图2:与替代性DSB测序技术相比,诱导seq表现出无与伦比的灵敏度和动态范围。(a)诱导seq同时检测高度复发的诱导DSB和低级内源性DSB,并以高分辨率。基因组浏览器视图(IgV)诱导seq读取映射到HEK293T细胞的10MB部分,随后与限制性核酸内核酸内切酶Hindiii进行原位裂解。(顶部面板)高度复发性酶诱导的断裂表示在低分辨率(10MB,0-1000读物)时的绝大多数读数。(底部面板)高分辨率视图(粉红色的亮点,500kb,0-20读取)显示出未处理样品中存在的低水平的单源性断裂,以及在复发性印度诱导的突破(绿色亮点)中。(b)诱导seq读取的映射在Hindiii目标位点显示了断裂两侧的单核苷酸断裂映射的精度。(c)对经过治疗和对照样品的每个细胞测量的断裂定量。诱导seq在样品之间的3个数量级上定量检测到每个细胞的断裂。(d和e)通过酶Hindiii和ecorv检测体外裂解限制位点时诱导seq和dsbapture之间的比较。(d)使用诱导seq映射到测序和对齐基因组的读取和对齐基因组的比例更大。(e)使用少800倍的细胞,诱导seq鉴定了与DSBCAPTURE确定的ECORV(93.7%)相似的Hindiii限制位点(92.7%)。(f)使用诱导seq的诱导DSB检测的动态范围。除了在印度内目标序列(AAGCTT)上鉴定出的断裂外,还确定了多个1BP和2BP不匹配靶向位点。诱导seq测得的诱导的休息事件,跨越了8个数量级,从在印度内靶标地点确定的约1.5亿次断裂到最少频繁的脱离目标的5个断裂。(g)在检测ASISI诱导的活细胞中诱导的疾病,DSBCAPTURE和BLISS之间的比较。将测序的读取数(顶部面板)与每个实验(底部面板)识别的ASISI位点的数量进行了比较。诱导seq使用比DSBCAPTUE少的40倍读数检测到最大数量的ASISI位点,而读取的读数比Bliss少23倍。
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斯科特·普拉特 施里弗哨兵报 自 2007 年以来,科罗拉多州施里弗空军基地一直致力于保护地球上最宝贵的资源之一,但今年夏天,为应对近期的干旱和更高的需求,基地领导发起了一项更具雄心的计划。空军太空司令部副司令约翰·E·海顿中将要求各设施重新审视其当前的流程、做法和活动,以节约用水。按照第 50 太空联队指挥官詹姆斯·罗斯上校的指示,施里弗开始遵守基地供水机构切诺基水务区自 6 月 6 日起对其常规住宅和商业客户实施的灌溉限制。罗斯说:“成为社区的好成员包括好好管理我们所占据的土地。遵循水务区的保护措施是一种负责任的做法。”整个夏季,基地将限制浇水时间,每周只有两天,即周一和周五,上午 9 点之前和下午 6 点之后,总共浇水 3 小时。基地能源经理 Abe Irshid 表示:“这将影响基地的景观区域。草坪应该会开始显得枯萎,但遵守这些限制将使我们受益匪浅。我们不仅将满足 Cherokee 的消耗限制,而且这项努力还将帮助我们满足 AFSPC 减少年度用水量的建议。”2007 年,国防部颁布了 13423 号行政命令,要求各设施在 2015 年之前每年减少 2% 的用水量。
摘要:我们探讨了与 DNA 双链断裂反应和修复相关的基因缺陷导致口腔潜在恶性疾病 (OPMD) 恶性转化为口腔鳞状细胞癌 (OSCC) 的可能性。同源重组/范康尼贫血 (HR/FA) 缺陷,而非非同源末端连接缺陷,导致 DNA 修复途径似乎与易患 OSCC 的家族性疾病特征一致 (FA、布卢姆综合征、毛细血管扩张性共济失调);对于发生在年轻患者身上的 OSCC 来说也是如此,有时这些患者很少或没有接触过经典风险因素。即使在先天性角化不良症(一种也易患 OSCC 的端粒酶复合物疾病)中,维持端粒长度的尝试也涉及一条具有共享 HR 基因的途径。因此,HR/FA 途径中的缺陷似乎在易患 OSCC 的疾病中起着关键作用。还有一些证据表明,HR/FA 通路异常与偶发病例 OPMD 和 OSCC 的恶性转化有关。我们提供的数据表明,与致命细胞系相比,一系列 OPMD 衍生的永生角质形成细胞系中 HR/FA 基因以细胞周期依赖性方式过度表达。本研究中的观察结果有力地证明了 HA/FA DNA 修复通路在 OSCC 发展中的重要作用。
