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方尖碑遗传变异性的生物信息学研究
在人类消化微生物组的链球菌的细菌群中，已经鉴定出了方尖碑RNA序列，尽管它们对微生物组或宿主生物体的生理影响仍然未知（Schmitt- Kremer等人，2024年）。在该菌株中发现了一个特定的方尖碑序列“方尖碑S.S”，长度为1,137个核苷酸，与Alpha和beta方尖碑的基因组相似，分别为41％和35％。尽管存在与Oblin-1的相似性，但没有发现与Oblin-2的基因组相似性。至少在上述菌株中，细菌种群中的方尖碑序列的存在表明它们可能存在于其他菌株甚至物种中。尚不清楚不同类型的上线孔是否表现出真核细胞的乳房（尽管它们在生态上与微生物群体及其宿主生物（Schmitt-Kremer等，2024））（2024）），是否为细菌提供了有益的功能（Maddamsotti等，2024），是否有与造成的效果。已经提出，通过包含小RNA的囊泡的细菌转运可能是一种通信策略，这可能是方尖碑传播的潜在机制的关键（Maddamsetti等，2024）。然而，细胞宿主中有方尖碑的存在似乎与蛋白质的产生有关，特别是至少两种类型（α和beta方尖碑）。作为潜在的新生物学实体，尚不清楚它们是否具有类似于噬菌体的翻译机制或类似于病毒的自动化机制，等待进一步研究是否真的生成了生物信息学工具预测的蛋白质结构。基于Zheludev等人，2024年提出的假设，可以推测，与细胞基因组进化一样，将外部序列纳入当前的细胞序列，方尖碑S.S.如生物信息学分析所建议的，可能有助于链球菌的转录组片段。
生物信息学软件开发：原理和未来方向
9这些作者同等贡献 *通信：huangtao@sibs.ac.cn（T.H.）; liyang_fudan@fudan.edu.cn（l.y。）; gcyu1@smu.edu.cn（g.y。）; pdu@tju.edu.cn（p.d.）收到：2024年5月9日；接受：2024年7月21日；在线发布：2024年8月13日； https://doi.org/10.59717/j.xinn-life.2024.100083©2024作者。这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。引用：Ma X.-K.，Yu Y.，Huang T.等，（2024）。生物信息学软件开发：原理和未来方向。创新生活2（3）：100083。用于分析生物医学数据的生物信息学软件对于将原始数据转换为有意义的生物学见解至关重要。在这篇评论中，我们概述了使用ClusterProfiler和CirceXplorer2作为说明性示例的生物启动软件开发的关键阶段和注意事项。此外，我们研究了一些已建立的大规模生命科学平台，并总结了开放科学的大数据和人工智能时代（AI）时代的设计原理。未来的大规模平台有望提供图形编程语言，并从数据和代码共享到物理资源的平台。AI革命将改变生物信息学软件的景观，并重新定义生命科学的研究范式。
生物信息学和计算生物学（BCB）
BCB 5810-生物信息学座谈会0-1学分（可重复）学分（可重复）该课程通过教职员工，学生和受邀演讲者的演讲为学生提供有关生物信息学和计算生物学研究的最新信息。入学学分的学生必须在研讨会的一部分中进行20-30分钟的演讲，在展示技术内容的同时展示他们的口头沟通技巧。学生必须具有研究生身份或获得CAS Associate Dean的许可，并获得毕业生和讲师的认可。提供秋季和春季。限制：入学率仅限于具有生物信息学专业的学生的学生。
第21届国际生物信息学研究研讨会...
论文提交请通过在线提交系统（https://easychair.org/conferences?conf=ISBRA2025提交扩展摘要（最多12页）。提交意味着至少一位作者愿意在研讨会上注册和出席。作者应选择以下曲目之一：曲目1：以（i）在Springer LNBI程序中发布扩展摘要的最多12页，以及（ii）邀请提交30％-50％ - 50％ - 延误版本，以提交ISBRA'24特殊问题。未决的批准期刊是计算生物学和生物信息学的IEEE/ACM交易，计算机科学技术杂志，Tsinghua科学技术，中国电子学杂志，《大数据挖掘与分析》或IEEE IEEE生物医学和健康信息学杂志。曲目2：以（i）在会议上的（i）演示和（ii）邀请提交全长纸向ISBRA'25特殊问题提交（i）的演示文稿的最多12页。未决的批准期刊是计算生物学，方法，跨学科科学及可生活科学，定量生物学，BMC生物信息学或BMC基因组学。重要日期
优化元基因组分析以早期检测结直肠癌：制定生物信息学方法和推进跨核心预测
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年2月27日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.22.639690 doi：Biorxiv Preprint
生物信息学：论文803（BIF 803）
此处发布的信息可能会发生变化，并且可以在此信息发布后修改。一般法规（G法规）适用于比勒陀利亚大学的所有学院。期望学生对这些法规以及一般规则部分中包含的信息很好地熟悉自己。关于这些法规和规则的无知将不会被视为任何违法行为的借口。
生物信息学（C004122）中的Capita Selecta
1本课程主要旨在表明学生表明生物信息学的领域是1个完整的开发中，它显示了不同的应用程序如何推动生物信息学中的基本研究，以及如何支持生物信息学来支持和1利用湿实验室研究。2对生物信息学应用领域的高级知识。3在生物信息学中识别重要的生物信息学方法。4理解英语的研讨会，用英语写报告。5了解寿命长期学习的重要性对于迅速发展的领域是一种生物信息学。6意识到与生物信息学有关的道德话题（例如合成1生物学，患者信息的机密性）。
生物信息学中的Chatgpt和DeepSeek -IJRPR
近年来，人工智能（AI）已成为各个领域的强大工具，生物信息学是其表现出变革性潜力的最杰出领域之一。生物信息学涉及大规模的生物学数据分析，包括基因组序列，蛋白质结构和临床数据。使用机器学习（ML），深度学习（DL）和自然语言处理（NLP）技术在理解复杂的生物学现象方面加速了进展，而在这项革命的最前沿，是OpenAI开发的大型语言模型。chatgpt建立在GPT（生成预审预测的变压器）等尖端神经网络体系结构上，在文本生成，数据解释甚至对话交流方面都表现出了非凡的功能。其在生物信息学中的实施可以导致更快，更有效的研究和更有效的临床决策。从协助基因组学到改善医学教育和增强药物发现，Chatgpt正在改变生物信息学家和医疗保健专业人员处理复杂问题的方式。但是，与任何技术进步一样，需要考虑的挑战。这些包括数据隐私问题，AI-I-Intent的道德含义以及AI模型在临床决策中的可靠性。本手稿旨在探索生物信息学中Chatgpt的潜力和局限性，从而概述其应用，道德考虑以及AI在生物医学科学中的未来方向。
特刊 - 生物信息学在微生物组中的应用...
基因对我们对生物学的理解至关重要，诸如基因组学和基因组编辑之类的现代进步一直保持遗传学为一个充满活力，多样和快速发展的领域。在该领域需要高质量的开放访问期刊，基因团队旨在在整个遗传学学科中提供专家手稿处理，认真的同行评审和快速发表。从2010年开始，该期刊现在已得到充分确认和认可。为什么不考虑下一篇遗传学纸的基因？
医疗保健的分子建模和生物信息学
准备系统：使用gromacs/namd/amber分析轨迹运行MD模拟的蛋白质，配体和溶剂设置轨迹：RMSD，RMSF，氢键和SASA自由能计算（MM-PBSA/MM-GBS）和案例研究