1。转化免疫学,西班牙Oviedo 33011 Asturias(ISPA)的研究研究所。2。ricors2040(肾脏病),萨鲁德·卡洛斯三世研究所,西班牙马德里28029。3。脂质在人类病理学中,巴利阿里群岛健康研究所(IDISBA),研究部门,大学医院儿子ESP,07120西班牙帕尔马。4。实验性肾脏学研讨会I trasplantoment(Lenit),调查研究所生物组织August pi I Sunyer(Idibaps),西班牙巴塞罗那。5。自噬和代谢实验室,西班牙奥维迪多·阿特里亚斯(ISPA)的研究研究所。6。deNeprología实验室实验,研究Instituto de Respuctionun Health-FundaciónJiménezDíaz,西班牙马德里的Autónomade Madrid大学。7。Serficio deNefrología,中央De Asturias,Oviedo,Asturias,西班牙大学医院。8。肾脏疾病实验室中的细胞生物学,Iis-FundaciónJiménezDíaz,马德里大学,马德里大学28040,西班牙马德里。9。肾脏科,肾脏肾脏,肾脏研究所,肾脏病学院I泌尿科,泌尿外科,巴塞罗那克莱尼奇医院,西班牙巴塞罗那10。基因组分析平台,CIC Biogune-BRTA,德里奥,西班牙。11。Centro deResjuctionciónBiomédicen Red en el el e el e e e e e enfermedadeshepáticas(ciberehd),西班牙马德里,西班牙。
急性髓系白血病 (AML) 是一种典型的致死性分子异质性疾病,几乎没有广谱治疗靶点。不同寻常的是,大多数 AML 保留了野生型 TP53,它编码促凋亡的肿瘤抑制因子 p53。激活野生型 p53 的 MDM2 抑制剂 (MDM2i) 和靶向 BET 家族共激活因子 BRD4 的 BET 抑制剂 (BETi) 均表现出令人鼓舞的临床前活性,但作为单一药物的临床活性有限。在这里,我们报告了 MDM2i 和 BETi 的组合对 AML 细胞系、原代人类母细胞和小鼠模型的增强毒性,这是因为 BETi 能够从 p53 靶基因中驱逐出意想不到的抑制形式的 BRD4,从而增强 MDM2i 诱导的 p53 激活。这些结果表明,野生型 TP53 和 BRD4 的转录抑制功能共同代表了 AML 潜在的广谱合成治疗脆弱性。
原理:蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 是一种双功能化合物,因其在靶向蛋白质降解 (TPD) 中的作用而受到广泛研究。降解已验证或不可成药的靶标的能力使 PROTAC 在癌症治疗中具有显着的效力。然而,PROTAC 的临床应用受到其体内效力差和药代动力学特性不利的限制。方法:在本研究中,通过将 BRD4 降解 PROTAC 与 ROR1(受体酪氨酸激酶样孤儿受体 1)抗体结合,开发了一种新型降解剂-抗体偶联物 (DAC)。评估了 ROR1 DAC 的体外亲和力、内化功效、降解和细胞毒活性。在小鼠模型中评估了 ROR1 DAC 的药代动力学、抗肿瘤活性和急性毒性。通过RNA测序(RNA-seq)和免疫组织化学方法分析ROR1 DAC与抗鼠程序性细胞死亡蛋白1(αmPD1)mAb联合治疗的疗效。
