摘要:严重急性呼吸综合症冠状病毒2(SARS-COV-2)引起的冠状病毒疾病2019年(COVID-19)是全球健康紧急情况。主要蛋白酶(M Pro)对于冠状病毒的生命周期至关重要。boceprevir是SARS-COV-2 M Pro的潜在抑制剂和药物候选者。在这项研究中,研究了M PRO的蛋白质结构的变化,这是由于SARS-COV-2突变以及这些变化对Boceprevir亲和力的影响(重要的潜在治疗剂)。用RDP4和Megax分析了突变。通过Promod3产生了突变M Pro的三维模型。定性模型能量分析,下原和或而者是用于野生型和突变体M蛋白的结构验证和建模。使用I-Tasser TM得分计算野生型和突变体M Pro的拓扑差异。使用Autodock 4.2进行分子对接。使用Dynomics创建了功能动态结构模型。在SARS-COV-2的M Pro中检测到了七个突变(L89F,K90R,P108,A191V,T224A,A234V和S254F)。突变导致潜在的蛋白酶抑制剂Boceprevir的亲和力降低。Boceprevir停靠到M Pro的活性位点,对于野生型和突变体而言,结合能分别为-10.34和-9.41 kcal.mol -1。通过弹性网络模型分析计算的Debye – Waller因子分别为0.58和0.64Å2,野生型M Pro和Mutant M Pro分别为0.58。是SARS-COV-2的重要药物靶标的结构中的突变可能会使现有的治疗疗法无效。
用于治疗丙型肝炎(HCV)(Boceprevir,Telaprevir,Elbasvir/Grazoprevir)的抗病毒药
摘要:尽管生物制剂量的应用数量增加,但共价抑制剂的发展仍然是药物发现中增长的领域。The successful approval of some covalent protein kinase inhibitors, such as ibrutinib (BTK covalent inhibitor) and dacomitinib (EGFR covalent inhibitor), and the very recent discovery of covalent inhibitors for viral proteases, such as boceprevir, narlaprevir, and nirmatrelvir, represent a new milestone in共价药物开发。通常,靶向蛋白质的共价键可以在目标选择性,耐药性和给药浓度方面提供不同优势。共价抑制剂的最重要因素是电力(弹头),它决定了选择性,反应性和蛋白质结合的类型(即可逆或不可逆),可以通过合理设计进行修改/优化。此外,共价抑制剂在蛋白水解中越来越普遍,靶向嵌合体(Protac)用于降解蛋白质,包括当前被认为是“不可能”的蛋白质。本综述的目的是强调共价抑制剂开发的现状,包括简短的历史概述以及Protac Technologies的应用以及SARS-COV-2病毒的某些示例。
CYP3A4抑制剂…由于甲吡嗪的活跃部分长期生活,可以在更长的共同管理过程中进一步增加总逆转的血浆。因此,甲哌嗪与强或中等的CYP3A4抑制剂的共同给药(例如boceprevir, clarithromycin, cobicistat, indinavir, itraconazole, ketoconazole, nefazodone, nelfinavir, posaconazole, ritonavir, saquinavir, telaprevir, telithromycin, voriconazole , diltiazem, erythromycin, fluconazole, verapamil ) s禁忌(请参阅第4.3节)。红霉素(每天两次500 mg),一种中等的CYP3A4抑制剂,平均导致甲虫给药3周后总甲虫的总甲虫的血浆暴露量增加1.4倍(范围1.03-2.32倍)。因此,在克里匹嗪与中等CYP3A4抑制剂(例如,红霉素,氟康唑,Diltiazem,Verapamil)共同给药期间,建议对个体反应和耐受性进行监测,并建议(如果需要),则需要(如果需要),甲虫的剂量应(Cariprazine剂量)的曝光量增加,以减少估计的重量。由于甲磷酸及其活性代谢产物的长期半衰期,开始或停止使用中等CYP3A4抑制剂或更改剂量的治疗,直到几周后才能完全反映在血浆药物水平中。应监测患者的不良反应和治疗反应,在启动或停止相互作用的药物或每次逆元剂量变化后几周。…
1斯坦福大学神经生物学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 2 Aarhus University化学系;丹麦的奥尔胡斯。 3斯坦福大学生物工程系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 4得克萨斯大学医学分公司微生物和免疫学系;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 5斯坦福大学医学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 6斯坦福大学的体外生物安全3级服务中心,斯坦福大学;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 7在斯坦福大学化学,工程和医学(Chem-H)的化学,工程和医学计划;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 8斯坦福大学,斯坦福大学大分子结构知识中心;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 9病理学系,德克萨斯大学医学分公司;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 10神经科学,细胞生物学和解剖学系,德克萨斯大学医学分支机构;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 11斯坦福大学微生物与免疫学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学12 Chan Zuckerberg Biohub;美国加利福尼亚州旧金山。 13斯坦福大学化学与系统生物学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 *相应的作者。 电子邮件:westberg@chem.au.dk,mzlin@stanford.edu摘要:SARS-COV-2主要蛋白酶(M Pro)的抑制剂,例如Nirmatrelvir(NTV)(NTV)和Entitrelvir(ETV),证明了在降低了与CRUTISS的相关性中的相关性,但有效地降低了与CRUTISS的相关性,并且存在于共同性的情况下,并且存在着众多的未来。 反抗。 第二代口服药物在这些突变体上保留功能。1斯坦福大学神经生物学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。2 Aarhus University化学系;丹麦的奥尔胡斯。 