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CSE7850/CX4803计算生物学中的机器学习
描述此研究生级课程的重点是机器学习与计算生物学之间的令人兴奋的交集。我们将涵盖现代机器学习技术，包括受监督和无监督的学习，特征选择，概率建模，图形模型，深度学习等。学生将学习这些方法的基本原则，基本的数学和实施细节。通过阅读和批评发表的研究论文，学生将学习机器学习方法在基因组学，单细胞分析，结构生物学和系统生物学中的各种生物学问题上的应用。学生还将通过深入的编程作业使用Pytorch学习使用Pytorch来实施深度学习模型。在最终项目中，学生将通过以生物学问题探索这些概念来应用他们所学的知识，以充满热情。
坎贝尔生物学，11e（urry）
Campbell Biology，11E（Urry）第12章细胞周期12.1多项选择问题1）真核染色体由以下哪个大分子组成？a）DNA和RNA b）仅DNA c）DNA和蛋白质d）DNA和磷脂答案：C Bloom的分类学：知识/理解性部分：12.1 2）从受精卵（Zygote）开始，一系列六个细胞分裂会与有多少个细胞产生早期胚胎？a）12 b）16 c）32 d）64答案：d Bloom的分类法：应用/分析部分：12.1 3）在具有5个染色体对的二倍体细胞中（2n = 10），在细胞分裂周期的G2的一个核中会发现多少个丝粒？a）5 b）10 c）20 d）40答案：B布卢姆的分类法：应用/分析部分：12.2 4）科学家分离细胞周期各个阶段的细胞。它们分离了一组DNA的细胞比G1相细胞多1/2倍。这些细胞被分离出来的细胞周期中最有可能的部分是什么？a）在细胞周期中的g1和s相之间的b）在细胞周期的G2阶段c）在细胞周期的m相中d）在细胞周期的s阶段答案：d Bloom的分类法：应用/分析部分：12.2
样本问题纸类XII 044生物学（2024-25）
（i）假设，GPP森林A = GPP森林B = GPP森林C，如果森林A的npp = 1254 J /m 2 /天；森林B，npp = 2157 J /m 2 /天；和森林C，npp = 779 J /m 2 /天，其中哪个森林通过呼吸而具有最大的能量损失？给出理由。（ii）画出以下食物链数量的生态金字塔a。草 - 动物 - 宿主动物上的流量b。树 - 昆虫 - 啄木鸟
dnabert，一种在生物学和健康中进行顺序预测的语言方法
本文论文讨论了这种新的DNABERT模型，并解决了它对生物学和健康产生影响的程度。在这里，与当前现有模型相比，DNABERT是否是革命性的。通过比较先前研究中预测模型的准确性与DNABERT的准确性，我得出的结论是，DNABERT可以在剪接位点预测上获得出色的性能，并且可以获得最高的准确性，但无法获得启动子预测的出色性能。因此，我的目的是确定DNABERT的工作原理，以便可以获得可能可以用于进一步优化和自定义的理解。因此，分析了DNABERT的K-MER令牌化方法和字节对编码。这是通过采用Ji等人的DNABERT的所述方法来进行的。（2021）和Zhou等人的DNABERT-2。（2023）。从此分析中可以得出结论，两种方法都比现有的DNA/RNA预测方法更好，但是BPE是最有前途的。之后，使用DNABERT（DNABERT-PROM）重点介绍了启动子预测，以清楚地了解其过程以及如何进行预培训。为了获得此信息，Ji等人的DNABERT-PROM方法的描述。（2021）进行了调整。在这里，可以确定的是，使用具有TATA-Box存在或不存在的远端启动子，对DNABERT-PROM进行了培训，以预测Homo Sapiens。此外，使用EPDNEW数据库获取启动子的数据。为此，Ji等人的DNABERT的描述特性。在分析了DNABERT-PROM之后，我得出的结论是，它是一个高效的模型，可以预测Homo Sapiens中的启动子。最后，我选择提供更广泛的DNABERT观点，以研究如何在生物学和健康领域中应用。（2021）进行了调整，并将其与生物学和健康中的当前限制进行了比较。在这里，我得出的结论是，DNABERT是生物学和健康中转录调节预测的最有前途的模型，因为它可以解决上下文所需的信息。我得出的结论是，DNABERT也应该是执行其他类型的DNA/RNA预测的“第一选择”方法，尽管它们的用法绝不能替代研究和诊断中的决策。尽管DNABERT已经是一个非常充分的预测模型，但仍需要进一步的优化和自定义来扩大其对生物学和健康中顺序预测的贡献。
生物学101生物学原理i
BIO 101为学生提供了生物学基本原理的介绍。本课程涵盖了生命的基础：细胞，大分子，能量流，遗传学和遗传，进化和生物多样性以及生态学。（先决条件：Biol 101L）
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作为生物学注释[最终]
●酶●70S核糖体●小圆形DNA●油滴●淀粉颗粒 - 来自光合作用类固醇和颗粒的碳水化合物的临时储存，叶绿体➔叶绿体具有膜的内部网络，形成了扁平的囊状囊囊。➔将几个类囊体堆叠在一起称为Granum（复数grana）➔grana被称为Lamella lamella的膜连接在一起。（光依赖反应）➔膜上的蛋白质与叶绿素分子相关，形成了称为光系统（1和2）的复合物，其中包含不同的光合色素。
Senthilkumar Kandasamy Maulin P. Shah Kavitha Subbiah Naveenkumar Manickam编辑微生物小nexus nexus维持环境生物学废物
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英国生物安全策略 - 2024年8月
通过工程生物学监管沙箱基金和合成核酸筛选实施方案的探索（英国科学，创新与技术部2024a;英国科学，创新与技术部2024B）。There have similarly been apparent efforts to develop and promote responsible innovation practices in collaboration with the United States, through initiatives such as the US-UK Strategic Dialogue on Biological Security and the US-UK partnership on AI safety ( Cabinet Office 2024a ; UK Department of Science, Innovation and Technology & AI Safety Institute 2024a ), as well as internationally, through the UK's participation in the UK AI Safety Summit 2023 and AI首尔峰会2024。
