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基于基因表达的表型预测深神经网络的生物学解释
摘要背景：使用预测基因标志来协助临床决策变得越来越重要。深度学习在基因表达谱的表型预测中具有巨大的潜力。但是，神经网络被视为黑匣子，在没有任何解释的情况下，提供了准确的预测。这些模型变得可解释的要求正在增加，尤其是在医学领域。结果：我们专注于解释由基因表达数据构建的深神经网络模型的预测。影响预测的最重要的神经元和基因被鉴定出来并与生物学知识有关。我们对CAN-CER预测的实验表明：（1）深度学习方法优于大型训练集的经典机器学习方法； （2）我们的方法产生的解释与生物学比最先进的方法更连贯； （3）我们可以对生物学家和医生的预测提供全面的解释。结论：我们提出了一种原始方法，用于从基因表达数据中对表型预测深度学习模型的生物学解释。由于模型可以找到表型和基因表达之间的关系，因此我们可以假设已鉴定的基因与表型之间存在联系。因此，解释可以导致生物学家研究新的生物学假设。
CNH使用自动化来提高零件仓库巴西尔顿的生产力和可持续性，2025年3月4日，在世界工程日，CNH发行了第一个
哥本哈根，丹麦，2025年2月25日 - 巴伐利亚北欧A/S（OMX：Bava）今天宣布与生物E. E. Limited（BE）建立战略合作伙伴关系，以扩大在低层和中等基础国家（LMIC）国家的巴伐利亚北欧北欧Chikungunya疫苗。最初，两家公司已签订了一项合同制造协议，以允许扩大能力，以使未来的LMIC国家供应。本协议包括Chikungunya疫苗的当前药物制造过程的技术转移，并选择在以后转移药物的过程。巴伐利亚北欧人保留了自己的制造能力，用于西方市场即将进行疫苗的商业化。巴伐利亚北欧人继续探索与其通过许可和分销合作伙伴为美国和欧洲以外的市场提供全球访问其基孔肯雅亚疫苗的策略一致的机会。美国疫苗最近和首次批准是12岁以下的第一种chikungunya疫苗，以及欧洲药品局的人类使用药品委员会的积极意见，证明了将监管机构批准扩大到这些市场之外的可行性。“我们很高兴地宣布我们的首次合作，以扩大对奇康古尼亚疫苗的全球访问权限，以及我们与生物E的第一家合作伙伴关系，他们在提供疫苗方面具有扎实的专业知识和全面的经验，以改善全球公共卫生，” Bavarian Nordic的总裁兼首席执行官Paul Chaplin说。由于VLP不含病毒遗传物质，因此疫苗无法感染细胞，再现或引起疾病。“扩大供应是我们解决对解决方案越来越多的解决方案需求的能力的先决条件。 Biological E. Limited董事总经理Mahima Datla女士说：“我们很高兴与巴伐利亚北欧合作，以帮助扩大其在低收入和中等收入国家的Chikungunya疫苗的可用性。我们制造业和成功提供全球疫苗接种的业绩的规模与巴伐利亚北欧协同保持一致，我们致力于利用我们的先进和高效的制造技术来满足地方性地区的健康需求。”关于CHIKV VLP疫苗CHIKV VLP是一种辅助VLP重组蛋白疫苗，用于预防12岁及以上的个体中的Chikungunya病毒（CHIKV）虽然Chikv VLP疫苗的作用机理仍需要进一步表征，但人们认为该疫苗可以通过诱导中和抗体来诱导CHIKV感染的保护，从而导致对某些CHIKV蛋白的中和抗体导致中和实时病毒的中和化。添加佐剂以增加疫苗介导的免疫反应的大小。在2025年2月，美国食品药品监督管理局（FDA）批准了Vimkunya™（Chikv VLP）为12岁以下的第一种Chikungunya疫苗。批准是基于两个3期临床试验的结果，该试验招募了3500多名12岁及以上的健康个体。研究符合其主要终点，结果表明，疫苗接种后的21天，该疫苗在多达97.8％的疫苗接种个体中诱导中和抗体，并且表现出一种快速的免疫反应，开始在一种
生物系统计算模型指南
乔·海尔斯坦（Joe Hellerstein）4 1,4 1.4*，彼得·亨特（Peter Hunter）14，14，露西安·史密斯（Lucian P. Olivier 11，Alexander A. Patrie 10，M。Quardokus 2，Sven 36，Sven 36，James C. Schaff 10，T.J。 Janis Shin 1，Jacky L. Snoep 37，Ion Moraru 10
生物数据库（I002642）