方法:这是一篇描述随机交叉研究的方案文章。我们将收集 13 名健康成年人的数据,他们的年龄在 40 至 60 岁之间,体重指数 < 35 kg/m 2 。参与者需要分三次进入实验室,坐 3 小时,每次访问时每 30 分钟以随机顺序休息 3 分钟,休息方式如下:(1) 社交休息;(2) 在跑步机上快走;或 (3) 简单的阻力活动。在每种实验条件之前和之后,将使用短分离通道功能性近红外光谱 (fNIRS) 测量脑血流量 (主要结果),并评估工作记忆 (计算机上的 1、2 和 3)。将收集以下其他次要结果:心理因素(问卷);动脉僵硬;唾液皮质醇水平;和血糖水平。
亲爱的同事们,更新 - TKI 治疗转移性肾细胞癌的治疗中断 我写信是为了通知您有关使用 TKI 治疗转移性肾细胞癌时治疗中断申请要求的更新。在 STAR 试验结果公布后,NHS England 现在允许接受 TKI 治疗肾细胞癌的患者按照 STAR 试验 1 方案进行有计划的治疗中断。有关 STAR 试验的更多信息,请访问:https://doi.org/10.1016/S1470- 2045(22)00793-8。NHS England 目前委托使用以下 TKI 治疗转移性肾细胞癌: 需要事先批准(Blueteq)表格:
替代末端连接 (alt-EJ) 机制,例如聚合酶θ介导的末端连接,越来越多地被认为是导致双链断裂修复不准确的重要因素。我们之前提出了一个 alt-EJ 模型,其中双链断裂附近的短 DNA 重复退火形成二级结构,从而引发有限的 DNA 合成。然后,新生的 DNA 与另一个断裂端的微同源序列配对。这种合成依赖性微同源介导的末端连接 (SD-MMEJ) 解释了果蝇 I-SceI 核酸酶切割后恢复的许多 alt-EJ 修复产物。然而,影响 SD-MMEJ 修复的序列特异性因素仍有待充分表征。在这里,我们通过对 1100 种不同序列环境中 Cas9 诱导的双链断裂处的修复产物进行计算分析,扩展了 SD-MMEJ 模型的实用性。我们在单核苷酸分辨率下发现了成功修复 SD-MMEJ 的序列特征的证据。这些特征包括最佳引物重复长度、重复与断裂的距离、引物重复之间的 DNA 序列灵活性以及微同源模板相对于首选引物重复的定位。此外,我们还表明 DNA 聚合酶 theta 是 Cas9 断裂处大多数 SD-MMEJ 修复所必需的。本文描述的分析包括一个计算流程,可用于表征任何序列环境中 alt-EJ 修复的首选机制。
1位环境和遗传毒理学实验室,路易斯维尔大学药理学与毒理学系,500 S Preston ST,RM 1422,RM 1422,美国肯塔基州路易斯维尔1位环境和遗传毒理学实验室,路易斯维尔大学药理学与毒理学系,500 S Preston ST,RM 1422,RM 1422,美国肯塔基州路易斯维尔
在彗星测定中的摘要中,如果细胞被X X倍化为Genoto XIC剂,则在单细胞凝胶电泳后形成尾巴。these尾巴包括DNA单链断裂(SSB)和双链断裂(DSB)的混合物。ho w e v er,这些两种类型的链断裂无法使用具有Con V en ventionDNA染色的彗星测定方案来区分。由于DSB对单元格是有问题的,因此如果可以在同一彗星中差异化SSB和DSB,则将很有用。为了能够区分SSB和DSB,我们为聚合酶辅助的DNA损伤分析(PADDA)设计了一种协议,可与Flash Comet协议或固定单元格结合使用。通过使用DNA聚合酶I将SSB和末端脱氧核苷酸转移酶标记为具有荧光团标记的核苷酸的DSB。在此,TK6细胞或HACAT细胞暴露于过氧化氢(H 2 O 2),电离辐射(X射线)或DNA切割酶,然后遵循彗星方案,以实施彗星方案。p adda提供了更广泛的检测范围,未发现的DNA链断裂的未发现的未发现。
身体上的不活动已成为我们人群的主要危险因素(Rezende等,2016; Bull等,2020)。尽管如此,最低限度的体育活动(PA)准则和建议清楚地表明,年轻人每天至少应进行至少60分钟的中度和剧烈的体育锻炼,但只有20%的青少年遵守这些建议(WHO,2021年)。促进健康的终身生活方式可以使用资源来激励和提高人们对更积极的原因和目的的认识(Frohlich和Potvin,2008)。因此,旨在促进PA的所有干预措施不仅应集中在体育锻炼的数量和强度上(Cairney等,2019),而且还应提高参与者对为什么要活跃和