XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemBiophysics
物理学专业，生物物理学专业
鼓励学生努力获得拉丁荣誉（即优等、极优等和最优等）。要获得资格，学生必须满足学院的学术要求，并在系里一名教员的监督下成功完成合适的项目。该项目，无论是实验性的还是理论性的，都应展示学生独立工作的能力。荣誉候选人必须在大四开学第一天之前向本科生研究委员会提出申请。申请应包括拟议项目的描述，并由指导教授共同签署。必须在三月截止日期前向委员会提交已完成工作的书面报告。通过注册物理 499，学生可以获得最多 6 个荣誉项目的学分。
医学生物物理学系
出售/共享（例如，必须了解Facebook组，课程英雄，Chegg等）未经明确许可的记录不允许录制（音频或视频），不得分发录音r学生将被期望学生承诺在Western承诺提供一个不受骚扰和歧视的学习和工作环境之前采取学术诚信保证。所有学生，教职员工和教职员工都在这一承诺中发挥作用，并有责任确保和促进安全，尊重的学习和工作环境。相关政策包括西方的非歧视/骚扰政策（M.A.P.P.1.35）和非歧视/骚扰政策 - 行政程序（M.A.P.P.1.35）。经历或证人行为可能是骚扰或歧视的任何学生，教职员工或教职员工都必须向西方人权办公室报告该行为。骚扰和歧视可以是基于人权的，也称为基于EDI的（性别歧视，种族主义，跨性别恐惧症，同性恋恐惧症，伊斯兰恐惧症，仇外心理，反犹太主义和能力主义）或非人类权利（个人骚扰或工作场所骚扰）。
生物物理报告
使用模型生物线虫C.秀丽隐杆线虫的研究极大地说明了我们对感觉生物学的理解，包括触摸，嗅觉，味觉，味觉，视觉和前置感。长期以来一直认为听力仅限于脊椎动物和某些节肢动物，但我们最近发现秀丽隐杆线虫能够以频率和声音源尺寸的方式感测和对机载声音。C.秀丽隐杆线虫的听觉感觉是当机载声音在物理上振动其外部角质层（皮肤）以通过烟碱乙酰胆碱受体（NACHR）激活声音敏感的机械感应FLP/PVD神经元时，就会发生听觉感觉。在这里，作者报告了逐步的方法来表征秀丽隐杆线虫听觉感觉的这三个特征，包括声音引起的皮肤振动，神经元激活和行为。这种方法提供了一个可访问的平台，以研究秀丽隐杆线虫中听觉感觉和机械传输机制的细胞和分子机制。
生理与生物物理学（PHOL）
PHOL 401A。 分子和细胞的生理学和生物物理学。 2个单位。 分子和细胞的生理学和生物物理学是一门研究生的入门课程，旨在提供现代生理学，蛋白质科学和结构生物学的基本原理，并为学生准备生物医学科学的高级课程。 该课程分为2个街区，可以在每年的春季学期中独立用作PHOL 401A或PHOL 401B（每个2个学分HR）。 第一个区块将涵盖蛋白质和脂质的结构和功能，以及细胞膜的组织。 主题将包括原发性，二级，三级和四方蛋白质结构和分析，酶动力学，变构和合作性，脂质膜组织和结构域结构，以及蛋白质 - 蛋白质蛋白和蛋白质脂质相互作用。 第二个区块将涵盖分子途径和对细胞稳态，功能和信号传导至关重要的过程。 Topics will include molecular mechanisms of transport across biological membranes and cellular compartments, ionic basis of the resting membrane potential, action potential generation and propagation, osmosis and Gibbs- Donnan equilibria, regulation of voltage-gated channels and electrogenic transporters, cellular pH regulation, and the biophysics of epithelial transport. 格式将是讲座，基于讨论的问题集，期刊纸质演示以及计算机实验室练习和演示的结合。 分级将基于在每个块中间和末尾进行的两种论文考试的表现（80％）以及班级参与（20％）。PHOL 401A。分子和细胞的生理学和生物物理学。 2个单位。 分子和细胞的生理学和生物物理学是一门研究生的入门课程，旨在提供现代生理学，蛋白质科学和结构生物学的基本原理，并为学生准备生物医学科学的高级课程。 该课程分为2个街区，可以在每年的春季学期中独立用作PHOL 401A或PHOL 401B（每个2个学分HR）。 第一个区块将涵盖蛋白质和脂质的结构和功能，以及细胞膜的组织。 主题将包括原发性，二级，三级和四方蛋白质结构和分析，酶动力学，变构和合作性，脂质膜组织和结构域结构，以及蛋白质 - 蛋白质蛋白和蛋白质脂质相互作用。 第二个区块将涵盖分子途径和对细胞稳态，功能和信号传导至关重要的过程。 Topics will include molecular mechanisms of transport across biological membranes and cellular compartments, ionic basis of the resting membrane potential, action potential generation and propagation, osmosis and Gibbs- Donnan equilibria, regulation of voltage-gated channels and electrogenic transporters, cellular pH regulation, and the biophysics of epithelial transport. 格式将是讲座，基于讨论的问题集，期刊纸质演示以及计算机实验室练习和演示的结合。 分级将基于在每个块中间和末尾进行的两种论文考试的表现（80％）以及班级参与（20％）。分子和细胞的生理学和生物物理学。2个单位。分子和细胞的生理学和生物物理学是一门研究生的入门课程，旨在提供现代生理学，蛋白质科学和结构生物学的基本原理，并为学生准备生物医学科学的高级课程。该课程分为2个街区，可以在每年的春季学期中独立用作PHOL 401A或PHOL 401B（每个2个学分HR）。第一个区块将涵盖蛋白质和脂质的结构和功能，以及细胞膜的组织。主题将包括原发性，二级，三级和四方蛋白质结构和分析，酶动力学，变构和合作性，脂质膜组织和结构域结构，以及蛋白质 - 蛋白质蛋白和蛋白质脂质相互作用。第二个区块将涵盖分子途径和对细胞稳态，功能和信号传导至关重要的过程。