3斯坦福大学生物工程系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 4得克萨斯大学医学分公司微生物和免疫学系;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 5斯坦福大学医学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 6斯坦福大学的体外生物安全3级服务中心,斯坦福大学;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 7在斯坦福大学化学,工程和医学(Chem-H)的化学,工程和医学计划;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 8斯坦福大学,斯坦福大学大分子结构知识中心;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 9病理学系,德克萨斯大学医学分公司;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 10神经科学,细胞生物学和解剖学系,德克萨斯大学医学分支机构;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 11斯坦福大学微生物与免疫学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学12 Chan Zuckerberg Biohub;美国加利福尼亚州旧金山。 13斯坦福大学化学与系统生物学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 *相应的作者。 电子邮件:westberg@chem.au.dk,mzlin@stanford.edu摘要:SARS-COV-2主要蛋白酶(M Pro)的抑制剂,例如Nirmatrelvir(NTV)(NTV)和Entitrelvir(ETV),证明了在降低了与CRUTISS的相关性中的相关性,但有效地降低了与CRUTISS的相关性,并且存在于共同性的情况下,并且存在着众多的未来。 反抗。 第二代口服药物在这些突变体上保留功能。2 Aarhus University化学系;丹麦的奥尔胡斯。3斯坦福大学生物工程系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。4得克萨斯大学医学分公司微生物和免疫学系;美国德克萨斯州加尔维斯顿。5斯坦福大学医学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 6斯坦福大学的体外生物安全3级服务中心,斯坦福大学;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 7在斯坦福大学化学,工程和医学(Chem-H)的化学,工程和医学计划;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 8斯坦福大学,斯坦福大学大分子结构知识中心;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 9病理学系,德克萨斯大学医学分公司;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 10神经科学,细胞生物学和解剖学系,德克萨斯大学医学分支机构;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 11斯坦福大学微生物与免疫学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学12 Chan Zuckerberg Biohub;美国加利福尼亚州旧金山。 13斯坦福大学化学与系统生物学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 *相应的作者。 电子邮件:westberg@chem.au.dk,mzlin@stanford.edu摘要:SARS-COV-2主要蛋白酶(M Pro)的抑制剂,例如Nirmatrelvir(NTV)(NTV)和Entitrelvir(ETV),证明了在降低了与CRUTISS的相关性中的相关性,但有效地降低了与CRUTISS的相关性,并且存在于共同性的情况下,并且存在着众多的未来。 反抗。 第二代口服药物在这些突变体上保留功能。5斯坦福大学医学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。6斯坦福大学的体外生物安全3级服务中心,斯坦福大学;美国加利福尼亚州斯坦福大学。7在斯坦福大学化学,工程和医学(Chem-H)的化学,工程和医学计划;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 8斯坦福大学,斯坦福大学大分子结构知识中心;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 9病理学系,德克萨斯大学医学分公司;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 10神经科学,细胞生物学和解剖学系,德克萨斯大学医学分支机构;美国德克萨斯州加尔维斯顿。 11斯坦福大学微生物与免疫学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学12 Chan Zuckerberg Biohub;美国加利福尼亚州旧金山。 13斯坦福大学化学与系统生物学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。 *相应的作者。 电子邮件:westberg@chem.au.dk,mzlin@stanford.edu摘要:SARS-COV-2主要蛋白酶(M Pro)的抑制剂,例如Nirmatrelvir(NTV)(NTV)和Entitrelvir(ETV),证明了在降低了与CRUTISS的相关性中的相关性,但有效地降低了与CRUTISS的相关性,并且存在于共同性的情况下,并且存在着众多的未来。 反抗。 第二代口服药物在这些突变体上保留功能。7在斯坦福大学化学,工程和医学(Chem-H)的化学,工程和医学计划;美国加利福尼亚州斯坦福大学。8斯坦福大学,斯坦福大学大分子结构知识中心;美国加利福尼亚州斯坦福大学。9病理学系,德克萨斯大学医学分公司;美国德克萨斯州加尔维斯顿。10神经科学,细胞生物学和解剖学系,德克萨斯大学医学分支机构;美国德克萨斯州加尔维斯顿。11斯坦福大学微生物与免疫学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学12 Chan Zuckerberg Biohub;美国加利福尼亚州旧金山。13斯坦福大学化学与系统生物学系;美国加利福尼亚州斯坦福大学。*相应的作者。电子邮件:westberg@chem.au.dk,mzlin@stanford.edu摘要:SARS-COV-2主要蛋白酶(M Pro)的抑制剂,例如Nirmatrelvir(NTV)(NTV)和Entitrelvir(ETV),证明了在降低了与CRUTISS的相关性中的相关性,但有效地降低了与CRUTISS的相关性,并且存在于共同性的情况下,并且存在着众多的未来。 反抗。第二代口服药物在这些突变体上保留功能。我们假设共价HCV蛋白酶抑制剂BOCEPREVIR(BPV)可以作为与现有药物更加紧密抑制SARS-COV-2 M Pro的口服生物可用药物的基础。执行BPV的结构引导的修饰,我们开发了一种皮摩尔亲和抑制剂ML2006A4,具有抗病毒活性,口服药代动力学和治疗效力,类似于NTV或优于NTV。ML2006A4的关键特征是酮酰胺反应性基团的新衍生化,可改善细胞的渗透性和口服生物利用度。最后,ML2006A4对几种对NTV或ETV的抗性的突变不太敏感,并且发生在天然SARS-COV-2种群中。因此,预期的药物设计可以预先解决潜在的抗药性机制。