BET BET BROMODOMAIN BRD4和RAC1 ONCEGONES被认为是癌症的重要治疗靶标,并在肿瘤发生,生存和转移中起关键作用。然而,在不同分子亚型的乳腺癌中,包括Luminal-A,HER-A-2阳性和三重阴性乳腺(TNBC)的BRD4-RAC1信号通路的联合抑制作用仍然未知。在这里,我们通过上下文依赖性的方式通过将乳腺癌的不同分子亚型中BRD4-RAC1致癌信号结合在一起,证明了一种新的共同定位策略。我们表明,JQ1(BRD4的抑制剂)和NSC23766(RAC1的抑制剂)的联合治疗可抑制细胞的生长,克隆性潜能,细胞迁移和乳腺干细胞的膨胀,并诱导乳腺癌细胞分子亚型的自噬和细胞衰老。从机械上讲,JQ1/NSC23766联合处理会破坏MYC/G9A轴,随后增强了FTH1以发挥抗肿瘤作用。此外,联合治疗靶标HDAC1/AC-H3K9轴,因此表明该组合在组蛋白修饰和染色质模型中的作用。c-myc消耗和与维生素-C共同治疗使乳腺癌细胞的不同分子亚型敏感到JQ1/NSC23766组合,并进一步降低细胞的生长,细胞迁移和乳腺圈形成。重要的是,使用异种移植小鼠模型在体内抑制乳腺肿瘤的生长。在临床上,RAC1和BRD4表达在乳腺癌患者的样本中呈正相关,并在乳腺癌的不同分子亚型中显示出高表达模式。Rac1和BRD4蛋白都可以预测乳腺癌患者的生存率不佳。综上所述,我们的结果表明,BRD4-RAC1途径的结合抑制作用代表了乳腺癌不同分子亚型的一种新颖而潜在的治疗方法,并突出了通过c-Myc/g9a/g9a/fth1 axis和下降量调节的乳房肿瘤发生在乳腺癌造成乳腺癌中的Rac1-BRD4信号传导的重要性。
•我们的大多数有效的CBP选择性降解器具有> 10µm的结合亲和力(Tr-Fret IC 50),而没有观察到BRD4(> 30µm)
摘要 背景 错配修复缺陷 (dMMR) 是免疫检查点阻断 (ICB) 反应的一个公认的生物标志物。将 MMR 熟练 (pMMR) 转化为 dMMR 表型以使肿瘤对 ICB 敏感的策略受到高度追捧。含溴结构域 4 (BRD4) 抑制和 ICB 的结合提供了有希望的抗肿瘤作用。然而,其潜在机制仍然未知。在这里,我们发现 BRD4 抑制会在癌症中诱导持续的 dMMR 表型。方法我们通过对癌症基因组图谱和临床蛋白质组肿瘤分析联盟数据进行生物信息学分析以及对卵巢癌标本的免疫组织化学 (IHC) 评分进行统计分析,证实了 BRD4 与错配修复 (MMR) 之间的相关性。通过定量逆转录 PCR、蛋白质印迹和 IHC 测量 MMR 基因 (MLH1、MSH2、MSH6、PMS2)。通过全外显子组测序、RNA 测序、MMR 检测和次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶基因突变检测确认 MMR 状态。在体内和体外诱导 BRD4i AZD5153 耐药模型。通过细胞系之间的染色质免疫沉淀和来自 Cistrome 数据浏览器的数据研究了 BRD4 对 MMR 基因转录的影响。在体内证明了对 ICB 的治疗反应。通过流式细胞术测量了肿瘤免疫微环境标志物,例如 CD4、CD8、TIM-3、FOXP3。结果我们在转录和翻译方面确定了 BRD4 和 MMR 基因之间的正相关性。此外,BRD4 转录抑制会降低 MMR 基因表达,导致 dMMR 状态和突变负荷升高。此外,长期暴露于 AZD5153 可在体内和体外促进持久的 dMMR 特征,增强肿瘤的免疫原性,并且尽管获得了耐药性,但仍增加了对 α - 程序性死亡配体-1 疗法的敏感性。
图 5. 三元复合物形成的亚细胞定位 (A) BRD4 (红色) 仅定位于细胞核,而大多数 HA-KLHL20 (绿色) 位于细胞质中。(左) BRD4 (红色) 和 HA- KLHL20 (绿色) 通道的合并图像。(右) 与 DAPI 染色的合并图像。(B) Strep-KLHL20 和 HA -KLHL20 (绿色) 显示出相似的定位模式。(C) BTR2004 不会改变 BRD4 (红色) 亚细胞定位。DAPI 核染色为蓝色。(D) BTR2004 不会改变 KLHL20 (绿色) 亚细胞定位。DAPI 核染色为蓝色。(E) 使用共聚焦显微镜成像通过邻近连接分析 (PLA) 揭示 BTR2004 介导的三元复合物形成。 (F) 定量 PLA 信号(使用 Imaris 程序)显示三元复合物主要在细胞核中形成。 (G) Exportin 1 抑制剂 KPT276 不能阻止 BRD2 降解,表明核形成的三元复合物被核蛋白酶体降解。