Topics will include molecular mechanisms of transport across biological membranes and cellular compartments, ionic basis of the resting membrane potential, action potential generation and propagation, osmosis and Gibbs- Donnan equilibria, regulation of voltage-gated channels and electrogenic transporters, cellular pH regulation, and the biophysics of epithelial transport.格式将是讲座，基于讨论的问题集，期刊纸质演示以及计算机实验室练习和演示的结合。分级将基于在每个块中间和末尾进行的两种论文考试的表现（80％）以及班级参与（20％）。
生物物理学：弥合生物学与物理学之间的差距
1。Horwitz R.细胞生物物理学。Biophys J.2016; 110（5）：993-996.1。 2。 Henon S，Lenormand G，Richert A，Gallet F.使用光学镊子对人红细胞膜的剪切模量的新确定。 Biophys J. 1999; 76（2）：1145-1151。 3。 Asano M，Basieva I，Khrennikov A，Ohya M，Tanaka Y，YamatoI。量子信息生物学：从量子力学的信息解释到分子生物学和认知心理学的应用。 找到了物理。 2015; 45：1362-1378。 4。 Zimmerberg J.膜生物物理学。 Curr Biol。 2006; 16（8）：R272-276。 5。 Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。 ADMET DMPK。 2019; 7（4）：222-241。 6。 sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。 生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。 int J Mol Sci。 2024; 25（7）：4127。 7。 Mohs RC，Greig NH。 药物发现和开发：基本生物学研究的作用。 阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。 2017; 3（4）：651-657。2016; 110（5）：993-996.1。2。Henon S，Lenormand G，Richert A，Gallet F.使用光学镊子对人红细胞膜的剪切模量的新确定。Biophys J.1999; 76（2）：1145-1151。 3。 Asano M，Basieva I，Khrennikov A，Ohya M，Tanaka Y，YamatoI。量子信息生物学：从量子力学的信息解释到分子生物学和认知心理学的应用。 找到了物理。 2015; 45：1362-1378。 4。 Zimmerberg J.膜生物物理学。 Curr Biol。 2006; 16（8）：R272-276。 5。 Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。 ADMET DMPK。 2019; 7（4）：222-241。 6。 sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。 生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。 int J Mol Sci。 2024; 25（7）：4127。 7。 Mohs RC，Greig NH。 药物发现和开发：基本生物学研究的作用。 阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。 2017; 3（4）：651-657。1999; 76（2）：1145-1151。3。Asano M，Basieva I，Khrennikov A，Ohya M，Tanaka Y，YamatoI。量子信息生物学：从量子力学的信息解释到分子生物学和认知心理学的应用。找到了物理。2015; 45：1362-1378。 4。 Zimmerberg J.膜生物物理学。 Curr Biol。 2006; 16（8）：R272-276。 5。 Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。 ADMET DMPK。 2019; 7（4）：222-241。 6。 sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。 生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。 int J Mol Sci。 2024; 25（7）：4127。 7。 Mohs RC，Greig NH。 药物发现和开发：基本生物学研究的作用。 阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。 2017; 3（4）：651-657。2015; 45：1362-1378。4。Zimmerberg J.膜生物物理学。Curr Biol。2006; 16（8）：R272-276。 5。 Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。 ADMET DMPK。 2019; 7（4）：222-241。 6。 sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。 生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。 int J Mol Sci。 2024; 25（7）：4127。 7。 Mohs RC，Greig NH。 药物发现和开发：基本生物学研究的作用。 阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。 2017; 3（4）：651-657。2006; 16（8）：R272-276。5。Holdgate G，Embrey K，Milbradt A，Davies G.早期药物发现中的生物物理方法。ADMET DMPK。2019; 7（4）：222-241。6。sun X，Zhou Y，Wang Z，Peng M，Wei X，Xie Y等。生物分子冷凝物破译细胞命运的分子代码：从生物物理基本原理到治疗实践。int J Mol Sci。2024; 25（7）：4127。7。Mohs RC，Greig NH。药物发现和开发：基本生物学研究的作用。阿尔茨海默氏症痴呆症（n y）。2017; 3（4）：651-657。2017; 3（4）：651-657。
