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Bruker Maldi Biotyper报告指南
Bruker Maldi Biotyper是什么？MALDI BIOTYPER使用MALDI-TOF（矩阵辅助激光解吸时间的飞行时间）鉴定微生物质谱法，以测量生物体的独特分子指纹。具体而言，MALDI Biotyper测量所有微生物中发现的高度丰富蛋白质。这些高度丰富的蛋白质的特征模式用于可靠，准确地确定特定的微生物，通过将各自的模式与广泛的开放数据库匹配，以确定微生物的身份，以便将微生物的身份归为物种水平。
外泌体在肿瘤免疫中的应用
摘要：芽孢杆菌和相关属是药物生产环境中最重要的污染物之一，在物种水平上鉴定这些微生物有助于研究污染的来源以及预防性和纠正性决策。这项研究的目的是评估三种方法，以表征从巴西里约热内卢的药物单位分离出的内孢子的有氧细菌菌株。MALDI-TOF MS，并使用Sanger方法进行了完整的16S rRNA基因测序。结果表明芽孢杆菌属（n = 9; 36.0％），priestia（n = 5; 20.0％）和佩尼比曲霉（N = 4; 16.0％）的流行率。三个（20.0％）菌株显示出<98.7％的DNA测序相似性在ezbiocloud数据库上，表明可能的新物种。此外，将芽孢杆菌杆菌的重新分类为Priestia属，为Priestia pseudoflexus sp。nov。提出了。总而言之，16S rRNA和MALDI TOF/MS不足以识别物种水平的所有菌株，并且需要进行互补分析。
使用增强型细胞破碎协议改进结核分枝杆菌的 MALDI-TOF MS 鉴定
摘要：结核分枝杆菌是导致结核病的微生物，这种疾病影响着全世界数百万人。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 是一种快速、可靠且经济高效的微生物鉴定方法，已用于鉴定分枝杆菌分离株。然而，分枝杆菌细胞壁富含脂质，这使得获取蛋白质进行 MALDI-TOF MS 分析变得困难。在本研究中，比较了两种细胞制备方案：MALDI-TOF 仪器制造商 Bruker Daltonics 推荐的 MycoEx 和本文描述的 MycoLyser 方案，后者使用 MagNA Lyser 仪器通过乙醇增强细胞破碎。使用两种方案对结核分枝杆菌 H37Rv 菌株进行细胞破碎和蛋白质提取步骤，并比较 MALDI-TOF MS 结果。MycoLyser 方案可以提高结核分枝杆菌的 Biotyper 鉴定率，因为使用此方案获得的 log(score) 值大多≥1.800，并且明显高于经过 MycoEx 处理的 log(score) 值。考虑到布鲁克标准，鉴定可靠性也提高了。鉴于这些结果，可以得出结论，MycoLyser 分枝杆菌细胞破碎和蛋白质提取方案提高了 MALDI-TOF MS 方法鉴定结核分枝杆菌的效率。
四个新颖的无结核分枝杆菌
作者分支机构：1个国际分枝杆菌学实验室，丹麦哥本哈根Statens Serum Institut； 2英国诺丁汉诺丁汉特伦特大学生物科学系； 3罗斯基尔德大学科学与环境系，丹麦4000 Roskilde； 4丹麦哥本哈根大学公共卫生系全球卫生科。*通信：Xenia Emilie Sinding Iversen，Xesi@ssi。DK关键字：burgundiense sp。nov。;分枝杆菌Holstebronense sp。nov。;分枝杆菌kokjensenii sp。nov。;分枝杆菌Wendilense sp。nov。;非结核分枝杆菌；新物种；分类学描述。†共享的最后作者身份：这些作者对工作也同样贡献。在线补充材料中提供了补充数字和两个补充表。006620©2025作者缩写：ALRT，近似似然比测试； AMR，抗菌素耐药性； ANI，平均核苷酸身份； AST，抗菌敏感性测试； BIC，贝叶斯信息标准； CD，蛋白质编码序列； CLSI，临床和实验室标准研究所； GGD，基因组到基因组距离； HPLC，高性能液相色谱； IRLM，分枝杆菌国际参考实验室；它的内部转录垫片； LJ，Löwenstein -Jensen； LPA，线探测测定； MALDI-TOF，基质辅助激光解吸电离时间； MB7H10，Middlebrook 7H10; MBT，MALDIBIOTYPER®； MGIT，分枝杆菌生长指示灯管； MHB，Mueller – Hinton汤； MIC，最少抑制浓度； MS，质谱； NCBI，国家生物技术信息中心； NTM，无结核分枝杆菌； ONT，牛津纳米孔技术； PGAP，原核基因组注释管道； PPS，病原体概率评分； SSI，Statens Serum Institut；结核病，结核病； TES，N-三三（羟甲基）甲基-2-氨基乙磺酸； WGS，全基因组测序； Zn，Ziehl – Neelsen。