主题领域:生物科学和生物技术 姓名:SANTOS MORENO, JAVIER 参考号:RYC2023-043017-I 电子邮箱:santosmoreno.j@gmail.com 职称:合成生物学家,研究基因回路对细胞行为的编程 履历:我拥有生物技术硕士学位(萨拉曼卡大学)和临床分析实验室硕士学位(庞培法布拉大学)。我在不到 3 年的时间里(2016 年,26 岁)在巴黎(索邦大学巴黎城分校)获得博士学位,研究蛋白质分泌。我研究了细菌(K. oxytoca)II 型分泌系统 (T2SS) 的分子机制,为此我描述了新的蛋白质相互作用并产生了重要的结果,这使我提出了一种新的 T2SS 分泌模型。在瑞士洛桑做博士后期间,我将研究重点从研究现有生物系统转向构建新系统。在研究大肠杆菌的过程中,我率先使用 CRISPRi 构建了一些最重要的合成电路(包括图案化电路、振荡器或双稳态开关),并将这些电路用于不同的应用,包括进化研究、人类病原体(S. penuemoniae)感染研究或细菌细胞生理学的重新编程。我目前在巴塞罗那进行研究,最初以玛丽居里研究员的身份进行,现在以胡安德拉谢尔瓦研究员的身份进行,旨在设计人类皮肤微生物组用于诊断和治疗目的。我成功地将最丰富的皮肤细菌(痤疮梭菌)变成了一种可常规转化的生物体,我为这种细菌开发了第一个分子工具箱(包括启动子、报告基因、转录因子、CRISPR 工具等),并且我构建了一种痤疮梭菌菌株,该菌株在人类皮肤细胞培养物中产生并分泌具有 ROS 清除活性的分子,这在治疗炎症性皮肤病方面具有巨大潜力。2023 年 9 月,我获得了 230 万欧元的 ERC 启动基金。我未来的研究将专注于活细胞中的编程时间。目前,我们对细胞随时间变化进行编程的能力仍然非常有限。我们依靠精确定时的人工干预或控制重复过程的分子振荡器,但我们仍然无法对细胞进行编程以在所需的时间自主执行自定义操作。我现在打算通过在 E. coli 中生成分子计时器来计算时间并在指定时间执行所需的操作,从而朝着这个目标迈出一大步。计时器将具有高度可编程性、可重复使用性和可扩展性,我将使用一种简单而有效的方法将时间可编程性扩展到其他生物体(包括酵母和哺乳动物细胞)。最后,我将利用生物计时器的潜力,将其用于不同的应用,包括:在生物控制中,在期望的时间后进行细胞程序性死亡;精确控制任务执行顺序和时间,用于生物生产;以及在期望的时间窗口内记录(外)细胞事件的“哨兵”细胞,用于生物传感。我的研究结果将释放出无数新的可能性,包括基础的和应用的。例如,在开放或难以接近的环境中(例如农田或受污染的湖泊)部署工程细胞最终可能成为现实,因为任务执行和自我毁灭将被遗传编码为在预定的时间发生。此外,编程的时间指令可以避免在大型生物反应器中对昂贵的诱导信号的需求,或者使研究发育过程时受到的外部干扰最小。总之,我的团队将开发出非常需要的、突破性的测量和编程细胞时间的能力。
Atkinson-Shiffrin 模型(模态模型):一种基于信息处理的记忆模型,最早于 20 世纪 60 年代开发,强调短期记忆作为信息进入长期记忆之前的入口所起的作用。氛围效应:在推理中,如果结论包含与前提相同的量词(“一些”、“全部”或“否”),则倾向于接受该结论为有效。注意:在特定时刻,增强某些信息并抑制其他信息的过程。注意瞬脱:如果第二条信息在第一条信息出现后的一定时间内出现,则报告第二条信息的性能会下降。注意控制器:冲突现象神经网络模型的一个组成部分,可激活与当前目标相关的表征。态度:对物体或人的相对持久的情感色彩信念、偏好和倾向,例如对人或物体的喜欢、爱、恨或渴望。自动过程:一种无需意图即可启动且无需注意即可运行的过程。 背景知识:一种指定属性如何产生、为何重要以及彼此之间如何关联的知识。 向后搜索:在解决问题时,从目标状态移动到初始状态。 巴德利-希奇模型:目前影响深远的工作记忆模型;它强调需要短期存储信息才能进行复杂的认知活动,采用两个短期存储缓冲区和一个控制系统。 基本情绪:六种基本情绪反应类型似乎在各个文化中都普遍存在:快乐、悲伤、愤怒、恐惧、厌恶和惊讶。 基础级别:最常用、最容易学习和最有效地处理的分类级别。 行为方法:一种测量直接可观察行为的技术,例如响应时间或响应准确性。 信念偏差:当有关世界的背景知识和个人信念影响记忆并将其重塑为与预期一致的形式时产生的偏差。信念偏差效应:在推理中,倾向于接受三段论的“可信”结论,而不是“不可信”结论。 约束问题:我们如何将形状、颜色和方向等不同特征关联起来,以便感知单个物体的问题。 双眼竞争:每只眼睛看到的单个图像之间的竞争。 生物运动:生物体独特产生的运动模式。 双稳态感知:对模糊刺激交替解释的感知。 阻塞(记忆):当其他信息与检索线索更紧密相关时,阻碍检索目标信息的障碍。 瓶颈:对一次可以处理的信息量的限制,需要选择信息以通过瓶颈。布罗卡失语症(非流利性失语症):一种失语症,其特征是言语不流利,通常理解能力相当好,但在处理复杂句子方面存在缺陷。布朗-彼得森任务:一项检查短期记忆中存储持续时间的任务。分类三段论:前提和结论与不同类别相关的三段论。基于类别的归纳:一种依赖于所涉及实例类别的归纳形式。类别特定障碍:在失认症中,选择性地无法检索某些类别的单词,例如水果或蔬菜,同时保留识别其他单词类别的能力。中央执行器:Baddeley-Hitch 工作记忆模型的控制系统组件,它控制两个存储缓冲系统中的信息操作。变化视盲:无法检测到场景物理方面的变化,被认为是由于无法在任何时候选择场景中存在的所有信息而引起的。块:工作记忆中的信息分组,通过将多比特信息作为单个单元进行处理,可以增加有效存储容量。 (情绪的)环形模型:一种描述情绪反应范围随唤醒和效价维度变化的模型。