摘要:传统的高通量筛查(HTS)药物发现效率低下。具有临床治疗潜力的化合物的命中率通常为0.5%,最大最高为2%。深度学习模型使筛查率丰富至28%;但是,这些结果包括具有非治疗性相关浓度的命中,其训练集的新颖性不足以及化学空间有限。这项研究介绍了一种新颖的人工智能(AI)驱动的平台,伽利略和分子几何深度学习(Mol-GDL)模型,Chemprint。该模型部署了两个T分配的随机邻居嵌入(T-SNE)数据分裂,以在训练和适应性分子嵌入过程中最大化化学差异,以增强预测能力并导航未知的分子领土。进行回顾性测试时,Chemprint的表现优于五个模型的小组,用于难以放药肿瘤学目标,AXL和BRD4,AXL的AUROC平均得分为0.897,BRD4的AUROC得分为0.876,使用T-SNE分配的BRD4为0.826至0.826至0.885的基准分型,而T-SNE分开的平均得分为0.885。在一项零照片的前瞻性研究中,体外测试表明,通过针对AXL和BRD4提名的41种化合物中有19种在浓度≤20µm时表现出抑制活性,命中率为46%。19次命中报告的平均最高tanimoto相似性得分为0.36,相对于其训练组,得分为0.13(AXL)和0.10(BRD4),相对于这些目标的临床阶段化合物。这会导致以低治疗浓度和高化学新颖性的高命中率发现化合物文库。我们的发现表明,通过训练和测试具有最大差异性的训练和测试化学印记增加了测试的难度增强了模型的预测能力。综上所述,提议的平台设定了新的性能标准。
摘要:传统的高通量筛选 (HTS) 药物发现效率低下。具有临床治疗潜力的化合物的命中率通常为 0.5%,最多只有 2%。深度学习模型将筛选率提高到 28%;然而,这些结果包括与治疗无关浓度的命中、训练集的新颖性不足以及遍历有限的化学空间。这项研究介绍了一种新型人工智能 (AI) 驱动平台 GALILEO 和分子几何深度学习 (Mol-GDL) 模型 ChemPrint。该模型部署了 t 分布随机邻域嵌入 (t-SNE) 数据分割,以在训练期间最大化化学差异,并部署了自适应分子嵌入,以增强预测能力并探索未知的分子领域。回顾性测试时,ChemPrint 的表现优于一组五个模型难以用药的肿瘤靶点 AXL 和 BRD4,使用 t-SNEsplit 实现平均 AUROC 得分 AXL 为 0.897,BRD4 为 0.876,相比之下,基准模型得分范围为 AXL 为 0.826 至 0.885,BRD4 为 0.801 至 0.852。在一项零样本前瞻性研究中,体外测试表明,ChemPrint 提名的 41 种化合物中有 19 种在浓度≤20µM 时表现出抑制活性,命中率为 46%。这 19 个命中报告的平均-最大 Tanimoto 相似度得分相对于其训练集为 0.36,得分为 0.13 (AXL)和 0.10(BRD4)相对于这些目标的临床阶段化合物。我们的研究结果表明,通过在具有最大差异性的数据集上训练和测试 ChemPrint 来增加测试集难度可以增强模型的预测能力。这导致发现具有低治疗浓度和高化学新颖性的高命中率的化合物库。综上所述,所提出的平台设定了新的性能标准。
摘要:横纹肌肉瘤(RMS)是儿童中最常见的软组织肉瘤,其中肌源性前体细胞无法进行分化。有两个主要亚型:肺泡横纹肌肉瘤,其特征是Pax3-福克斯1融合蛋白的表达。和胚胎类型,这是融合阴性的。当前的护理标准在高危疾病中无效。表观遗传脱位是小儿癌的标志。确定染色质修饰剂可维持肿瘤生长并构成RMS中的肌源分化缺陷,他们进行了表观遗传筛查,并确定了介导H3K9 DI-甲基化的EHMT1/EHMT2的放松管制。以及乙酰化标记的读者BRD4。他们对EHMT1/EHMT2的研究在介导分化块和维持肿瘤启动细胞方面显示出差异作用。她将讨论他们最近在RMS中对BRD4同工型特异性功能的研究。