1。生物数据库管理1.1。关系数据模型1.2。数据归一化1.3。结构化查询语言1.4。BioSQL/Chado：生物学数据模型1.5。面向对象的数据库1.6。生物数据库1.7。生物数据库集成1.8。ditribed注释系统（DAS）1.9。层次和基于框架的系统（XML，Daml+Oil）2。异质数据库集成2.1。（应用）集成框架2.2。分析方法：将大型数据库耦合到统计2.3。使用LWP，机器人和蜘蛛2.4的非关系数据集成。文本挖掘
胶质母细胞瘤患者放射治疗的个性化问题的生物学方面
谷氨酰胺是胶质母细胞瘤细胞的必要底物，对肿瘤生长很重要。我们研究了ERN1敲低对EGFR，ERBB2，TOB1和CEBPB基因表达在U87MG胶质母细胞瘤细胞中响应谷氨酰胺缺乏的影响。表明，EGFR和ERBB2基因的表达水平与对照胶质母细胞瘤细胞中的谷氨酰胺缺乏症相关，但ERN1敲低导致上调这些基因表达。此外，在对照和ERN1敲低胶质母细胞瘤细胞中，TOB1和CEBPB基因表达对谷氨酰胺剥夺敏感，但抑制ERN1会显着提高这些基因对谷氨酰胺剥夺的敏感性，尤其是CEBPB基因。这些结果表明，内质网应激的主要信号通路ERN1控制着所有研究的基因对基因特异性方式胶质母细胞瘤细胞中谷氨酰胺剥夺的敏感性，并且以基因特异性方式，并且较低路径。
生物学上诱导的甘氨酸去除氨基酸的微生物代谢，并产生的指纹作为潜在的生物签名
1 UK Center for Astrobiology, University of Edinburgh, Edinburgh, United Kingdom, 2 University of Florida, Plant Pathology Department, Space Life Sciences Lab, Exploration Park, Merritt Island, FL, United States, 3 Laboratory for Astrophysics, Leiden Observatory, Leiden University, Leiden, Netherlands, 4 Life Support and Physical Sciences Instrumentation Section, European Space Agency, Nordwijk, Netherlands, 5太空政策研究所，乔治华盛顿大学，华盛顿特区，美国，6德国航空航天中心（DLR），航空医学研究所，航空医学研究所，放射生物学系，研究小组，研究小组，德国，德国，7个中心，生物生物学中心MOLéculaire，MOLéculaire，National de la Rechorche Sciention Institution Instuction Institution Institution Institution Institution Institution Institution Institution Instuction Instription and or e>卫生，微生物学和环境医学，格拉兹，奥地利，奥地利9中心（CSIC-INTA），西班牙马德里，西班牙10 CBMSO，西班牙10 CBMSO，MADIS OHF，11 MATIS OHF，MATIS OHF，微生物学集团，研究与创新部，研究与创新部，食品科学和营养学院，伊克兰大学，冰岛，ICIDEND，ICLEAND）法国斯特拉斯堡
癌症干细胞和骨肉瘤复发性疾病的生物学证据
hal是一个多学科的开放访问档案，用于存款和传播科学研究文件，无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构，也可能来自公共或私人研究中心。
生物学和生物医学科学，博士学位
硕士学位和博士学位道路为学生提供了一种教育，该教育为他们提供了高级知识水平，尤其是在生物学和生物医学科学的应用领域，并有助于他们发展关键和独立的独立推理能力。
表观遗传学和寿命延长：表观遗传修饰在衰老和通过生活方式干预的逆转生物年龄
表观遗传学通过调节基因表达而不改变DNA序列在衰老和寿命中起着至关重要的作用。最近的研究表明，表观遗传修饰，例如DNA甲基化，组蛋白修饰和非编码RNA相互作用，会导致衰老过程，并且可能受到外部因素的影响。生活方式干预措施，包括饮食，体育锻炼，压力管理和睡眠优化，已通过调节表观遗传标记来逆转生物年龄的结果。本文探讨了表观遗传老化的机制，环境和生活方式因素的影响以及利用表观遗传可塑性的策略来实现健康和寿命。了解这些机制为开发有针对性的干预措施促进健康衰老并延长寿命铺平了道路。