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印度尼西亚活性海洋化合物的分子对接研究
1 农业研究计划，艾哈迈德达兰大学农业学院，印度尼西亚 *通讯作者：ikhymanno97@gmail.com 摘要 背景：许多天然和合成疗法被用于帮助 COVID-19（2019 冠状病毒病）患者的康复，但抑制这种病毒的有效性仍需进一步研究。 目的：预测海参中的硫酸软骨素化合物是否对 COVID-19 具有抗病毒活性。 方法：使用分子对接方法，基于硫酸软骨素与 6LU7 和 2GTB 蛋白（COVID-19 中发现的主要蛋白酶 (M pro)）的相互作用，测试其对 COVID-19 的抗病毒活性。研究阶段包括准备6LU7和2GTB蛋白质结构数据库，使用Biovia Discovery Studio应用程序准备和优化3D硫酸软骨素结构，以及使用Autodock 4.2应用程序验证6LU7和2GTB蛋白质上的分子对接和硫酸软骨素对接方法。结果：硫酸软骨素与6LU7蛋白具有较高的亲和力并形成氢键，其对6LU7受体的亲和力值为（-9.5 kcal/mol），RMSD Ib为（0.000），RMSD ub为（0.000），而2GTB蛋白的亲和力较低，即对2GTB受体的亲和力值为（-7.7 kcal/mol），RMSD Ib为（0.000），RMSD ub为（0.000）。结论：根据分子对接研究结果，硫酸软骨素具有抗病毒潜力，因为它与 6LU7 和 2GTB 蛋白具有亲和力，可以抑制 COVID-19 病毒的感染途径。关键词：COVID-19，硫酸软骨素，6LU7 和 2GTB 受体，分子对接
在硅酸α-雄激素化合物中作为糖原语法酶激酶3β受体（GSK3β）的抑制剂作为替代疗法
Health Makassar摘要乳腺癌部的2个Poltekkes是一种癌症，由乳腺细胞形成，该乳腺细胞生长，并具有长期控制的地方，位于小叶层和管道通道中。通过Wnt/β-catenin途径过表达糖原合酶3β（GSK3β）引起的乳腺癌的原因之一，因此β-catenin不会引起癌症。具有活性作为乳腺癌活性的化合物之一是α-Mangostin。这项研究的目的是确定α-蜂蛋白化合物可以作为对乳腺癌中GSK3β受体的抑制剂。这项研究中的方法是通过GSK3β受体中的分子对接（GDP代码：1Q3D，1PYX，4ACC，3GB2，4PTE，1Q5K）和α-Mangostin使用Autodock工具4.2和Biovia Discoverio2019。分子对接（分子对接）的结果表明，比天然配体（比较）在1q3d GDP代码（-8.76 kcal//mol和376.96 Nm）中，α-粘蛋白化合物具有较低的键合能量和抑制常数（比较），4ACC（-7.66 kcal/mol/sol）和1.66 kcal/solm and.66 kcal/4um and.4.66 kcal/6um anc.（-66 kcal/molum and 2.4.66 kcal/molum and）（ kcal/mol和17.55μm）。氨基酸残基α-蜂窝蛋白化合物的相互作用的结果与三种天然配体的相似性，百分比范围为66-84％。这表明α-甲状腺素化合物可以用作乳腺癌药物的候选者。关键词：α-蜂窝蛋白，乳腺癌，GSK3β受体，中
洞察与葡萄糖酶的茉莉花分子对接相互作用
iabetes mellitus（DM）是印度尼西亚的非传染性疾病。这项研究探讨了茉莉香肠植物化学成分对处理DM的潜力。使用多个数据库和计算机辅助药物发现工具在计算机分析中证明了茉莉花Sambac作为DM治疗候选者的潜力。本研究利用PubChem数据获得了分析的生物活性化合物，同时使用的受体是从RSCB获得的（PDB ID：4LC9）。使用swissadme测试了化合物的ADME特性。此外，还采用了瑞士目标预测和DB弦来分别分析靶蛋白和代谢途径，生物活性和相关疾病。通过使用PYRX版本0.8的分子对接进行了进一步的分析，使用Biovia Discovery Studio Visualizer版本4.5进行可视化。从jasminum sambac中包含的化合物的搜索结果中发现其中包含几种活性化合物。