直保持遗传学为一个充满活力，多样和快速发展的领域。在该领域需要高质量的开放访问期刊，基因团队旨在在整个遗传学学科中提供专家手稿处理，认真的同行评审和快速发表。从2010年开始，该期刊现在已得到充分确认和认可。为什么不考虑下一篇遗传学纸的基因？
医疗保健的分子建模和生物信息学
准备系统：使用gromacs/namd/amber分析轨迹运行MD模拟的蛋白质，配体和溶剂设置轨迹：RMSD，RMSF，氢键和SASA自由能计算（MM-PBSA/MM-GBS）和案例研究
NASA GL4U：使用空间生物学数据
“我学到的关于生物信息学的知识要比其他任何高等教育课程阅读遗传学论文时，这将大大提高我的理解。我不能足够强调这个研讨会的价值，需要继续为其他学生继续，我绝对会希望将来参加更多这样的研讨会。”
肠道3凝胶：一种用于培养人肠道菌群nataliasuárezvargas 1 *的高吞吐量粘液模型，Miguel Antunes 1 *; JoãoSobral1，
图3。ABHD12序列的系统发育分析。 （a）代表来自860个生物的ABHD12序列的系统发育树。 外部彩色圆圈分别代表序列所属的类和门。 （b，c）pie-thart分析，代表来自（b）不同门的系统发育树的数据，以及（c）门神经元内的各种类别。 PIE-CHART上的数字表示该类别中的ABHD12序列的数量。 PIE-CHART分析表明，门丘塔氏菌包含大多数ABHD12序列，在类Aves，Actinopterygii和哺乳动物中具有主要分布。ABHD12序列的系统发育分析。（a）代表来自860个生物的ABHD12序列的系统发育树。外部彩色圆圈分别代表序列所属的类和门。（b，c）pie-thart分析，代表来自（b）不同门的系统发育树的数据，以及（c）门神经元内的各种类别。PIE-CHART上的数字表示该类别中的ABHD12序列的数量。PIE-CHART分析表明，门丘塔氏菌包含大多数ABHD12序列，在类Aves，Actinopterygii和哺乳动物中具有主要分布。
生物信息学分析L-天冬酰胺酶结构（枯草芽孢杆菌），中嗜（Kibdelosporangium）和嗜热（Thermoco
抽象背景：L-天冬酰胺酶在治疗急性淋巴细胞白血病（ALL）方面用作抗癌药。此外，它在医学，食品和制药行业中广泛应用。方法：源自枯草芽孢杆菌的L-天冬酰胺酶的核苷酸和氨基酸序列最佳7613，kibdelosporangium sp。MJ126-NF4和kodakarensis kod1是从GenBank和NCBI数据库中获得的。使用Clustalw 1.83进行了浮雕水的成对序列比对。使用瑞士模型软件进行了研究的不同L-天冬酰胺酶分子的二级和三级蛋白质结构的预测。此外，使用Prosite软件分析了源自三种细菌的L-天冬酰胺酶的蛋白质结构域。使用蛋白质PI计算器（http：// isoelectric.ovh.org/）预测理论等电点（PI），分子量和氨基酸组成。结果：尽管三种细菌菌株中L-天冬酰胺酶的结构差异，但其功能特征没有差异，包括分子量，PI和功能域。结论：分析结构差异并找到功能相似性可用于设计具有较高稳定性和生物半衰期的药物。我们的分析表明，具有不同结构的蛋白质可能具有相似的功能特征，这证明了密码子使用假设。关键字：天冬酰胺酶，淋巴细胞白血病，生物信息学