2 药物发现的生物物理学和生物化学简介 .........................................9 2.1 药用和生物化学 ......。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。9 2.1.1 化学信息学和图论。...................11 2.1.2 描述符和相似性 ...........................12 2.1.3 化学空间 .....。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。.16 2.2 蛋白质与疾病 ....................。。。。。。。。。。。18 2.3 蛋白质-配体结合 ...........................20 2.3.1 绑定模型 ...........................22 2.4 蛋白质-配体结合的计算建模 .............22 2.4.1 使用分子动力学进行生物物理建模 ............23 2.4.2 结合自由能估计 ......。。。。。。。。。。。。。24 2.5 结论。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。26
转化模型确定了纳米粒子递送的 miRNA-22 与三阴性乳腺癌标准治疗药物之间的协同作用 Prashant Dogra,1,2 Javier Ruiz Ramírez,1 Joseph D. Butner,1 Maria J. Peláez,1 Caroline Chung,3 Anupama Hooda-Nehra,4,5 Renata Pasqualini,4,6 Wadih Arap,4,5 Vittorio Cristini,1,7,8 George A. Calin,9 Bulent Ozpolat,10 Zhihui Wang 1,2,7,* 1 休斯顿卫理公会研究所医学数学项目,美国德克萨斯州休斯顿 77030;2 威尔康奈尔医学院生理学和生物物理学系,美国纽约州纽约 10065; 3 德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心放射肿瘤学系,美国德克萨斯州休斯顿 77030;4 新泽西州罗格斯癌症研究所,美国新泽西州纽瓦克 07101;5 罗格斯新泽西医学院医学系、血液学/肿瘤学分部,美国新泽西州纽瓦克 07103;6 罗格斯新泽西医学院癌症生物学分部放射肿瘤学系,美国新泽西州纽瓦克 07103;7 德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心成像物理学系,美国德克萨斯州休斯顿 77230;8 威尔康奈尔医学院医学科学研究生院生理学、生物物理学和系统生物学项目,美国纽约州纽约 10065;
1卢布林卢布林生活科学生命科学与生物技术学院化学系,阿卡迪米卡(Akademicka)15,20-950 lublin,波兰; iwona.budziak@up.lublin.pl 2 Jagiellonian大学的精确和自然科学博士学位,St. dominika.kaczmarczyk@doctoral.uj.edu.pl 3 3理论化学系,贾吉洛隆大学化学学院,jagiellonian大学,gronostajowa 2,30-387kraków,波兰4,波兰4生物物理学,生物学系,环境生物学学院,环境生物学学院,Life of Life Sci of Life Sci in clublines of Life Sci in clublins in life cliens in l Life Sci in in 9 libl in lublins in lublin oblin in lublin,波兰; klaudia.rzad@up.lublin.pl 5玛丽亚·库里·斯克洛多夫斯卡大学(Maria Curie-Sklodowska University,akademicka)19,20-033卢布林,波兰卢布林; mariusz.gagos@mail.umcs.pl 6卢布林医科大学生物化学与分子生物学系,波兰卢布林20-093; Andrzej.stepulak@umlub.pl 7植物生理学和生物化学系,生物化学学院,生物物理学和生物技术学院,Jagiellonian University,Gronostajowa 7,30-387 Krak rand; B.Mysliwa-kurdziel@uj.edu.pl 8化学技术与环境分析系(C1),化学工程技术学院,克拉科夫技术大学,华盛斯卡大学24,31-155 Krak rand,波兰; dariusz.karcz@pk.edu.pl(D.K.); karolina.starzak@pk.edu.pl(K.S.)9 Ecotech-Complex - 高级环境友好技术的分析和计划中心,Maria Curie-Sklodowska University,Gł˛eboka,Gł˛eboka39,20-033 Lublin,波兰10物理学学院波兰; gotardb@amu.edu.pl *通信:monika.srebro@uj.edu.pl(m.s.-h.); arkadiusz.matwijczuk@up.lublin.pl(a.m.);电话。: +48-12-686-2383(M.S.-H。); +48-81-445-6909(A.M.)