Some of these compounds passed the ADME criteria, compounds (Z, Z,Z)-3,6,9-Dodecatrien -1-ol,( Z)- Jasmone, linalool, Nerolidol, (-)-alpha-Cadinol, Benzenemethanol, Benzaldehyde, Linalyl benzoate, and 2,2,3,4-Tetramethylpentane.此外，对发生的分子相互作用，这些化合物的结合与人类中发现的葡萄糖激酶酶的结合以及它们的潜力如何成为糖尿病的抑制剂，进行了深入的分析。这增加了开发新药物化合物以抑制糖尿病的可能性。在植物茉莉香肠中发现的化合物，特别是苯基苯甲酸甲醇和苯甲酰甲醇，与葡萄糖酶蛋白具有强大的键合能力。关键字：茉莉花sambac |糖尿病| GCK | Linalyl苯甲酸酯|在硅中，这种称为糖尿病（DM）的疾病的特征是血糖（血糖）水平高于正常水平，尤其是当空腹血糖水平高于或等于126 mg/dl时，血糖水平等于或大于200 mg/dl。由于当今儿童不受管制的生活方式，这种疾病现在影响了许多年轻人。这种情况也是由几个环境变量引起的，由于其生活环境，许多人患有糖尿病。除了其他变量外，糖尿病患者的产生更有可能患上糖尿病1糖尿病，糖尿病是一种具有高血糖水平的异质疾病。呈现了糖尿病的当前分类，并比较了1型和2型糖尿病的主要特征。此外，在禁食和口服葡萄糖中使用准确的生化诊断标准和血红蛋白A1C（HBA1C）
通过计算机模拟分析 admet 特性和抑制...
1 犹他大学生物化学系，犹他州，美国 2 拉各斯州立大学理学院化学系，拉各斯，尼日利亚 3 拉各斯州立大学理学院生物化学系，拉各斯，尼日利亚 *通讯作者电子邮件地址：zechariaholuwadamilola@gmail.com 摘要：不同类别的生物碱已证明具有抗癌治疗功效。干扰素诱导的四肽重复序列 5 蛋白 (IFIT5) 与肾细胞癌 (RCC) 的发病机制有关。人们对这些药理相关类别的生物碱对 IFIT5 的抑制作用知之甚少。因此，我们确定了这些生物碱的 ADMET 特性，以及它们对 IFIT5 的抑制潜力。从 PubChem 中检索到 50 种生物碱。IFIT5 的结构是从蛋白质数据库中获得的，并使用 Biovia Discovery Studio 进行处理以消除非标准分子。使用 PyRx 进行分子对接以评估蛋白质-配体复合物的结合亲和力，而使用 AdmetSAR 和 swissADME 进行 ADMET 分析。对接结果显示，所有 50 种选定的生物碱均表现出较高的 IFIT5 结合效果，范围从 -7.1 到 -11.0 kcal/mol，超过二（羟乙基）醚共结晶配体（-3.9 kcal/mol），其中 nortopsentin A 成为最有希望的候选药物。此外，前五种 IFIT5 结合生物碱中的四种（nortopsentin A、stylopine、氧化苦参碱和脱氧微管蛋白）表现出良好的类药物特性。这些生物碱（尤其是 nortopsentin A）表现出的良好类药物特性和强大的 IFIT5 结合影响凸显了它们在开发用于靶向 RCC 治疗的选择性 IFIT5 抑制剂的临床前/临床试验中的潜力。关键词：肾细胞癌，IFIT5，生物碱，结合亲和力，药代动力学，毒性介绍肾细胞癌 (RCC) 是一种隐匿性肿瘤，约占全球癌症诊断和死亡的 2% (Padala 等人，2020 年)。RCC 的一个独特特征是许多患者通常无症状；据估计，超过 50% 的患者在因无关问题进行影像学检查时被偶然诊断出患有 RCC (Rosner 等人，2021 年)。与 RCC 相关的几个主要风险因素包括吸烟、体重过重、饮酒、高血压、糖尿病、慢性肾病，以及遗传因素，例如 von Hippel-Lindau (VHL) 肿瘤抑制基因突变 (Al-Bayati 等人，2019 年)。大多数肾细胞癌发生在肾脏皮质，由肾小球、肾小管和集合管组成（El-Zaatari 等人，2020 年）。发达国家的肾细胞癌病例通常通过影像学诊断，只有 10% 的患者出现经典的三联症状，包括血尿、腰痛、可触及的肿块、发热、体重减轻和白细胞增多（Satwikananda 等人，2023 年）。