生物物理学的年度综述下一代遗传编码的荧光生物传感器照亮细胞信号传导和代谢
进行高通量筛选。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。282 3.1。基于结构和计算信息的理性设计。。。。。。。。282 3.2。基于筛选的技术。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。284 4。生物传感器的新应用。。。。。。。。。。。。。。。。 div>。 div>285 4.1。 div>多重载体。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>285 4.2。 div> 超分辨率显微兼容的生物构成。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 287 4.3。 div> 在道态生理条件下的应用。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div>285 4.2。 div>超分辨率显微兼容的生物构成。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>287 4.3。 div>在道态生理条件下的应用。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>288 4.4。 div> 进一步的申请。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 289 5。 div> 结论。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div>288 4.4。 div>进一步的申请。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>289 5。 div>结论。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>290 div>
生物物理学祖先重建和蛋白质能量景观的演变的年度审查
蛋白质的序列决定了其构象能量景观。这又决定了蛋白质的功能。了解新蛋白质功能的演变需要了解突变如何改变蛋白质能量景观。祖先序列重建（ASR）已证明是解决此问题的宝贵工具。在ASR中，一个系统发育集团从而渗透了古代蛋白质的序列，从而允许其性质表征。当与生物物理，生化和功能表征耦合时，ASR可以揭示历史突变如何改变古代蛋白质的能量景观，从而允许酶活性的演化，具有构象，具有结合特异性，寡聚性，低聚性，低聚性和许多其他蛋白质特征。在本文中，我们回顾了如何使用ASR研究来剖析能量景观的演变。我们还讨论了ASR研究，这些研究揭示了能量景观如何影响蛋白质的演化。最后，我们建议从能量景观的角度考虑进化的思考可以改善我们的接近和解释ASR研究的方式。
2024 -Q2_NEWSLETTER_NWO_POL.PDF -NWO BIOPHYSICS
我们的椅子（Kristina Ganzinger）是圆桌物理学（RTP）的成员。当然，荷兰物理学领域的利益相关者比RTP（荷兰物理委员会）多，每个利益相关者的作用以及他们如何相互联系的角色并不明显。为了帮助人们浏览这一景观，已准备好的信息图来说明物理领域的组织方式，相关利益相关者是谁以及他们的角色彼此之间的关系。信息图可以在这里和这里找到。NWO已要求包括美国和RTP在内的物理咨询委员会进一步改进。最近在圆桌物理学（RTP）上讨论的其他项目与我们的社区相关，以下部分在“新约会，赠款，奖品和其他新闻”中列出。
生物化学和化学生物学结构生物学和分子生物物理学7,8-二羟基氟氟酮是吡啶还毒素磷酸酶的直接抑制剂
维生素B6缺乏症已与人类脑疾病的认知障碍联系在一起数十年。仍然，将维生素B6与这些病理联系起来的分子机制仍然很少了解，并且补充维生素B6是否可以改善认知也不清楚。吡啶毒素磷酸酶（PDXP）是一种控制吡啶多毒素5'-磷酸盐水平（PLP）的酶，即维生素B6的共酶活性形式，可能代表一种替代性的治疗剂进入维生素B6相关病理学。但是，缺乏测试此概念的药理学PDXP抑制剂。现在，我们确定了鼠海马中PLP水平的PDXP和年龄依赖性下降，这为PDXP抑制剂的发展提供了理由。使用小分子筛选，蛋白质晶体学和生物层干涉法，我们发现，可视化和分析7,8-二羟基氟氟酮（7,8-DHF）作为直接且有效的PDXP抑制剂。7,8-DHF结合并可逆地抑制PDXP，其微摩尔亲和力和亚微摩尔效应。在小鼠海马神经元中，7,8-DHF以PDXP依赖性方式增加了PLP。这些发现将PDXP验证为可药的目标。值得注意的是，尽管对其作用机理进行了积极的争论，但7,8-DHF是脑部疾病模型中良好的分子。我们发现7,8-DHF作为PDXP抑制剂提供了有关围绕大脑7,8-DHF介导的作用的争议的新型机械见解。
神经丝生物物理学：从结构到生物力学
摘要神经丝（NFS）是多基因的，神经元特异性的中间细丝，该细丝由直径10 nm的细丝“核心”组成，周围是一层长的内在无序蛋白（IDP）“尾巴”。 NF被认为可以调节发育过程中的轴突能力，然后稳定成熟的轴突，而NF亚基的不利性，突变和Ag gregation在多种神经系统疾病中显着。该领域对NF结构，力学和功能的理解已被多种生物化学，细胞生物学和小鼠遗传研究深入了解了四十年以上。这些研究为我们对轴突生理学和疾病中NF功能的集体理解做出了很大的贡献。近年来，在两个新的情况下，人们对NF亚基蛋白引起了人们的兴趣：作为神经元损伤的潜在血液和脑脊液的生物标记，以及具有吸引人特性的模型IDP。在这里，我们回顾了NF结构和功能方面的既定原则和最新发现。在Pos sible的地方，我们将这些发现放在NF组装，相互作用和对轴突力学的贡献的背景下。