作者贡献:构思和设计实验:A.L.,B.H.A.,V.A.,R.T.D进行了实验:Y.H.,S.S.S.S.D分析了数据:Y.H.,S.S.S.S.S.,P.E. J.J.,B.H.A.,V.A.,R.T.D。在其他作者的贡献中,竞争利益声明:作者声明没有竞争利益。分类:生物科学:生物化学;物理科学:生物物理学和计算生物学关键词:组蛋白;晶体结构;核小体;染色质;核苷此文件包括:
•Jamie Naso,MPH(jnaso@bu.edu)1•Susy Rojas(surojas93@gmail.com)2•James Peng,MS(James.peng@ucsf.edu)3•Carina Marquez,MD (maria.conreras@ucsf.edu)1•Edgar Castellos(Edgar.castellanosdiaz@ucsf.edu)1•Susana Rojas(susan@calle24sf.org)2•路易斯·卢比奥(Luis Rubio) 1•乔恩·雅各布(Jon Jacobo)(jjacobo@todco.org)2•道格拉斯·布莱克(Douglas Black)(douglas.black@ucsf.edu)3•valerie tulierlawaai(apachesol@sbcglobal.net) (gabriel.chamie@ucsf.edu)3•Genay Pilalowski,博士学位(genaylarawski@gmail.com)1•Joseph Derisi,博士学位(joe@derisillab.ucsf.edu)6,7•Diane Havlir。医学博士,博士学位(mayaliv@berkeley.edu)8* 1联合1* Salud,美国加利福尼亚州旧金山2号,美国加利福尼亚州旧金山,旧金山,旧金山,加利福尼亚州旧金山3,美国3弗朗西斯科,旧金山,感染性疾病和全球医学,艾滋病疾病和全球医学部,圣弗朗西斯科,圣弗朗西斯科,圣弗朗西斯科。 5 Bay Area phlebotomy and Laboratory Services, San Francisco, Ca, USA 6 chan zuckerberg biohub, San Francisco, California, USA 7 Department of Biochemistry and Biophysics, University of California San Francisco, San Francisco, California, USA 8 Division of Bifor California, Ca, Verkeleyleys, Berkeleyleys作者
1。B. SC生物技术介绍生物技术的跨学科性质整合了活性系统,包括动物,植物和微生物及其从分子生物学到细胞生物学的研究,从生物化学到生物物理学,从基因工程到生物学细胞研究,从生物学技术到生物学 - 来自生物学的生物学生物学,来自生物学生物学,来自生物学生物学,来自生物学生物学,来自生物学生物学,来自环境生物学,来自生物学生物学,来自生物学生物学。对物质转化等生化。 这些研究对生物体及其生物处理的相关性和应用在课程大纲中广泛涵盖。 生物技术计划。生物技术的跨学科性质整合了活性系统,包括动物,植物和微生物及其从分子生物学到细胞生物学的研究,从生物化学到生物物理学,从基因工程到生物学细胞研究,从生物学技术到生物学 - 来自生物学的生物学生物学,来自生物学生物学,来自生物学生物学,来自生物学生物学,来自生物学生物学,来自环境生物学,来自生物学生物学,来自生物学生物学。对物质转化等生化。这些研究对生物体及其生物处理的相关性和应用在课程大纲中广泛涵盖。生物技术计划。
每个研究小组的活动都以基础科学为基础,由此产生了具有与工业合作潜力的应用研究和创新。CEITEC BUT 在物理学、化学、生物物理学、生物化学和材料科学领域开展研究。CEITEC BUT 认为跨学科的先进纳米和微技术以及先进材料(尤其是与生命科学相关的)是其进一步科学发展的关键领域。这些领域应催化该地区乃至整个欧洲改善生活产业的发展。所涉及的研究领域与欧盟为 H2020 和以下欧盟计划定义的关键使能技术直接相关。具体来说:
